CuGenDBv2

Gene ID	IVF0000100
Organism	Cucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Description	Unknown protein
Genome location	chr06:7436400..7439073
RNA-Seq Expression	IVF0000100
Synteny	IVF0000100
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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3.18e-134

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XP_008457044.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103496817 isoform X3 [Cucumis melo]

8.62e-128

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XP_031738082.1 uncharacterized protein LOC101219659 isoform X1 [Cucumis sativus]

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TrEMBL top hits

e value

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Alignment

A0A0A0L741 Uncharacterized protein

2.5e-96

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A0A1S3C467 uncharacterized protein LOC103496817 isoform X1

3.9e-97

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A0A1S3C4K4 uncharacterized protein LOC103496817 isoform X3

7.9e-98

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A0A1S3C4P1 uncharacterized protein LOC103496817 isoform X2

6.2e-103

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A0A6J1IZQ5 uncharacterized protein LOC111482129

2.6e-61

75.4

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        MAS LFLL L TIS S+ S ARPCKSLF+SFSL RHRTLDS  HPFS+MA+IVDITEFKSSS S            P DIL  DLPRP P S   QHFPY
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        DFTSLRDRTKDIL+VVVALLFGVGCGALTAATMYLAYSL AG+FG+RSSVYDD  E++DD SDDNKENIKKMGYI I DD APVKSV
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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

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Alignment

AT1G65720.1 unknown protein

6.3e-15

35.71

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        M S  +L F   +    S +  + ARPCK+ FL  S     T ++P+  S       +T F                 +P  ++ F + R    P   + 
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        +  P    +  S RDRT+DILSVVVALLFGVGCGALTAATMYL ++L   +  +      DF E++DD  +D  +  ++KK+GY+ IP    APVK
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCGTCGCCTCTCTTTCTCCTCTTTCTCTTCACCATTTCCTTCTCAATTCCCTCTCAAGCTCGTCCTTGCAAATCCCTTTTCCTTTCCTTTTCCCTTCACCGTCACCG
AACCCTCGATTCCCCCCATCCCTTTTCCCAGATGGCCATTATCGTCGATATCACCGAGTTCAAATCTTCCTCCTTTTCCTCTTCTTCCGATCCCCTTTTCCCCTCCGTCG
CCGACCCCACCGACATCCTCCGCTTCGATCTCCCTCGTCCTACCCCTGTTTCAGCAACAACCCAACACTTCCCTTACGATTTCACCTCTCTCCGCGATCGCACCAAGGAT
ATTCTCAGCGTTGTTGTCGCTTTGCTCTTTGGCGTTGGCTGTGGCGCTCTCACTGCTGCCACTATGTATTTGGCTTACTCTTTGTTTGCTGGTCAATTCGGGCATCGCTC
CTCTGTGTATGATGACTTTGGGGAGGATGATGATGATCTCAGTGATGATAACAAGGAGAATATTAAGAAGATGGGTTATATCAACATCCCTGACGACGTTGCCCCCGTTA
AATCAGTGGGTTTCGCTCTCTCGTGTAGAATGAAATGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

GAAGGGGAAGGGGAAGGTGAAGGATAGAGAGAGAAGAAAAGATAGGACTGAATTGAATCGACACACAAACAATCAAAACACTCGACAAAGTCTTCTTTCTTCCATTCTCT
TCTCTCAAACCCAAGAAAAAAGTTCTCCTTTTTTCAAACCCTTCATCCATGGCGTCGCCTCTCTTTCTCCTCTTTCTCTTCACCATTTCCTTCTCAATTCCCTCTCAAGC
TCGTCCTTGCAAATCCCTTTTCCTTTCCTTTTCCCTTCACCGTCACCGAACCCTCGATTCCCCCCATCCCTTTTCCCAGATGGCCATTATCGTCGATATCACCGAGTTCA
AATCTTCCTCCTTTTCCTCTTCTTCCGATCCCCTTTTCCCCTCCGTCGCCGACCCCACCGACATCCTCCGCTTCGATCTCCCTCGTCCTACCCCTGTTTCAGCAACAACC
CAACACTTCCCTTACGATTTCACCTCTCTCCGCGATCGCACCAAGGATATTCTCAGCGTTGTTGTCGCTTTGCTCTTTGGCGTTGGCTGTGGCGCTCTCACTGCTGCCAC
TATGTATTTGGCTTACTCTTTGTTTGCTGGTCAATTCGGGCATCGCTCCTCTGTGTATGATGACTTTGGGGAGGATGATGATGATCTCAGTGATGATAACAAGGAGAATA
TTAAGAAGATGGGTTATATCAACATCCCTGACGACGTTGCCCCCGTTAAATCAGTGGGTTTCGCTCTCTCGTGTAGAATGAAATGATATGGAGAGACGAATCGCATTGTG
AAAGTTAAGGTCAAGTAGGTTGCAGGAAGGGAATAATTATTGCACAAGAAAGGACTGAAGCTAACTAAGAACAGAAAGGATTGGAGCTTTGGTGATGTGACTTTGCGAGT
GGAGTTTGGGATTCCTTTTTTTTTTGGACGTTTGGCATGAAGAGTGTTTGCCACAGAGATGTCAGTGCTACGAGGAGTTTCTACTCAATCCACCTTTTTGGGAGAGACTG
GTTTCTTTGGCTTGCTTGGTGTATGCGGTCTTGTAGGTTCTGTGGGGCAGGTGAGTTGAGTGGGATCATATGGAGTTTTGATCTTTGATTTCATGTTTCCCTCTCGAGTT
TCATTTCAAAGACCTTTTGTAACTTATAATTTCACGTAGTTGGAGCTCATGTAGTGAGTATTTCCCTTTTTTGAGGC

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MASPLFLLFLFTISFSIPSQARPCKSLFLSFSLHRHRTLDSPHPFSQMAIIVDITEFKSSSFSSSSDPLFPSVADPTDILRFDLPRPTPVSATTQHFPYDFTSLRDRTKD
ILSVVVALLFGVGCGALTAATMYLAYSLFAGQFGHRSSVYDDFGEDDDDLSDDNKENIKKMGYINIPDDVAPVKSVGFALSCRMK

IVF0000100 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome