| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6591720.1 50S ribosomal protein 6, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 3.81e-54 | 84.11 | Show/hide |
Query: MSISTFLGCKISVPPLLNSSASKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGDENVEIVSTS-SSA
MSISTF G +ISVPPLLNSSASK APCSGGNL IECSSRPNKKATAHHMKTRP+KSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWT+VSS+S DE VE+ ++S SSA
Subjt: MSISTFLGCKISVPPLLNSSASKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGDENVEIVSTS-SSA
Query: QAPLTSE
QAP T+E
Subjt: QAPLTSE
|
|
| XP_008466097.1 PREDICTED: 50S ribosomal protein 6, chloroplastic [Cucumis melo] | 1.39e-67 | 100 | Show/hide |
Query: MSISTFLGCKISVPPLLNSSASKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGDENVEIVSTSSSAQ
MSISTFLGCKISVPPLLNSSASKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGDENVEIVSTSSSAQ
Subjt: MSISTFLGCKISVPPLLNSSASKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGDENVEIVSTSSSAQ
Query: APLTSE
APLTSE
Subjt: APLTSE
|
|
| XP_011652886.1 50S ribosomal protein 6, chloroplastic [Cucumis sativus] | 1.06e-62 | 94.34 | Show/hide |
Query: MSISTFLGCKISVPPLLNSSASKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGDENVEIVSTSSSAQ
MSISTFLGCKISVPPLLNSSASKAAPCS GNL IECSSRPNKKATAHHMKTRP+KSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGDENVEI S SSSAQ
Subjt: MSISTFLGCKISVPPLLNSSASKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGDENVEIVSTSSSAQ
Query: APLTSE
AP+TSE
Subjt: APLTSE
|
|
| XP_022975752.1 50S ribosomal protein 6, chloroplastic [Cucurbita maxima] | 7.69e-54 | 84.11 | Show/hide |
Query: MSISTFLGCKISVPPLLNSSASKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGDENVEIVST-SSSA
MSISTF G +ISVPPLLNSSASK APCSGGNL IECSSRPNKKATAHHMKTRP+KSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWT+VSS+S DE VE+ S+ +SSA
Subjt: MSISTFLGCKISVPPLLNSSASKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGDENVEIVST-SSSA
Query: QAPLTSE
QAP T+E
Subjt: QAPLTSE
|
|
| XP_023536142.1 50S ribosomal protein 6, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 3.81e-54 | 84.11 | Show/hide |
Query: MSISTFLGCKISVPPLLNSSASKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGDENVEIVST-SSSA
MSISTF G +ISVPPLLNSSASK APCSGGNL IECSSRPNKKATAHHMKTRP+KSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWT+VSS+S DE VE+ S+ +SSA
Subjt: MSISTFLGCKISVPPLLNSSASKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGDENVEIVST-SSSA
Query: QAPLTSE
QAP T+E
Subjt: QAPLTSE
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LHS7 Uncharacterized protein | 2.6e-47 | 94.34 | Show/hide |
Query: MSISTFLGCKISVPPLLNSSASKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGDENVEIVSTSSSAQ
MSISTFLGCKISVPPLLNSSASKAAPCS GNL IECSSRPNKKATAHHMKTRP+KSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGDENVEI S SSSAQ
Subjt: MSISTFLGCKISVPPLLNSSASKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGDENVEIVSTSSSAQ
Query: APLTSE
AP+TSE
Subjt: APLTSE
|
|
| A0A1S3CQF4 50S ribosomal protein 6, chloroplastic | 5.1e-51 | 100 | Show/hide |
Query: MSISTFLGCKISVPPLLNSSASKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGDENVEIVSTSSSAQ
MSISTFLGCKISVPPLLNSSASKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGDENVEIVSTSSSAQ
Subjt: MSISTFLGCKISVPPLLNSSASKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGDENVEIVSTSSSAQ
Query: APLTSE
APLTSE
Subjt: APLTSE
|
|
| A0A5A7TB88 50S ribosomal protein 6 | 5.1e-51 | 100 | Show/hide |
Query: MSISTFLGCKISVPPLLNSSASKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGDENVEIVSTSSSAQ
MSISTFLGCKISVPPLLNSSASKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGDENVEIVSTSSSAQ
Subjt: MSISTFLGCKISVPPLLNSSASKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGDENVEIVSTSSSAQ
Query: APLTSE
APLTSE
Subjt: APLTSE
|
|
| A0A6J1F7W7 50S ribosomal protein 6, chloroplastic-like | 3.1e-40 | 83.18 | Show/hide |
Query: MSISTFLGCKISVPPLLNSSASKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGDENVEIVST-SSSA
MSIST+ G +ISVPPLLNSSASK APCSGGNL IECSSRPNKKATAHHMKTRP+KSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWT VSS+S DE VE+ S+ +SSA
Subjt: MSISTFLGCKISVPPLLNSSASKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGDENVEIVST-SSSA
Query: QAPLTSE
QAP T+E
Subjt: QAPLTSE
|
|
| A0A6J1IDX3 50S ribosomal protein 6, chloroplastic | 1.4e-40 | 84.11 | Show/hide |
Query: MSISTFLGCKISVPPLLNSSASKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGDENVEIVST-SSSA
MSISTF G +ISVPPLLNSSASK APCSGGNL IECSSRPNKKATAHHMKTRP+KSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWT+VSS+S DE VE+ S+ +SSA
Subjt: MSISTFLGCKISVPPLLNSSASKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGDENVEIVST-SSSA
Query: QAPLTSE
QAP T+E
Subjt: QAPLTSE
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P11892 50S ribosomal protein 6, chloroplastic | 1.4e-16 | 56.63 | Show/hide |
Query: SISTFLGCKISVPP---LLNSSASKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLV
S+S+ GC +S+ P L N + + G L IECSSRP KK+TAHHMKTRP+KS+ D RKPTVY PLPPLPPD+T+V
Subjt: SISTFLGCKISVPP---LLNSSASKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLV
|
|
| P82411 50S ribosomal protein 6, chloroplastic | 3.1e-21 | 49.55 | Show/hide |
Query: MSISTFLGCK-ISVPPLLNSSA----------SKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGDEN
MS+S G + +++P +L +S+ S C GG + IECSSRP KK TAHHMKTRPKK+ WDI+R P VYPPLPPLP +WT+VSS + +
Subjt: MSISTFLGCK-ISVPPLLNSSA----------SKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGDEN
Query: VEIVSTSSSAQ
+TSSSA+
Subjt: VEIVSTSSSAQ
|
|
| Q9FKP0 50S ribosomal protein 6, chloroplastic | 6.1e-17 | 52.75 | Show/hide |
Query: MSISTFLGCKI----SVPPLLNSSASKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGD
MS+S G I + P L K G + IECSSRP KK+TAHH KTRPKK+QPWDI+RKPTVY PLPPLP +W+ + S D
Subjt: MSISTFLGCKI----SVPPLLNSSASKAAPCSGGNLPIECSSRPNKKATAHHMKTRPKKSQPWDIRRKPTVYPPLPPLPPDWTLVSSVSGD
|
|
