CuGenDBv2

Gene ID	HG10020309
Organism	Lagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description	Unknown protein
Genome location	Chr04:30760779..30763471
RNA-Seq Expression	HG10020309
Synteny	HG10020309
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	IPR040344 - Uncharacterized protein At3g17950-like

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAA0044086.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold236G004360 [Cucumis melo var. makuwa]

2.6e-92

86.79

Show/hide

Query:  EDGWPLGLRLMNARV-GLAGNHDLSASVSFNTLLTHSPSSFTDSSSDLDTESTGSFYHDKSITLGSLIGVSSIFELSRRSTKGNEVEILEDKKKYKSKPW
        EDGWPLGLR+MNARV GLAGNHDLSASVSFNTL THSPSSFTDSSSDLDT+STGSFY DKSITLGSLIGVSSI ELSRRSTKGN+VEILEDKKKYKSKPW
Subjt:  EDGWPLGLRLMNARV-GLAGNHDLSASVSFNTLLTHSPSSFTDSSSDLDTESTGSFYHDKSITLGSLIGVSSIFELSRRSTKGNEVEILEDKKKYKSKPW

Query:  LFSLSLCIKLRPDAVSLNSSPSLEHSLEAEKRATRNHRIHNPTLYGPNDYSPIRPVTVSGTNSLFSSDQVAPVSFEPAGEEESRRSNEELVQDGNSQGIP
        LFSLSLCIKLRPDAVS +SSPSL+HSLEAE++ATRN R HN TLYGPNDYS + P  VSG NSLFSSD+V PVSF  AGEEESRRS+ ELVQ+GNSQGIP
Subjt:  LFSLSLCIKLRPDAVSLNSSPSLEHSLEAEKRATRNHRIHNPTLYGPNDYSPIRPVTVSGTNSLFSSDQVAPVSFEPAGEEESRRSNEELVQDGNSQGIP

Query:  LLFSCLYCQLIK
        LLFSCLYCQLIK
Subjt:  LLFSCLYCQLIK

KAG6580547.1 hypothetical protein SDJN03_20549, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

2.4e-90

85.85

Show/hide

Query:  EDGWPLGLRLMNARVGLAGNHDLSASVSFNTLLTHSPSSFTDSSSDLDTESTGSFYHDKSITLGSLIGVSSIFELSRRSTKGNEVEILEDKKKYKSKPWL
        EDGWPLGLRLMN RVGLAGNHDLSASVSFNTL THSPSSFTDSSSDLDTESTGSFYHDKSITLGSLIGVSS+ ELSRRSTKGN VEIL+DKKKYKSKPWL
Subjt:  EDGWPLGLRLMNARVGLAGNHDLSASVSFNTLLTHSPSSFTDSSSDLDTESTGSFYHDKSITLGSLIGVSSIFELSRRSTKGNEVEILEDKKKYKSKPWL

Query:  FSLSLCIKLRPDAVSLNSSPSLEHSLEAEKRATRNHRIHNPTLYGPNDYSPIRPVTVSGTNSLFSSDQVAPVS-FEPAGEEESRRSNEELVQDGNSQGIP
        FSLSLCIKLRPDAVSL+SSPSLEHSLEAE+RA      HNPT+YGPNDYSP+RP  VSGTNSLFSSDQVAPV  F PA  EESRRS  EL +DG  QGIP
Subjt:  FSLSLCIKLRPDAVSLNSSPSLEHSLEAEKRATRNHRIHNPTLYGPNDYSPIRPVTVSGTNSLFSSDQVAPVS-FEPAGEEESRRSNEELVQDGNSQGIP

Query:  LLFSCLYCQLIK
         LFSCLYCQLIK
Subjt:  LLFSCLYCQLIK

XP_008442557.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486392 [Cucumis melo]

2.6e-92

86.79

Show/hide

Query:  EDGWPLGLRLMNARV-GLAGNHDLSASVSFNTLLTHSPSSFTDSSSDLDTESTGSFYHDKSITLGSLIGVSSIFELSRRSTKGNEVEILEDKKKYKSKPW
        EDGWPLGLR+MNARV GLAGNHDLSASVSFNTL THSPSSFTDSSSDLDT+STGSFY DKSITLGSLIGVSSI ELSRRSTKGN+VEILEDKKKYKSKPW
Subjt:  EDGWPLGLRLMNARV-GLAGNHDLSASVSFNTLLTHSPSSFTDSSSDLDTESTGSFYHDKSITLGSLIGVSSIFELSRRSTKGNEVEILEDKKKYKSKPW

Query:  LFSLSLCIKLRPDAVSLNSSPSLEHSLEAEKRATRNHRIHNPTLYGPNDYSPIRPVTVSGTNSLFSSDQVAPVSFEPAGEEESRRSNEELVQDGNSQGIP
        LFSLSLCIKLRPDAVS +SSPSL+HSLEAE++ATRN R HN TLYGPNDYS + P  VSG NSLFSSD+V PVSF  AGEEESRRS+ ELVQ+GNSQGIP
Subjt:  LFSLSLCIKLRPDAVSLNSSPSLEHSLEAEKRATRNHRIHNPTLYGPNDYSPIRPVTVSGTNSLFSSDQVAPVSFEPAGEEESRRSNEELVQDGNSQGIP

Query:  LLFSCLYCQLIK
        LLFSCLYCQLIK
Subjt:  LLFSCLYCQLIK

XP_011651900.1 uncharacterized protein LOC101206844 [Cucumis sativus]

7.6e-92

86.79

Show/hide

Query:  EDGWPLGLRLMNARV-GLAGNHDLSASVSFNTLLTHSPSSFTDSSSDLDTESTGSFYHDKSITLGSLIGVSSIFELSRRSTKGNEVEILEDKKKYKSKPW
        EDGWPLGLR+MNARV G+AGNHDLSASVSFNTL THSPSSFTDSSSDLDTESTGSFY DKSITLGSLIGVSSI ELSRRSTKGN+VEILEDKKKYKSKP 
Subjt:  EDGWPLGLRLMNARV-GLAGNHDLSASVSFNTLLTHSPSSFTDSSSDLDTESTGSFYHDKSITLGSLIGVSSIFELSRRSTKGNEVEILEDKKKYKSKPW

Query:  LFSLSLCIKLRPDAVSLNSSPSLEHSLEAEKRATRNHRIHNPTLYGPNDYSPIRPVTVSGTNSLFSSDQVAPVSFEPAGEEESRRSNEELVQDGNSQGIP
        LFSLSLCIKLRPDAVS +SSPSL+HSLEAE++ATRN R HNPTLYGPNDYSP     V G NSLFSSDQV PVSFE AGEEESRRS+ ELV++GNSQGIP
Subjt:  LFSLSLCIKLRPDAVSLNSSPSLEHSLEAEKRATRNHRIHNPTLYGPNDYSPIRPVTVSGTNSLFSSDQVAPVSFEPAGEEESRRSNEELVQDGNSQGIP

Query:  LLFSCLYCQLIK
        LLFSCLYCQLIK
Subjt:  LLFSCLYCQLIK

XP_022145575.1 uncharacterized protein LOC111014995 isoform X2 [Momordica charantia]

7.6e-92

86.26

Show/hide

Query:  EDGWPLGLRLMNARVGLAGNHDLSASVSFNTLLTHSPSSFTDSSSDLDTESTGSFYHDKSITLGSLIGVSSIFELSRRSTKGNEVEILEDKKKYKSKPWL
        EDGWPLGLRLMNARVGLAGN DLSASVSFNTL THSPSSFTDSSSDLDTESTGSFYHDKSITLGSLIGVSSI ELSRRSTKGN+VE LEDKKK KSKPWL
Subjt:  EDGWPLGLRLMNARVGLAGNHDLSASVSFNTLLTHSPSSFTDSSSDLDTESTGSFYHDKSITLGSLIGVSSIFELSRRSTKGNEVEILEDKKKYKSKPWL

Query:  FSLSLCIKLRPDAVSLNSSPSLEHSLEAEKRATRNHRIHNPTLYGPNDYSPIRPVTVSGTNSLFSSDQVAPVSFEPAGEEESRRSNEELVQDGNSQGIPL
        FSLSLCIKLRPDAVSL SSPSLEHSL AE+ ATRNHRI NPT+YGPND+SPIRP  VSGTNSLF+ DQVAP+SF P  EE +R+SN EL   GNSQG+PL
Subjt:  FSLSLCIKLRPDAVSLNSSPSLEHSLEAEKRATRNHRIHNPTLYGPNDYSPIRPVTVSGTNSLFSSDQVAPVSFEPAGEEESRRSNEELVQDGNSQGIPL

Query:  LFSCLYCQLIK
        LFSCLYCQLIK
Subjt:  LFSCLYCQLIK

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LA63 Uncharacterized protein

3.7e-92

86.79

Show/hide

Query:  EDGWPLGLRLMNARV-GLAGNHDLSASVSFNTLLTHSPSSFTDSSSDLDTESTGSFYHDKSITLGSLIGVSSIFELSRRSTKGNEVEILEDKKKYKSKPW
        EDGWPLGLR+MNARV G+AGNHDLSASVSFNTL THSPSSFTDSSSDLDTESTGSFY DKSITLGSLIGVSSI ELSRRSTKGN+VEILEDKKKYKSKP 
Subjt:  EDGWPLGLRLMNARV-GLAGNHDLSASVSFNTLLTHSPSSFTDSSSDLDTESTGSFYHDKSITLGSLIGVSSIFELSRRSTKGNEVEILEDKKKYKSKPW

Query:  LFSLSLCIKLRPDAVSLNSSPSLEHSLEAEKRATRNHRIHNPTLYGPNDYSPIRPVTVSGTNSLFSSDQVAPVSFEPAGEEESRRSNEELVQDGNSQGIP
        LFSLSLCIKLRPDAVS +SSPSL+HSLEAE++ATRN R HNPTLYGPNDYSP     V G NSLFSSDQV PVSFE AGEEESRRS+ ELV++GNSQGIP
Subjt:  LFSLSLCIKLRPDAVSLNSSPSLEHSLEAEKRATRNHRIHNPTLYGPNDYSPIRPVTVSGTNSLFSSDQVAPVSFEPAGEEESRRSNEELVQDGNSQGIP

Query:  LLFSCLYCQLIK
        LLFSCLYCQLIK
Subjt:  LLFSCLYCQLIK

A0A1S3B5Y9 uncharacterized protein LOC103486392

1.3e-92

86.79

Show/hide

Query:  EDGWPLGLRLMNARV-GLAGNHDLSASVSFNTLLTHSPSSFTDSSSDLDTESTGSFYHDKSITLGSLIGVSSIFELSRRSTKGNEVEILEDKKKYKSKPW
        EDGWPLGLR+MNARV GLAGNHDLSASVSFNTL THSPSSFTDSSSDLDT+STGSFY DKSITLGSLIGVSSI ELSRRSTKGN+VEILEDKKKYKSKPW
Subjt:  EDGWPLGLRLMNARV-GLAGNHDLSASVSFNTLLTHSPSSFTDSSSDLDTESTGSFYHDKSITLGSLIGVSSIFELSRRSTKGNEVEILEDKKKYKSKPW

Query:  LFSLSLCIKLRPDAVSLNSSPSLEHSLEAEKRATRNHRIHNPTLYGPNDYSPIRPVTVSGTNSLFSSDQVAPVSFEPAGEEESRRSNEELVQDGNSQGIP
        LFSLSLCIKLRPDAVS +SSPSL+HSLEAE++ATRN R HN TLYGPNDYS + P  VSG NSLFSSD+V PVSF  AGEEESRRS+ ELVQ+GNSQGIP
Subjt:  LFSLSLCIKLRPDAVSLNSSPSLEHSLEAEKRATRNHRIHNPTLYGPNDYSPIRPVTVSGTNSLFSSDQVAPVSFEPAGEEESRRSNEELVQDGNSQGIP

Query:  LLFSCLYCQLIK
        LLFSCLYCQLIK
Subjt:  LLFSCLYCQLIK

A0A5A7TPR1 Uncharacterized protein

1.3e-92

86.79

Show/hide

Query:  EDGWPLGLRLMNARV-GLAGNHDLSASVSFNTLLTHSPSSFTDSSSDLDTESTGSFYHDKSITLGSLIGVSSIFELSRRSTKGNEVEILEDKKKYKSKPW
        EDGWPLGLR+MNARV GLAGNHDLSASVSFNTL THSPSSFTDSSSDLDT+STGSFY DKSITLGSLIGVSSI ELSRRSTKGN+VEILEDKKKYKSKPW
Subjt:  EDGWPLGLRLMNARV-GLAGNHDLSASVSFNTLLTHSPSSFTDSSSDLDTESTGSFYHDKSITLGSLIGVSSIFELSRRSTKGNEVEILEDKKKYKSKPW

