| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_004145262.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Cucumis sativus] | 7.4e-152 | 84.8 | Show/hide |
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MSYSRRSRYSRSPS+KRSVSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPR+TRRELEKHFSAEG VLDVHLVADPLTRESRGFGFITM+SNDEAENCI
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KYLNRSVLEGR+ITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVH RRRS SYSSRRSPSYSPYRRSSSRSTH SSDRSRSRS S+D+HRR+YGSPYH RS SYSR+
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RYDSPD YRHHKSYSRSRSPYRRWSRDRSYSP D+YSPDPYYRRHRYRSVSRSLSPK+R RHYSRSYSP PRRRTLR Y RSPS+E
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SYSRSISPERSR S YS S+SPER RSSRSRSCSHTP+RH EST RGYS RSRSRS+SV SRSVSPA
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| XP_008457405.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like [Cucumis melo] | 2.6e-157 | 86.7 | Show/hide |
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MSYSRRSRYSRSPS+KRSVSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPR+TRRELEKHFSAEG VLDVHL+ADPLTRESRGFGFITM+SNDEAENCI
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KYLNRSVLEGR+ITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVHVRRRS SYSSRRSPSYSPYRRSSSRSTHYSSDRSRSRS S++RHRRSYGSPYH RS SYSR+
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RYDSP YRHH+SYSRS SPYRRWSRDRSYSPYD YSPDPYYRRHRYRSVSRSLSPK+R GRHYSRSYSP PRRRTL R+YS SPSRESR
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RSYSRSISPERSRRSGSS YS S+SPER RS RSRSCSHTP+RH EST RGYS RSRSRS+SV SRSVSPA
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| XP_022150940.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like isoform X1 [Momordica charantia] | 8.8e-129 | 78.8 | Show/hide |
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MSYSR+SRYSRSPSY+RS+SRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPR+TRRELEKHFSAEG VLDVHLVADP TRESRGFGFITM+SN+EAE CI
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KYLNRSVLEGR+ITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTV VRRRSHSYS R SPSYSPYRRSSSRS+ YSS+RSRSRSHS RHRRSYGSPYH+RS S YSR
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+RYDSP YR H+SYSR SRSPY R DRSYS YD YS D YYRRHRYRSVSRS+SPKARI GR YSRSYSP P RRTLR R YSR
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SPS E RSYSRS+SPERS+RSGS S RSR SRSRS SHT +RHS+K YE++ R YSG SRSRSRSV SRSVSPA
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| XP_022970544.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like isoform X2 [Cucurbita maxima] | 8.5e-124 | 77.72 | Show/hide |
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MSYSRRSRYSRSPSYKRSVSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRVT+RELEKHFSAEG VLDVHLVADP TRESRGFGFITM+SN+EAE CI
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KYLNRSVLEGR+ITVEKARRRRGRTPTPGRYLGL RT R RS HSYSSRRSPSYSPY RSSS S+HYSSDRSRSRS+SVDRH+RS+ SP YS
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R+RYDS DYRHH+SYSRS SPYR R+RSYSPYD YSP+PYYRRHR+ S R SP+ Y RH RS S PRRRTL RSYSRSPS+
