; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0001076 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0001076
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionDEAD-box ATP-dependent RNA helicase
Genome locationchr05:26694268..26728137
RNA-Seq ExpressionIVF0001076
SyntenyIVF0001076
Gene Ontology termsGO:0003723 - RNA binding (molecular function)
GO:0003724 - RNA helicase activity (molecular function)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0016787 - hydrolase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000629 - ATP-dependent RNA helicase DEAD-box, conserved site
IPR001650 - Helicase, C-terminal
IPR011545 - DEAD/DEAH box helicase domain
IPR014001 - Helicase superfamily 1/2, ATP-binding domain
IPR014014 - RNA helicase, DEAD-box type, Q motif
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004141076.1 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 17 [Cucumis sativus]0.095.19Show/hide
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XP_008460014.1 PREDICTED: DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 17 isoform X1 [Cucumis melo]0.099.37Show/hide
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XP_022946513.1 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 17 isoform X1 [Cucurbita moschata]4.23e-30290.45Show/hide
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XP_022946514.1 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 17 isoform X2 [Cucurbita moschata]2.33e-30390.45Show/hide
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XP_022975312.1 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 17 isoform X2 [Cucurbita maxima]1.82e-30089.81Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CB30 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 17 isoform X19.3e-27399.79Show/hide
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A0A6J1G419 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 17 isoform X27.2e-24190.83Show/hide
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A0A6J1G427 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 17 isoform X17.2e-24190.83Show/hide
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A0A6J1ICQ6 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 17 isoform X21.2e-23890.19Show/hide
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        IAARGLDFP VRCIIQYDPPGEAIEYVHRVGRTARLGERGDSLLFLQPTE DYLQDL+NHGVSLTEY L
Subjt:  IAARGLDFPKVRCIIQYDPPGEAIEYVHRVGRTARLGERGDSLLFLQPTETDYLQDLQNHGVSLTEYLL

A0A6J1IGD1 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 17 isoform X11.2e-23890.19Show/hide
Query:  INEGVKTTAKKMVKEGEIFASCTFASLGLDPTLCDQLRDKMGFEVPTLVQAQAIPAILSRRHVLVNAATGTGKTVAYLVPIIHHLQKSTRRTQRADGTFA
        +NE +KTT KKMVKE EIFASCTFASLGL  TLCD+LRDKMGFEVPTLVQAQAIPAILS RHVLVNAATGTGKTVAYLVPIIHHLQKS RR QRADGTF+
Subjt:  INEGVKTTAKKMVKEGEIFASCTFASLGLDPTLCDQLRDKMGFEVPTLVQAQAIPAILSRRHVLVNAATGTGKTVAYLVPIIHHLQKSTRRTQRADGTFA

Query:  LVLVPTRELCMQVYESLQKLLQRYHWIVPGYITGGESRSKEKARLRKGISILVATPGRLLDHLKNTSSFLYSNLHWIVFDEADRIFELGCGKEVEEILDH
        LVLVPTRELCMQVYE+LQKLL RYHWIVPGYITGGESRSKEKARLRKGISILVATPGRLLDHLKNTSSFLYSNLHWIVFDEADRIFELGCGKEVEEILDH
Subjt:  LVLVPTRELCMQVYESLQKLLQRYHWIVPGYITGGESRSKEKARLRKGISILVATPGRLLDHLKNTSSFLYSNLHWIVFDEADRIFELGCGKEVEEILDH

Query:  LGSRRNIHVKKDNAISSFGFPQQNLLFSATLNEKVIHFAKISLENPIMIGLDAGDSALEFQPSERGRFLGQDINDEVQPIRKEKSFSIADYKIPTQLVQS
        LGS +NI V KDN  SSF FPQQNLLFSATLNEKVI FAKISLENPIMIGLD G++ALEFQPSE GRFLG DINDE QP RKEK   IADYKIPTQLVQS
Subjt:  LGSRRNIHVKKDNAISSFGFPQQNLLFSATLNEKVIHFAKISLENPIMIGLDAGDSALEFQPSERGRFLGQDINDEVQPIRKEKSFSIADYKIPTQLVQS

