CuGenDBv2

Gene ID	IVF0000575
Organism	Cucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Description	Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold containing protein
Genome location	tig00001378:48113..50672
RNA-Seq Expression	IVF0000575
Synteny	IVF0000575
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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KAE8649997.1 hypothetical protein Csa_011663 [Cucumis sativus]

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XP_004146157.1 uncharacterized protein LOC101219661 [Cucumis sativus]

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XP_008448520.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103490671 [Cucumis melo]

1.62e-148

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XP_038903454.1 uncharacterized protein LOC120090039 [Benincasa hispida]

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TrEMBL top hits

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Alignment

A0A0A0L108 Uncharacterized protein

1.1e-105

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A0A1S3BJ95 uncharacterized protein LOC103490671

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A0A5A7UB34 Putative universal stress protein

4.9e-114

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A0A5D3CMG3 Putative universal stress protein

1.9e-113

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A0A6J1FSW2 uncharacterized protein LOC111448467 isoform X1

8.2e-93

84.29

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G66090.1 unknown protein

1.6e-56

58.95

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        T  S+  S +  +P    R +  +  ++     +  RVKA+ +++EA+     V  +F+  KHLLLP+ DRNP+LSEGTRQA ATT +LAK  GADITVV
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        +ID ++++S  EHE Q+S+IRWHLSEGGF+EFKLLERLGEG K TAIIGEVAD+L ++LVV+SMEAIHSK++DANLLAEFIPCPV+LLPL
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

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TCCTTCGGATTATCGTCGCCCCCGAGGTTTTAAGCCCCCAATCACCACTCTCTGCTGCAAAATGATCCATCGCGTAAAAGCCAAGCCACAAGATTCAGAAGCAACATTAG
TTGCCGGCTCCTTCACTGAATTTAAACACCTGCTACTGCCAATAACCGATCGCAATCCATTTCTTTCCGAGGGAACGAGACAGGCTATTGCTACTACTGCTGCTTTGGCA
AAGAACAATGGGGCTGACATAACAGTAGTCTTGATCGATGCAAAGCAGAAAGATTCGATTCCAGAACACGAGAACCAACTCTCGAGCATTCGTTGGCATTTGTCTGAAGG
GGGATTCCAAGAGTTTAAATTGTTGGAGCGATTAGGGGAAGGAAGCAAGCCAACAGCAATCATTGGGGAGGTGGCTGATGATCTGAATTTAGATTTGGTAGTTCTAAGCA
TGGAAGCCATTCATTCCAAGCATGTGGATGCTAACCTACTGGCTGAGTTCATTCCATGCCCTGTTATGCTCTTGCCGTTATGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

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GATTCCAAGAGTTTAAATTGTTGGAGCGATTAGGGGAAGGAAGCAAGCCAACAGCAATCATTGGGGAGGTGGCTGATGATCTGAATTTAGATTTGGTAGTTCTAAGCATG
GAAGCCATTCATTCCAAGCATGTGGATGCTAACCTACTGGCTGAGTTCATTCCATGCCCTGTTATGCTCTTGCCGTTATGATTTTTGTATAATTTGAGTTCTATGCCTCA
GCCATATCATACTTATGCTTTCTTTAACAATATACTGAGTGTACTTGTGATTTATGTATATATTATAAA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

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KNNGADITVVLIDAKQKDSIPEHENQLSSIRWHLSEGGFQEFKLLERLGEGSKPTAIIGEVADDLNLDLVVLSMEAIHSKHVDANLLAEFIPCPVMLLPL

IVF0000575 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome