; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10022856 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10022856
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionR3H-assoc domain-containing protein
Genome locationChr05:29009098..29012609
RNA-Seq ExpressionHG10022856
SyntenyHG10022856
Gene Ontology termsGO:0009058 - biosynthetic process (biological process)
GO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
GO:0003824 - catalytic activity (molecular function)
InterPro domainsIPR025952 - R3H-associated N-terminal domain
IPR036867 - R3H domain superfamily
IPR039629 - R3H domain-containing protein 4


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008451376.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103492685 [Cucumis melo]1.7e-12390.73Show/hide
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XP_023548227.1 uncharacterized protein LOC111806930 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-12388.31Show/hide
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XP_038896192.1 R3H domain-containing protein 4 [Benincasa hispida]2.6e-13295.56Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K5V5 R3H-assoc domain-containing protein3.5e-12791.94Show/hide
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A0A1S3BS51 uncharacterized protein LOC1034926858.1e-12490.73Show/hide
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A0A6J1DA21 uncharacterized protein LOC111018421 isoform X12.1e-12489.92Show/hide
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A0A6J1HB10 R3H domain-containing protein 4-like4.0e-12387.5Show/hide
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A0A6J1KSN3 R3H domain-containing protein 4-like1.5e-12287.1Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2KIL7 R3H domain-containing protein 42.8e-0427.97Show/hide
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        W+ F +   +++ +++   E+   S A+R+G    +       A+     ++RI  R R  L+RS +P E +E +EE +  F S    + V T  + + F
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Query:  HRLLLHGVCEFYNLDSVT
         RLLLH +C++ +L S +
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Q4VBF2 R3H domain-containing protein 42.8e-0438.24Show/hide
Query:  WRRIECRTREALRRSFLP-ELVEGFEECIRSFISETGKEDVLTLRVQDPFHRLLLHGVCEFYNLDSVT
        +RRI  R R  L+RS +P E +E +EE + +F S    + V T  + + + RLLLH VC++ +L S +
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Q96D70 R3H domain-containing protein 49.6e-0525.41Show/hide
Query:  LTGKVTNRKS-RRWLNDRLLMEL------VPRLNAEEIRGLFAPPPWGDDVRPTTFSMIDAGDWDKFRSIDMDKEAKIIGVFEN---SSAKRKG------
        L  K   RKS +R  N + L+ L      +P L   ++    +P  + +     T+  +    W+ F +   +++ +++   E+   S A+R+G      
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Query:  -HIDADKMAFLNAWRRIECRTREALRRSFLP-ELVEGFEECIRSFISETGKEDVLTLRVQDPFHRLLLHGVCEFYNLDSVT
           +         ++RI  R R  L+RS +P E +E +EE +  F S    + V T  + + F RLLLH VC++ +L S +
Subjt:  -HIDADKMAFLNAWRRIECRTREALRRSFLP-ELVEGFEECIRSFISETGKEDVLTLRVQDPFHRLLLHGVCEFYNLDSVT

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G03250.1 unknown protein9.3e-8863.2Show/hide
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        MA+T+V++R+E     S L DP  GD   SRG+S+EKKIE LESL G+V+NR+SRRWLNDR+LMELVPRL+A+EIRGLFAPPPWGDDV P+ FS+ + G+
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        WDKFR+IDMDKEA I+     SS ++KG +D DK+A LNAWRRI+CRTR+ALRRSFLPEL+EG+E CI  FI E G+ DVL L+VQDPFHRLLLHGVCE+
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        +NL S T  E     ++K T I  KK   + E P+I+L HFL+MSKEG W
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AT1G03250.2 unknown protein8.7e-8661.72Show/hide
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        MA+T+V++R+E     S L DP  GD   SRG+S+EKKIE LESL G+V+NR+SRRWLNDR+LMELVPRL+A+EIRGLFAPPPWGDDV P+ FS+ + G+
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        HGVCE++NL S T  E     ++K T I  KK   + E P+I+L HFL+MSKEG W
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGTCCACCGATGTTCTTAAACGAGAAGAGAATCGCTTCACCTTTTCCCCTCTCAACGATCCACTCAATGGTGATCCGGATTCTCGGGGTATGTCAATCGAGAAGAA
GATAGAATTTTTGGAGAGCTTGACTGGGAAGGTTACCAATAGGAAGTCTCGCAGATGGTTAAATGATCGTCTTTTGATGGAGCTTGTTCCTCGTTTGAATGCTGAAGAAA
TTAGAGGCTTGTTTGCTCCACCACCTTGGGGTGATGATGTACGGCCCACAACGTTCTCCATGATTGATGCAGGAGACTGGGACAAGTTCAGGAGTATTGACATGGATAAA
GAGGCTAAGATCATTGGAGTCTTCGAGAACTCATCTGCTAAGAGAAAGGGTCATATTGATGCAGACAAAATGGCTTTCTTGAATGCCTGGCGCAGAATTGAGTGTCGAAC
GAGAGAGGCGCTTCGCCGTAGTTTTCTTCCAGAGCTTGTTGAAGGTTTTGAGGAGTGCATAAGATCATTCATTTCAGAAACTGGTAAAGAAGATGTCTTAACGTTGCGGG
TTCAAGATCCTTTTCACAGATTATTGCTACATGGAGTTTGTGAGTTCTACAATTTGGACTCTGTGACTGTTCCCGAGTTGAAGAATGGTGGCTCTATAAAGATGACTCGG
ATAACAAGGAAGAAGAAGGCCGCGGTTGAGGTCCCAAATATAACTCTGACCCATTTCCTTAAAATGTCGAAAGAAGGAACATGGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGTCCACCGATGTTCTTAAACGAGAAGAGAATCGCTTCACCTTTTCCCCTCTCAACGATCCACTCAATGGTGATCCGGATTCTCGGGGTATGTCAATCGAGAAGAA
GATAGAATTTTTGGAGAGCTTGACTGGGAAGGTTACCAATAGGAAGTCTCGCAGATGGTTAAATGATCGTCTTTTGATGGAGCTTGTTCCTCGTTTGAATGCTGAAGAAA
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GAGAGAGGCGCTTCGCCGTAGTTTTCTTCCAGAGCTTGTTGAAGGTTTTGAGGAGTGCATAAGATCATTCATTTCAGAAACTGGTAAAGAAGATGTCTTAACGTTGCGGG
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ATAACAAGGAAGAAGAAGGCCGCGGTTGAGGTCCCAAATATAACTCTGACCCATTTCCTTAAAATGTCGAAAGAAGGAACATGGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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EAKIIGVFENSSAKRKGHIDADKMAFLNAWRRIECRTREALRRSFLPELVEGFEECIRSFISETGKEDVLTLRVQDPFHRLLLHGVCEFYNLDSVTVPELKNGGSIKMTR
ITRKKKAAVEVPNITLTHFLKMSKEGTW