| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA8542646.1 hypothetical protein F0562_023855 [Nyssa sinensis] | 6.1e-32 | 92.31 | Show/hide |
Query: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+ + +GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| KAB1227682.1 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 [Morella rubra] | 6.1e-32 | 92.31 | Show/hide |
Query: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+ + +GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| KAF8398634.1 hypothetical protein HHK36_014489 [Tetracentron sinense] | 6.1e-32 | 92.31 | Show/hide |
Query: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+ + +GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| XP_022155134.1 sm-like protein LSM8 [Momordica charantia] | 6.1e-32 | 92.31 | Show/hide |
Query: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+ + +GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| XP_028094514.1 uncharacterized protein LOC114294600 [Camellia sinensis] | 1.6e-32 | 78.12 | Show/hide |
Query: VRDLKNSLAVTGVELGKIEASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
V L SL++ + + + + +GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELD+NLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: VRDLKNSLAVTGVELGKIEASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LT86 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 3.0e-32 | 92.31 | Show/hide |
Query: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+ + +GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| A0A1S3ATI1 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 3.0e-32 | 92.31 | Show/hide |
Query: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+ + +GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| A0A6A1WQX6 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 3.0e-32 | 92.31 | Show/hide |
Query: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+ + +GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| A0A6J1GT46 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 3.0e-32 | 92.31 | Show/hide |
Query: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+ + +GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| A0A6J1K221 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 3.0e-32 | 92.31 | Show/hide |
Query: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+ + +GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O95777 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 3.2e-23 | 64.38 | Show/hide |
Query: LGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+G LKGFDQ N+ILDESHERV+S+ +GV+Q+VLGLYI+RGDN++++GE+DEE DS LDL +RA PL V H
Subjt: LGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Q3ZCE0 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 3.2e-23 | 64.38 | Show/hide |
Query: LGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+G LKGFDQ N+ILDESHERV+S+ +GV+Q+VLGLYI+RGDN++++GE+DEE DS LDL +RA PL V H
Subjt: LGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Q5RCP3 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 3.2e-23 | 64.38 | Show/hide |
Query: LGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+G LKGFDQ N+ILDESHERV+S+ +GV+Q+VLGLYI+RGDN++++GE+DEE DS LDL +RA PL V H
Subjt: LGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Q6ZWM4 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 3.2e-23 | 64.38 | Show/hide |
Query: LGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+G LKGFDQ N+ILDESHERV+S+ +GV+Q+VLGLYI+RGDN++++GE+DEE DS LDL +RA PL V H
Subjt: LGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Q8VYI0 Sm-like protein LSM8 | 2.4e-31 | 80.77 | Show/hide |
Query: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+ + +GVLKGFDQATNIILDESHERV+STKEGVQQ VLGLYIIRGDNI ++GELDEELD++LD SKLRAHPLKPV+H
Subjt: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G19120.1 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 1.1e-07 | 43.1 | Show/hide |
Query: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEE
+ +G+L+ FDQ N +L+E++ERV + + LGLYIIRG+N+ ++GELD E
Subjt: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEE
|
|
| AT1G65700.1 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 1.7e-32 | 80.77 | Show/hide |
Query: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+ + +GVLKGFDQATNIILDESHERV+STKEGVQQ VLGLYIIRGDNI ++GELDEELD++LD SKLRAHPLKPV+H
Subjt: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| AT1G65700.2 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 1.7e-32 | 80.77 | Show/hide |
Query: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
+ + +GVLKGFDQATNIILDESHERV+STKEGVQQ VLGLYIIRGDNI ++GELDEELD++LD SKLRAHPLKPV+H
Subjt: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| AT1G65700.3 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 3.2e-26 | 52.07 | Show/hide |
Query: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTK-------------------------------------------EGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDE
+ + +GVLKGFDQATNIILDESHERV+STK EGVQQ VLGLYIIRGDNI ++GELDE
Subjt: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTK-------------------------------------------EGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDE
Query: ELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
ELD++LD SKLRAHPLKPV+H
Subjt: ELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| AT3G14080.1 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 9.5e-07 | 41.38 | Show/hide |
Query: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEE
+ +G L+ FDQ N +L+ + ERV E + LGLY+IRG+N+ ++GELD E
Subjt: EASSFLGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEE
|
|
