; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10021497 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10021497
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionTLC domain-containing protein
Genome locationChr05:10060314..10064398
RNA-Seq ExpressionHG10021497
SyntenyHG10021497
Gene Ontology termsGO:0055088 - lipid homeostasis (biological process)
GO:0005783 - endoplasmic reticulum (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR006634 - TRAM/LAG1/CLN8 homology domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6573446.1 TLC domain-containing protein 4-B, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.8e-14396.25Show/hide
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XP_023543000.1 transmembrane protein 56 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.0e-14396.63Show/hide
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XP_038894770.1 TLC domain-containing protein 4-like [Benincasa hispida]4.1e-14498.12Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0M188 TLC domain-containing protein1.2e-14195.86Show/hide
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A0A1S4E2B6 transmembrane protein 56-like2.2e-14397.37Show/hide
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A0A5D3E1H6 Transmembrane protein 56-like2.2e-14397.37Show/hide
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A0A6J1GTT4 transmembrane protein 565.5e-14295.51Show/hide
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A0A6J1K6A0 transmembrane protein 56-like4.2e-14296.25Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q550S9 TLC domain-containing protein 4 B1.9e-1125Show/hide
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        L C L++      + +++   + K+ +G  + +R+EW NR +ST++AI  S +S+Y +++++   +   +      +S +S FI      YF+ D  +  
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        +    L     ++HH+++ L+  +    G           +EITTP IN+R++L    +K    Y+ING++IF  +++ R+     T + V     HY  
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Query:  VIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMK
        +    +I + + F  P +  ++NL W   I K + K
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Q5XIY2 TLC domain-containing protein 4-B1.9e-1123.75Show/hide
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        V G  +  +L +  ++ ++S+ + + Y  L   +  +WN+R +ST+HA+ + +  LY +++ D  ++    G        L    + I+ GY   DL L+
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Query:  IWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLI-NGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVY-LHYDQ
           + ++G + +V HH  +  A  Y +  G    +    LISE++TP +N RW+ +     R+   ++ NGI +   + + RI +    +  V+ + Y  
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Query:  VIKMHVIGYLLVFGVPTV-LGMMNLMWFGKIIKGLMKTIS
          +   +   + + +  V L ++N++W  KI +G  K I+
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Q6PGS5 TLC domain-containing protein 4-B7.1e-1428.37Show/hide
Query:  LTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFS
        L+  Q++EWN+R +S+ HA+ +    LY + + D  +     G        +    + ++ GY ++DL LII+ +  +G   +V HH L+ L   Y V  
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Query:  GEGQL--YTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAG-MKRSCAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHY-DQVIKMHVIGYLLVFGVPTV-LGMMNLMW
        GEG L  +    LI+E +TP +N RW+ +  G  K S   ++NG+++  ++ + RI +    +  V+  +  +      +G    + + +V L +MN+MW
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Query:  FGKIIKGLMKTISKR
          KI KG  K +  R
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Q8CGF5 TLC domain-containing protein 41.4e-1427.44Show/hide
Query:  YLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYS
        Y  L+  +++EWN+R +ST H++ + I  LY  F+ +        G  T+ +  ++T     + GY ++DL +I++ +  +G   +++HH  +GL   Y 
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Query:  VFSGEGQLY-TYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGM-KRSCAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHY--DQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNL
        V +     Y     L++E+++P +N RW+ +     K S A +INGI++   + + RI+     ++ +Y  Y  +  I+   +   +      +L +MN+
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Query:  MWFGKIIKGLMKTIS
        MW  KI KG +K IS
Subjt:  MWFGKIIKGLMKTIS

Q96MV1 TLC domain-containing protein 41.4e-1429.61Show/hide
Query:  FYFKSYLGLTKI----------QRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLY-FVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGM
        FYF SY    K+          +++EWN+R +ST H++ + I  LY F+F     +D    G       +L+   + I+ GY ++DL +II  +  +G  
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Query:  EYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGM-KRSCAYLINGIVIFFAWLVARI--LLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGY
         +++HH  S  A    + +G         L++E+++P +N RW+ +     K S A +INGI++   + + RI  +L  Y F +     +  I++ V+  
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Query:  LLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTISKRR
        L       VL +MN+MW  KI KG +K IS  R
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G31300.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein6.9e-11372.83Show/hide
Query:  AIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLIYDITQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLV
        AIKSY  QA  LVKNYLLAD F+PYTSVL G+  CK++YD+   +SN + K+Y+ LTKIQR+EWNNRG+ST+HAI+IS MSLYFVFWSDLFSD+ H  LV
Subjt:  AIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLIYDITQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLV

Query:  TFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIVIF
         F+SS LS+  LGIS+GYFLADLG+I W YPSLGG+EY+VHHSLSG+AVAYS+FSGEGQLYTYMVLISEITTPEIN+RWYLDTAGMK+S AY++NG+ IF
Subjt:  TFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIVIF

Query:  FAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTISKR
         AWLVARILLF Y FYHVYLHY+QV++MH+ GY+LVFGVP  LG+MNL+WFGKI++G+ KT++KR
Subjt:  FAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTISKR

AT1G31300.2 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein6.9e-11372.83Show/hide
Query:  AIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLIYDITQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLV
        AIKSY  QA  LVKNYLLAD F+PYTSVL G+  CK++YD+   +SN + K+Y+ LTKIQR+EWNNRG+ST+HAI+IS MSLYFVFWSDLFSD+ H  LV
Subjt:  AIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLIYDITQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLV

Query:  TFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIVIF
         F+SS LS+  LGIS+GYFLADLG+I W YPSLGG+EY+VHHSLSG+AVAYS+FSGEGQLYTYMVLISEITTPEIN+RWYLDTAGMK+S AY++NG+ IF
Subjt:  TFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIVIF

Query:  FAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTISKR
         AWLVARILLF Y FYHVYLHY+QV++MH+ GY+LVFGVP  LG+MNL+WFGKI++G+ KT++KR
Subjt:  FAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTISKR

AT4G10360.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein5.3e-6549.17Show/hide
Query:  SVLGGMLACKLIYDITQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLI
        S+  G L CK++YD+T+ +S   F  Y  L    R+EWNNRG ST HA++ S+ S+YF+  SD F +  H   V   ++ LS  ++GIS+GYFLADL +I
Subjt:  SVLGGMLACKLIYDITQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLI

Query:  IWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVI
         W +P+LGG+EYV HH LS  A+  SV SG+ Q Y ++VL+SE TTP +N+RWYLD +G K S AY +NGI +F  WLVAR+LLF + F H+YLH+ QV 
Subjt:  IWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVI

Query:  KMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTISKRR
        ++  +G+  +  +P  L +MNL+WF KI KGL+KT+SK +
Subjt:  KMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTISKRR

AT4G19645.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein1.5e-10770.9Show/hide
Query:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLIYDITQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGL
        M IKSYQ+QA+  V++YLLAD F+PYTSVL G+  CKL+YD+T+L S+ + KSY  LTKI+R+EWNNRG+ST+HAI+IS M+LYF F+SDLFSDQR    
Subjt:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLIYDITQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGL

Query:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIV
        +T F++S LSTF LG+SVGYFLADLG+I WLYPSLGG EY++HH LSG AVAYS+FSGE QLYTYMVLISE+TTPEIN+RWYLD AG+KRS AYL+NG+ 
Subjt:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIV

Query:  IFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTISKRR
        IFFAWL ARILLF Y FYHVY HYDQVI+MH  GYLLVF VP  L +MNL+WFGKI+KGL KT+ KR+
Subjt:  IFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTISKRR

AT4G19645.2 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein1.5e-10770.9Show/hide
Query:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLIYDITQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGL
        M IKSYQ+QA+  V++YLLAD F+PYTSVL G+  CKL+YD+T+L S+ + KSY  LTKI+R+EWNNRG+ST+HAI+IS M+LYF F+SDLFSDQR    
Subjt:  MAIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLIYDITQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGL

Query:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIV
        +T F++S LSTF LG+SVGYFLADLG+I WLYPSLGG EY++HH LSG AVAYS+FSGE QLYTYMVLISE+TTPEIN+RWYLD AG+KRS AYL+NG+ 
Subjt:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIV

Query:  IFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTISKRR
        IFFAWL ARILLF Y FYHVY HYDQVI+MH  GYLLVF VP  L +MNL+WFGKI+KGL KT+ KR+
Subjt:  IFFAWLVARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTISKRR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTATTAAATCTTACCAAAGTCAAGCTGATGCATTAGTAAAGAACTATTTATTAGCAGACCGTTTTGTCCCATACACTTCTGTCCTTGGAGGCATGCTTGCTTGTAA
ATTGATTTATGATATTACTCAATTAGTTAGCAATTTTTACTTCAAGAGTTATCTGGGTCTTACAAAAATCCAACGAGTCGAGTGGAATAACCGCGGCATGTCCACTATTC
ATGCAATCTATATCTCAATTATGTCATTGTACTTCGTTTTCTGGTCAGATCTCTTCTCTGACCAGCGTCATGCTGGCCTCGTTACCTTTCAAAGTTCAACGTTGTCTACT
TTCATATTGGGGATTTCAGTTGGGTACTTCTTGGCAGATCTTGGATTGATTATTTGGCTGTATCCTTCCTTAGGTGGGATGGAGTATGTTGTCCACCACTCTCTTTCCGG
ACTAGCAGTAGCATACTCTGTTTTCTCTGGAGAAGGGCAACTATATACTTATATGGTCCTCATTTCGGAGATTACAACTCCTGAGATTAATATGAGATGGTATCTTGATA
CAGCTGGTATGAAGAGGTCCTGTGCATATTTGATTAATGGCATTGTAATATTTTTTGCATGGCTGGTTGCTCGCATACTGTTGTTTGGTTACACATTCTATCATGTTTAC
CTGCACTATGATCAGGTAATTAAGATGCATGTAATCGGATATCTTCTGGTATTTGGAGTGCCAACAGTGCTAGGTATGATGAACTTGATGTGGTTCGGAAAGATCATTAA
GGGATTAATGAAAACTATATCAAAGAGGCGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTATTAAATCTTACCAAAGTCAAGCTGATGCATTAGTAAAGAACTATTTATTAGCAGACCGTTTTGTCCCATACACTTCTGTCCTTGGAGGCATGCTTGCTTGTAA
ATTGATTTATGATATTACTCAATTAGTTAGCAATTTTTACTTCAAGAGTTATCTGGGTCTTACAAAAATCCAACGAGTCGAGTGGAATAACCGCGGCATGTCCACTATTC
ATGCAATCTATATCTCAATTATGTCATTGTACTTCGTTTTCTGGTCAGATCTCTTCTCTGACCAGCGTCATGCTGGCCTCGTTACCTTTCAAAGTTCAACGTTGTCTACT
TTCATATTGGGGATTTCAGTTGGGTACTTCTTGGCAGATCTTGGATTGATTATTTGGCTGTATCCTTCCTTAGGTGGGATGGAGTATGTTGTCCACCACTCTCTTTCCGG
ACTAGCAGTAGCATACTCTGTTTTCTCTGGAGAAGGGCAACTATATACTTATATGGTCCTCATTTCGGAGATTACAACTCCTGAGATTAATATGAGATGGTATCTTGATA
CAGCTGGTATGAAGAGGTCCTGTGCATATTTGATTAATGGCATTGTAATATTTTTTGCATGGCTGGTTGCTCGCATACTGTTGTTTGGTTACACATTCTATCATGTTTAC
CTGCACTATGATCAGGTAATTAAGATGCATGTAATCGGATATCTTCTGGTATTTGGAGTGCCAACAGTGCTAGGTATGATGAACTTGATGTGGTTCGGAAAGATCATTAA
GGGATTAATGAAAACTATATCAAAGAGGCGATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAIKSYQSQADALVKNYLLADRFVPYTSVLGGMLACKLIYDITQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLST
FILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFYHVY
LHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTISKRR