; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0000891 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0000891
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionProtein RALF-like 33
Genome locationchr07:24125565..24126080
RNA-Seq ExpressionIVF0000891
SyntenyIVF0000891
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044366.1 protein RALF-like 33 [Cucumis melo var. makuwa]2.86e-7898.33Show/hide
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XP_022983404.1 protein RALF-like 1 [Cucurbita maxima]2.95e-6987.6Show/hide
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XP_023529110.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.19e-6987.6Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KWI2 Uncharacterized protein3.1e-5289.34Show/hide
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A0A5A7TQI0 Protein RALF-like 333.8e-5898.33Show/hide
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A0A6J1F244 protein RALF-like 11.5e-5187.6Show/hide
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A0A6J1J798 protein RALF-like 12.6e-5187.6Show/hide
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A0A6J5XM33 Uncharacterized protein4.0e-2856.67Show/hide
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        M NSSS   F   +FT  + +S+ ++       D  L+W+ +  RC G SI+ECM + EF+MDSEINRRILATS YISY +L+ N +PCSRRG+SYYNC+
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 332.4e-2552.89Show/hide
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Q945T0 Rapid alkalinization factor1.1e-2251.85Show/hide
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Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 233.8e-2348.51Show/hide
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Q9MA62 Protein RALF-like 226.7e-2062.67Show/hide
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Q9SRY3 Protein RALF-like 14.5e-2454.39Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 13.2e-2554.39Show/hide
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AT2G33775.1 ralf-like 196.0e-1647.37Show/hide
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AT3G05490.1 ralf-like 224.7e-2162.67Show/hide
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AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 232.7e-2448.51Show/hide
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AT4G15800.1 ralf-like 331.7e-2652.89Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGCAACTCCTCTTCTCCACCTGCCTTTACTATTCTCATTTTCACCGTAGCCGTCTTCGTCTCGTCATCCTCTTTAGCAGTCACGGCCATGAGTAGCGACCAGAGTCT
CAATTGGCTCTCGACGGAAGTACGATGCCATGGACGTTCCATAAGCGAATGCATGATGAACATTGAGTTTGAAATGGATTCTGAGATCAACCGTCGCATCTTAGCCACTT
CGAGTTACATAAGTTACAAGTCGTTGAAGGCAAACAACATTCCATGCTCTCGGAGAGGTTCGTCCTACTACAATTGCCAACCCGGAGCCGAAGCTAACCCGTATCAGCGA
GGTTGTACCGCCATTACTCGTTGCAGAAGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCAGCAATGGGCAACTCCTCTTCTCCACCTGCCTTTACTATTCTCATTTTCACCGTAGCCGTCTTCGTCTCGTCATCCTCTTTAGCAGTCACGGCCATGAGTAGCGACCA
GAGTCTCAATTGGCTCTCGACGGAAGTACGATGCCATGGACGTTCCATAAGCGAATGCATGATGAACATTGAGTTTGAAATGGATTCTGAGATCAACCGTCGCATCTTAG
CCACTTCGAGTTACATAAGTTACAAGTCGTTGAAGGCAAACAACATTCCATGCTCTCGGAGAGGTTCGTCCTACTACAATTGCCAACCCGGAGCCGAAGCTAACCCGTAT
CAGCGAGGTTGTACCGCCATTACTCGTTGCAGAAGCTAAGAAAAGCTCTATCTTCTTGTTTGATTTTTCTCTTTGTAACATAGAATAAATTTGAAAAAGGCTGTGTTGCC
ATGTTGGGTTTGGAGTAGATTTTTAACATTATTGTAAACTTATCTTTACAAATATAAATAAAAAATTCTAAGGAGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGNSSSPPAFTILIFTVAVFVSSSSLAVTAMSSDQSLNWLSTEVRCHGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYNCQPGAEANPYQR
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