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SR SYSRSIS ERS RSG SYS SVSPE SR SRSRSCSHTP+R SYK YES RG+SG S+SRS+SV SRSVSPA
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|
| XP_038894517.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a isoform X1 [Benincasa hispida] | 5.3e-158 | 89.32 | Show/hide |
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MS SRRSRYSRSPSYKRSVSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPR+TRRELEKHFSAEG VLDVHLV DPLTRESRGFGFITM+SNDEA+NCI
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KYLNRSVLEGR+ITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVHVRRRS SYSSRRSPSYSPYRRSSSRST YSS+RSRSRSHSVDRHRRSYGS Y+YRS SYSR+
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RYDSPD R HKSYSRSRSPYRR RDRSYSPYD+YSPDPYYRRHRYRSVSRSLSPKARI RHYSRSYSP PRRRTLRRSYSRS S ESRRSYSRSISPE
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RSRRS SSYSYSVSPERSRSSRSRS S+T +RHSYK YES RSRSRSRSV SRSVSPA
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|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
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| A0A0A0LXJ6 RRM domain-containing protein | 3.6e-152 | 84.8 | Show/hide |
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MSYSRRSRYSRSPS+KRSVSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPR+TRRELEKHFSAEG VLDVHLVADPLTRESRGFGFITM+SNDEAENCI
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KYLNRSVLEGR+ITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVH RRRS SYSSRRSPSYSPYRRSSSRSTH SSDRSRSRS S+D+HRR+YGSPYH RS SYSR+
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RYDSPD YRHHKSYSRSRSPYRRWSRDRSYSP D+YSPDPYYRRHRYRSVSRSLSPK+R RHYSRSYSP PRRRTLR Y RSPS+E
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SYSRSISPERSR S YS S+SPER RSSRSRSCSHTP+RH EST RGYS RSRSRS+SV SRSVSPA
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| A0A1S3C508 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like | 1.3e-157 | 86.7 | Show/hide |
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MSYSRRSRYSRSPS+KRSVSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPR+TRRELEKHFSAEG VLDVHL+ADPLTRESRGFGFITM+SNDEAENCI
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KYLNRSVLEGR+ITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVHVRRRS SYSSRRSPSYSPYRRSSSRSTHYSSDRSRSRS S++RHRRSYGSPYH RS SYSR+
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RYDSP YRHH+SYSRS SPYRRWSRDRSYSPYD YSPDPYYRRHRYRSVSRSLSPK+R GRHYSRSYSP PRRRTL R+YS SPSRESR
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RSYSRSISPERSRRSGSS YS S+SPER RS RSRSCSHTP+RH EST RGYS RSRSRS+SV SRSVSPA
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| A0A6J1D9V3 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like isoform X1 | 4.2e-129 | 78.8 | Show/hide |
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MSYSR+SRYSRSPSY+RS+SRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPR+TRRELEKHFSAEG VLDVHLVADP TRESRGFGFITM+SN+EAE CI
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KYLNRSVLEGR+ITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTV VRRRSHSYS R SPSYSPYRRSSSRS+ YSS+RSRSRSHS RHRRSYGSPYH+RS S YSR
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Query: QRYDSPDYRHHKSYSR--SRSPYRR---WSRDRSYSP-YDNYSPDP-YYRRHRYRSVSRSLSPKARIYGRHYSRSYSPGPRRRTLR---------RSYSR
+RYDSP YR H+SYSR SRSPY R DRSYS YD YS D YYRRHRYRSVSRS+SPKARI GR YSRSYSP P RRTLR R YSR
Subjt: QRYDSPDYRHHKSYSR--SRSPYRR---WSRDRSYSP-YDNYSPDP-YYRRHRYRSVSRSLSPKARIYGRHYSRSYSPGPRRRTLR---------RSYSR
Query: SPSRESRRSYSRSISPERSRRSGSSYSYSVSPERSRSSRSRSCSHTPKRHSYKSYESTHGRGYSGRSRSRSRSVASRSVSPA
SPS E RSYSRS+SPERS+RSGS S RSR SRSRS SHT +RHS+K YE++ R YSG SRSRSRSV SRSVSPA
Subjt: SPSRESRRSYSRSISPERSRRSGSSYSYSVSPERSRSSRSRSCSHTPKRHSYKSYESTHGRGYSGRSRSRSRSVASRSVSPA
|
|
| A0A6J1HP51 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like isoform X2 | 1.6e-123 | 73.09 | Show/hide |
Query: MSYSRRSRYSRSPSYKRSVSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRVTRRELEKHFSAEGMVLDVHLVADPLTRESRGFGFITMASNDEAENCI
MSYSRRSRYSRSPSYKRSVSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRVT+RELEKHFSAEG VLDVHLVADP TRESRGFGFITM+SNDEAE CI
Subjt: MSYSRRSRYSRSPSYKRSVSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRVTRRELEKHFSAEGMVLDVHLVADPLTRESRGFGFITMASNDEAENCI
Query: KYLNRSVLEGRVITVEKARRRRGRTPTPGRYLGL-RTVHVRRR-SHSYSSRRSPSYSPYRRSSSRSTHYSSDRSRSRSHSVDRHRRSYGSPYHYRSCSYS
KYLNRSVLEGR+ITVEKARRRRGRTPTPG+YLGL RTV R R SHSYSSRRSPSYSPY +SSS S+HYSSDRSRSRSHSVDRH+RS+ SP YS
Subjt: KYLNRSVLEGRVITVEKARRRRGRTPTPGRYLGL-RTVHVRRR-SHSYSSRRSPSYSPYRRSSSRSTHYSSDRSRSRSHSVDRHRRSYGSPYHYRSCSYS
Query: RQRYDSPDYRHHKSYSRSRSPYR--RWSRDRSYSPYDNYSPDPYYRRHRY--RSVSRSLSPKARIYGRHYSRSYSP------------------------
R+RYDSPDYRHH+SYSRSRSPYR RDRSYSPYD YSP+PYYRRHR+ RS SRS +P R R RSYSP
Subjt: RQRYDSPDYRHHKSYSRSRSPYR--RWSRDRSYSPYDNYSPDPYYRRHRY--RSVSRSLSPKARIYGRHYSRSYSP------------------------
Query: ----------GPRRRTLRRSYSRSPSRESRRSYSRSISPERSRRSGSSYSYSVSPERSRSSRSRSCSHTPKRHSYKSYESTHGRGYSGRSRSRSRSVASR
PRRRT+ RSYSRSPS+ESR +YS SIS ERS RSG SYS SVSPE SR SRSRSCSHTP+RH YES RG SG SRSRS+SV SR
Subjt: ----------GPRRRTLRRSYSRSPSRESRRSYSRSISPERSRRSGSSYSYSVSPERSRSSRSRSCSHTPKRHSYKSYESTHGRGYSGRSRSRSRSVASR
Query: SVSPA
+VSPA
Subjt: SVSPA
|
|
| A0A6J1I361 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like isoform X2 | 4.1e-124 | 77.72 | Show/hide |
Query: MSYSRRSRYSRSPSYKRSVSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRVTRRELEKHFSAEGMVLDVHLVADPLTRESRGFGFITMASNDEAENCI
MSYSRRSRYSRSPSYKRSVSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRVT+RELEKHFSAEG VLDVHLVADP TRESRGFGFITM+SN+EAE CI
Subjt: MSYSRRSRYSRSPSYKRSVSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRVTRRELEKHFSAEGMVLDVHLVADPLTRESRGFGFITMASNDEAENCI
Query: KYLNRSVLEGRVITVEKARRRRGRTPTPGRYLGL-RTVHVRRRS-HSYSSRRSPSYSPYRRSSSRSTHYSSDRSRSRSHSVDRHRRSYGSPYHYRSCSYS
KYLNRSVLEGR+ITVEKARRRRGRTPTPGRYLGL RT R RS HSYSSRRSPSYSPY RSSS S+HYSSDRSRSRS+SVDRH+RS+ SP YS
Subjt: KYLNRSVLEGRVITVEKARRRRGRTPTPGRYLGL-RTVHVRRRS-HSYSSRRSPSYSPYRRSSSRSTHYSSDRSRSRSHSVDRHRRSYGSPYHYRSCSYS
Query: RQRYDSPDYRHHKSYSRSRSPYR--RWSRDRSYSPYDNYSPDPYYRRHRYRSVS------RSLSPKARIYGRHYSRSYSP--GPRRRTLRRSYSRSPSRE
R+RYDS DYRHH+SYSRS SPYR R+RSYSPYD YSP+PYYRRHR+ S R SP+ Y RH RS S PRRRTL RSYSRSPS+
Subjt: RQRYDSPDYRHHKSYSRSRSPYR--RWSRDRSYSPYDNYSPDPYYRRHRYRSVS------RSLSPKARIYGRHYSRSYSP--GPRRRTLRRSYSRSPSRE
