; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10021336 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10021336
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description40S ribosomal protein S14
Genome locationChr05:7799945..7801990
RNA-Seq ExpressionHG10021336
SyntenyHG10021336
Gene Ontology termsGO:0000028 - ribosomal small subunit assembly (biological process)
GO:0000462 - maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0048027 - mRNA 5'-UTR binding (molecular function)
GO:0070181 - small ribosomal subunit rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001971 - Ribosomal protein S11
IPR018102 - Ribosomal S11, conserved site
IPR036967 - Ribosomal protein S11 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6573353.1 hypothetical protein SDJN03_27240, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.0e-7598.68Show/hide
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KAG6583920.1 hypothetical protein SDJN03_19852, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.0e-7598.68Show/hide
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KAG7012516.1 40S ribosomal protein S14-2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.0e-7598.68Show/hide
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XP_004147409.1 40S ribosomal protein S14-2 [Cucumis sativus]1.0e-7598.68Show/hide
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XP_038893713.1 40S ribosomal protein S14-2-like [Benincasa hispida]4.7e-7699.34Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B9H6 40S ribosomal protein S14-2-like5.1e-7698.68Show/hide
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A0A6J1CHJ7 40S ribosomal protein S141.6e-7498.68Show/hide
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A0A6J1GTR2 40S ribosomal protein S14-2-like5.1e-7698.68Show/hide
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A0A6J1J4Y9 40S ribosomal protein S14-22.8e-7498.66Show/hide
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A0A6J1KQN4 40S ribosomal protein S14-2-like5.1e-7698.68Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P19950 40S ribosomal protein S142.5e-7294.63Show/hide
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P19951 40S ribosomal protein S141.1e-7293.42Show/hide
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P42036 40S ribosomal protein S14-33.3e-7291.28Show/hide
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Q9CAX6 40S ribosomal protein S14-23.0e-7393.29Show/hide
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Q9SIH0 40S ribosomal protein S14-12.5e-7291.95Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G36160.1 Ribosomal protein S11 family protein1.8e-7391.95Show/hide
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AT3G11510.1 Ribosomal protein S11 family protein2.1e-7493.29Show/hide
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AT3G52580.1 Ribosomal protein S11 family protein2.3e-7391.28Show/hide
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ATCG00750.1 ribosomal protein S114.3e-1132.19Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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