; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10021351 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10021351
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionChlorophyll a-b binding protein, chloroplastic
Genome locationChr05:7974996..7976909
RNA-Seq ExpressionHG10021351
SyntenyHG10021351
Gene Ontology termsGO:0009416 - response to light stimulus (biological process)
GO:0009768 - photosynthesis, light harvesting in photosystem I (biological process)
GO:0018298 - protein-chromophore linkage (biological process)
GO:0009522 - photosystem I (cellular component)
GO:0009523 - photosystem II (cellular component)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016168 - chlorophyll binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001344 - Chlorophyll A-B binding protein, plant and chromista
IPR022796 - Chlorophyll A-B binding protein
IPR023329 - Chlorophyll a/b binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG2672494.1 hypothetical protein I3760_13G044400 [Carya illinoinensis]3.7e-11192.63Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSAS--KSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
        MAASTMALSSPSLAG+A+KL PSS ++LG GRV+MRK+A   + VSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSAS--KSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE

Query:  VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGSFDPLGLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLAD
        VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAG+QIFSEGGSFDPLGLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLAD
Subjt:  VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGSFDPLGLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLAD

Query:  PVNNNAWAYATNFVPGK
        PVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  PVNNNAWAYATNFVPGK

XP_008444193.1 PREDICTED: chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Cucumis melo]1.6e-10979.25Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPEL GN RV+MRKSA+KSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE--------------------------------------------------GGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE                                                  GGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE--------------------------------------------------GGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

XP_022142169.1 chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Momordica charantia]7.0e-11079.62Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRK  SKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE--------------------------------------------------GGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIF+E                                                  GGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE--------------------------------------------------GGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

XP_023001458.1 chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Cucurbita maxima]9.2e-11079.62Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAAS MALSSPSLAGKAVKLTPSS EL+GNGRVSMRKSA+KSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE--------------------------------------------------GGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE                                                  GGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE--------------------------------------------------GGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

XP_038877609.1 chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Benincasa hispida]7.0e-11080.08Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGN-GRVSMRKSASKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGN GRVSMRKSASKS+SSGSPWYGPDRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGN-GRVSMRKSASKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE--------------------------------------------------GGSFDPLGL
        IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE                                                  GGSFDPLGL
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE--------------------------------------------------GGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BAK6 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic7.6e-11079.25Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPEL GN RV+MRKSA+KSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE--------------------------------------------------GGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE                                                  GGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE--------------------------------------------------GGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

A0A5D3DAQ5 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic7.6e-11079.25Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPEL GN RV+MRKSA+KSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE--------------------------------------------------GGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE                                                  GGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE--------------------------------------------------GGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

A0A6J1CDN4 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic1.3e-10979.55Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRK  SKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE--------------------------------------------------GGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIF+E                                                  GGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE--------------------------------------------------GGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPG
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPG
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPG

A0A6J1CKT5 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic3.4e-11079.62Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRK  SKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE--------------------------------------------------GGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIF+E                                                  GGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE--------------------------------------------------GGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

A0A6J1KQK6 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic4.4e-11079.62Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAAS MALSSPSLAGKAVKLTPSS EL+GNGRVSMRKSA+KSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE--------------------------------------------------GGSFDPLGLA
        HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE                                                  GGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE--------------------------------------------------GGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P07369 Chlorophyll a-b binding protein 3C, chloroplastic1.9e-10574.16Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKS--VSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
        MA STMALSS + AGKAVKL+PSS E+ GNGRV+MRK+A+K+   SSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKS--VSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE

Query:  VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE--------------------------------------------------GGSFDPLG
        VIH RWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE                                                  GGSFDPLG
Subjt:  VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE--------------------------------------------------GGSFDPLG

Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LADDPEAFAELKVKE+KNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

P07370 Chlorophyll a-b binding protein 1B, chloroplastic1.9e-10573.21Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAA+TMALSSPS AG+AVKL+PS+ E+ GNGR++MRK+ +KS  S SPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE--------------------------------------------------GGSFDPLGLA
        H RWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE                                                  GGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE--------------------------------------------------GGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        +DPEAFAELKVKE+KNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

P09756 Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic6.4e-10676.14Show/hide
Query:  AASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIH
        AAS+MALSSPSLAGKAVKL PS+PE+   GRVSMRK+ +K VSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIH
Subjt:  AASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIH

Query:  SRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE--------------------------------------------------GGSFDPLGLAD
        SRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE                                                  GGSFDPLGLAD
Subjt:  SRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE--------------------------------------------------GGSFDPLGLAD

Query:  DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLA PVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

P27493 Chlorophyll a-b binding protein 21, chloroplastic1.5e-10774.72Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAA+TMALSSPS AG+AVKL+PS+PE+ GNGRVSMRK+ +K V+S SPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE--------------------------------------------------GGSFDPLGLA
        H RWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE                                                  GGSFDPLGLA
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE--------------------------------------------------GGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        +DPEAFAELKVKE+KNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

P27495 Chlorophyll a-b binding protein 40, chloroplastic1.2e-10775.66Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSAS--KSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
        MAASTMALSSPS AGKAVKL+PSS E+ GNG+V+MRK+AS  K+VSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSAS--KSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE

Query:  VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE--------------------------------------------------GGSFDPLG
        VIH RWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE                                                  GGSFDPLG
Subjt:  VIHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE--------------------------------------------------GGSFDPLG

Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LA+DPEAFAELKVKE+KNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G29910.1 chlorophyll A/B binding protein 32.3e-10371.91Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAASTMALSSP+ AGKAV L+P++ E+LG+GRV+MRK+ +K    SGSPWYG DRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE---------------------------------------------------GGSFDPLG
        IHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+                                                   GGSFDPLG
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE---------------------------------------------------GGSFDPLG

Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGP+ENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

AT1G29920.1 chlorophyll A/B-binding protein 22.3e-10371.91Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAASTMALSSP+ AGKAV L+P++ E+LG+GRV+MRK+ +K    SGSPWYG DRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE---------------------------------------------------GGSFDPLG
        IHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+                                                   GGSFDPLG
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE---------------------------------------------------GGSFDPLG

Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGP+ENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

AT1G29930.1 chlorophyll A/B binding protein 16.1e-10472.28Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAASTMALSSP+ AGKAVKL+P++ E+LG+GRV+MRK+ +K    SGSPWYG DRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE---------------------------------------------------GGSFDPLG
        IHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+                                                   GGSFDPLG
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE---------------------------------------------------GGSFDPLG

Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGP+ENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

AT2G34420.1 photosystem II light harvesting complex gene B1B26.3e-10171.16Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MA+STMALSSP+ AGKAVK  P++ ++LG+GRV+MRK+ +K    SGSPWYG DRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE---------------------------------------------------GGSFDPLG
        IHSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+                                                   GGSFDPLG
Subjt:  IHSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE---------------------------------------------------GGSFDPLG

Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        LA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK

AT2G34430.1 light-harvesting chlorophyll-protein complex II subunit B11.4e-10371.43Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        MAASTMALSSP+L GKAVKL+P++ E+ G GR++MRK++  +  SGSPWYG DRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEVI
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE---------------------------------------------------GGSFDPLGL
        HSRWAMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIFS+                                                   GGSFDPLGL
Subjt:  HSRWAMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSE---------------------------------------------------GGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK
        A DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATNFVPGK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCCTCAACAATGGCTTTGTCCTCGCCCTCACTCGCTGGAAAGGCGGTGAAACTCACGCCCTCCTCCCCTGAGCTTCTCGGCAACGGTAGAGTCAGCATG
AGGAAATCCGCCTCCAAGTCGGTTTCTTCTGGAAGCCCATGGTACGGACCCGACCGTGTTAAGTATTTGGGACCATTCTCCGGCGAGTCTCCGTCATATCTTACC
GGAGAATTCCCCGGTGACTACGGCTGGGATACTGCCGGACTTTCCGCAGACCCTGAGACCTTCGCCAAGAACCGTGAGCTTGAAGTCATCCACTCTAGGTGGGCT
ATGTTGGGAGCATTGGGCTGCGTTTTTCCAGAGCTTCTTTCCCGCAATGGCGTGAAGTTCGGAGAAGCGGTGTGGTTCAAGGCCGGTTCACAGATCTTCAGTGAA
GGTGGGAGCTTTGACCCGTTGGGCCTTGCAGACGACCCAGAAGCCTTTGCAGAGCTGAAAGTGAAGGAGCTGAAGAATGGGAGATTGGCCATGTTCTCAATGTTT
GGATTCTTCGTTCAAGCCATCGTGACAGGAAAGGGCCCACTTGAGAATCTTGCTGACCATCTTGCTGACCCAGTCAACAACAATGCTTGGGCTTATGCTACCAAC
TTTGTTCCTGGAAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGGCCTCAACAATGGCTTTGTCCTCGCCCTCACTCGCTGGAAAGGCGGTGAAACTCACGCCCTCCTCCCCTGAGCTTCTCGGCAACGGTAGAGTCAGCATG
AGGAAATCCGCCTCCAAGTCGGTTTCTTCTGGAAGCCCATGGTACGGACCCGACCGTGTTAAGTATTTGGGACCATTCTCCGGCGAGTCTCCGTCATATCTTACC
GGAGAATTCCCCGGTGACTACGGCTGGGATACTGCCGGACTTTCCGCAGACCCTGAGACCTTCGCCAAGAACCGTGAGCTTGAAGTCATCCACTCTAGGTGGGCT
ATGTTGGGAGCATTGGGCTGCGTTTTTCCAGAGCTTCTTTCCCGCAATGGCGTGAAGTTCGGAGAAGCGGTGTGGTTCAAGGCCGGTTCACAGATCTTCAGTGAA
GGTGGGAGCTTTGACCCGTTGGGCCTTGCAGACGACCCAGAAGCCTTTGCAGAGCTGAAAGTGAAGGAGCTGAAGAATGGGAGATTGGCCATGTTCTCAATGTTT
GGATTCTTCGTTCAAGCCATCGTGACAGGAAAGGGCCCACTTGAGAATCTTGCTGACCATCTTGCTGACCCAGTCAACAACAATGCTTGGGCTTATGCTACCAAC
TTTGTTCCTGGAAAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKSASKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHSRWA
MLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFSEGGSFDPLGLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATN
FVPGK