; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

HG10023036 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome

Gene IDHG10023036
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationChr05:30653832..30657615
RNA-Seq ExpressionHG10023036
SyntenyHG10023036
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0046709.1 putative transmembrane protein [Cucumis melo var. makuwa]1.4e-6579.68Show/hide
Query:  RPTISKSNFMGIIVSIDDQKNSTEIDLEFVGLSRKTLGDLDKNLEGEDDHEVFAHMEKNNARGKHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMK
        R   S SNF   +  I        I  E +GL       +DKNLEGEDDHEVFAHMEK+NARGKHKNKKKA KPPRPPKGPSLDAADRMMVKE+AVLAMK
Subjt:  RPTISKSNFMGIIVSIDDQKNSTEIDLEFVGLSRKTLGDLDKNLEGEDDHEVFAHMEKNNARGKHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMK

Query:  KRARVERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVIIIQGISSRSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPPNESNVSNPSS
        KRAR ERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVIIIQGIS RSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPP+ES+VSNP S
Subjt:  KRARVERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVIIIQGISSRSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPPNESNVSNPSS

TYK18245.1 putative transmembrane protein [Cucumis melo var. makuwa]1.5e-6479.89Show/hide
Query:  RPTISKSNFMGIIVSIDDQKNSTEIDLEFVGLSRKTLGDLDKNLEGEDDHEVFAHMEKNNARGKHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMK
        R   S SNF   +  I        I  E +GL       +DKNLEGEDDHEVFAHMEK+NARGKHKNKKKA KPPRPPKGPSLDAADRMMVKE+AVLAMK
Subjt:  RPTISKSNFMGIIVSIDDQKNSTEIDLEFVGLSRKTLGDLDKNLEGEDDHEVFAHMEKNNARGKHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMK

Query:  KRARVERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVIIIQGISSRSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPPNESNVSN
        KRAR ERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVIIIQGIS RSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPP+ES+VSN
Subjt:  KRARVERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVIIIQGISSRSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPPNESNVSN

XP_008451449.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103492741 [Cucumis melo]5.2e-6579.14Show/hide
Query:  RPTISKSNFMGIIVSIDDQKNSTEIDLEFVGLSRKTLGDLDKNLEGEDDHEVFAHMEKNNARGKHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMK
        R   S SNF   +  I        I  E +GL       ++KNLEGEDDHEVFAHMEK+NARGKHKNKKKA KPPRPPKGPSLDAADRMMVKE+AVLAMK
Subjt:  RPTISKSNFMGIIVSIDDQKNSTEIDLEFVGLSRKTLGDLDKNLEGEDDHEVFAHMEKNNARGKHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMK

Query:  KRARVERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVIIIQGISSRSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPPNESNVSNPSS
        KRAR ERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVIIIQGIS RSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPP+ES+VSNP S
Subjt:  KRARVERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVIIIQGISSRSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPPNESNVSNPSS

XP_031744965.1 uncharacterized protein LOC101218752 [Cucumis sativus]2.1e-6694.59Show/hide
Query:  LDKNLEGEDDHEVFAHMEKNNARGKHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMKKRARVERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVI
        +DKNLEGED HEVF H+EKNNARGKHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKE+AVLAMKKRAR ERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVI
Subjt:  LDKNLEGEDDHEVFAHMEKNNARGKHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMKKRARVERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVI

Query:  IIQGISSRSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPPNESNVSNPSS
        IIQGIS RSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPPNESNVSNP S
Subjt:  IIQGISSRSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPPNESNVSNPSS

XP_038898210.1 uncharacterized protein LOC120085950 [Benincasa hispida]2.3e-6895.95Show/hide
Query:  LDKNLEGEDDHEVFAHMEKNNARGKHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMKKRARVERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVI
        +DKNLEGEDDHEVF HMEKNNARGKHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMKKRAR ERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPA+IITFLFFLVI
Subjt:  LDKNLEGEDDHEVFAHMEKNNARGKHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMKKRARVERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVI

Query:  IIQGISSRSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPPNESNVSNPSS
        IIQGISSRSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPPNESN+SNP S
Subjt:  IIQGISSRSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPPNESNVSNPSS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K5U6 Uncharacterized protein1.4e-6385.37Show/hide
Query:  LDKNLEGEDDHEVFAHMEKNNARGKHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMKKRARVERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVI
        +DKNLEGED HEVF H+EKNNARGKHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKE+AVLAMKKRAR ERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVI
Subjt:  LDKNLEGEDDHEVFAHMEKNNARGKHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMKKRARVERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVI

Query:  IIQ----------------GISSRSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPPNESNVSNPSS
        IIQ                GIS RSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPPNESNVSNP S
Subjt:  IIQ----------------GISSRSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPPNESNVSNPSS

A0A1S4DYQ5 uncharacterized protein LOC1034927412.5e-6579.14Show/hide
Query:  RPTISKSNFMGIIVSIDDQKNSTEIDLEFVGLSRKTLGDLDKNLEGEDDHEVFAHMEKNNARGKHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMK
        R   S SNF   +  I        I  E +GL       ++KNLEGEDDHEVFAHMEK+NARGKHKNKKKA KPPRPPKGPSLDAADRMMVKE+AVLAMK
Subjt:  RPTISKSNFMGIIVSIDDQKNSTEIDLEFVGLSRKTLGDLDKNLEGEDDHEVFAHMEKNNARGKHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMK

Query:  KRARVERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVIIIQGISSRSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPPNESNVSNPSS
        KRAR ERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVIIIQGIS RSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPP+ES+VSNP S
Subjt:  KRARVERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVIIIQGISSRSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPPNESNVSNPSS

A0A5A7TZQ1 Putative transmembrane protein6.6e-6679.68Show/hide
Query:  RPTISKSNFMGIIVSIDDQKNSTEIDLEFVGLSRKTLGDLDKNLEGEDDHEVFAHMEKNNARGKHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMK
        R   S SNF   +  I        I  E +GL       +DKNLEGEDDHEVFAHMEK+NARGKHKNKKKA KPPRPPKGPSLDAADRMMVKE+AVLAMK
Subjt:  RPTISKSNFMGIIVSIDDQKNSTEIDLEFVGLSRKTLGDLDKNLEGEDDHEVFAHMEKNNARGKHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMK

Query:  KRARVERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVIIIQGISSRSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPPNESNVSNPSS
        KRAR ERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVIIIQGIS RSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPP+ES+VSNP S
Subjt:  KRARVERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVIIIQGISSRSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPPNESNVSNPSS

A0A5D3D3X4 Putative transmembrane protein7.3e-6579.89Show/hide
Query:  RPTISKSNFMGIIVSIDDQKNSTEIDLEFVGLSRKTLGDLDKNLEGEDDHEVFAHMEKNNARGKHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMK
        R   S SNF   +  I        I  E +GL       +DKNLEGEDDHEVFAHMEK+NARGKHKNKKKA KPPRPPKGPSLDAADRMMVKE+AVLAMK
Subjt:  RPTISKSNFMGIIVSIDDQKNSTEIDLEFVGLSRKTLGDLDKNLEGEDDHEVFAHMEKNNARGKHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMK

Query:  KRARVERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVIIIQGISSRSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPPNESNVSN
        KRAR ERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVIIIQGIS RSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPP+ES+VSN
Subjt:  KRARVERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVIIIQGISSRSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPPNESNVSN

A0A6J1JVV1 uncharacterized protein LOC1114883458.4e-6187.67Show/hide
Query:  LDKNLEGEDDHEVFAHMEKNNARGKHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMKKRARVERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVI
        +DKNLEGEDD E FAH+EK NARGKHKNKKKA KPPRPPKGPSLDAADR +VKEIAV+AMKKRARVERMKAL+K+KAEKTSSFNSCIPA+IITFLFFLVI
Subjt:  LDKNLEGEDDHEVFAHMEKNNARGKHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMKKRARVERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVI

Query:  IIQGISSRSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPPNESNVSNP
        I+QGISSRSS +LQGSPEPAV GSSGFISVQYIKSFPPNESN++NP
Subjt:  IIQGISSRSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPPNESNVSNP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02380.1 unknown protein2.9e-2143.45Show/hide
Query:  GLSRKTLGDL------DKNLEGEDDHEVFAHMEKNNARGKHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMKKRARVERM-KALKKAKAEKTSSFN
        G+S K   DL      D+N   E   +     EK    GK K  +KA KPPRPPKGPSL   DR ++++I  LAM+KRAR+ERM K+LK+ KA KTS  +
Subjt:  GLSRKTLGDL------DKNLEGEDDHEVFAHMEKNNARGKHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMKKRARVERM-KALKKAKAEKTSSFN

Query:  SCIP--ALIITFLFFLVIIIQGISSRSSSI-LQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPPNESNVSNPSSS
         CI   ++IIT +FF  ++ QG S+ SSS+    SP P V  ++  ISVQ+   F P E    +P++S
Subjt:  SCIP--ALIITFLFFLVIIIQGISSRSSSI-LQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPPNESNVSNPSSS

AT3G17120.1 unknown protein1.6e-1947.33Show/hide
Query:  KHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMKKRARVERMKALKKAKAEKTSSFNSC---IPALIITFLFFLVIIIQGISSRSSSILQGSPEPAV
        K K KK A KPPRPP+GPSLDAAD+ +++EIA LAM KRAR+ERM+ALKK++A K +S  S    + A + T +FF V++ QG+S R++    G     V
Subjt:  KHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMKKRARVERMKALKKAKAEKTSSFNSC---IPALIITFLFFLVIIIQGISSRSSSILQGSPEPAV

Query:  GG--SSGFISVQYIKSFPPNESNVSNPSSSK
         G  + GF+SVQY            NPS+S+
Subjt:  GG--SSGFISVQYIKSFPPNESNVSNPSSSK

AT3G17120.2 unknown protein1.6e-1947.33Show/hide
Query:  KHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMKKRARVERMKALKKAKAEKTSSFNSC---IPALIITFLFFLVIIIQGISSRSSSILQGSPEPAV
        K K KK A KPPRPP+GPSLDAAD+ +++EIA LAM KRAR+ERM+ALKK++A K +S  S    + A + T +FF V++ QG+S R++    G     V
Subjt:  KHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMKKRARVERMKALKKAKAEKTSSFNSC---IPALIITFLFFLVIIIQGISSRSSSILQGSPEPAV

Query:  GG--SSGFISVQYIKSFPPNESNVSNPSSSK
         G  + GF+SVQY            NPS+S+
Subjt:  GG--SSGFISVQYIKSFPPNESNVSNPSSSK

AT4G01960.1 unknown protein3.5e-1944.44Show/hide
Query:  KHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMKKRARVERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVIIIQGISSRSSSI-LQGSPEPAVGG
        K K  +K  KPPRPPKGP L A D+ +++EI  LAM+KRAR+ERMK L++ KA K+SS  S I A+I+T +FF+ +I QG  + ++S+    SP P    
Subjt:  KHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMKKRARVERMKALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVIIIQGISSRSSSI-LQGSPEPAVGG

Query:  SSGFISVQYIKSFPPNESNVSNPSSS
        ++  +SVQ+   F P E    +P++S
Subjt:  SSGFISVQYIKSFPPNESNVSNPSSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCGGCCGACGATTTCAAAATCAAATTTCATGGGAATTATTGTTTCCATTGATGATCAGAAGAACAGTACCGAAATCGATTTGGAATTTGTCGGTCTGAGCAGGAAAAC
GCTTGGAGATTTGGATAAGAATTTGGAAGGGGAAGATGATCATGAAGTTTTTGCGCATATGGAGAAAAATAATGCTAGAGGGAAGCATAAGAATAAGAAAAAGGCTCCAA
AGCCACCACGGCCGCCCAAAGGTCCTTCACTTGATGCCGCTGACCGAATGATGGTGAAGGAAATTGCAGTGCTTGCCATGAAAAAACGTGCAAGAGTTGAGCGAATGAAA
GCATTGAAGAAGGCAAAAGCAGAGAAAACATCCTCTTTCAATAGTTGCATACCTGCCTTGATTATCACATTCCTCTTCTTCCTTGTAATCATCATTCAAGGAATAAGCTC
CAGAAGCAGTTCGATATTGCAGGGGTCGCCTGAACCTGCTGTTGGTGGTAGTAGCGGTTTCATATCCGTTCAGTACATTAAAAGCTTTCCCCCGAATGAAAGCAATGTAT
CCAATCCCTCCTCGTCTAAAGTTATGATGATATTATTGGCTGATGCTCATCCCTCTACACTTTTGGACATATCCAATCCCGTTCATCGAGGACAAACAGAGTTGAGAGCT
TCAACAAGACAGACTGATCCTGTGGTGAAGCTATGTCTAGCTGCCTGCGATGTGCTGAGTTGTAACCGCTACGACGATCCAATGCTCAATGGGGCATCTTATGTCGAAGG
AGTACAAGATTGCAATTCCGTGGATGTAGCTCGGAAGGTCGAGGCTTGCAAAGGAGCCATTCAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCGGCCGACGATTTCAAAATCAAATTTCATGGGAATTATTGTTTCCATTGATGATCAGAAGAACAGTACCGAAATCGATTTGGAATTTGTCGGTCTGAGCAGGAAAAC
GCTTGGAGATTTGGATAAGAATTTGGAAGGGGAAGATGATCATGAAGTTTTTGCGCATATGGAGAAAAATAATGCTAGAGGGAAGCATAAGAATAAGAAAAAGGCTCCAA
AGCCACCACGGCCGCCCAAAGGTCCTTCACTTGATGCCGCTGACCGAATGATGGTGAAGGAAATTGCAGTGCTTGCCATGAAAAAACGTGCAAGAGTTGAGCGAATGAAA
GCATTGAAGAAGGCAAAAGCAGAGAAAACATCCTCTTTCAATAGTTGCATACCTGCCTTGATTATCACATTCCTCTTCTTCCTTGTAATCATCATTCAAGGAATAAGCTC
CAGAAGCAGTTCGATATTGCAGGGGTCGCCTGAACCTGCTGTTGGTGGTAGTAGCGGTTTCATATCCGTTCAGTACATTAAAAGCTTTCCCCCGAATGAAAGCAATGTAT
CCAATCCCTCCTCGTCTAAAGTTATGATGATATTATTGGCTGATGCTCATCCCTCTACACTTTTGGACATATCCAATCCCGTTCATCGAGGACAAACAGAGTTGAGAGCT
TCAACAAGACAGACTGATCCTGTGGTGAAGCTATGTCTAGCTGCCTGCGATGTGCTGAGTTGTAACCGCTACGACGATCCAATGCTCAATGGGGCATCTTATGTCGAAGG
AGTACAAGATTGCAATTCCGTGGATGTAGCTCGGAAGGTCGAGGCTTGCAAAGGAGCCATTCAGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRPTISKSNFMGIIVSIDDQKNSTEIDLEFVGLSRKTLGDLDKNLEGEDDHEVFAHMEKNNARGKHKNKKKAPKPPRPPKGPSLDAADRMMVKEIAVLAMKKRARVERMK
ALKKAKAEKTSSFNSCIPALIITFLFFLVIIIQGISSRSSSILQGSPEPAVGGSSGFISVQYIKSFPPNESNVSNPSSSKVMMILLADAHPSTLLDISNPVHRGQTELRA
STRQTDPVVKLCLAACDVLSCNRYDDPMLNGASYVEGVQDCNSVDVARKVEACKGAIQ