; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10022549 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10022549
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionExtensin like
Genome locationChr05:25411078..25411506
RNA-Seq ExpressionHG10022549
SyntenyHG10022549
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAF3452552.1 hypothetical protein FNV43_RR02985 [Rhamnella rubrinervis]3.8e-1162.96Show/hide
Query:  TYKVTPLPPPKKDKYDHSPPPPPTKYEYKSPPPPPPKKDKYDLPPLPPTKYKYKSPPPPPPKKDKYDSPLTPPTKYDYKSP
        +YK  P PPP   KY +  PPPP KY YKSPPPPP  K  Y  PP PP KY YKSPPPPPPK   Y SP  PP KY YKSP
Subjt:  TYKVTPLPPPKKDKYDHSPPPPPTKYEYKSPPPPPPKKDKYDLPPLPPTKYKYKSPPPPPPKKDKYDSPLTPPTKYDYKSP

XP_007019457.2 PREDICTED: extensin [Theobroma cacao]1.7e-1160.71Show/hide
Query:  YKVTPLPPPKKDKYDH---SPPPPPTKYEYKSPPPPPPKKDKYDLPPLPPTKYKYKSPPPPPPKKD-KYDSPLTPPTKYDYKSP
        YK  P PPP   K+ +   SPPPPP  Y+YKSPPPPP +  KY  PP PP  YKYKSPPPPPPK+  KY SP  PP  Y YKSP
Subjt:  YKVTPLPPPKKDKYDH---SPPPPPTKYEYKSPPPPPPKKDKYDLPPLPPTKYKYKSPPPPPPKKD-KYDSPLTPPTKYDYKSP

XP_022039692.1 extensin-3-like [Helianthus annuus]5.8e-1266.67Show/hide
Query:  YKVTPLPPPKKDKYDHSPPPPPTK--YEYKSPPPPPPKKD-KYDLPPLPPTK--YKYKSPPPPPPKKD-KYDSPLTPPTK-YDYKSP
        YK  P PPPKK  Y  SPPPPP K  YEYKSPPPPPPK   KY  PP PP K  Y+YKSPPPPPPK   KY SP  PP K Y+YKSP
Subjt:  YKVTPLPPPKKDKYDHSPPPPPTK--YEYKSPPPPPPKKD-KYDLPPLPPTK--YKYKSPPPPPPKKD-KYDSPLTPPTK-YDYKSP

XP_039023264.1 extensin-like isoform X4 [Hibiscus syriacus]1.3e-1162.2Show/hide
Query:  YKVTPLPPPKKDKYDH-SPPPPPTKYEYKSPPPPPPKKDKYDLPPLPPTKYKYKSPPPPPPKKD-KYDSPLTPPTKYDYKSP
        YK    PPP K+ Y + SPPPPP  Y+YKSPPPPP +  KY  PP PP  YKYKSPPPPPPK+  KY SP  PP  Y YKSP
Subjt:  YKVTPLPPPKKDKYDH-SPPPPPTKYEYKSPPPPPPKKDKYDLPPLPPTKYKYKSPPPPPPKKD-KYDSPLTPPTKYDYKSP

XP_039023272.1 extensin-like isoform X11 [Hibiscus syriacus]1.3e-1162.2Show/hide
Query:  YKVTPLPPPKKDKYDH-SPPPPPTKYEYKSPPPPPPKKDKYDLPPLPPTKYKYKSPPPPPPKKD-KYDSPLTPPTKYDYKSP
        YK    PPP K+ Y + SPPPPP  Y+YKSPPPPP +  KY  PP PP  YKYKSPPPPPPK+  KY SP  PP  Y YKSP
Subjt:  YKVTPLPPPKKDKYDH-SPPPPPTKYEYKSPPPPPPKKDKYDLPPLPPTKYKYKSPPPPPPKKD-KYDSPLTPPTKYDYKSP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A2P5CD94 Uncharacterized protein5.3e-1145.28Show/hide
Query:  YKVTPLPPPKKDKYDHSPPPPPTKYEYKSPPP-------PPPKKDKYDLPPLPPTKYKYKSPPPPPPKKD-KYDSPLTPP-TKYDYKSPLQYHGQRNRLL
        Y  +P PPP   K   SPPPPP +Y YKSPPP       PPP    Y  PP PP K  YKSPPPPPPK D  Y SP  PP   YDYKSP       + LL
Subjt:  YKVTPLPPPKKDKYDHSPPPPPTKYEYKSPPP-------PPPKKDKYDLPPLPPTKYKYKSPPPPPPKKD-KYDSPLTPP-TKYDYKSPLQYHGQRNRLL

Query:  HYCQKIGLLHHRHIR--SLLHHH-------------------RRETDTSRLLHHNPLTT
        H      LLHH H+   +LLHHH                    R T T+RLLHH    T
Subjt:  HYCQKIGLLHHRHIR--SLLHHH-------------------RRETDTSRLLHHNPLTT

A0A2R6R2L8 Extensin like4.1e-1160.44Show/hide
Query:  YKVTPLPPPKKDKYDHSPPPPPTKYEYKSPPPPPPKKDKYDLPPLPPTK----------YKYKSPPPPPPKKD-KYDSPLTPPTKYDYKSP
        YK  P PPPKK     SPPPPP  Y+YKSPPPPP K  KY  PP PP K          YKYKSPPPPPPKK  KY SP  PP  Y YKSP
Subjt:  YKVTPLPPPKKDKYDHSPPPPPTKYEYKSPPPPPPKKDKYDLPPLPPTK----------YKYKSPPPPPPKKD-KYDSPLTPPTKYDYKSP

A0A4V3WQ10 Uncharacterized protein6.9e-1159.55Show/hide
Query:  TPLPPPKKDKYDHSPPPPPTKYEYKSPPPPPPKKD-----------KYDLPPLPPTKYKYKSPPPPPPKKD-KYDSPLTPPTKYDYKSP
        +P PPP   KY   PPPPP  Y+YKSPPPPPPKK            KY  PP PP  YKYKSPPPPPPKK  KY SP  PP  Y YKSP
Subjt:  TPLPPPKKDKYDHSPPPPPTKYEYKSPPPPPPKKD-----------KYDLPPLPPTKYKYKSPPPPPPKKD-KYDSPLTPPTKYDYKSP

A0A5J5BUT1 Uncharacterized protein1.5e-1062.07Show/hide
Query:  YKVTPLPPPKKDKYDHSPPPPPTK-YEYKSPPPPPPKKD-KYDLPPLPPTK--YKYKSPPPPPPKKD-KYDSPLTPPTK--YDYKSP
        YK    PPP K+ Y +  PPPPT  Y+YKSPPPPPPK+  KY  PP PP K  YKYKSPPPPPPK+  KY SP  PP K  Y YKSP
Subjt:  YKVTPLPPPKKDKYDHSPPPPPTK-YEYKSPPPPPPKKD-KYDLPPLPPTK--YKYKSPPPPPPKKD-KYDSPLTPPTK--YDYKSP

A0A5J5BV08 Uncharacterized protein6.9e-1157.29Show/hide
Query:  YKVTPLPPPKKDKYDHSPPPPPTKYEYKSPPPPPPKKD-------------KYDLPPLPPTKYKYKSPPPPPPKKD-KYDSPLTPPTK--YDYKSP
        YK  P PPPKK  Y  SPPPP   Y+YKSPPPPPPKK              KY  PP P   YKYKSPPPPPPK+  KY SP  PP K  Y YKSP
Subjt:  YKVTPLPPPKKDKYDHSPPPPPTKYEYKSPPPPPPKKD-------------KYDLPPLPPTKYKYKSPPPPPPKKD-KYDSPLTPPTK--YDYKSP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P06599 Extensin9.4e-0545.19Show/hide
Query:  PPPKKDKYDHSPPPPPTKYEYKSPPPP-----PPKKDKYDLPPLPPTKYKYKSPP----------------PPPPK---------KDKYDSPLTPPTKYD
        PPP K    HSPPPP   Y+YKSPPPP     P    KY  PP P   YKYKSPP                PPPPK         K KY SP  P   Y 
Subjt:  PPPKKDKYDHSPPPPPTKYEYKSPPPP-----PPKKDKYDLPPLPPTKYKYKSPP----------------PPPPK---------KDKYDSPLTPPTKYD

Query:  YKSP
        YKSP
Subjt:  YKSP

Q9FLQ7 Formin-like protein 203.6e-0447.3Show/hide
Query:  TYKVTPLPPPKKDKYDHSPPPPPTKYEYKSPPPPPPKKDKY-DLPPLPPTKYKYKSPPPPPPKKDKYDSPLTPP
        +Y   P PPP    Y   PPPPP    Y SPPPPPP    Y   PP PP    Y SPPPPPP    + S + PP
Subjt:  TYKVTPLPPPKKDKYDHSPPPPPTKYEYKSPPPPPPKKDKY-DLPPLPPTKYKYKSPPPPPPKKDKYDSPLTPP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G21310.1 extensin 32.1e-0441.67Show/hide
Query:  PPPKKDKYDHSPPPPPTKYEYKSPPPP-----PPKKDKYDLPPLPPTKYKYKSPPP-------------PPPKKDKYDSPLTPPTKYDYKSPLQYHGQRN
        PPP      HSPPPP   YEYKSPPPP     PP    Y  PP P   Y YKSPPP             PPP K  Y     PP    Y  P  YH    
Subjt:  PPPKKDKYDHSPPPPPTKYEYKSPPPP-----PPKKDKYDLPPLPPTKYKYKSPPP-------------PPPKKDKYDSPLTPPTKYDYKSPLQYHGQRN