Query: SRRSYSRSISPERSRRSGSSYSYSVSPERSRSSRSRSCSHTPKRHSYKSYESTHGRGYSGRSRSRSRSVASRSVSPA
SR SYSRSIS ERS RSG SYS SVSPE SR SRSRSCSHTP+R SYK YES RG+SG S+SRS+SV SRSVSPA
Subjt: SRRSYSRSISPERSRRSGSSYSYSVSPERSRSSRSRSCSHTPKRHSYKSYESTHGRGYSGRSRSRSRSVASRSVSPA
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| Q01130 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 7.0e-12 | 38.54 | Show/hide |
Query: PSSDVENPGNNLYVTGLSPRVTRRELEKHFSAEGMVLDVHLVADPLTRESRGFGFITMASNDEAENCIKYLNRSVLEGRVITVEKARRRR-------GRT
P DVE +L V L+ R + L + F G V DV++ D T+ESRGF F+ +AE+ + ++ +VL+GR + V+ AR R R
Subjt: PSSDVENPGNNLYVTGLSPRVTRRELEKHFSAEGMVLDVHLVADPLTRESRGFGFITMASNDEAENCIKYLNRSVLEGRVITVEKARRRR-------GRT
Query: PTPGRY----LGLRTVHVRR----RSHSYSSRRSPSYSPYRRSSSRSTHYSSDRSRSRSHSVDRHRRSYGSPYHYRSCSYSRQRYDSP---DYRHHKSYS
P P RY G R+ RR RS S S RS S S Y RS SRS S RS S+S S R + S RS S SR R SP R KS S
Subjt: PTPGRY----LGLRTVHVRR----RSHSYSSRRSPSYSPYRRSSSRSTHYSSDRSRSRSHSVDRHRRSYGSPYHYRSCSYSRQRYDSP---DYRHHKSYS
Query: RSRSP
RS+SP
Subjt: RSRSP
|
|
| Q10422 Uncharacterized RNA-binding protein C25G10.01 | 1.7e-13 | 34.52 | Show/hide |
Query: SRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRVTRRELEKHFSAEGMVLDVHLVADPLTRESRGFGFITMASNDEAENCIKYLNRSVLEGRVITVEKAR
+ S + + +S EN GN+L+V+G++ R+ EL++ FS G V V ++ +P+T+ SRGFGF++ ++ +EA + I LN GRV+ V+KA+
Subjt: SRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRVTRRELEKHFSAEGMVLDVHLVADPLTRESRGFGFITMASNDEAENCIKYLNRSVLEGRVITVEKAR
Query: RRRGRTPTPGRYLGLRTVHVRRRSHSYSSRRSPSYSPYRRSSSRSTHYSSDRSRSRSHSVDRHRRSYGSPYHYRSCSYSRQRYDSPDYRHHKSYSRS
R R +PTPG+Y+G RR S + S YRR++ R S+R R+ S+ R +R + SP +YR R DS R + RS
Subjt: RRRGRTPTPGRYLGLRTVHVRRRSHSYSSRRSPSYSPYRRSSSRSTHYSSDRSRSRSHSVDRHRRSYGSPYHYRSCSYSRQRYDSPDYRHHKSYSRS
|
|
| Q3MHR5 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 7.0e-12 | 38.54 | Show/hide |
Query: PSSDVENPGNNLYVTGLSPRVTRRELEKHFSAEGMVLDVHLVADPLTRESRGFGFITMASNDEAENCIKYLNRSVLEGRVITVEKARRRR-------GRT
P DVE +L V L+ R + L + F G V DV++ D T+ESRGF F+ +AE+ + ++ +VL+GR + V+ AR R R
Subjt: PSSDVENPGNNLYVTGLSPRVTRRELEKHFSAEGMVLDVHLVADPLTRESRGFGFITMASNDEAENCIKYLNRSVLEGRVITVEKARRRR-------GRT
Query: PTPGRY----LGLRTVHVRR----RSHSYSSRRSPSYSPYRRSSSRSTHYSSDRSRSRSHSVDRHRRSYGSPYHYRSCSYSRQRYDSP---DYRHHKSYS
P P RY G R+ RR RS S S RS S S Y RS SRS S RS S+S S R + S RS S SR R SP R KS S
Subjt: PTPGRY----LGLRTVHVRR----RSHSYSSRRSPSYSPYRRSSSRSTHYSSDRSRSRSHSVDRHRRSYGSPYHYRSCSYSRQRYDSP---DYRHHKSYS
Query: RSRSP
RS+SP
Subjt: RSRSP
|
|
| Q62093 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 7.0e-12 | 38.54 | Show/hide |
Query: PSSDVENPGNNLYVTGLSPRVTRRELEKHFSAEGMVLDVHLVADPLTRESRGFGFITMASNDEAENCIKYLNRSVLEGRVITVEKARRRR-------GRT
P DVE +L V L+ R + L + F G V DV++ D T+ESRGF F+ +AE+ + ++ +VL+GR + V+ AR R R
Subjt: PSSDVENPGNNLYVTGLSPRVTRRELEKHFSAEGMVLDVHLVADPLTRESRGFGFITMASNDEAENCIKYLNRSVLEGRVITVEKARRRR-------GRT
Query: PTPGRY----LGLRTVHVRR----RSHSYSSRRSPSYSPYRRSSSRSTHYSSDRSRSRSHSVDRHRRSYGSPYHYRSCSYSRQRYDSP---DYRHHKSYS
P P RY G R+ RR RS S S RS S S Y RS SRS S RS S+S S R + S RS S SR R SP R KS S
