| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KGN52445.1 hypothetical protein Csa_008476 [Cucumis sativus] | 2.9e-37 | 56.69 | Show/hide |
Query: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTW--------------------------------------QTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAVN
+IGSLGKHG E VEF+HVKDV FT TTNG RIKTW QTSAVK+SNVLY+++SGTSKSKIAVN
Subjt: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTW--------------------------------------QTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAVN
Query: LACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEED--TSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCLNE
LACS++ PCRNILMKD++L SI EDEEE+ TSS+C NVV+G KDG++IPNVPCL +
Subjt: LACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEED--TSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCLNE
|
|
| XP_016902407.1 PREDICTED: probable polygalacturonase At1g80170 [Cucumis melo] | 4.7e-35 | 55.62 | Show/hide |
Query: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTWQ--------------------------------------TSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAVN
+IGSLGKHG ETVEFVHVKDV FT TTNG RIKTWQ TSAVKISNV Y++ISGTS+SKIAVN
Subjt: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTWQ--------------------------------------TSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAVN
Query: LACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEED---TSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCLNEMS
L CS++ PCRNILMKD++L SI +DEEE TSS C NVV+G K G++IPNVPCL +M+
Subjt: LACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEED---TSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCLNEMS
|
|
| XP_022133622.1 probable polygalacturonase At1g80170 [Momordica charantia] | 1.2e-38 | 58.71 | Show/hide |
Query: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTW--------------------------------------QTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAVN
+IGSLGKHGQRETVE +HV+DV FTGTTNGARIKTW QTSAVKISNVLY KISGTS S+IAV
Subjt: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTW--------------------------------------QTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAVN
Query: LACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEEDTSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCLNE
LACSDS+PCRNI+MKD+EL D + TSSFCGNVVNGL++GT+IP+VPCLN+
Subjt: LACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEEDTSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCLNE
|
|
| XP_031741769.1 probable polygalacturonase At1g80170, partial [Cucumis sativus] | 2.9e-37 | 56.69 | Show/hide |
Query: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTW--------------------------------------QTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAVN
+IGSLGKHG E VEF+HVKDV FT TTNG RIKTW QTSAVK+SNVLY+++SGTSKSKIAVN
Subjt: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTW--------------------------------------QTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAVN
Query: LACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEED--TSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCLNE
LACS++ PCRNILMKD++L SI EDEEE+ TSS+C NVV+G KDG++IPNVPCL +
Subjt: LACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEED--TSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCLNE
|
|
| XP_038889205.1 probable polygalacturonase At1g80170 [Benincasa hispida] | 1.7e-45 | 64.97 | Show/hide |
Query: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTW--------------------------------------QTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAVN
+IGSLGKHG ETVEFV+VKDVIFTGTTNGARIKTW QTSAVKISNV+YSKISGTS+SKIAVN
Subjt: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTW--------------------------------------QTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAVN
Query: LACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEEDTSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCLNEMS
LACS+SVPCRNI MKD+ELGSIHEDE++ TSS+CGNVVNGL DGT+IP VPCLN MS
Subjt: LACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEEDTSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCLNEMS
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0KS58 Uncharacterized protein | 1.4e-37 | 56.69 | Show/hide |
Query: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTW--------------------------------------QTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAVN
+IGSLGKHG E VEF+HVKDV FT TTNG RIKTW QTSAVK+SNVLY+++SGTSKSKIAVN
Subjt: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTW--------------------------------------QTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAVN
Query: LACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEED--TSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCLNE
LACS++ PCRNILMKD++L SI EDEEE+ TSS+C NVV+G KDG++IPNVPCL +
Subjt: LACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEED--TSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCLNE
|
|
| A0A1S4E2F6 probable polygalacturonase At1g80170 | 2.3e-35 | 55.62 | Show/hide |
Query: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTWQ--------------------------------------TSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAVN
+IGSLGKHG ETVEFVHVKDV FT TTNG RIKTWQ TSAVKISNV Y++ISGTS+SKIAVN
Subjt: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTWQ--------------------------------------TSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAVN
Query: LACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEED---TSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCLNEMS
L CS++ PCRNILMKD++L SI +DEEE TSS C NVV+G K G++IPNVPCL +M+
Subjt: LACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEED---TSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCLNEMS
|
|
| A0A6J1BX76 probable polygalacturonase At1g80170 | 5.7e-39 | 58.71 | Show/hide |
Query: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTW--------------------------------------QTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAVN
+IGSLGKHGQRETVE +HV+DV FTGTTNGARIKTW QTSAVKISNVLY KISGTS S+IAV
Subjt: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTW--------------------------------------QTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAVN
Query: LACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEEDTSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCLNE
LACSDS+PCRNI+MKD+EL D + TSSFCGNVVNGL++GT+IP+VPCLN+
Subjt: LACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEEDTSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCLNE
|
|
| A0A6P4MGW6 probable polygalacturonase At1g80170 | 3.0e-27 | 57.26 | Show/hide |
Query: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTWQTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAVNLACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEEDTSSFCGNVV
+IGSLG G+ E VEFVHV++V F GTTNG RIKTWQTSAVKI+N+ Y I+GTS + AV L+CS S PCRNI MK++ L +E ++ TSS+C N
Subjt: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTWQTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAVNLACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEEDTSSFCGNVV
Query: NGLKDGTIIPNVPCLNE
+GL++G + PNVPCL++
Subjt: NGLKDGTIIPNVPCLNE
|
|
| A0A6P4MGX0 probable polygalacturonase At1g80170 | 9.2e-29 | 57.26 | Show/hide |
Query: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTWQTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAVNLACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEEDTSSFCGNVV
+IGSLG G+ E VEFVHV++V F GTTNG RIKTWQTSAV+ISN+ Y I+GTS KIAV L+CS+S+PC+NI MKD+ L I+E ++ TSS+C N
Subjt: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTWQTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAVNLACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEEDTSSFCGNVV
Query: NGLKDGTIIPNVPCLNE
GL++G + P++ CL +
Subjt: NGLKDGTIIPNVPCLNE
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O22818 Probable polygalacturonase At2g43860 | 3.1e-13 | 33.77 | Show/hide |
Query: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTW---------------------------------------QTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAV
+IGSLG+ + + V+ V V +V F GT NG RIKTW Q S VK+SNV Y I GTS +++AV
Subjt: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTW---------------------------------------QTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAV
Query: NLACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEEDTSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCL
L CS PC I+M DV L S+H + + C N D ++P PCL
Subjt: NLACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEEDTSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCL
|
|
| P43212 Polygalacturonase | 6.4e-11 | 31.54 | Show/hide |
Query: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTW---------------------------------------QTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAV
+IGSLG+ R V +VHV F T NG RIKTW Q SAV+I +V Y I GTS + A+
Subjt: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTW---------------------------------------QTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAV
Query: NLACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEEDTSSFCGNVVNGLKDGTIIP
L CSDS+PC++I + D+ L + +S + NG G +IP
Subjt: NLACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEEDTSSFCGNVVNGLKDGTIIP
|
|
| Q94AJ5 Probable polygalacturonase At1g80170 | 2.3e-13 | 33.97 | Show/hide |
Query: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTW---------------------------------------QTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAV
+IGSLGK E V + V I + T NG RIKTW QTSA+ I N+ + + GTS SK A+
Subjt: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTW---------------------------------------QTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAV
Query: NLACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEEDTSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCLNE
++CSDS PCRNIL++D++L + D T SFC G G + P PCL++
