; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0000406 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0000406
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationchr03:3714110..3743016
RNA-Seq ExpressionIVF0000406
SyntenyIVF0000406
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR015943 - WD40/YVTN repeat-like-containing domain superfamily
IPR036322 - WD40-repeat-containing domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578880.1 hypothetical protein SDJN03_23328, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.43e-23788.49Show/hide
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XP_008441506.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103485610 isoform X1 [Cucumis melo]1.08e-273100Show/hide
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XP_011656631.1 uncharacterized protein LOC101213824 isoform X1 [Cucumis sativus]5.41e-25894.84Show/hide
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XP_023550817.1 uncharacterized protein LOC111808847 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.47e-23888.32Show/hide
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XP_038885903.1 uncharacterized protein LOC120076210 [Benincasa hispida]3.20e-24491.03Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K8Q9 Uncharacterized protein7.6e-20394.84Show/hide
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A0A1S3B4D3 uncharacterized protein LOC103485610 isoform X18.7e-215100Show/hide
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A0A6J1BXM2 uncharacterized protein LOC1110066412.2e-18186.41Show/hide
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A0A6J1FLD9 uncharacterized protein LOC111445286 isoform X11.0e-18687.77Show/hide
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A0A6J1JYQ8 uncharacterized protein LOC111489092 isoform X26.7e-18386.96Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTGAAGGCAAAGGGTCTGAGGAAGGTGGTCGTGCCGTCCATTCTCATGGATCATCCTTCCCCCGGGAATATCCAGCCCACTCGTCTCGCCCTCCATGTTAGTCCGGA
CGGATCTTCCTGCTGGGTCTTCATTGCTTCCGGTTCTCGCGTGTTTAAACTCCAGATTTCCATGGATGAATCATCAGTCCTTGAGGGAAAAGATAGCTTACTGATCCCCG
AACAGACAAAGGTTCTAGACTCTTTATTACTGGATCGCTGTCCTCATCGCTCAGAAATACAGAGCTTGGTCCTGGCTGAAGTTGATAGTTCCAGCGACCAATTACTGGGG
ACAGTAGATTCCTATGGCCACCTCATCGTTTCTAAACTAGATGCCGCTGGCAAAGATGCAGACAGGTTTACGTATTCTGTATTGCCTCGAGATTCAGGTCTTGGTGAGGG
CAGCTGGGCAGGATTATGCTTCAGTCCAAGTGAATTGTTCACGGCAGCTGTTGCTCGTAGCTTTGGCAAAACTGTTGATATTTATGACCAGGATGTCCATGTTCGGACAT
TACGCACACTGTTGTATCCAACTGCATTGACCTTCATTCAGAATCATTGTTTTGGGAATGGAAGCTCTGTGTTAGCTGTCACCGAAGGTTGTCAGTTGACGATCTGGGAT
TTGAGAATGAAAGAAAACGGTGGTTGTCTGCAAAGAATCTGTGGCTCTGTTGGTGATAATTTCTATGCTGTCTGCACTTCCTCAAATGGTAATATTGCGGTGGGTGGTGC
TGATCGAACTATAACGACATATGATCCTCGAAGGTGGTCAGCATTATCAAGATGGGTTCACTGCTCAAAGTACGAGATTACGGGATTGGCTTTCTCATCAATTGACTCTG
ATTGCATTTATGTCCAGGGAGTTGACTATGAGGTCTTTTGTGGACAGTGGAAAGAACGCAACAAATTATTTTCATTAAGAGGAGACTCAAATTGGCTTGGATTTAGTAAG
AGCAGCAGGAGGGATGTCTTAGGCGGATGGTGTGATTCAGGTAGCATCTTTTTGACAGATGTTACTCGCAACAGCGAAGAAGACACGTCAAATGGCTTCGTCAATTGCCT
TTCCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAAATAAACAACTAAATTTCTTCTTCTCCAAATCGTGAAGCCCCACCCCTCTCTAGAAACCTCTTCCGCTCACCGCTTCTCTTTTTCTCCTCTAGTCGACGCCACCAT
CAGCCACCCCCTTGCGACGTTTGACTCGCCGACCAACATAACCCAGTCGAAGCCAGCGTTTGTGTCTTCTTTTTCGTGCGTCAGTTACAATGTGGCTCGCCGACGCCAAT
CAACCGCCGTCGTGCCGCCCATCTAGTTGAACAACAGCCACACCATGTCGAGCCCTTCGTGGGTCATGCAAATTTGAAGTCTTTGGGTTTGATTGAAGTCATTCTTCAAG
CCGAACCACTGCCAGCTTCGTTCTTTTCCAACTCCTTGTCGTTGAAACTAAGTTTTAGATTTGGGTTTTAAAGGAGTTTGAACCCCTATTCAGCAGTTTGAAAGCTCGAA
ATTTAGGCGTTTGACACAACTTGGCACTACGTGAATGTGTTTCCGTAGCGCTACCTATGGTTATTAGGGGTTCCAGTGCTGAAAGAGGTCGTGACCGGAGATTCGGGAAC
CTGAACCTAAGTGAGGATGTGGATGGAGGATTGTGATATGACTTCAAGCCTAGCATAACCTGTGGTGGGTGGCTCTATATGCACATAGGAGCGAATATGGACGTTGTTAC
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GGATTGGATTGGTTAGAAGTTGCCATCGTGGAGGATACTAAAGATGCCTGAGCTAATTTTGGCCACATGATTCTTTGTCATGTGCAAGCTATCTTTGGCTGTATCTTTAG
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