; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0000395 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0000395
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionBeta-galactosidase
Genome locationtig00001929:64944..65381
RNA-Seq ExpressionIVF0000395
SyntenyIVF0000395
Gene Ontology termsGO:0010467 - gene expression (biological process)
GO:0016070 - RNA metabolic process (biological process)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0032571.1 Beta-galactosidase [Cucumis melo var. makuwa]9.41e-1546.79Show/hide
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KAA0041048.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold477G00200 [Cucumis melo var. makuwa]9.95e-100100Show/hide
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KAA0059989.1 Cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 8 [Cucumis melo var. makuwa]1.94e-1548.6Show/hide
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KAA0065740.1 DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1 [Cucumis melo var. makuwa]8.85e-1740.65Show/hide
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TYK26825.1 putative mitochondrial protein [Cucumis melo var. makuwa]4.11e-1458.67Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7SSP2 Beta-galactosidase9.9e-1346.79Show/hide
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A0A5A7V2E9 Cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 82.6e-1348.6Show/hide
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A0A5A7VEV7 DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC12.4e-1440.65Show/hide
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A0A5D3CLP8 Uncharacterized protein3.7e-76100Show/hide
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A0A5D3DU30 Putative mitochondrial protein1.4e-1158.67Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTATCAGAGCGAGGTAAAAATGAAACCCTAGATACGATTATCAATGATACTGAGATAGAGAGACGAGACAGCCACAATCGTGGATGCTGCCGTCGTCACCGTCATGG
AAAAGTTGCTCCACCAGCTTCAGAAGACGTTGGTGATCAGTACAACCACGTGCCGTTGCTGCCCTCTATTTACGGATTGCCCTCGTTTCATGCGTTGTTGCCCTCTGATT
CTTTACCGCGGCCGTGCATCCGTGGTACTGGGATTGATCAACTCCATAATAAATCAGGGTCTAAAGTTGGTGAATCTTCAACACAATCCAAACTAATCGACTTGTCGATG
TATTTCAAGAACTCGATAACTTCACTCCCTATTTTGTCCTCAAATTATATAACTAGTTCTCTGGCACCGACTACAAGTGTTTTTCCAAGGGAGAAGCTGAATGGCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTATCAGAGCGAGGTAAAAATGAAACCCTAGATACGATTATCAATGATACTGAGATAGAGAGACGAGACAGCCACAATCGTGGATGCTGCCGTCGTCACCGTCATGG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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