; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10022076 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10022076
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Descriptionmini zinc finger protein 2
Genome locationChr05:20526249..20526539
RNA-Seq ExpressionHG10022076
SyntenyHG10022076
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000976 - transcription regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006456 - ZF-HD homeobox protein, Cys/His-rich dimerisation domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004148693.1 mini zinc finger protein 2 [Cucumis sativus]1.1e-4193.48Show/hide
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XP_016902406.1 PREDICTED: mini zinc finger protein 2 [Cucumis melo]2.1e-4595.83Show/hide
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XP_022134197.1 mini zinc finger protein 2-like [Momordica charantia]3.1e-4190.62Show/hide
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XP_022939280.1 mini zinc finger protein 2-like [Cucurbita moschata]1.8e-4190.62Show/hide
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XP_038890678.1 mini zinc finger protein 2-like [Benincasa hispida]3.9e-4493.75Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KVJ7 Transcription factor5.1e-4293.48Show/hide
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A0A1S4E2E9 mini zinc finger protein 21.0e-4595.83Show/hide
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A0A5D3CUT9 Mini zinc finger protein 21.0e-4595.83Show/hide
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A0A6J1BYZ4 mini zinc finger protein 2-like1.5e-4190.62Show/hide
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A0A6J1FM92 mini zinc finger protein 2-like8.8e-4290.62Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8BLT3 Mini zinc finger protein 26.7e-2370Show/hide
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        VRY ECQ+NHAA +GG+AVDGCREFMASG +GT AA+ CAACGCHQ+FHRR+V      CDCSS  S+GT
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B9GBM3 Mini zinc finger protein 26.7e-2370Show/hide
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Q2Q493 Mini zinc finger protein 31.4e-2360.64Show/hide
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        M+KRQVV+++ +     T +SS    +VRY ECQKNHAA +GGYAVDGCREFMASG +    A+TCAACGCH+NFHRR+V TEVVC+ S   +N
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Q9CA51 Mini zinc finger protein 12.1e-2456.7Show/hide
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        M+KRQ+V+++    S          + +SS  + +VRY ECQKNHAA +GGYAVDGCREFMA+G EGT  A+ CAACGCH+NFHR++V TEVVC+ S
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Q9LJW5 Mini zinc finger protein 25.3e-3677.78Show/hide
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        MRKRQVVLRR+  EEPSR  + ASS TVR+VRYGECQKNHAA VGGYAVDGCREFMAS G+EGT AA+TCAACGCH++FHRR++ TEVVCDC+S PS G
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18835.1 mini zinc finger9.6e-2560.64Show/hide
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AT1G74660.1 mini zinc finger 11.5e-2556.7Show/hide
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AT3G28917.1 mini zinc finger 23.8e-3777.78Show/hide
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AT3G50890.1 homeobox protein 289.7e-1761.82Show/hide
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        +  +Y ECQKNHAA  GG+ VDGC EFMA G+EGT  A+ CAAC CH++FHR++V
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AT4G24660.1 homeobox protein 225.7e-1765.38Show/hide
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        +RY EC KNHA  +GG+AVDGC EFM SG++GT  A+ CAACGCH+NFHR++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGGAAGCGTCAAGTTGTGCTTAGAAGATCAGAAGAACCCTCAAGGGAGACTGTGGCTTCCTCTTTCACAGTAAGGAGTGTAAGATATGGGGAGTGCCAAAAGAACCA
CGCCGCCGGGGTCGGAGGGTACGCTGTTGACGGGTGTCGAGAATTCATGGCGAGTGGCGACGAAGGGACGACCGCTGCAATGACTTGCGCCGCCTGCGGTTGCCACCAGA
ATTTTCATAGAAGGCAAGTTGGAACTGAGGTAGTTTGTGATTGCTCTTCATCACCCTCAAATGGAACTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGGAAGCGTCAAGTTGTGCTTAGAAGATCAGAAGAACCCTCAAGGGAGACTGTGGCTTCCTCTTTCACAGTAAGGAGTGTAAGATATGGGGAGTGCCAAAAGAACCA
CGCCGCCGGGGTCGGAGGGTACGCTGTTGACGGGTGTCGAGAATTCATGGCGAGTGGCGACGAAGGGACGACCGCTGCAATGACTTGCGCCGCCTGCGGTTGCCACCAGA
ATTTTCATAGAAGGCAAGTTGGAACTGAGGTAGTTTGTGATTGCTCTTCATCACCCTCAAATGGAACTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRKRQVVLRRSEEPSRETVASSFTVRSVRYGECQKNHAAGVGGYAVDGCREFMASGDEGTTAAMTCAACGCHQNFHRRQVGTEVVCDCSSSPSNGT