Subjt: NLACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEEDTSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCLNE
|
|
| Q9LW07 Probable polygalacturonase At3g15720 | 3.4e-12 | 31.41 | Show/hide |
Query: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTWQ-----------------------------------------TSAVKISNVLYSKISGTSKSKI
+IGSLGK G+ TVE V V++ F GT NGARIKTWQ +SAV++S V++S GTSKS+
Subjt: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTWQ-----------------------------------------TSAVKISNVLYSKISGTSKSKI
Query: AVNLACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEEDTSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCL
V+ CS+ VPC I ++D+++ + + C NV +P + CL
Subjt: AVNLACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEEDTSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCL
|
|
| Q9SFB7 Polygalacturonase QRT2 | 2.2e-11 | 33.33 | Show/hide |
Query: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTW---------------------------------------QTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAV
+IGSLG+ V V V GTTNG RIKTW Q SAV++SNVLY I GTS IAV
Subjt: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTW---------------------------------------QTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAV
Query: NLACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEEDTSSFCGNV
CS ++PCR I M++V+L + + +++ + + C NV
Subjt: NLACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEEDTSSFCGNV
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G80170.1 Pectin lyase-like superfamily protein | 1.7e-14 | 33.97 | Show/hide |
Query: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTW---------------------------------------QTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAV
+IGSLGK E V + V I + T NG RIKTW QTSA+ I N+ + + GTS SK A+
Subjt: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTW---------------------------------------QTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAV
Query: NLACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEEDTSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCLNE
++CSDS PCRNIL++D++L + D T SFC G G + P PCL++
Subjt: NLACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEEDTSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCLNE
|
|
| AT2G26620.1 Pectin lyase-like superfamily protein | 1.3e-14 | 35.85 | Show/hide |
Query: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTWQTSAVKI--SNVLYSKIS---------------------------------------GTSKSKI
++GSLGK+ + V+ + V+DVIF GT++G RIKTW++SA KI SN +Y I GTSK+K+
Subjt: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTWQTSAVKI--SNVLYSKIS---------------------------------------GTSKSKI
Query: AVNLACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEEDTSSF--CGNVVNGLKDGTIIPNVPCLN
AVNL CS S PC+N+ + D+ +I ++ ED SS C N V+G G + P CLN
Subjt: AVNLACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEEDTSSF--CGNVVNGLKDGTIIPNVPCLN
|
|
| AT2G40310.1 Pectin lyase-like superfamily protein | 2.8e-14 | 33.96 | Show/hide |
Query: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTWQTSAVKI--SNVLYSKIS-----------------------------------------GTSKS
++GSLGK+ + V+ + V+DVIF GT++G RIKTW++SA KI SN +Y I GTSK+
Subjt: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTWQTSAVKI--SNVLYSKIS-----------------------------------------GTSKS
Query: KIAVNLACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEEDTSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCLN
K+A+NL CS S PC+NI + D+ + S + E + + C N V+G G ++P CLN
Subjt: KIAVNLACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEEDTSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCLN
|
|
| AT2G43860.1 Pectin lyase-like superfamily protein | 2.2e-14 | 33.77 | Show/hide |
Query: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTW---------------------------------------QTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAV
+IGSLG+ + + V+ V V +V F GT NG RIKTW Q S VK+SNV Y I GTS +++AV
Subjt: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTW---------------------------------------QTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAV
Query: NLACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEEDTSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCL
L CS PC I+M DV L S+H + + C N D ++P PCL
Subjt: NLACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEEEDTSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCL
|
|
| AT5G39910.1 Pectin lyase-like superfamily protein | 4.4e-23 | 46.83 | Show/hide |
Query: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTWQTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAVNLACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEE-----------
+IGSLG++G +ETVE V V+D F TTNG RIKTWQT AV+I NV+++ I GTS K V L CS SVPCR+I M D+ + +E+EE
Subjt: NIGSLGKHGQRETVEFVHVKDVIFTGTTNGARIKTWQTSAVKISNVLYSKISGTSKSKIAVNLACSDSVPCRNILMKDVELGSIHEDEE-----------
Query: EDTSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCL
+ S+ C N V G +G + P + CL
Subjt: EDTSSFCGNVVNGLKDGTIIPNVPCL
|
|