Query:  LFSLSLCIKLRPDAVSLNSSPSLEHSLEAEKRATRNHRIHNPTLYGPNDYSPIRPVTVSGTNSLFSSDQVAPVSFEPAGEEESRRSNEELVQDGNSQGIP
        LFSLSLCIKLRPDAVS +SSPSL+HSLEAE++ATRN R HN TLYGPNDYS + P  VSG NSLFSSD+V PVSF  AGEEESRRS+ ELVQ+GNSQGIP
Subjt:  LFSLSLCIKLRPDAVSLNSSPSLEHSLEAEKRATRNHRIHNPTLYGPNDYSPIRPVTVSGTNSLFSSDQVAPVSFEPAGEEESRRSNEELVQDGNSQGIP

Query:  LLFSCLYCQLIK
        LLFSCLYCQLIK
Subjt:  LLFSCLYCQLIK

A0A6J1CUV3 uncharacterized protein LOC111014995 isoform X2

3.7e-92

86.26

Show/hide

Query:  EDGWPLGLRLMNARVGLAGNHDLSASVSFNTLLTHSPSSFTDSSSDLDTESTGSFYHDKSITLGSLIGVSSIFELSRRSTKGNEVEILEDKKKYKSKPWL
        EDGWPLGLRLMNARVGLAGN DLSASVSFNTL THSPSSFTDSSSDLDTESTGSFYHDKSITLGSLIGVSSI ELSRRSTKGN+VE LEDKKK KSKPWL
Subjt:  EDGWPLGLRLMNARVGLAGNHDLSASVSFNTLLTHSPSSFTDSSSDLDTESTGSFYHDKSITLGSLIGVSSIFELSRRSTKGNEVEILEDKKKYKSKPWL

Query:  FSLSLCIKLRPDAVSLNSSPSLEHSLEAEKRATRNHRIHNPTLYGPNDYSPIRPVTVSGTNSLFSSDQVAPVSFEPAGEEESRRSNEELVQDGNSQGIPL
        FSLSLCIKLRPDAVSL SSPSLEHSL AE+ ATRNHRI NPT+YGPND+SPIRP  VSGTNSLF+ DQVAP+SF P  EE +R+SN EL   GNSQG+PL
Subjt:  FSLSLCIKLRPDAVSLNSSPSLEHSLEAEKRATRNHRIHNPTLYGPNDYSPIRPVTVSGTNSLFSSDQVAPVSFEPAGEEESRRSNEELVQDGNSQGIPL

Query:  LFSCLYCQLIK
        LFSCLYCQLIK
Subjt:  LFSCLYCQLIK

A0A6J1CVN1 uncharacterized protein LOC111014995 isoform X1

2.6e-90

84.26

Show/hide

Query:  EDGWPLGLRLMNARVGLAGNHDLSASVSFNTLLTHSPSSFTDSSSDLDTE-----STGSFYHDKSITLGSLIGVSSIFELSRRSTKGNEVEILEDKKKYK
        EDGWPLGLRLMNARVGLAGN DLSASVSFNTL THSPSSFTDSSSDLDTE     STGSFYHDKSITLGSLIGVSSI ELSRRSTKGN+VE LEDKKK K
Subjt:  EDGWPLGLRLMNARVGLAGNHDLSASVSFNTLLTHSPSSFTDSSSDLDTE-----STGSFYHDKSITLGSLIGVSSIFELSRRSTKGNEVEILEDKKKYK

Query:  SKPWLFSLSLCIKLRPDAVSLNSSPSLEHSLEAEKRATRNHRIHNPTLYGPNDYSPIRPVTVSGTNSLFSSDQVAPVSFEPAGEEESRRSNEELVQDGNS
        SKPWLFSLSLCIKLRPDAVSL SSPSLEHSL AE+ ATRNHRI NPT+YGPND+SPIRP  VSGTNSLF+ DQVAP+SF P  EE +R+SN EL   GNS
Subjt:  SKPWLFSLSLCIKLRPDAVSLNSSPSLEHSLEAEKRATRNHRIHNPTLYGPNDYSPIRPVTVSGTNSLFSSDQVAPVSFEPAGEEESRRSNEELVQDGNS

