| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6575671.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 3.1e-112 | 89.84 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLFHSSTKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPPHTLLRISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NL HSS KPTEIPQNLSTQFLRPISFHP +TLLR+SP LQTS KR TRLFAVAE AV+ Q SSVAARKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLFHSSTKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPPHTLLRISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
+EHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEKPLVNT+D SLLQA++SQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Subjt: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNAV
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNA+
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNAV
|
|
| XP_022954328.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like isoform X1 [Cucurbita moschata] | 5.2e-112 | 89.84 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLFHSSTKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPPHTLLRISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NL HSS KPTEIPQ LSTQFLRPISFHP +TLLR+SP LQTS KR TRLFAVAEAAV+ Q SSVAARKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLFHSSTKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPPHTLLRISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
+EHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEKPLVNT+D SLLQA++SQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Subjt: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNAV
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNA+
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNAV
|
|
| XP_022954329.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like isoform X2 [Cucurbita moschata] | 5.2e-112 | 89.84 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLFHSSTKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPPHTLLRISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NL HSS KPTEIPQ LSTQFLRPISFHP +TLLR+SP LQTS KR TRLFAVAEAAV+ Q SSVAARKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLFHSSTKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPPHTLLRISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
+EHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEKPLVNT+D SLLQA++SQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Subjt: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNAV
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNA+
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNAV
|
|
| XP_022991923.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like [Cucurbita maxima] | 1.1e-112 | 90.24 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLFHSSTKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPPHTLLRISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NL HSS KPTEIPQNLSTQFLRPISFHP +TLLR+SP LQTS KR TRLFAVAEAAV+ Q SSVAARKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLFHSSTKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPPHTLLRISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
+EHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEKPLVNT+D SLLQA++SQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Subjt: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNAV
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNA+
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNAV
|
|
| XP_023548333.1 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 2.6e-111 | 89.43 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLFHSSTKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPPHTLLRISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NL SS KPTEIPQNLSTQFLRPISFHP +TLLR+SP LQTS KR TRLFAVAEAAV+ Q SSVAARKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLFHSSTKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPPHTLLRISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
+EHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEKPLVNT+D SLLQA++SQFIDSPYKVYVGNISSTVST+TLKNF
Subjt: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNAV
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNA+
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNAV
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3CEQ4 30S ribosomal protein 2, chloroplastic | 1.9e-107 | 87.8 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLFHSSTKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPPHTLLRISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+PTNL H+S KPTEI Q LS+QFLRPISFHPPH LLRISP + PTRLFAVAEAA +QGASSVA RKLYIGNIPRNV+NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLFHSSTKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPPHTLLRISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTV+DANAAIEKLNETEVGGR IKVNITEKP+VNT+D S+LQAE+SQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Subjt: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNAV
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNA+
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNAV
|
|
| A0A5A7UYL6 30S ribosomal protein 2 | 1.9e-107 | 87.8 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLFHSSTKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPPHTLLRISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+PTNL H+S KPTEI Q LS+QFLRPISFHPPH LLRISP + PTRLFAVAEAA +QGASSVA RKLYIGNIPRNV+NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLFHSSTKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPPHTLLRISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTV+DANAAIEKLNETEVGGR IKVNITEKP+VNT+D S+LQAE+SQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Subjt: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNAV
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNA+
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNAV
|
|
| A0A6J1GQT6 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like isoform X1 | 2.5e-112 | 89.84 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLFHSSTKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPPHTLLRISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NL HSS KPTEIPQ LSTQFLRPISFHP +TLLR+SP LQTS KR TRLFAVAEAAV+ Q SSVAARKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLFHSSTKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPPHTLLRISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
+EHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEKPLVNT+D SLLQA++SQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Subjt: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNAV
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNA+
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNAV
|
|
| A0A6J1GSN8 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like isoform X2 | 2.5e-112 | 89.84 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLFHSSTKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPPHTLLRISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NL HSS KPTEIPQ LSTQFLRPISFHP +TLLR+SP LQTS KR TRLFAVAEAAV+ Q SSVAARKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLFHSSTKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPPHTLLRISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
+EHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEKPLVNT+D SLLQA++SQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Subjt: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNAV
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNA+
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNAV
|
|
| A0A6J1JXN0 30S ribosomal protein 2, chloroplastic-like | 5.1e-113 | 90.24 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLFHSSTKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPPHTLLRISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
MASISSIL+P NL HSS KPTEIPQNLSTQFLRPISFHP +TLLR+SP LQTS KR TRLFAVAEAAV+ Q SSVAARKLYIGNIPRNV NEELTRIV
Subjt: MASISSILSPTNLFHSSTKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPPHTLLRISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIV
Query: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
+EHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANA IEKLN+TEVGGRTIKVNITEKPLVNT+D SLLQA++SQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Subjt: QEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNF
Query: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNAV
FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNA+
Subjt: FSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNAV
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P19684 33 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic | 4.1e-27 | 37.21 | Show/hide |
Query: ASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPL--VNTIDTSLLQA
+ SV +LY+GN+P ++ + +L+ I E G V E++YD+ + RSR FAFVTM +V++A AI + ++VGGRT+KVN E P + ++ +++
Subjt: ASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPL--VNTIDTSLLQA
Query: EDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFN
F+DSP+K+YV N+S ++++ L++ F+++ +SAKV + +S G+GF+TFSS E + +A+ + N
Subjt: EDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFN
|
|
| P82277 30S ribosomal protein 2, chloroplastic | 2.4e-67 | 58 | Show/hide |
Query: MASISSILSPTNLF-HSSTKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPPHTLLRISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASS---VAARKLYIGNIPRNVDNEEL
MA+ISSIL L H S+ + S+Q L + L++ + T+ P R E + +S +SS AR+LY+GNIPRN++N+EL
Subjt: MASISSILSPTNLF-HSSTKPTEIPQNLSTQFLRPISFHPPHTLLRISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASS---VAARKLYIGNIPRNVDNEEL
Query: TRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTET
IV+EHGA+E AEVMYDKYSGRSRRF FVTMKTV+DANA IEKLN+TE+GGR IKVNITEKPL +D + QAEDSQF++SPYKVY+GN++ TV+ E
Subjt: TRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTET
Query: LKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNAV
LK+FFSEKGKVL AKV R PGTSKS+G+GFV+FSSEEEVEAAI + NN+V
Subjt: LKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNAV
|
|
| Q08935 29 kDa ribonucleoprotein A, chloroplastic | 1.1e-24 | 38.69 | Show/hide |
Query: KLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSP
K+++GN+P + D+ L + + G VE EV+YDK +GRSR F FVTM + ++ AA ++ N E+ GR ++VN P + + DS
Subjt: KLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSP
Query: YKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNAVSN
+VYVGN++ V + L+ FSE+GKV+ AKV + +S G+GFVT+SS EEV AI S + N
Subjt: YKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNNAVSN
|
|
| Q39061 RNA-binding protein CP33, chloroplastic | 2.2e-28 | 36.26 | Show/hide |
Query: VAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPL--V
V E T+Q + +LY+GN+P + + EL++I E G V +++YDK + RSR F FVTM ++++A A++ N +++GGRT+KVN E P
Subjt: VAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPL--V
Query: NTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFN
N + + ++ + ++DSP+KVY GN+ ++++ LK+ F ++ VL AKV T +S G+GF++F S E V++A+++ N
Subjt: NTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFN
|
|
| Q8VYM4 30S ribosomal protein 2, chloroplastic | 2.5e-64 | 63.86 | Show/hide |
Query: RISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNET
R P T T ++P L SS AAR++YIGNIPR V NE+LT++V+EHGAVEK +VMYDKYSGRSRRF F TMK+V+DANA +EKLN
Subjt: RISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNET
Query: EVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNN
V GR IKVNITEKP+ ++ D S+LQ+EDS F+DSPYKVYVGN++ TV+ E L+N FSEKGKV+SAKVSRVPGTSKS+G+GFVTFSSEE+VEAAI + NN
Subjt: EVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNN
Query: AV
++
Subjt: AV
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G60000.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.1e-27 | 36.49 | Show/hide |
Query: STQFLRPISFHPPHTLLRISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASSV------AARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSR
S Q L +F P LL S + + E GAS+V KLY GN+P NVD+ L +I+Q+ E EV+Y++ +G+SR
Subjt: STQFLRPISFHPPHTLLRISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASSV------AARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSR
Query: RFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKS
FAFVTM V+D N I+ L+ TE GR +KVN +KP N ++ + ++ +K++VGN+S TV++E+L F E G V+ A+V T +S
Subjt: RFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKS
Query: SGYGFVTFSSEEEVEAAISSFN
GYGFV +SS+ E+E A+ S +
Subjt: SGYGFVTFSSEEEVEAAISSFN
|
|
| AT3G52150.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.8e-65 | 63.86 | Show/hide |
Query: RISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNET
R P T T ++P L SS AAR++YIGNIPR V NE+LT++V+EHGAVEK +VMYDKYSGRSRRF F TMK+V+DANA +EKLN
Subjt: RISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNET
Query: EVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNN
V GR IKVNITEKP+ ++ D S+LQ+EDS F+DSPYKVYVGN++ TV+ E L+N FSEKGKV+SAKVSRVPGTSKS+G+GFVTFSSEE+VEAAI + NN
Subjt: EVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNN
Query: AV
++
Subjt: AV
|
|
| AT3G52150.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.8e-65 | 63.86 | Show/hide |
Query: RISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNET
R P T T ++P L SS AAR++YIGNIPR V NE+LT++V+EHGAVEK +VMYDKYSGRSRRF F TMK+V+DANA +EKLN
Subjt: RISPALQTSTPKRPTRLFAVAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNET
Query: EVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNN
V GR IKVNITEKP+ ++ D S+LQ+EDS F+DSPYKVYVGN++ TV+ E L+N FSEKGKV+SAKVSRVPGTSKS+G+GFVTFSSEE+VEAAI + NN
Subjt: EVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFNN
Query: AV
++
Subjt: AV
|
|
| AT3G52380.1 chloroplast RNA-binding protein 33 | 1.5e-29 | 36.26 | Show/hide |
Query: VAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPL--V
V E T+Q + +LY+GN+P + + EL++I E G V +++YDK + RSR F FVTM ++++A A++ N +++GGRT+KVN E P
Subjt: VAEAAVTSQGASSVAARKLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPL--V
Query: NTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFN
N + + ++ + ++DSP+KVY GN+ ++++ LK+ F ++ VL AKV T +S G+GF++F S E V++A+++ N
Subjt: NTIDTSLLQAEDSQFIDSPYKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFN
|
|
| AT5G50250.1 chloroplast RNA-binding protein 31B | 1.1e-24 | 37.42 | Show/hide |
Query: KLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSP
KL++GN+P +VD++ L + ++ G VE +EV+Y++ + +SR F FVTM TV++A A+EK N EV GR + VN + D+
Subjt: KLYIGNIPRNVDNEELTRIVQEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVDDANAAIEKLNETEVGGRTIKVNITEKPLVNTIDTSLLQAEDSQFIDSP
Query: YKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFN
+++YVGN+ V + L+ FSE GKV+ A+V T +S G+GFV S+E EV AI++ +
Subjt: YKVYVGNISSTVSTETLKNFFSEKGKVLSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFSSEEEVEAAISSFN
|
|
