; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0000590 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0000590
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionFlocculation protein FLO11-like
Genome locationchr02:15882890..15883728
RNA-Seq ExpressionIVF0000590
SyntenyIVF0000590
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0049940.1 flocculation protein FLO11-like [Cucumis melo var. makuwa]4.76e-2236.07Show/hide
Query:  MAIDSSSMASSPPKNASLAKGKHYK--------IILLRCLFKKVCHP---------------------------DATD---------------------E
        ++++SS MA SPPKNAS  KGK YK        ++ ++     V  P                           D++D                     E
Subjt:  MAIDSSSMASSPPKNASLAKGKHYK--------IILLRCLFKKVCHP---------------------------DATD---------------------E

Query:  SNLHIPSANLVQCAQQ-----DVPYHTTDHEDLYKTDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPKETTVPDDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVG
        S+   P+A  +    +     +V +HTTD ED +KTDE ES ED DDDY+  P+ET+VP+ET VP+     SP NKT EP L +V RD TT + P G+VG
Subjt:  SNLHIPSANLVQCAQQ-----DVPYHTTDHEDLYKTDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPKETTVPDDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVG

Query:  SSSKEPRRPLVKRQRVIST
        SSS+ P++PL K  R+I T
Subjt:  SSSKEPRRPLVKRQRVIST

KAA0054111.1 flocculation protein FLO11-like [Cucumis melo var. makuwa]5.43e-3044.81Show/hide
Query:  MASSPPKNASLAKGKHYKIILLRCLFKKVCHPDATDESNLHIPSANLVQCAQQDVPYHT---------------------------------TDHEDLYK
        MASSPPKNAS  KGK Y+ I + CLFKKV   DATD+SNLHIP   L +   Q +P                                       ++  +
Subjt:  MASSPPKNASLAKGKHYKIILLRCLFKKVCHPDATDESNLHIPSANLVQCAQQDVPYHT---------------------------------TDHEDLYK

Query:  TDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPKETTVPDDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKRQRVIS
        TD+DES  DT +DYVL  ++T++PKET V  DD   S  N+T EPQ T+VPRDSTT LS  GHVGSS + P RP V+R+R+ S
Subjt:  TDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPKETTVPDDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKRQRVIS

KAA0058484.1 flocculation protein FLO11-like [Cucumis melo var. makuwa]4.70e-2140.53Show/hide
Query:  MASSPPKNASLAKGKHYKIILLRCLFKK----VCHPDATDESNLHIP-------------------SANLVQCAQQDVPYHTTDH-------------ED
        M +SP K  +  KGK YK I  R  FKK    V   DAT  S L  P                   S + V   ++DVP  TTDH             + 
Subjt:  MASSPPKNASLAKGKHYKIILLRCLFKK----VCHPDATDESNLHIP-------------------SANLVQCAQQDVPYHTTDH-------------ED

Query:  LYKTDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPKETTVPDDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKRQRVISTKAG
           TD+DE+ +D D+DYV V +ET+  +ET    +DL SSP N+T EPQ TK P +S+  +SP  HVGSSS+ P R LV+ QRV+STK G
Subjt:  LYKTDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPKETTVPDDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKRQRVISTKAG

TYK00112.1 flocculation protein FLO11-like [Cucumis melo var. makuwa]3.53e-5352.42Show/hide
Query:  MAIDSSSMASSPPKNASLAKGKHYKI--------------------------------------------------------------------ILLRCL
        MAIDSSSMASSPPKNASLAKG   ++                                                                    I+L  L
Subjt:  MAIDSSSMASSPPKNASLAKGKHYKI--------------------------------------------------------------------ILLRCL

Query:  FKKVCHPDATDESNLHIPSANLVQCAQQDVPYHTTDHEDLYKTDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPKETTVPDDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPL
         ++    D +D     +P A+ +       P      EDLYKTDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPKETTVPDDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPL
Subjt:  FKKVCHPDATDESNLHIPSANLVQCAQQDVPYHTTDHEDLYKTDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPKETTVPDDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPL

Query:  SPQGHVGSSSKEPRRPLVKRQRVISTK
        SPQGHVGSSSKEPRRPLVKRQRVISTK
Subjt:  SPQGHVGSSSKEPRRPLVKRQRVISTK

TYK06511.1 putative mitochondrial protein [Cucumis melo var. makuwa]7.44e-1940.21Show/hide
Query:  SSSMASSPPKNASLAKGKHYKIILLRCLFKKVCHPDATDESNLHIP------SANLVQCAQ------------QDVPYHTTDH-------------EDLY
        S SMASSP KN    K                   DAT   NLHIP      SA+     Q            +D+P  +T+               + +
Subjt:  SSSMASSPPKNASLAKGKHYKIILLRCLFKKVCHPDATDESNLHIP------SANLVQCAQ------------QDVPYHTTDH-------------EDLY

Query:  KTDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPKETTVPDDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKRQRVISTKAGR
        +TD+DE+ +D ++DYV + E+T  PKETTV  DD  SSP N+TSEP  T+V  +S+ PL PQGHVG S   P+R  VKRQRV+STKAGR
Subjt:  KTDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPKETTVPDDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKRQRVISTKAGR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7U3T5 Flocculation protein FLO11-like9.7e-1757.14Show/hide
Query:  DVPYHTTDHEDLYKTDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPKETTVPDDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVK
        +V +HTTD ED +KTDE ES ED DDDY+  P+ET+VP+ET VP+     SP NKT EP L +V RD TT + P G+VGSSS+ P++PL K
Subjt:  DVPYHTTDHEDLYKTDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPKETTVPDDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVK

A0A5D3BN12 Flocculation protein FLO11-like6.0e-4352.42Show/hide
Query:  MAIDSSSMASSPPKNASLAKGKHYKI--------------------------------------------------------------------ILLRCL
        MAIDSSSMASSPPKNASLAKG   ++                                                                    I+L  L
Subjt:  MAIDSSSMASSPPKNASLAKGKHYKI--------------------------------------------------------------------ILLRCL

Query:  FKKVCHPDATDESNLHIPSANLVQCAQQDVPYHTTDHEDLYKTDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPKETTVPDDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPL
         ++    D +D     +P A+ +       P      EDLYKTDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPKETTVPDDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPL
Subjt:  FKKVCHPDATDESNLHIPSANLVQCAQQDVPYHTTDHEDLYKTDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPKETTVPDDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPL

Query:  SPQGHVGSSSKEPRRPLVKRQRVISTK
        SPQGHVGSSSKEPRRPLVKRQRVISTK
Subjt:  SPQGHVGSSSKEPRRPLVKRQRVISTK

A0A5D3C3N3 Putative mitochondrial protein3.7e-1640.21Show/hide
Query:  SSSMASSPPKNASLAKGKHYKIILLRCLFKKVCHPDATDESNLHIP------SANLVQCAQ------------QDVPYHTTDH-------------EDLY
        S SMASSP KN    K                   DAT   NLHIP      SA+     Q            +D+P  +T+               + +
Subjt:  SSSMASSPPKNASLAKGKHYKIILLRCLFKKVCHPDATDESNLHIP------SANLVQCAQ------------QDVPYHTTDH-------------EDLY

Query:  KTDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPKETTVPDDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKRQRVISTKAGR
        +TD+DE+ +D ++DYV + E+T  PKETTV  DD  SSP N+TSEP  T+V  +S+ PL PQGHVG S    R P VKRQRV+STKAGR
Subjt:  KTDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPKETTVPDDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKRQRVISTKAGR

A0A5D3C7L1 Flocculation protein FLO11-like5.1e-1840.53Show/hide
Query:  MASSPPKNASLAKGKHYKIILLRCLFKK----VCHPDATDESNLHIP-------------------SANLVQCAQQDVPYHTTDH-------------ED
        M +SP K  +  KGK YK I  R  FKK    V   DAT  S L  P                   S + V   ++DVP  TTDH             + 
Subjt:  MASSPPKNASLAKGKHYKIILLRCLFKK----VCHPDATDESNLHIP-------------------SANLVQCAQQDVPYHTTDH-------------ED

Query:  LYKTDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPKETTVPDDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKRQRVISTKAG
           TD+DE+ +D D+DYV V +ET+  +ET    +DL SSP N+T EPQ TK P +S+  +SP  HVGSSS+ P R LV+ QRV+STK G
Subjt:  LYKTDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPKETTVPDDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKRQRVISTKAG

A0A5D3E1D9 Flocculation protein FLO11-like2.8e-2444.81Show/hide
Query:  MASSPPKNASLAKGKHYKIILLRCLFKKVCHPDATDESNLHIPSANLVQCAQQDVPY---------------------------------HTTDHEDLYK
        MASSPPKNAS  KGK Y+ I + CLFKKV   DATD+SNLHIP   L +   Q +P                                       ++  +
Subjt:  MASSPPKNASLAKGKHYKIILLRCLFKKVCHPDATDESNLHIPSANLVQCAQQDVPY---------------------------------HTTDHEDLYK

Query:  TDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPKETTVPDDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKRQRVIS
        TD+DES  DT +DYVL  ++T++PKET V  DD   S  N+T EPQ T+VPRDSTT LS  GHVGSS + P RP V+R+R+ S
Subjt:  TDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPKETTVPDDDLASSPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKRQRVIS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTATTGATTCCTCTTCCATGGCTTCATCTCCTCCCAAGAATGCATCTCTTGCTAAGGGTAAACATTACAAGATTATTTTGCTGCGTTGTCTATTCAAGAAAGTTTG
TCATCCTGATGCAACTGATGAATCAAATCTCCACATTCCCTCAGCCAATCTTGTTCAGTGTGCACAGCAGGATGTTCCTTATCATACTACAGACCATGAAGATTTATATA
AAACTGATGAAGATGAGTCAGGTGAAGATACTGATGATGACTACGTTCTTGTCCCTGAGGAAACATATGTTCCAAAAGAAACCACTGTTCCAGATGATGACCTAGCTTCG
TCTCCTGTCAACAAAACGTCTGAGCCTCAGTTGACTAAGGTTCCTAGAGACTCTACCACTCCTCTGTCGCCTCAGGGTCATGTTGGTTCTTCCTCCAAAGAACCTAGAAG
ACCACTTGTTAAAAGGCAACGAGTTATTTCCACCAAGGCTGGTCGTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTATTGATTCCTCTTCCATGGCTTCATCTCCTCCCAAGAATGCATCTCTTGCTAAGGGTAAACATTACAAGATTATTTTGCTGCGTTGTCTATTCAAGAAAGTTTG
TCATCCTGATGCAACTGATGAATCAAATCTCCACATTCCCTCAGCCAATCTTGTTCAGTGTGCACAGCAGGATGTTCCTTATCATACTACAGACCATGAAGATTTATATA
AAACTGATGAAGATGAGTCAGGTGAAGATACTGATGATGACTACGTTCTTGTCCCTGAGGAAACATATGTTCCAAAAGAAACCACTGTTCCAGATGATGACCTAGCTTCG
TCTCCTGTCAACAAAACGTCTGAGCCTCAGTTGACTAAGGTTCCTAGAGACTCTACCACTCCTCTGTCGCCTCAGGGTCATGTTGGTTCTTCCTCCAAAGAACCTAGAAG
ACCACTTGTTAAAAGGCAACGAGTTATTTCCACCAAGGCTGGTCGTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAIDSSSMASSPPKNASLAKGKHYKIILLRCLFKKVCHPDATDESNLHIPSANLVQCAQQDVPYHTTDHEDLYKTDEDESGEDTDDDYVLVPEETYVPKETTVPDDDLAS
SPVNKTSEPQLTKVPRDSTTPLSPQGHVGSSSKEPRRPLVKRQRVISTKAGR