Query:  QGIPLLFSCLYCQLIK
        QG+PLLFSCLYCQLIK
Subjt:  QGIPLLFSCLYCQLIK

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q6DR24 Uncharacterized protein At3g17950

9.5e-05

71.43

Show/hide

Query:  SPSSFTDSSSDLDTESTGSFYHDKSITLGSLIGVS
        SP+  + SSSDLDTESTGSF+HD+SITLG+L+G S
Subjt:  SPSSFTDSSSDLDTESTGSFYHDKSITLGSLIGVS

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G17950.1 unknown protein

6.8e-06

71.43

Show/hide

Query:  SPSSFTDSSSDLDTESTGSFYHDKSITLGSLIGVS
        SP+  + SSSDLDTESTGSF+HD+SITLG+L+G S
Subjt:  SPSSFTDSSSDLDTESTGSFYHDKSITLGSLIGVS

AT5G02440.1 unknown protein

3.7e-20

40.94

Show/hide

Query:  EDGWPLGLRLMNARVG--LAGNHD-------LSASVSFNTLLTHSPSSFTDSSSDLDTESTGSFYHDKSITLGSLIGVSSIFELSRRS--TKGNEVEILE
        E+GWPLGLR +NAR+G    G H         + S+SF++LL+ SPSS   SSSDLD++S GSF+ D+S TLG+LIG+SS  ELSRRS  T+ ++     
Subjt:  EDGWPLGLRLMNARVG--LAGNHD-------LSASVSFNTLLTHSPSSFTDSSSDLDTESTGSFYHDKSITLGSLIGVSSIFELSRRS--TKGNEVEILE

Query:  DKKKYKS-----KPWLFSLSLCIKLRPDAVSL-------------NSSPSLEHSLEAEKRATRNHRIHNPT
        + + +K+     KPW+F  S+C KL  +A  +             N+  SL H L  E+RA  +     PT
Subjt:  DKKKYKS-----KPWLFSLSLCIKLRPDAVSL-------------NSSPSLEHSLEAEKRATRNHRIHNPT

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGTCTGCTCCACACAAAACTGCATTTCTTCACACTTCAAACTTCACTCACCCTGTTCTTGCAGCGCCAAATGCCAGCCATGTCATGCAATTTTGCAAGACCTCAATCGA
AGATGGATGGCCATTAGGCTTGCGGCTTATGAACGCTAGAGTTGGATTGGCGGGAAATCATGATCTCTCTGCGTCGGTTTCTTTCAATACTTTGCTTACTCATTCTCCTA
GTTCCTTCACCGACTCTTCCTCAGATCTTGATACAGAGTCAACTGGATCATTCTACCATGATAAGAGCATCACTCTTGGGAGTCTCATTGGAGTCTCTAGCATTTTTGAG
CTATCGCGAAGATCGACGAAAGGAAATGAAGTGGAAATACTCGAAGATAAAAAGAAGTACAAGTCCAAACCATGGTTGTTTTCTTTATCTTTATGCATTAAACTCCGCCC
TGATGCTGTGAGCTTGAACAGCTCTCCTTCACTTGAGCACTCTCTTGAAGCAGAAAAGAGAGCTACAAGAAATCACAGGATTCACAACCCTACCCTTTATGGACCCAATG
ATTACTCACCTATTCGTCCTGTAACTGTTTCTGGAACAAACTCTTTGTTTTCCAGTGATCAAGTTGCTCCTGTCTCATTTGAACCGGCGGGGGAAGAAGAAAGCAGAAGA
TCAAATGAAGAACTTGTTCAAGATGGTAACAGCCAAGGGATTCCTCTACTCTTTTCATGTCTATATTGTCAACTGATTAAATAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MSAPHKTAFLHTSNFTHPVLAAPNASHVMQFCKTSIEDGWPLGLRLMNARVGLAGNHDLSASVSFNTLLTHSPSSFTDSSSDLDTESTGSFYHDKSITLGSLIGVSSIFE
LSRRSTKGNEVEILEDKKKYKSKPWLFSLSLCIKLRPDAVSLNSSPSLEHSLEAEKRATRNHRIHNPTLYGPNDYSPIRPVTVSGTNSLFSSDQVAPVSFEPAGEEESRR
SNEELVQDGNSQGIPLLFSCLYCQLIK

HG10020309 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome