; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10022260 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10022260
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionChlorophyll A-B binding protein
Genome locationChr05:22409242..22409796
RNA-Seq ExpressionHG10022260
SyntenyHG10022260
Gene Ontology termsGO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK05751.1 uncharacterized protein E5676_scaffold98G002400 [Cucumis melo var. makuwa]1.0e-8090.27Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADSE-PGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSSAATSSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSL LPSNSK HKP+ LTF+TRAADPES  +DSE PGSDGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSKKGS+ A SSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADSE-PGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSSAATSSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVISYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGK VISYHTPAIILIQVYFVAAVAA+YIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVISYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
XP_004149820.1 uncharacterized protein LOC101221723 [Cucumis sativus]9.0e-8291.35Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADSE-PGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSSAATSSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSL LPSNSKP KPK LTF+TRAADPESPA DSE PGSDGDDFEDRLAKVR+RYRSGTGKKAEIRKARKSK+GS+ A SSVYLPPV L
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADSE-PGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSSAATSSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVISYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGK VISYHTPAIILIQVYFVAAVAA+YIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVISYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
XP_022133568.1 uncharacterized protein LOC111006119 [Momordica charantia]1.1e-8289.25Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADSEPGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSSAAT--SSVYLPPVP
        MAAIPSSSLQFPNSL  PSNSKPHK KPLTFVTRAADPE+PAAD EPGSDGDDFE+RLAKVRL+YRSGTGKKAEIRKARKS KGS+A    SSVYLPPVP
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADSEPGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSSAAT--SSVYLPPVP

Query:  LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVISYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        LKEAVSGGLKVEFGFSP+SERINGWIAILGISALVLVELATGKGVI+YHTPAIILIQVYFVAAVAA+Y+K+EKEKVSVWPP+E+KN
Subjt:  LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVISYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
XP_023550096.1 uncharacterized protein LOC111808391 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.0e-8090.76Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADSEPGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSSAATSSVYLPPVPLK
        MAAIPSSSLQFPNSLA  SNSKPHKPK LTFVTRAADPESPAADSEP SDGDDFEDRLA  RL+ R GTGKKAEIRKARKS+KGS+AA SSVYLPPVPLK
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADSEPGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSSAATSSVYLPPVPLK

Query:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVISYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILG+SALVLVELATGKGVI+YHTPAIILIQVYFVAA AALYIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVISYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
XP_038890345.1 uncharacterized protein LOC120079944 [Benincasa hispida]6.3e-8393.48Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADSEPGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSSAATSSVYLPPVPLK
        MAAIPSSSLQFPNSL L     P KPK LTFVTRAADPESPAADSE GSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGS+AA SSVYLPPVPLK
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADSEPGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSSAATSSVYLPPVPLK

Query:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVISYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVI+YHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
Subjt:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVISYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KS45 Uncharacterized protein4.4e-8291.35Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADSE-PGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSSAATSSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSL LPSNSKP KPK LTF+TRAADPESPA DSE PGSDGDDFEDRLAKVR+RYRSGTGKKAEIRKARKSK+GS+ A SSVYLPPV L
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADSE-PGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSSAATSSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVISYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGK VISYHTPAIILIQVYFVAAVAA+YIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVISYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
A0A1S3CJX9 uncharacterized protein LOC1035016671.4e-8089.73Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADSE-PGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSSAATSSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSL LPSNSK HKP+ LTF+TRAADPES  +DSE PGSDGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSKKGS+ A SSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADSE-PGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSSAATSSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVISYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGK VISYHTPAIILIQVYFVAAV A+YIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVISYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
A0A5D3C1D6 Uncharacterized protein4.8e-8190.27Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADSE-PGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSSAATSSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSL LPSNSK HKP+ LTF+TRAADPES  +DSE PGSDGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSKKGS+ A SSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADSE-PGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSSAATSSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVISYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGK VISYHTPAIILIQVYFVAAVAA+YIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVISYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
A0A6J1BZH5 uncharacterized protein LOC1110061195.2e-8389.25Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADSEPGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSSAAT--SSVYLPPVP
        MAAIPSSSLQFPNSL  PSNSKPHK KPLTFVTRAADPE+PAAD EPGSDGDDFE+RLAKVRL+YRSGTGKKAEIRKARKS KGS+A    SSVYLPPVP
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADSEPGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSSAAT--SSVYLPPVP

