CuGenDBv2

Gene ID	HG10023330
Organism	Lagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description	NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L, chloroplastic
Genome location	Chr05:33129624..33129926
RNA-Seq Expression	HG10023330
Synteny	HG10023330
Gene Ontology terms	GO:0019684 - photosynthesis, light reaction (biological process) GO:0042773 - ATP synthesis coupled electron transport (biological process) GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0008137 - NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity (molecular function) GO:0046872 - metal ion binding (molecular function) GO:0048038 - quinone binding (molecular function) GO:0051539 - 4 iron, 4 sulfur cluster binding (molecular function)
InterPro domains	IPR001133 - NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L/K IPR039428 - NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L/Mnh complex subunit C1-like

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

YP_009317438.1 NADH dehydrogenase subunit 4L [Coccinia grandis]

1.9e-41

Show/hide

Query:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK
        MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFF SRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK
Subjt:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK

YP_009326042.1 NADH dehydrogenase subunit 4L [Citrullus lanatus]

1.9e-41

Show/hide

Query:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK
        MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFF SRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK
Subjt:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK

YP_009447503.1 NADH dehydrogenase subunit 4L [Cucurbita maxima]

3.2e-41

Show/hide

Query:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK
        MLEHVLI+SAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFF SRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK
Subjt:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK

YP_009456114.1 NADH dehydrogenase subunit 4L [Momordica charantia]

2.5e-41

Show/hide

Query:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK
        MLEHVL+ISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFF SRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK
Subjt:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK

YP_009751789.1 NADH dehydrogenase subunit E [Herpetospermum pedunculosum]

2.5e-41

Show/hide

Query:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK
        MLEHVL+ISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFF SRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK
Subjt:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1P8LE30 NADH-quinone oxidoreductase subunit K

9.1e-42

Show/hide

Query:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK
        MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFF SRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK
Subjt:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK

A0A1P8LEK6 NADH-quinone oxidoreductase subunit K

9.1e-42

Show/hide

Query:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK
        MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFF SRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK
Subjt:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK

A0A2Z2CGG1 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L, chloroplastic

9.1e-42

Show/hide

Query:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK
        MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFF SRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK
Subjt:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK

A0A6H0EW53 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L, chloroplastic

9.1e-42

Show/hide

Query:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK
        MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFF SRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK
Subjt:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK

A0A7T3QNP0 NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit 4L

9.1e-42

Show/hide

Query:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK
        MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFF SRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK
Subjt:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

B1NWK1 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L, chloroplastic

5.2e-42

Show/hide

Query:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK
        MLEHVL++SAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVN+NFVTFSDFF SRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVS+IYRNRKS  INQSNLLNK
Subjt:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK

B2XWJ3 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L, chloroplastic

6.1e-43

Show/hide

Query:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK
        MLEHVL++SAYLFSIGIYGLITSRN+VRALMCLELILNAVN+NFVTFSDFF SRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVS+IYRNRKSTRINQSNLLNK
Subjt:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK

Q09WW6 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L, chloroplastic

1.6e-43

Show/hide

Query:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK
        MLEHVL++SAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVN+NFVTFSDFF SRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK
Subjt:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK

Q0ZIW6 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L, chloroplastic

1.4e-42

Show/hide

Query:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK
        MLEHVL++SAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVN+NFVTFSDFF +RQLKG+IFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK
Subjt:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK

Q2QD39 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L, chloroplastic

5.5e-44

Show/hide

Query:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK
        MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFF SRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAI+SSIYRNRKSTRINQSNLLNK
Subjt:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

ATCG01070.1 NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 4L

7.2e-39

Show/hide

Query:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK
        +LEHVL++SAYLF IG+YGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFF + QLKG IF IFVIAIAAAEAAIG AIVSSIYRNRKS RINQS LLNK
Subjt:  MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCTCGAACATGTACTTATTATAAGTGCCTATTTATTTTCTATCGGTATCTATGGATTGATCACGAGCCGAAATATGGTTAGGGCCCTTATGTGTCTTGAGCTTATACT
GAATGCAGTTAATATGAATTTCGTAACATTTTCTGATTTTTTTTATAGTCGCCAATTAAAAGGGAATATTTTCTCAATTTTTGTTATAGCTATTGCAGCCGCTGAAGCAG
CTATTGGCCCAGCTATTGTTTCGTCAATTTATCGTAACAGAAAATCAACTCGTATCAATCAATCGAATTTGTTGAATAAGTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MLEHVLIISAYLFSIGIYGLITSRNMVRALMCLELILNAVNMNFVTFSDFFYSRQLKGNIFSIFVIAIAAAEAAIGPAIVSSIYRNRKSTRINQSNLLNK

HG10023330 (gene) of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1 genome