Query:  RLLHYCQK
           HY  K
Subjt:  RLLHYCQK

AT1G26240.1 Proline-rich extensin-like family protein5.6e-0552.44Show/hide
Query:  TPLPPPKKDKYDHSPP-----PPPTKYEYKSPPPPPPKKDKYDLPPLPPTKYKYKSPPPPPPKKDKYDSPLTPPTKYDYKSP
        +P PPP   K    PP     PPP+ Y YKSPPPPP     Y  PP PP  Y YKSPPPPP     Y SP  PP  Y YKSP
Subjt:  TPLPPPKKDKYDHSPP-----PPPTKYEYKSPPPPPPKKDKYDLPPLPPTKYKYKSPPPPPPKKDKYDSPLTPPTKYDYKSP

AT1G26250.1 Proline-rich extensin-like family protein2.5e-0555.84Show/hide
Query:  TPLPPPKKDKYDHSPPPPPTKYEYKSPPPPPPKKDKYDLPPLPPTKYKYKSPPPPPPKKDKYDSPLTPPTKYDYKSP
        +P PPP    Y +SPPPPP  Y Y+SPPPPP     Y  PP PP  Y YKSPPPPP     Y SP  PP  Y YKSP
Subjt:  TPLPPPKKDKYDHSPPPPPTKYEYKSPPPPPPKKDKYDLPPLPPTKYKYKSPPPPPPKKDKYDSPLTPPTKYDYKSP

AT4G08370.1 Proline-rich extensin-like family protein1.3e-0456.76Show/hide
Query:  PPPKKDKYDHSPPPPPTKYEYKSPPPPPPKKDKYDLPPLPPTKYKYKSPPPPPPKKDKYDSPLTPPTKYDYKSP
        PPP    Y  SPPPPP  Y Y SPPPPPP    Y+ PP PP  Y YKSPPPPP     Y SP  PP  Y Y SP
Subjt:  PPPKKDKYDHSPPPPPTKYEYKSPPPPPPKKDKYDLPPLPPTKYKYKSPPPPPPKKDKYDSPLTPPTKYDYKSP

AT5G07740.1 actin binding2.5e-0547.3Show/hide
Query:  TYKVTPLPPPKKDKYDHSPPPPPTKYEYKSPPPPPPKKDKY-DLPPLPPTKYKYKSPPPPPPKKDKYDSPLTPP
        +Y   P PPP    Y   PPPPP    Y SPPPPPP    Y   PP PP    Y SPPPPPP    + S + PP
Subjt:  TYKVTPLPPPKKDKYDHSPPPPPTKYEYKSPPPPPPKKDKY-DLPPLPPTKYKYKSPPPPPPKKDKYDSPLTPP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGCACTTATAAAGTCACCCCCCTACCACCACCAAAAAAAGACAAATATGATCACTCGCCTCCACCGCCACCAACTAAGTACGAATACAAGTCACCCCCTCCACCGCC
ACCAAAGAAAGACAAATATGACTTGCCTCCACTACCACCAACTAAGTACAAGTACAAGTCACCCCCTCCACCCCCACCAAAAAAAGACAAATATGATTCGCCTCTAACAC
CACCAACTAAGTACGATTACAAGTCACCCCTCCAGTACCATGGTCAAAGAAATCGCCTCCTCCACTACTGCCAAAAAATTGGCCTTCTCCACCACCGTCACATAAGAAGT
CTCCTCCACCACCACCGAAGAGAGACAGATACAAGTCGTCTCCTCCACCACAATCCCCTTACAACTATTAGGTCAACAAGGGCTTCTCATCAACTATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGCACTTATAAAGTCACCCCCCTACCACCACCAAAAAAAGACAAATATGATCACTCGCCTCCACCGCCACCAACTAAGTACGAATACAAGTCACCCCCTCCACCGCC
ACCAAAGAAAGACAAATATGACTTGCCTCCACTACCACCAACTAAGTACAAGTACAAGTCACCCCCTCCACCCCCACCAAAAAAAGACAAATATGATTCGCCTCTAACAC
CACCAACTAAGTACGATTACAAGTCACCCCTCCAGTACCATGGTCAAAGAAATCGCCTCCTCCACTACTGCCAAAAAATTGGCCTTCTCCACCACCGTCACATAAGAAGT
CTCCTCCACCACCACCGAAGAGAGACAGATACAAGTCGTCTCCTCCACCACAATCCCCTTACAACTATTAGGTCAACAAGGGCTTCTCATCAACTATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSTYKVTPLPPPKKDKYDHSPPPPPTKYEYKSPPPPPPKKDKYDLPPLPPTKYKYKSPPPPPPKKDKYDSPLTPPTKYDYKSPLQYHGQRNRLLHYCQKIGLLHHRHIRS
LLHHHRRETDTSRLLHHNPLTTIRSTRASHQL