Query:  LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVISYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        LKEAVSGGLKVEFGFSP+SERINGWIAILGISALVLVELATGKGVI+YHTPAIILIQVYFVAAVAA+Y+K+EKEKVSVWPP+E+KN
Subjt:  LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVISYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
A0A6J1JUJ1 uncharacterized protein LOC1114890221.6e-7989.67Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADSEPGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSSAATSSVYLPPVPLK
        MAAIPSSSLQFPNSLAL SNSKPHKPK LTFV RAADPESPAADSEP SDGDDFEDRLA  RL+ R GTGKKAEIRKARKS+KGS+AA SSVYLPPVPLK
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADSEPGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSSAATSSVYLPPVPLK

Query:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVISYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILG+ ALVLVELATGKGVI+YHTPAIILIQ YFVAA AALYIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVISYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G12345.1 unknown protein5.3e-4863.51Show/hide
Query:  TRAADPESPAADSEPGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSSAATSSVYLPPVPLKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISAL
        T    P+     SE G+D D FE RL+ +RLRYRSGTGKKAE+RK++K   GS +  + +YLPPV LKEAVSGGLKVE GFSP+SERING IA LG++AL
Subjt:  TRAADPESPAADSEPGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSSAATSSVYLPPVPLKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISAL

Query:  VLVELATGKGVISYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPD
        +LVELATGK V++YHTP+++ +Q+YFVAAV+A+++K EKEKVSVWP D
Subjt:  VLVELATGKGVISYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPD

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCCATTCCATCTTCCTCACTGCAATTCCCCAACTCTCTCGCACTTCCTTCCAATTCAAAGCCTCACAAGCCGAAGCCTCTCACCTTCGTAACCAGAGCAGCAGA
TCCGGAATCTCCTGCCGCCGACTCAGAACCTGGATCGGATGGCGACGATTTCGAGGACCGACTGGCCAAGGTCCGACTCCGATACCGAAGTGGAACAGGAAAAAAGGCAG
AGATACGGAAGGCAAGGAAGTCCAAGAAAGGATCGAGCGCCGCCACCTCGTCGGTGTACCTACCGCCAGTGCCGCTAAAGGAGGCGGTTTCCGGCGGACTTAAAGTGGAA
TTCGGATTCAGTCCGTACAGCGAGAGGATCAATGGATGGATTGCGATACTTGGAATATCGGCGCTGGTTCTGGTGGAATTGGCTACTGGAAAAGGCGTCATTAGTTACCA
TACGCCGGCGATTATACTGATTCAAGTGTATTTTGTAGCGGCGGTTGCTGCTCTGTATATCAAATACGAGAAGGAGAAGGTTAGCGTTTGGCCACCGGATGAAATAAAAA
ATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGGCCATTCCATCTTCCTCACTGCAATTCCCCAACTCTCTCGCACTTCCTTCCAATTCAAAGCCTCACAAGCCGAAGCCTCTCACCTTCGTAACCAGAGCAGCAGA
TCCGGAATCTCCTGCCGCCGACTCAGAACCTGGATCGGATGGCGACGATTTCGAGGACCGACTGGCCAAGGTCCGACTCCGATACCGAAGTGGAACAGGAAAAAAGGCAG
AGATACGGAAGGCAAGGAAGTCCAAGAAAGGATCGAGCGCCGCCACCTCGTCGGTGTACCTACCGCCAGTGCCGCTAAAGGAGGCGGTTTCCGGCGGACTTAAAGTGGAA
TTCGGATTCAGTCCGTACAGCGAGAGGATCAATGGATGGATTGCGATACTTGGAATATCGGCGCTGGTTCTGGTGGAATTGGCTACTGGAAAAGGCGTCATTAGTTACCA
TACGCCGGCGATTATACTGATTCAAGTGTATTTTGTAGCGGCGGTTGCTGCTCTGTATATCAAATACGAGAAGGAGAAGGTTAGCGTTTGGCCACCGGATGAAATAAAAA
ATTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPKPLTFVTRAADPESPAADSEPGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSSAATSSVYLPPVPLKEAVSGGLKVE
FGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVISYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN