; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10021352 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10021352
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionChlorophyll a-b binding protein, chloroplastic
Genome locationChr05:7988155..7989712
RNA-Seq ExpressionHG10021352
SyntenyHG10021352
Gene Ontology termsGO:0009416 - response to light stimulus (biological process)
GO:0009768 - photosynthesis, light harvesting in photosystem I (biological process)
GO:0018298 - protein-chromophore linkage (biological process)
GO:0009522 - photosystem I (cellular component)
GO:0009523 - photosystem II (cellular component)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016168 - chlorophyll binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001344 - Chlorophyll A-B binding protein, plant and chromista
IPR022796 - Chlorophyll A-B binding protein
IPR023329 - Chlorophyll a/b binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008444193.1 PREDICTED: chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Cucumis melo]2.0e-11582.71Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPEL  N  RV+MRKS++KSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL
        IHS                                    SEGGLDY GNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLG+VTDPIYPGGSFDPLGL
Subjt:  IHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWAYATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

XP_022139935.1 chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic-like [Momordica charantia]3.5e-11583.4Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELL N GRVSMRK  SKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL
        IHS                                    +EGGLDY GNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLG+VTDPIYPGGSFDPLGL
Subjt:  IHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPG
        ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWAYATNFVPG
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPG

XP_022142169.1 chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Momordica charantia]7.0e-11683.46Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELL N GRVSMRK  SKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL
        IHS                                    +EGGLDY GNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLG+VTDPIYPGGSFDPLGL
Subjt:  IHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWAYATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

XP_038877609.1 chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Benincasa hispida]4.0e-11984.21Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELL NGGRVSMRKS+SKS+SSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL
        IHS                                    SEGGLDY GNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLG+VTDPIYPGGSFDPLGL
Subjt:  IHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWAYATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

XP_038882052.1 chlorophyll a-b binding protein of LHCII type 1-like [Benincasa hispida]7.8e-11581.95Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAASTMALSSPSLAGKAVKL+P++PE+  N GRVSMRK++SKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL
        IHS                                    SEGGLDY GNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLG+VTDPIYPGGSFDPLGL
Subjt:  IHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWAYATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BAK6 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic9.9e-11682.71Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPEL  N  RV+MRKS++KSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL
        IHS                                    SEGGLDY GNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLG+VTDPIYPGGSFDPLGL
Subjt:  IHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWAYATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

A0A5D3DAQ5 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic9.9e-11682.71Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPEL  N  RV+MRKS++KSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL
        IHS                                    SEGGLDY GNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLG+VTDPIYPGGSFDPLGL
Subjt:  IHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWAYATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

A0A6J1CDN4 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic1.7e-11583.4Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELL N GRVSMRK  SKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL
        IHS                                    +EGGLDY GNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLG+VTDPIYPGGSFDPLGL
Subjt:  IHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPG
        ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWAYATNFVPG
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPG

A0A6J1CKT5 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic3.4e-11683.46Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELL N GRVSMRK  SKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL
        IHS                                    +EGGLDY GNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLG+VTDPIYPGGSFDPLGL
Subjt:  IHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWAYATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

A0A6M3WGX2 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic8.4e-11580.83Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAASTMALSSPSLAGKAVKL+PS+PEL+ N GRVSMRK++SKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL
        IH                                     SEGGLDY GNPSLIHAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AGGPLG+VTDPIYPGGSFDPLGL
Subjt:  IHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        ADDPEAFAELKVKE+KNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWAYATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P07370 Chlorophyll a-b binding protein 1B, chloroplastic8.6e-10975.19Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAA+TMALSSPS AG+AVKL+PS+ E+  N GR++MRK+ +KS  S SPWYGPDRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL
        IH                                     SEGGLDY GNPSL+HAQSILAIWA QVVLMGAVEGYRIAGGPLG+V DP+YPGGSFDPLGL
Subjt:  IHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        A+DPEAFAELKVKE+KNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

P08221 Chlorophyll a-b binding protein of LHCII type I, chloroplastic (Fragment)6.0e-11078.12Show/hide
Query:  PSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHS-------
        P+LAG+AVKL+P++PE+  N  + +MRK++SKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHS       
Subjt:  PSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHS-------

Query:  -----------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGLADDPEAFAEL
                                     SEGGLDY GNPSL+HAQSILAIWA QVVLMGAVEGYRIAGGPLG+VTDPIYPGGSFDPLGLADDPEAFAEL
Subjt:  -----------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGLADDPEAFAEL

Query:  KVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        KVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWAYATNFVPGK
Subjt:  KVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

P09756 Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic2.0e-11379.62Show/hide
Query:  AASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
        AAS+MALSSPSLAGKAVKL PS+PE+    GRVSMRK+ +K VSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI
Subjt:  AASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVI

Query:  HS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGLA
        HS                                    SEGGLDY GNPSLIHAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYRIAGGPLG+VTDPIYPGGSFDPLGLA
Subjt:  HS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGLA

Query:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLA PV+NNAWAYATNFVPGK
Subjt:  DDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

P27493 Chlorophyll a-b binding protein 21, chloroplastic1.2e-11075.94Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAA+TMALSSPS AG+AVKL+PS+PE+  N GRVSMRK+ +K V+S SPWYGPDRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL
        IH                                     SEGGLDY GNPSL+HAQSILAIWA QV+LMGAVEGYR+AGGPLG+V DP+YPGGSFDPLGL
Subjt:  IHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGL

Query:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        A+DPEAFAELKVKE+KNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWAYATNFVPGK
Subjt:  ADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

P27495 Chlorophyll a-b binding protein 40, chloroplastic9.2e-11176.87Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSS--KSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNREL
        MAASTMALSSPS AGKAVKL+PSS E+  N G+V+MRK++S  K+VSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNREL
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSS--KSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNREL

Query:  EVIHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPL
        EVIH                                     SEGGLDY GNPSL+HAQSILAIWA QVVLMGAVEGYR+AGGPLG+V DP+YPGGSFDPL
Subjt:  EVIHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPL

Query:  GLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        GLA+DPEAFAELKVKE+KNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWAYATNFVPGK
Subjt:  GLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G29910.1 chlorophyll A/B binding protein 31.5e-10372.39Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
        MAASTMALSSP+ AGKAV L+P++ E+L   GRV+MRK+ +K    SGSPWYG DRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELE
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE

Query:  VIHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGKVTDPIYPGGSFDPL
        VIHS                                    S+GGLDY GNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLG+  D +YPGGSFDPL
Subjt:  VIHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGKVTDPIYPGGSFDPL

Query:  GLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        GLA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGP+ENLADHLADPV+NNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  GLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

AT1G29920.1 chlorophyll A/B-binding protein 21.5e-10372.39Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
        MAASTMALSSP+ AGKAV L+P++ E+L   GRV+MRK+ +K    SGSPWYG DRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELE
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE

Query:  VIHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGKVTDPIYPGGSFDPL
        VIHS                                    S+GGLDY GNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLG+  D +YPGGSFDPL
Subjt:  VIHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGKVTDPIYPGGSFDPL

Query:  GLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        GLA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGP+ENLADHLADPV+NNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  GLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

AT1G29930.1 chlorophyll A/B binding protein 13.8e-10472.76Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
        MAASTMALSSP+ AGKAVKL+P++ E+L   GRV+MRK+ +K    SGSPWYG DRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELE
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE

Query:  VIHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGKVTDPIYPGGSFDPL
        VIHS                                    S+GGLDY GNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLG+  D +YPGGSFDPL
Subjt:  VIHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGKVTDPIYPGGSFDPL

Query:  GLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        GLA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGP+ENLADHLADPV+NNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  GLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

AT2G34420.1 photosystem II light harvesting complex gene B1B21.6e-10272.39Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE
        MA+STMALSSP+ AGKAVK  P++ ++L   GRV+MRK+ +K    SGSPWYG DRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELE
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVS-SGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELE

Query:  VIHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGKVTDPIYPGGSFDPL
        VIHS                                    S+GGLDY GNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLG+  D +YPGGSFDPL
Subjt:  VIHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGKVTDPIYPGGSFDPL

Query:  GLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        GLA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  GLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK

AT2G34430.1 light-harvesting chlorophyll-protein complex II subunit B15.4e-10673.03Show/hide
Query:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV
        MAASTMALSSP+L GKAVKL+P++ E+    GR++MRK+S  +  SGSPWYG DRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEV
Subjt:  MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEV

Query:  IHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGKVTDPIYPGGSFDPLG
        IHS                                    S+GGLDY GNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLG+  D +YPGGSFDPLG
Subjt:  IHS------------------------------------SEGGLDYFGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGKVTDPIYPGGSFDPLG

Query:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK
        LA DPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPV+NNAWA+ATNFVPGK
Subjt:  LADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAWAYATNFVPGK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCCTCAACAATGGCTCTCTCTTCTCCGTCGCTTGCTGGAAAGGCAGTGAAACTCACTCCCTCTTCGCCGGAGCTTCTCGACAATGGCGGCAGAGTCAGCATGAG
GAAATCCTCCTCCAAATCTGTTTCTTCTGGTAGCCCTTGGTATGGACCTGACCGTGTCAAGTACTTGGGACCATTCTCCGGCGAGCCTCCGTCTTATCTCACTGGTGAGT
TTCCCGGTGACTATGGCTGGGATACTGCTGGACTTTCTGCAGATCCCGAGACCTTCGCTAAGAACCGTGAGCTTGAAGTCATTCACTCTAGTGAAGGTGGGCTCGATTAC
TTTGGGAACCCGAGCTTGATCCACGCCCAAAGCATTCTAGCCATTTGGGCCTCCCAGGTGGTTCTCATGGGAGCCGTCGAGGGATACCGTATCGCCGGTGGCCCACTTGG
GAAGGTGACCGACCCAATTTACCCGGGCGGGAGCTTTGACCCGTTAGGCCTTGCAGATGACCCGGAAGCCTTTGCAGAGCTGAAAGTGAAGGAGCTGAAGAATGGAAGGT
TGGCCATGTTCTCTATGTTTGGATTCTTCGTTCAAGCCATCGTGACTGGAAAAGGCCCACTTGAGAATCTTGCTGATCATCTTGCTGACCCAGTCAGCAATAATGCTTGG
GCTTATGCTACCAACTTCGTTCCTGGAAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGGCCTCAACAATGGCTCTCTCTTCTCCGTCGCTTGCTGGAAAGGCAGTGAAACTCACTCCCTCTTCGCCGGAGCTTCTCGACAATGGCGGCAGAGTCAGCATGAG
GAAATCCTCCTCCAAATCTGTTTCTTCTGGTAGCCCTTGGTATGGACCTGACCGTGTCAAGTACTTGGGACCATTCTCCGGCGAGCCTCCGTCTTATCTCACTGGTGAGT
TTCCCGGTGACTATGGCTGGGATACTGCTGGACTTTCTGCAGATCCCGAGACCTTCGCTAAGAACCGTGAGCTTGAAGTCATTCACTCTAGTGAAGGTGGGCTCGATTAC
TTTGGGAACCCGAGCTTGATCCACGCCCAAAGCATTCTAGCCATTTGGGCCTCCCAGGTGGTTCTCATGGGAGCCGTCGAGGGATACCGTATCGCCGGTGGCCCACTTGG
GAAGGTGACCGACCCAATTTACCCGGGCGGGAGCTTTGACCCGTTAGGCCTTGCAGATGACCCGGAAGCCTTTGCAGAGCTGAAAGTGAAGGAGCTGAAGAATGGAAGGT
TGGCCATGTTCTCTATGTTTGGATTCTTCGTTCAAGCCATCGTGACTGGAAAAGGCCCACTTGAGAATCTTGCTGATCATCTTGCTGACCCAGTCAGCAATAATGCTTGG
GCTTATGCTACCAACTTCGTTCCTGGAAAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAASTMALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLDNGGRVSMRKSSSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHSSEGGLDY
FGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGKVTDPIYPGGSFDPLGLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVSNNAW
AYATNFVPGK