; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0001009 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0001009
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionGag/pol protein
Genome locationchr08:21550057..21550625
RNA-Seq ExpressionIVF0001009
SyntenyIVF0001009
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0031748.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold506G00110 [Cucumis melo var. makuwa]8.54e-4058.13Show/hide
Query:  MDLDEQDDVLMARLLKKVFDFNVAFAKSADLVISAHDVTSPNPHSKLAPVP-VDEFTETEG---------RIDVSDDETSVNDENVEPTNTGTTNTVEPN
        MD DEQ DV +ARLLKK F  NVA  KS + +ISA    S +      P P +   ++ E          R DV   ET ++DENV+PTNT  TN VEP+
Subjt:  MDLDEQDDVLMARLLKKVFDFNVAFAKSADLVISAHDVTSPNPHSKLAPVP-VDEFTETEG---------RIDVSDDETSVNDENVEPTNTGTTNTVEPN

Query:  VHNDFQLGIQQSPEISRRMGKKFQQNRRNITTKTGRKKIPSNIPSVPIDEISFYLEENVQ
        V++DFQL  QQSP +SR  GKKFQQNRRNITTKTGRKKIP NIPSVPID ISF+LEENVQ
Subjt:  VHNDFQLGIQQSPEISRRMGKKFQQNRRNITTKTGRKKIPSNIPSVPIDEISFYLEENVQ

KAA0041887.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold67G002840 [Cucumis melo var. makuwa]1.38e-8784.94Show/hide
Query:  MDLDEQDDVLMARLLKKVFDFNVAFAKSADLVISAH----------------DVTSPNPHSKLAPVPVDEFTETEGRIDVSDDETSVNDENVEPTNTGTT
        MDLDEQDDVL+ARLLKKVF FNVAFAKSAD VISA                 DVTSPNPHSKLAPVPVDEFTETEGRIDVSDDETSVNDENVEPTN+GTT
Subjt:  MDLDEQDDVLMARLLKKVFDFNVAFAKSADLVISAH----------------DVTSPNPHSKLAPVPVDEFTETEGRIDVSDDETSVNDENVEPTNTGTT

Query:  NTVEPNVHNDFQLGIQQSPEISRRMGKKFQQNRRNITTKTGRKKIPSNIPSVPIDEISFYLEENVQ
        NTVEPNVHNDFQLG QQSP++SRRMGKKFQQNRRNITTKTGRKKIP NIPSVPIDEISFYLEENVQ
Subjt:  NTVEPNVHNDFQLGIQQSPEISRRMGKKFQQNRRNITTKTGRKKIPSNIPSVPIDEISFYLEENVQ

KAA0060145.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold542G00020 [Cucumis melo var. makuwa]3.64e-4253.16Show/hide
Query:  MDLDEQDDVLMARLLKKVFDFNVAFAKSADLVISA----------------------------------------HDVTSPNPHSKLAPVPVDEFTETEG
        MD D+QD+V + RLLKK F  NVA AKSAD  ISA                                        +DV +PN HSK A +P+DEF   E 
Subjt:  MDLDEQDDVLMARLLKKVFDFNVAFAKSADLVISA----------------------------------------HDVTSPNPHSKLAPVPVDEFTETEG

Query:  RIDVSDDETSVNDENVEPTNTGTTNTVEPNVHNDFQLGIQQSPEISRRMGKKFQQNRRNITTKTGRKKIPSNIPSVPIDEISFYLEENVQ
        R DVS DET  +DENVE  NT TTNTVE +V+NDFQ   QQ PE+SR  GKKFQQN RNITTKTGRKKI  NIPSVPI+ ISF+L ENVQ
Subjt:  RIDVSDDETSVNDENVEPTNTGTTNTVEPNVHNDFQLGIQQSPEISRRMGKKFQQNRRNITTKTGRKKIPSNIPSVPIDEISFYLEENVQ

TYK05410.1 uncharacterized protein E5676_scaffold83G00980 [Cucumis melo var. makuwa]1.44e-7682.39Show/hide
Query:  MDLDEQDDVLMARL-------LKKVFDFNVAFAKSADLVISA--HDVTSPNPHSKLAPVPVDEFTETEGRIDVSDDETSVNDENVEPTNTGTTNTVEPNV
        MDLDEQDDVLMARL       L           + +  V S+   DVTSPNPHSKLAPVPVDEFTETEGRIDVSDDETSVNDENVEPTNTGTTNTVEPNV
Subjt:  MDLDEQDDVLMARL-------LKKVFDFNVAFAKSADLVISA--HDVTSPNPHSKLAPVPVDEFTETEGRIDVSDDETSVNDENVEPTNTGTTNTVEPNV

Query:  HNDFQLGIQQSPEISRRMGKKFQQNRRNITTKTGRKKIPSNIPSVPIDEISFYLEENVQ
        HNDFQLGIQQSPEISRRMGKKFQQNRRNITTKTGRKKIPSNIPSVPIDEISFYLEENVQ
Subjt:  HNDFQLGIQQSPEISRRMGKKFQQNRRNITTKTGRKKIPSNIPSVPIDEISFYLEENVQ

TYK08882.1 uncharacterized protein E5676_scaffold1411G00040 [Cucumis melo var. makuwa]1.96e-4058.86Show/hide
Query:  MDLDEQDDVLMARLLKKVFDFNVAFAKSADLVISAHDVTSPNPHSKLAPVP-VDEFTETEG---------RIDVSDDETSVNDENVEPTNTGTTNTVEPN
        MD DEQDDV +ARLLKK F  NVA  KS + +ISA    S +      P P +   ++ E          R DV   ET ++DENV+PTNT  TN VEP+
Subjt:  MDLDEQDDVLMARLLKKVFDFNVAFAKSADLVISAHDVTSPNPHSKLAPVP-VDEFTETEG---------RIDVSDDETSVNDENVEPTNTGTTNTVEPN

Query:  VHNDFQLGIQQSPEISRRMGKKFQQNRRNITTKTGRKKIPSNIPSVPIDEISFYLEEN
        VH+DFQL  QQS E+SR  GKKFQQNRRNITTKTGRKKIP NIPSVPID ISF+LEEN
Subjt:  VHNDFQLGIQQSPEISRRMGKKFQQNRRNITTKTGRKKIPSNIPSVPIDEISFYLEEN

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7SM94 Uncharacterized protein1.8e-3358.13Show/hide
Query:  MDLDEQDDVLMARLLKKVFDFNVAFAKSADLVISAHDVTSPNPHSKLAPVP-VDEFTETEG---------RIDVSDDETSVNDENVEPTNTGTTNTVEPN
        MD DEQ DV +ARLLKK F  NVA  KS + +ISA    S +      P P +   ++ E          R DV   ET ++DENV+PTNT  TN VEP+
Subjt:  MDLDEQDDVLMARLLKKVFDFNVAFAKSADLVISAHDVTSPNPHSKLAPVP-VDEFTETEG---------RIDVSDDETSVNDENVEPTNTGTTNTVEPN

Query:  VHNDFQLGIQQSPEISRRMGKKFQQNRRNITTKTGRKKIPSNIPSVPIDEISFYLEENVQ
        V++DFQL  QQSP +SR  GKKFQQNRRNITTKTGRKKIP NIPSVPID ISF+LEENVQ
Subjt:  VHNDFQLGIQQSPEISRRMGKKFQQNRRNITTKTGRKKIPSNIPSVPIDEISFYLEENVQ

A0A5A7TJJ3 Uncharacterized protein5.5e-6784.94Show/hide
Query:  MDLDEQDDVLMARLLKKVFDFNVAFAKSADLVISAH----------------DVTSPNPHSKLAPVPVDEFTETEGRIDVSDDETSVNDENVEPTNTGTT
        MDLDEQDDVL+ARLLKKVF FNVAFAKSAD VISA                 DVTSPNPHSKLAPVPVDEFTETEGRIDVSDDETSVNDENVEPTN+GTT
Subjt:  MDLDEQDDVLMARLLKKVFDFNVAFAKSADLVISAH----------------DVTSPNPHSKLAPVPVDEFTETEGRIDVSDDETSVNDENVEPTNTGTT

Query:  NTVEPNVHNDFQLGIQQSPEISRRMGKKFQQNRRNITTKTGRKKIPSNIPSVPIDEISFYLEENVQ
        NTVEPNVHNDFQLG QQSP++SRRMGKKFQQNRRNITTKTGRKKIP NIPSVPIDEISFYLEENVQ
Subjt:  NTVEPNVHNDFQLGIQQSPEISRRMGKKFQQNRRNITTKTGRKKIPSNIPSVPIDEISFYLEENVQ

A0A5A7V2P0 Uncharacterized protein3.1e-3353.16Show/hide
Query:  MDLDEQDDVLMARLLKKVFDFNVAFAKSADLVISA----------------------------------------HDVTSPNPHSKLAPVPVDEFTETEG
        MD D+QD+V + RLLKK F  NVA AKSAD  ISA                                        +DV +PN HSK A +P+DEF   E 
Subjt:  MDLDEQDDVLMARLLKKVFDFNVAFAKSADLVISA----------------------------------------HDVTSPNPHSKLAPVPVDEFTETEG

Query:  RIDVSDDETSVNDENVEPTNTGTTNTVEPNVHNDFQLGIQQSPEISRRMGKKFQQNRRNITTKTGRKKIPSNIPSVPIDEISFYLEENVQ
        R DVS DET  +DENVE  NT TTNTVE +V+NDFQ   QQ PE+SR  GKKFQQN RNITTKTGRKKI  NIPSVPI+ ISF+L ENVQ
Subjt:  RIDVSDDETSVNDENVEPTNTGTTNTVEPNVHNDFQLGIQQSPEISRRMGKKFQQNRRNITTKTGRKKIPSNIPSVPIDEISFYLEENVQ

A0A5D3C226 Uncharacterized protein1.6e-5882.39Show/hide
Query:  MDLDEQDDVLMARL-------LKKVFDFNVAFAKSADLVISA--HDVTSPNPHSKLAPVPVDEFTETEGRIDVSDDETSVNDENVEPTNTGTTNTVEPNV
        MDLDEQDDVLMARL       L           + +  V S+   DVTSPNPHSKLAPVPVDEFTETEGRIDVSDDETSVNDENVEPTNTGTTNTVEPNV
Subjt:  MDLDEQDDVLMARL-------LKKVFDFNVAFAKSADLVISA--HDVTSPNPHSKLAPVPVDEFTETEGRIDVSDDETSVNDENVEPTNTGTTNTVEPNV

Query:  HNDFQLGIQQSPEISRRMGKKFQQNRRNITTKTGRKKIPSNIPSVPIDEISFYLEENVQ
        HNDFQLGIQQSPEISRRMGKKFQQNRRNITTKTGRKKIPSNIPSVPIDEISFYLEENVQ
Subjt:  HNDFQLGIQQSPEISRRMGKKFQQNRRNITTKTGRKKIPSNIPSVPIDEISFYLEENVQ

A0A5D3CC65 Uncharacterized protein6.2e-3458.86Show/hide
Query:  MDLDEQDDVLMARLLKKVFDFNVAFAKSADLVISAHDVTSPNPHSKLAPVP-VDEFTETEG---------RIDVSDDETSVNDENVEPTNTGTTNTVEPN
        MD DEQDDV +ARLLKK F  NVA  KS + +ISA    S +      P P +   ++ E          R DV   ET ++DENV+PTNT  TN VEP+
Subjt:  MDLDEQDDVLMARLLKKVFDFNVAFAKSADLVISAHDVTSPNPHSKLAPVP-VDEFTETEG---------RIDVSDDETSVNDENVEPTNTGTTNTVEPN

Query:  VHNDFQLGIQQSPEISRRMGKKFQQNRRNITTKTGRKKIPSNIPSVPIDEISFYLEEN
        VH+DFQL  QQS E+SR  GKKFQQNRRNITTKTGRKKIP NIPSVPID ISF+LEEN
Subjt:  VHNDFQLGIQQSPEISRRMGKKFQQNRRNITTKTGRKKIPSNIPSVPIDEISFYLEEN

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATTTGGACGAGCAAGATGATGTTCTGATGGCTAGATTGTTGAAGAAAGTTTTTGATTTCAATGTCGCTTTTGCAAAATCAGCTGATCTTGTCATATCAGCTCATGA
TGTTACTTCTCCTAATCCGCATTCAAAACTTGCACCTGTTCCTGTTGATGAATTTACTGAGACTGAGGGAAGGATTGATGTTTCTGATGATGAGACCTCTGTTAATGATG
AAAATGTTGAACCTACTAACACTGGTACAACCAATACTGTTGAACCAAATGTTCATAATGATTTTCAACTTGGGATTCAACAATCCCCTGAAATATCTAGGCGAATGGGG
AAGAAATTTCAGCAGAACCGACGTAACATTACCACCAAGACTGGAAGGAAGAAGATTCCCTCGAACATTCCATCTGTCCCCATAGATGAAATATCTTTTTACCTTGAAGA
AAATGTTCAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATTTGGACGAGCAAGATGATGTTCTGATGGCTAGATTGTTGAAGAAAGTTTTTGATTTCAATGTCGCTTTTGCAAAATCAGCTGATCTTGTCATATCAGCTCATGA
TGTTACTTCTCCTAATCCGCATTCAAAACTTGCACCTGTTCCTGTTGATGAATTTACTGAGACTGAGGGAAGGATTGATGTTTCTGATGATGAGACCTCTGTTAATGATG
AAAATGTTGAACCTACTAACACTGGTACAACCAATACTGTTGAACCAAATGTTCATAATGATTTTCAACTTGGGATTCAACAATCCCCTGAAATATCTAGGCGAATGGGG
AAGAAATTTCAGCAGAACCGACGTAACATTACCACCAAGACTGGAAGGAAGAAGATTCCCTCGAACATTCCATCTGTCCCCATAGATGAAATATCTTTTTACCTTGAAGA
AAATGTTCAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDLDEQDDVLMARLLKKVFDFNVAFAKSADLVISAHDVTSPNPHSKLAPVPVDEFTETEGRIDVSDDETSVNDENVEPTNTGTTNTVEPNVHNDFQLGIQQSPEISRRMG
KKFQQNRRNITTKTGRKKIPSNIPSVPIDEISFYLEENVQ