; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0000867 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0000867
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionPITH domain-containing protein
Genome locationchr03:26584723..26588884
RNA-Seq ExpressionIVF0000867
SyntenyIVF0000867
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR008979 - Galactose-binding-like domain superfamily
IPR010400 - PITH domain
IPR037047 - PITH domain superfamily
IPR045099 - PITH domain-containing protein 1-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7029274.1 PITH domain-containing protein 1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.28e-9695.77Show/hide
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XP_004142920.1 PITH domain-containing protein 1 [Cucumis sativus]3.34e-100100Show/hide
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XP_016899908.1 PREDICTED: PITH domain-containing protein 1 [Cucumis melo]3.34e-100100Show/hide
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XP_022997023.1 PITH domain-containing protein 1 [Cucurbita maxima]1.51e-9695.77Show/hide
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XP_038884105.1 PITH domain-containing protein 1 isoform X1 [Benincasa hispida]3.72e-9797.18Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LKF7 PITH domain-containing protein2.9e-77100Show/hide
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A0A1S2XA04 PITH domain-containing protein 11.9e-7392.96Show/hide
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A0A1S4DVA9 PITH domain-containing protein 12.9e-77100Show/hide
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A0A6J1HFH3 PITH domain-containing protein 15.1e-7495.74Show/hide
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A0A6J1KCP1 PITH domain-containing protein 11.7e-7496.45Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q54Z24 PITH domain-containing protein 16.7e-2338.69Show/hide
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        IDF +  S    QEW+L E+ +G + Y T+ +KF  +
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Q8BWR2 PITH domain-containing protein 16.5e-1839.52Show/hide
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Q95ZI6 PITH domain-containing protein ZK353.93.4e-1937.25Show/hide
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Q9GZP4 PITH domain-containing protein 13.8e-1841.13Show/hide
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Q9VK68 PITH domain-containing protein CG61532.9e-1839.72Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G25950.1 Protein of unknown function (DUF1000)4.0e-7185.92Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTGCTTACACGATCACAGCTGCGAAGATCATGATTGTTCTTCTGATTGGTCTCTTTACAAGCACATAGACCTCCCCAGAGTTTCAGCATTGAATGAGGCAACTCC
AGGAAGTGTGAAGTCTGTATTTAAAGCTTGGGAGCATCGGTTAAACTCATCTGGGGATCACTTGGAAAGCAACGAGGGTGATCCTGAACTGCTAGTTTTCATCCCATTTA
CATCAGATGTTAAAATCAAAAGCATATCTATCATCGGTGGTCCAGATGGTACTAGTCCTTCAAAGATGAGGGTATTTATCAACCGAGAAGGTATTGACTTCTCAGATGCT
CAAAGTATGCAAGCTGTTCAGGAGTGGGATTTGGCTGAAAACTTGCAAGGAGTATTAGAGTACCAGACAAGATATTCCAAATTTCAAGGTGTGGGAATCTCACCTTGCAT
TTTCCTGATAATTATGGTGGTGACACGACTCAGATACACTACATTGGGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAAAATTTAATTGATGCTTTCTTTGTGATGGCTTTATATCAAAGCGAAAACAATCCTCCACGAAGGAAACGGCACCGTTTTGAGCATCTCGAACTTTCTCTTTTCCTCTG
AAATCTCTCTTCATTCTGCCTATTGTTCTGGAGCCTCAAAGATGGCTTGCTTACACGATCACAGCTGCGAAGATCATGATTGTTCTTCTGATTGGTCTCTTTACAAGCAC
ATAGACCTCCCCAGAGTTTCAGCATTGAATGAGGCAACTCCAGGAAGTGTGAAGTCTGTATTTAAAGCTTGGGAGCATCGGTTAAACTCATCTGGGGATCACTTGGAAAG
CAACGAGGGTGATCCTGAACTGCTAGTTTTCATCCCATTTACATCAGATGTTAAAATCAAAAGCATATCTATCATCGGTGGTCCAGATGGTACTAGTCCTTCAAAGATGA
GGGTATTTATCAACCGAGAAGGTATTGACTTCTCAGATGCTCAAAGTATGCAAGCTGTTCAGGAGTGGGATTTGGCTGAAAACTTGCAAGGAGTATTAGAGTACCAGACA
AGATATTCCAAATTTCAAGGTGTGGGAATCTCACCTTGCATTTTCCTGATAATTATGGTGGTGACACGACTCAGATACACTACATTGGGTTGAAAGGTGAAGCCACGCAG
CTAAAGAGAGATGTCGTTGCAACAATTGTCTATGAAATCACGCCAAATCCTTCTGACCACAAGACTCGAGCTGAAGGTGGTGCTGGATTTTCACATGTCGAATGAAGAAA
TAATCAGTATCCTTCTTTCTAAAATATTTCGTCTGTATCATCTCTACTGGATCCTGACTCTGTTAACTATTTTGAGTTACATTTACATGAATTTCCTTCCAGCCCTTCTT
TTTGTGTAGTAAGTGGAGAATCTCATTAGTTTCTTGGAAAGAGGGACTTCGATGTTGATTGGAAATTTGGAATTTGACCAAGTAGTGTTGGGACTGTTGAGACAAGTTTC
ACATCTGCTTAATGCTCCAACCAATCAAATTTACACTAAAATCAATGATTTGTAGTTTCATCAGCCAGTTTTGTTGCCTTTTGTTTTCTCTATATTTGAAAAGAACATGT
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AAGAGTGGGGAAAAAATGTAGAAATGGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MACLHDHSCEDHDCSSDWSLYKHIDLPRVSALNEATPGSVKSVFKAWEHRLNSSGDHLESNEGDPELLVFIPFTSDVKIKSISIIGGPDGTSPSKMRVFINREGIDFSDA
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