; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10021063 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10021063
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionProtein of unknown function, DUF584
Genome locationChr05:5027278..5027820
RNA-Seq ExpressionHG10021063
SyntenyHG10021063
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR007608 - Senescence regulator S40


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6584092.1 hypothetical protein SDJN03_20024, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.2e-7180Show/hide
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XP_004153812.1 uncharacterized protein LOC101208118 [Cucumis sativus]2.9e-7788.46Show/hide
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XP_008441031.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103485264 [Cucumis melo]5.4e-7991.11Show/hide
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XP_022924226.1 uncharacterized protein LOC111431737 [Cucurbita moschata]3.2e-7180Show/hide
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XP_038894875.1 uncharacterized protein LOC120083273 [Benincasa hispida]1.4e-7990.11Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LX30 Uncharacterized protein1.4e-7788.46Show/hide
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A0A1S3B355 uncharacterized protein LOC1034852642.6e-7991.11Show/hide
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A0A5D3BLZ0 Zinc-regulated protein 82.6e-7991.11Show/hide
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A0A6J1E8Z7 uncharacterized protein LOC1114317371.5e-7180Show/hide
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E5GC55 Uncharacterized protein2.6e-7991.11Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G15040.1 Protein of unknown function, DUF5845.8e-1542.54Show/hide
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        SS   +S+ SSSS   +PTAPK   + +              SAPV +P  S     M     EF      D D+EE   EE +M+PPHE +A+ LA+S 
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        + S SV EG GRTLKGRDL +VRNA+  +TGF++
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AT4G04630.1 Protein of unknown function, DUF5841.4e-2948.52Show/hide
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        E+ +EEDVW+ +   E SS  +    + +      SSSSSSSSS W +             R  +      +SSAP+++PDWSK+YG+  S+  S     
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           DD      D E+DD  MVPPHEW+A+KLAR++ISSFS+CEGVGRTLKGRDLSKVRNA+L+KTGFLE
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AT4G21970.1 Protein of unknown function, DUF5849.6e-2643.37Show/hide
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        E+ +EE+VW+ +   E     +  + ++  +S+SSSSS+             + IPK      +E      +SSAP++IPDWSK+YG +  ++S      
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          DD D       E  MVPPHE +A++LAR++ISSFS+CEG+GRTLKGRDLSK RNA+LT+TGFLE
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AT4G26950.1 Protein of unknown function, DUF5846.4e-1437.58Show/hide
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        D +E+DVW+ ++G +             +  SS+ ++  S S+   LP+ P+MIP+   T   E      + S PV++PDWS +                
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          + ++ +D   D+ V P E+    L RSR  SS SV EGVGR LKGRDLSKVRNAIL +TGFLE
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AT5G60680.1 Protein of unknown function, DUF5843.8e-1438.46Show/hide
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        S  F+  +   Y+ +S S      S     + +      + IS+     + ++NR          SS PV++PDWSKI       +   S E  DD D +
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          DG   D +PPHE+    LA++R++SFSV EGVGRTLKGRDLS+VRNAI  K GF
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGAATTGGGGCAGTGCTCTGAGAAAAAACTATGGATTCAGTGAAGATTTAGAAGAAGAAGATGTCTGGAATTCTGTTGAAGGTAAAGAAGATTCTTCAAATTTCAT
CACTAGAAACTCCAATGACTATTACTACTCGTCTTCTTCGTCGTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCAACTTGGCGTCTTCCAACTGCACCAAAAATGATCCCAAAATCCA
TTTCAACAAGAACACACGAAACCCAGATGACGAATAATCGATCCTCTGCTCCGGTGGATATTCCCGATTGGTCCAAAATTTACGGCAACATGGGTTCGTCGTCCGGCGAG
TTTTCCGGCGAAAAAACTGACGACAGAGATCAAGAAGAAATCGACGGTGAAGAAGACGATATGGTGCCTCCTCATGAATGGATTGCTCAGAAATTAGCGAGAAGCAGAAT
TTCATCTTTCTCTGTTTGTGAAGGGGTTGGAAGAACTCTCAAAGGAAGGGATTTAAGCAAAGTTCGAAACGCCATTTTAACCAAGACTGGTTTTTTAGAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGAATTGGGGCAGTGCTCTGAGAAAAAACTATGGATTCAGTGAAGATTTAGAAGAAGAAGATGTCTGGAATTCTGTTGAAGGTAAAGAAGATTCTTCAAATTTCAT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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FSGEKTDDRDQEEIDGEEDDMVPPHEWIAQKLARSRISSFSVCEGVGRTLKGRDLSKVRNAILTKTGFLE