Subjt: PTPGRY----LGLRTVHVRR----RSHSYSSRRSPSYSPYRRSSSRSTHYSSDRSRSRSHSVDRHRRSYGSPYHYRSCSYSRQRYDSP---DYRHHKSYS
Query: RSRSP
RS+SP
Subjt: RSRSP
|
|
| Q84TH4 Serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 1.2e-59 | 54.09 | Show/hide |
Query: MSYSRRSRYSRSPS-YKRSVSRSLSRSRSRS--RSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRVTRRELEKHFSAEGMVLDVHLVADPLTRESRGFGFITMASNDEAE
MSYSRRSRYS S S Y + RS+SRS SRS RS SSD ENPGN+LYVTGLS RVT R+LE HF+ EG V DVHLV DP TRESRGFGFI+M S +A
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CI+ L+ SVL+GRVITVEKARRRRGRTPTPG+YLGLRT R +S SYS RRS S S SRS YSSDR RS S S R RS SP++ R
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YS R SPD R+++ RS SP YRR R RSYS PYY R RYRS SRS SP+ R Y R RSYSP + R RSYS S
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RS S S+SP G S S S+SP + R SRS+S +RH +S H R +RS SRSVSP
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MSYSRRSRYS S S Y + RS+SRS SRS RS SSD ENPGN+LYVTGLS RVT R+LE HF+ EG V DVHLV DP TRESRGFGFI+M S +A
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CI+ L+ SVL+GRVITVEKARRRRGRTPTPG+YLGLRT R +S SYS RRS S S SRS YSSDR RS S S R RS SP++ R
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YS R SPD R+++ RS SP YRR R RSYS PYY R RYRS SRS SP+ R Y R RSYSP + R RSYS S
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RS S S+SP G S S S+SP + R SRS+S +RH +S H R +RS SRSVSP
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| AT1G07350.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.1e-33 | 69.17 | Show/hide |
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MSYSRRSRYS S S Y + RS+SRS SRS RS SSD ENPGN+LYVTGLS RVT R+LE HF+ EG V DVHLV DP TRESRGFGFI+M S +A
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CI+ L+ SVL+GRVITVEK
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| AT4G35785.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.4e-36 | 46.03 | Show/hide |
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S SR SRS S R VS S SR RSRSRS S+VENPG LYVTGLS RVT ++LE HF+ EG V LV +P TR SRGF F+TM+S +AE CIK
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YLN+SVLEGR ITVE++RR+R RTPTPG YLGL++ S D R S RH
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YD DYR +S R SP RR RDRSYSP+ SP+ R RS R
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| AT4G35785.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 6.0e-35 | 45.85 | Show/hide |
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S SR SRS S R VS S SR RSRSRS S+VENPG LYVTGLS RVT ++LE HF+ EG V LV +P TR SRGF F+TM+S +AE CI
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KYLN+SVLEGR ITVE++RR+R RTPTPG YLGL++ S D R S RH
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YD DYR +S R SP RR RDRSYSP+ SP+ R RS R
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| AT4G35785.3 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 9.3e-28 | 62.39 | Show/hide |
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S SR SRS S R VS S SR RSRSRS S+VENPG LYVTGLS RVT ++LE HF+ EG V LV +P TR SRGF F+TM+S +AE CI
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Query: KYLNRSVLEGRVITVEK
KYLN+SVLEGR ITVE+
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