; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10021766 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10021766
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Descriptionhistone-lysine N-methyltransferase SETD1B-like
Genome locationChr05:16371332..16371898
RNA-Seq ExpressionHG10021766
SyntenyHG10021766
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR007789 - Protein of unknown function DUF688


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6583323.1 hypothetical protein SDJN03_19255, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.4e-5876.16Show/hide
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XP_022970378.1 uncharacterized protein LOC111469381 [Cucurbita maxima]5.8e-6077.33Show/hide
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XP_023519368.1 uncharacterized protein LOC111782803 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.6e-6077.33Show/hide
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XP_038894794.1 uncharacterized protein LOC120083212 [Benincasa hispida]1.1e-7988.08Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LYC9 Uncharacterized protein1.2e-5870.3Show/hide
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A0A1S3C5A7 uncharacterized protein At4g009505.1e-6271.78Show/hide
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A0A5D3BF70 NADPH oxidase activator5.1e-6271.78Show/hide
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A0A6J1HLP7 uncharacterized protein LOC1114647335.9e-5875.58Show/hide
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A0A6J1I3P2 uncharacterized protein LOC1114693812.8e-6077.33Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06930.1 unknown protein6.7e-1441.76Show/hide
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        E DY+ G SA+VPFKWES+PGTP+        + F  + +    + +PLTPPPSYF    +S   H+S K    KT   N++F  L  K    PSSP S 
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        SSSSSSS  SS  R    S RR S  F+S                S+L +G  S K  GCY  LVKV  R
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AT2G40475.1 unknown protein2.9e-0937.96Show/hide
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        Y+ G  ASVPF WE+ PGTPK           PLTPPPSY+S+ ++S    +S      +T F+ ++  +   + +   SS  S SSSS SSS+  S+  
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         RP      S  S V +DD ++    SP STL + RG
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AT3G56260.2 unknown protein1.2e-1034.97Show/hide
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        R  DD +I+EE       AS+PF WES PGTPK +   +  +  PLTPPPSY+S+        +S+    SK     S F   S+ + L+ S+ G     
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          SFS SS+SS+SS          +R+S D +   +  +  +D+   SP STL    G   GC
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AT5G01790.1 unknown protein5.2e-0654.76Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CCAGAGATTCTAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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