Query:  YVQAPCGSRLTVLFSVLKYLFERESFEKILVLFSTCDAVDFHYSLFGEFKFSSSESESRPEHLFLKCKIFRLHGSMKPEDRRTTFQAFKTEKLALLLSTD
        YVQAPC SRL VLFSVLKYLFER+ FEK LVLFSTCDAVDFHYSLFG FKFSSSESE R EHLFL CKIFRLHGSMKPEDRRTTFQAFK+EKLALLLSTD
Subjt:  YVQAPCGSRLTVLFSVLKYLFERESFEKILVLFSTCDAVDFHYSLFGEFKFSSSESESRPEHLFLKCKIFRLHGSMKPEDRRTTFQAFKTEKLALLLSTD

Query:  IAARGLDFPKVRCIIQYDPPGEAIEYVHRVGRTARLGERGDSLLFLQPTETDYLQDLQNHGVSLTEYLL
        IAARGLDFP VRCIIQYDPPGEAIEYVHRVGRTARLGERGDSLLFLQPTE DYLQDL+NHGVSLTEY L
Subjt:  IAARGLDFPKVRCIIQYDPPGEAIEYVHRVGRTARLGERGDSLLFLQPTETDYLQDLQNHGVSLTEYLL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0DLB9 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 171.2e-15557.93Show/hide
Query:  GVKTTAKKMVKEGEIFASCTFASLGLDPTLCDQLRDKMGFEVPTLVQAQAIPAILSRRHVLVNAATGTGKTVAYLVPIIHHLQKSTRRTQRADGTFALVL
        G    AK+  KEG +FASC+F  LGL PTLC  L+DKMGF+ PT +QAQAIP  +S +H+LV AATGTGKT+AYL PI+H LQ    R +R DGTFALVL
Subjt:  GVKTTAKKMVKEGEIFASCTFASLGLDPTLCDQLRDKMGFEVPTLVQAQAIPAILSRRHVLVNAATGTGKTVAYLVPIIHHLQKSTRRTQRADGTFALVL

Query:  VPTRELCMQVYESLQKLLQRYHWIVPGYITGGESRSKEKARLRKGISILVATPGRLLDHLKNTSSFLYSNLHWIVFDEADRIFELGCGKEVEEILDHLGS
        VPTRELC+QVY   Q+L+ R+HW+VPGYI GGE+R+KEKARLRKGISIL+ATPGRLLDHL++TSSF+Y N+ WIVFDEAD I ELG GK +E+IL+HLGS
Subjt:  VPTRELCMQVYESLQKLLQRYHWIVPGYITGGESRSKEKARLRKGISILVATPGRLLDHLKNTSSFLYSNLHWIVFDEADRIFELGCGKEVEEILDHLGS

Query:  RRNIHVKKDNAISSFGFPQQNLLFSATLNEKVIHFAKISLENPIMIGLDAGDSALEFQPSERGRFLGQDINDEVQPIRKEKSFSIA----DYKIPTQLVQ
        R +   +  N +      +QNLL SATLNEKV   AKISL+NP+MIGLD  +S      S  G+     ++D+ + I ++ + ++     D+K+P QLVQ
Subjt:  RRNIHVKKDNAISSFGFPQQNLLFSATLNEKVIHFAKISLENPIMIGLDAGDSALEFQPSERGRFLGQDINDEVQPIRKEKSFSIA----DYKIPTQLVQ

Query:  SYVQAPCGSRLTVLFSVLKYLFERESFEKILVLFSTCDAVDFHYSLFGEFKFSSS-ESESRPEHLFLKCKIFRLHGSMKPEDRRTTFQAFKTEKLALLLS
         YV+  CGSRL +L ++LK LFER+   K++V  STCD+VDFH+++  + ++S   + ++  +  F+ CK+FRLHG+M  +DR+ +F  F +EK A+L+S
Subjt:  SYVQAPCGSRLTVLFSVLKYLFERESFEKILVLFSTCDAVDFHYSLFGEFKFSSS-ESESRPEHLFLKCKIFRLHGSMKPEDRRTTFQAFKTEKLALLLS

Query:  TDIAARGLDFPKVRCIIQYDPPGEAIEYVHRVGRTARLGERGDSLLFLQPTETDYLQDLQNHGVSLTEYLLSR
        TD+AARGLDFPKV+CIIQYD PGEA EYVHRVGRTAR+GE+G++LLFLQP ETDYL+DL+ HG SLTEY L +
Subjt:  TDIAARGLDFPKVRCIIQYDPPGEAIEYVHRVGRTARLGERGDSLLFLQPTETDYLQDLQNHGVSLTEYLLSR

Q6NZQ2 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX311.1e-8940.3Show/hide
Query:  TTAKKMVKEGEIFASCTFASLGLDPTLCDQLRDKMGFEVPTLVQAQAIPAILSRRHVLVNAATGTGKTVAYLVPIIHHLQKSTRRTQRADGTFALVLVPT
        +T  K  +E ++F+   F  L L P L   +   +     T VQ Q+IP +L  R  LV + TG+GKT+AY VP++  LQ  T + QR+DG +ALVLVPT
Subjt:  TTAKKMVKEGEIFASCTFASLGLDPTLCDQLRDKMGFEVPTLVQAQAIPAILSRRHVLVNAATGTGKTVAYLVPIIHHLQKSTRRTQRADGTFALVLVPT

Query:  RELCMQVYESLQKLLQRYHWIVPGYITGGESRSKEKARLRKGISILVATPGRLLDHLKNTSSFLYSNLHWIVFDEADRIFELGCGKEVEEILDHLGSRRN
        REL +Q ++++QKLL+ + WIVPG + GGE R  EKARLRKGI+IL++TPGRL+DH+K+T +  ++ + W++ DEADRI +LG  K++  IL        
Subjt:  RELCMQVYESLQKLLQRYHWIVPGYITGGESRSKEKARLRKGISILVATPGRLLDHLKNTSSFLYSNLHWIVFDEADRIFELGCGKEVEEILDHLGSRRN

Query:  IHVKKDNAISSFGFPQQNLLFSATLNEKVIHFAKISLENPIMIGLDAGDSALEFQPSERGRFLGQDINDEVQPIRKE-KSFSIADYKIPTQLVQSYVQAP
              NA+++    +QN+L SATL E V     ISL NP+ I +                 L ++ N   QP  KE  S  +  + IP  L Q  V  P
Subjt:  IHVKKDNAISSFGFPQQNLLFSATLNEKVIHFAKISLENPIMIGLDAGDSALEFQPSERGRFLGQDINDEVQPIRKE-KSFSIADYKIPTQLVQSYVQAP

Query:  CGSRLTVLFSVLKYLFERESFEKILVLFSTCDAVDFHYSLFGEFKFSSSESESRPEHL---FLKCKIFRLHGSMKPEDRRTTFQAFKTEKLALLLSTDIA
           RL  L + +    + E  +K++V FS+C+ V+FHYSLF       S + +  EHL       K  RLHG+M+ E+R + F  F   +  +LL TD+A
Subjt:  CGSRLTVLFSVLKYLFERESFEKILVLFSTCDAVDFHYSLFGEFKFSSSESESRPEHL---FLKCKIFRLHGSMKPEDRRTTFQAFKTEKLALLLSTDIA

Query:  ARGLDFPKVRCIIQYDPPGEAIEYVHRVGRTARLGERGDSLLFLQPTETDYLQDLQNHGVSLTE
        +RGLD P+V  I+QY  P    EY+HR+GRTAR+G  G SLL L P+E +Y+  L +H +++ E
Subjt:  ARGLDFPKVRCIIQYDPPGEAIEYVHRVGRTARLGERGDSLLFLQPTETDYLQDLQNHGVSLTE

Q7XJN0 DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 177.6e-16363.24Show/hide
Query:  IFASCTFASLGLDPTLCDQLRDKMGFEVPTLVQAQAIPAILSRRHVLVNAATGTGKTVAYLVPIIHHLQKSTRRTQRADGTFALVLVPTRELCMQVYESL
        +FASC+F+SLGLD  L DQL+++MGFE PTLVQAQAIP ILS R VLVNA TGTGKT+AYL P+IHHLQ  + +  R+ GTFALV+VPTRELC+QVYE+L
Subjt:  IFASCTFASLGLDPTLCDQLRDKMGFEVPTLVQAQAIPAILSRRHVLVNAATGTGKTVAYLVPIIHHLQKSTRRTQRADGTFALVLVPTRELCMQVYESL

Query:  QKLLQRYHWIVPGYITGGESRSKEKARLRKGISILVATPGRLLDHLKNTSSFLYSNLHWIVFDEADRIFELGCGKEVEEILDHLGSRRNIHVKKDNAISS
        +KLL R+HWIVPGY+ GGE ++KEKARLRKGISIL+ATPGRLLDHLKNT+SF++ NL W++FDEAD I ELG GKE+E+I+  LGS +N   ++D+ +  
Subjt:  QKLLQRYHWIVPGYITGGESRSKEKARLRKGISILVATPGRLLDHLKNTSSFLYSNLHWIVFDEADRIFELGCGKEVEEILDHLGSRRNIHVKKDNAISS

Query:  FGFPQQNLLFSATLNEKVIHFAKISLENPIMIGLDAGDSALEFQPS-ERGRFLGQDINDEVQPIRKEKSFSIADYKIPTQLVQSYVQAPCGSRLTVLFSV
         G  +QNLL SATLN+KV   AK+SL++P+MIGLD  ++ L+   S E       D  D V  + K  +    DY IP+QLVQ Y++ PCG+RL  L SV
Subjt:  FGFPQQNLLFSATLNEKVIHFAKISLENPIMIGLDAGDSALEFQPS-ERGRFLGQDINDEVQPIRKEKSFSIADYKIPTQLVQSYVQAPCGSRLTVLFSV

Query:  LKYLFERESFEKILVLFSTCDAVDFHYSLFGEFKF--SSSESESRPEHLFLKCKIFRLHGSMKPEDRRTTFQAFKTEKLALLLSTDIAARGLDFPKVRCI
        LK LFERE+ +K++V FST DAVDFHYSL  EF++  +S   E   + LFLKCK FRLHGSM+ EDRR+ F  FKTEK A+LLSTD+AARGLDFPKVRCI
Subjt:  LKYLFERESFEKILVLFSTCDAVDFHYSLFGEFKF--SSSESESRPEHLFLKCKIFRLHGSMKPEDRRTTFQAFKTEKLALLLSTDIAARGLDFPKVRCI

Query:  IQYDPPGEAIEYVHRVGRTARLGERGDSLLFLQPTETDYLQDLQNHGVSLTEYLLSR
        IQYD PGEA EYVHRVGRTAR+GE+G++LLFLQP E DYL++L+ HG SLTEY L +
Subjt:  IQYDPPGEAIEYVHRVGRTARLGERGDSLLFLQPTETDYLQDLQNHGVSLTEYLLSR

Q869P0 Probable ATP-dependent RNA helicase ddx312.4e-8436.06Show/hide
Query:  VKEGEIFASCTFASLGLDPTLCDQLRDKMGFEVPTLVQAQAIPAILSRRHVLVNAATGTGKTVAYLVPIIHHLQKSTRRTQRADGTFALVLVPTRELCMQ
        V++ E F+S  + SL L  TL   L   M  E PT +Q  +I  IL     LV A TG+GKT++YL+P++  L  + +R  R+DG + +++ PTREL  Q
Subjt:  VKEGEIFASCTFASLGLDPTLCDQLRDKMGFEVPTLVQAQAIPAILSRRHVLVNAATGTGKTVAYLVPIIHHLQKSTRRTQRADGTFALVLVPTRELCMQ

Query:  VYESLQKLLQRYHWIVPGYITGGESRSKEKARLRKGISILVATPGRLLDHLKNTSSFLYSNLHWIVFDEADRIFELGCGKEVEEILDHLGSRRNIHVKKD
        +YE LQKLL+ ++WIVPG I GGE+RS EKAR+RKGI+ILVATPGRLLDHL+NT SF   N+ W + DEAD++ +LG  K+V  I++ L S++       
Subjt:  VYESLQKLLQRYHWIVPGYITGGESRSKEKARLRKGISILVATPGRLLDHLKNTSSFLYSNLHWIVFDEADRIFELGCGKEVEEILDHLGSRRNIHVKKD

Query:  NAISSFGFPQQNLLFSATLNEKVIHFAKISLENPIMIGLDAGDSALEFQPSERGRFLGQDINDEVQPIRKEKSFSIADYKIPTQLVQSYVQAPCGSRLTV
            +  F +QN+L SATL+E +   A +SL +P+ IGLD+       +  E+G        +  Q   KE        + P QL Q YV+     RLT 
Subjt:  NAISSFGFPQQNLLFSATLNEKVIHFAKISLENPIMIGLDAGDSALEFQPSERGRFLGQDINDEVQPIRKEKSFSIADYKIPTQLVQSYVQAPCGSRLTV

Query:  LFSVLKYLFERESFE-------------KILVLFSTCDAVDFHYSLFGEFKF------------------------------------------------
        L + +++     + +             K++V FS+CD+VDFH+ +F   K                                                 
Subjt:  LFSVLKYLFERESFE-------------KILVLFSTCDAVDFHYSLFGEFKF------------------------------------------------

Query:  ----SSSESESRPEHLFLK-------------------CKIFRLHGSMKPEDRRTTFQAFKTEKLALLLSTDIAARGLDFPKVRCIIQYDPPGEAIEYVH
            ++S+SE+  E    K                     IF+LHG +  + R  TF  FK     +LL+TD++ARGLD P V  I+QYDP  +  +Y+H
Subjt:  ----SSSESESRPEHLFLK-------------------CKIFRLHGSMKPEDRRTTFQAFKTEKLALLLSTDIAARGLDFPKVRCIIQYDPPGEAIEYVH

Query:  RVGRTARLGERGDSLLFLQPTETDYLQDLQNHGVSLTE
        R+GRTARLG +G SLLFL P+E  Y+  L    VS+ E
Subjt:  RVGRTARLGERGDSLLFLQPTETDYLQDLQNHGVSLTE

Q9H8H2 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX315.7e-9440.34Show/hide
Query:  SSSIEYINEGVKTTAKKMVK--EGEIFASCTFASLGLDPTLCDQLRDKMGFEVPTLVQAQAIPAILSRRHVLVNAATGTGKTVAYLVPIIHHLQKSTRRT
        +SS+   N  +    + +VK  + ++F S  F  LGL P L   +   +     T VQ Q+IP +L  R  LV + TG+GKT+AY +P++  LQ    + 
Subjt:  SSSIEYINEGVKTTAKKMVK--EGEIFASCTFASLGLDPTLCDQLRDKMGFEVPTLVQAQAIPAILSRRHVLVNAATGTGKTVAYLVPIIHHLQKSTRRT

Query:  QRADGTFALVLVPTRELCMQVYESLQKLLQRYHWIVPGYITGGESRSKEKARLRKGISILVATPGRLLDHLKNTSSFLYSNLHWIVFDEADRIFELGCGK
        QR+DG +ALVLVPTREL +Q ++++QKLL+ + WIVPG + GGE R  EKARLRKGI+IL++TPGRL+DH+K+T +  +S L W+VFDEADRI +LG  K
Subjt:  QRADGTFALVLVPTRELCMQVYESLQKLLQRYHWIVPGYITGGESRSKEKARLRKGISILVATPGRLLDHLKNTSSFLYSNLHWIVFDEADRIFELGCGK

Query:  EVEEILDHLGSRRNIHVKKDNAISSFGFPQQNLLFSATLNEKVIHFAKISLENPIMIGLDAGDSALEFQPSERGRFLGQDINDEVQPIRKEKSFSIADYK
        ++  IL              NA+++    +QN+L SATL E V   A ISL +P+ I +    S  +  P ++       + +   P   +K  S A   
Subjt:  EVEEILDHLGSRRNIHVKKDNAISSFGFPQQNLLFSATLNEKVIHFAKISLENPIMIGLDAGDSALEFQPSERGRFLGQDINDEVQPIRKEKSFSIADYK

Query:  IPTQLVQSYVQAPCGSRLTVLFSVLKYLFERESFEKILVLFSTCDAVDFHYSLFGEFKFSSSESESRPE--HLFLKCKIFRLHGSMKPEDRRTTFQAFKT
        IP  L Q     P   RL  L + +    + E  +K++V FS+C+ V+FHYSLF +   SSS + +  +     ++ K  RLHG M+ E+R   FQ F  
Subjt:  IPTQLVQSYVQAPCGSRLTVLFSVLKYLFERESFEKILVLFSTCDAVDFHYSLFGEFKFSSSESESRPE--HLFLKCKIFRLHGSMKPEDRRTTFQAFKT

Query:  EKLALLLSTDIAARGLDFPKVRCIIQYDPPGEAIEYVHRVGRTARLGERGDSLLFLQPTETDYLQDLQNHGVSLTE
         +  +LL TD+AARGLD P+V  I+QY+ P    EY+HR+GRTAR+G  G SLL L P+E +Y+  L +H ++++E
Subjt:  EKLALLLSTDIAARGLDFPKVRCIIQYDPPGEAIEYVHRVGRTARLGERGDSLLFLQPTETDYLQDLQNHGVSLTE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G71370.1 DEA(D/H)-box RNA helicase family protein3.7e-4829.84Show/hide
Query:  DKMGFEVPTLVQAQAIPAILSRRHVLVNAATGTGKTVAYLVPIIHHLQKSTRRTQRADGTFALVLVPTRELCMQVYESLQKLLQRYHWIVPGYITGGESR
        D+ GFEV T VQA+ IP + S + V+V+AATG+GKT+A+L+P I  +++S     +      +++ PTREL  Q+++  +  +     +    + GG   
Subjt:  DKMGFEVPTLVQAQAIPAILSRRHVLVNAATGTGKTVAYLVPIIHHLQKSTRRTQRADGTFALVLVPTRELCMQVYESLQKLLQRYHWIVPGYITGGESR

Query:  SKEKARL-RKGISILVATPGRLLDHLKNTSSFLYSNLHWIVFDEADRIFELGCGKEVEEILDHLGSRRNIHVKKDNAISSFGFPQQNLLFSATLNEKVIH
          +   L  +G ++L+ TPGRL D +K      + NL  ++ DEADR+ ++G  K+V  I+  L  +R                 +  LFSAT  + V  
Subjt:  SKEKARL-RKGISILVATPGRLLDHLKNTSSFLYSNLHWIVFDEADRIFELGCGKEVEEILDHLGSRRNIHVKKDNAISSFGFPQQNLLFSATLNEKVIH

Query:  FAKISLENPIMIGLDAGDSALEFQPSERGRFLGQDINDEVQPIRKEKSFSIADYKIPTQLVQSYVQAPCGSRLTVLFSVLKYLFERESFEKILVLFSTCD
         AK  L N +                            EV    + KS      K  + L   Y++     +     S L +L      +K++V F TC 
Subjt:  FAKISLENPIMIGLDAGDSALEFQPSERGRFLGQDINDEVQPIRKEKSFSIADYKIPTQLVQSYVQAPCGSRLTVLFSVLKYLFERESFEKILVLFSTCD

Query:  AVDFHYSLFGEFKFSSSESESRPEHLFLKCKIFRLHGSMKPEDRRTTFQAFKTEKLALLLSTDIAARGLDFPKVRCIIQYDPPGEAIEYVHRVGRTARLG
         VD+   +  +     S S             F  HG M  + R T   +F      +LL TD+AARGLD P +  ++QYDPP +   ++HRVGRTAR+ 
Subjt:  AVDFHYSLFGEFKFSSSESESRPEHLFLKCKIFRLHGSMKPEDRRTTFQAFKTEKLALLLSTDIAARGLDFPKVRCIIQYDPPGEAIEYVHRVGRTARLG

Query:  ERGDSLLFLQPTETDYLQDLQNHGVSLTE
         +G +++FL P ETDY++ ++   V L E
Subjt:  ERGDSLLFLQPTETDYLQDLQNHGVSLTE

AT2G40700.1 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein5.4e-16463.24Show/hide
Query:  IFASCTFASLGLDPTLCDQLRDKMGFEVPTLVQAQAIPAILSRRHVLVNAATGTGKTVAYLVPIIHHLQKSTRRTQRADGTFALVLVPTRELCMQVYESL
        +FASC+F+SLGLD  L DQL+++MGFE PTLVQAQAIP ILS R VLVNA TGTGKT+AYL P+IHHLQ  + +  R+ GTFALV+VPTRELC+QVYE+L
Subjt:  IFASCTFASLGLDPTLCDQLRDKMGFEVPTLVQAQAIPAILSRRHVLVNAATGTGKTVAYLVPIIHHLQKSTRRTQRADGTFALVLVPTRELCMQVYESL

Query:  QKLLQRYHWIVPGYITGGESRSKEKARLRKGISILVATPGRLLDHLKNTSSFLYSNLHWIVFDEADRIFELGCGKEVEEILDHLGSRRNIHVKKDNAISS
        +KLL R+HWIVPGY+ GGE ++KEKARLRKGISIL+ATPGRLLDHLKNT+SF++ NL W++FDEAD I ELG GKE+E+I+  LGS +N   ++D+ +  
Subjt:  QKLLQRYHWIVPGYITGGESRSKEKARLRKGISILVATPGRLLDHLKNTSSFLYSNLHWIVFDEADRIFELGCGKEVEEILDHLGSRRNIHVKKDNAISS

Query:  FGFPQQNLLFSATLNEKVIHFAKISLENPIMIGLDAGDSALEFQPS-ERGRFLGQDINDEVQPIRKEKSFSIADYKIPTQLVQSYVQAPCGSRLTVLFSV
         G  +QNLL SATLN+KV   AK+SL++P+MIGLD  ++ L+   S E       D  D V  + K  +    DY IP+QLVQ Y++ PCG+RL  L SV
Subjt:  FGFPQQNLLFSATLNEKVIHFAKISLENPIMIGLDAGDSALEFQPS-ERGRFLGQDINDEVQPIRKEKSFSIADYKIPTQLVQSYVQAPCGSRLTVLFSV

Query:  LKYLFERESFEKILVLFSTCDAVDFHYSLFGEFKF--SSSESESRPEHLFLKCKIFRLHGSMKPEDRRTTFQAFKTEKLALLLSTDIAARGLDFPKVRCI
        LK LFERE+ +K++V FST DAVDFHYSL  EF++  +S   E   + LFLKCK FRLHGSM+ EDRR+ F  FKTEK A+LLSTD+AARGLDFPKVRCI
Subjt:  LKYLFERESFEKILVLFSTCDAVDFHYSLFGEFKF--SSSESESRPEHLFLKCKIFRLHGSMKPEDRRTTFQAFKTEKLALLLSTDIAARGLDFPKVRCI

Query:  IQYDPPGEAIEYVHRVGRTARLGERGDSLLFLQPTETDYLQDLQNHGVSLTEYLLSR
        IQYD PGEA EYVHRVGRTAR+GE+G++LLFLQP E DYL++L+ HG SLTEY L +
Subjt:  IQYDPPGEAIEYVHRVGRTARLGERGDSLLFLQPTETDYLQDLQNHGVSLTEYLLSR

AT3G18600.1 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein7.3e-6034.04Show/hide
Query:  IEYINEGVKTTAKKMVKEGEIFASCTFASLGLDPTLCDQLRDKMGFEVPTLVQAQAIPAILSRRHVLVNAATGTGKTVAYLVPIIHHLQKSTRRTQRADG
        +E + +G       +V +G I  + TF SL L       +++ MGF+  T +QA +I  +L  + VL  A TG+GKT+A+L+P +  L K   R    +G
Subjt:  IEYINEGVKTTAKKMVKEGEIFASCTFASLGLDPTLCDQLRDKMGFEVPTLVQAQAIPAILSRRHVLVNAATGTGKTVAYLVPIIHHLQKSTRRTQRADG

Query:  TFALVLVPTRELCMQVYESLQKLLQRYHWIVPGYITGGESRSKEKARLRKGISILVATPGRLLDHLKNTSSFLYSNLHWIVFDEADRIFELGCGKEVEEI
        T  +V+ PTREL +Q     ++LL ++H      + GG +R  E  R+  G ++++ATPGRLLDHL+NT +F+Y +L  +V DEADRI E    +++ +I
Subjt:  TFALVLVPTRELCMQVYESLQKLLQRYHWIVPGYITGGESRSKEKARLRKGISILVATPGRLLDHLKNTSSFLYSNLHWIVFDEADRIFELGCGKEVEEI

Query:  LDHLGSRRNIHVKKDNAISSFGFPQQNLLFSATLNEKVIHFAKISLENPIMIGLDAGDSALEFQPSERGRFLGQDINDEVQPIRKEKSFSIADYKIPTQL
        L  L   R                 Q  LFSAT   KV   A++SL +P+ + +D G   +  +  E+G                               
Subjt:  LDHLGSRRNIHVKKDNAISSFGFPQQNLLFSATLNEKVIHFAKISLENPIMIGLDAGDSALEFQPSERGRFLGQDINDEVQPIRKEKSFSIADYKIPTQL

Query:  VQSYVQAPCGSRLTVLFSVLKYLFERESFEKILVLFSTCDAVDFHYSLFGEFKFSSSESESRPEHLFLKCKIFRLHGSMKPEDRRTTFQAFKTEKLALLL
           Y   P   RL +L S LK    +   +KI+V FSTC +V FH  +    K S  +             +  +HG M    R  TF  F   K  +LL
Subjt:  VQSYVQAPCGSRLTVLFSVLKYLFERESFEKILVLFSTCDAVDFHYSLFGEFKFSSSESESRPEHLFLKCKIFRLHGSMKPEDRRTTFQAFKTEKLALLL

Query:  STDIAARGLDFPKVRCIIQYDPPGEAIEYVHRVGRTAR-LGERGDSLLFLQPTETDYLQDLQNHGVSLTE
         TD+AARGLD P V  IIQYDPP +  EY+HRVGRTAR  G +G +LL L P E  +++ L+   V + E
Subjt:  STDIAARGLDFPKVRCIIQYDPPGEAIEYVHRVGRTAR-LGERGDSLLFLQPTETDYLQDLQNHGVSLTE

AT5G05450.1 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein8.9e-5029.64Show/hide
Query:  LDPTLCDQLRDKMG---FEVPTLVQAQAIPAILSRRHVLVNAATGTGKTVAYLVPIIHHLQKSTRRTQRADGTFALVLVPTRELCMQVYESLQKLLQRYH
        L+P L   + + +    FE  T VQA  IP + S + V V+AATG+GKT+A++VP++  L++ST    +      +++ PTREL  Q+Y   Q  +    
Subjt:  LDPTLCDQLRDKMG---FEVPTLVQAQAIPAILSRRHVLVNAATGTGKTVAYLVPIIHHLQKSTRRTQRADGTFALVLVPTRELCMQVYESLQKLLQRYH

Query:  WIVPGYITGG-ESRSKEKARLRKGISILVATPGRLLDHLKNTSSFLYSNLHWIVFDEADRIFELGCGKEVEEILDHLGSRRNIHVKKDNAISSFGFPQQN
         +    + GG E ++  K    +G ++L+ TPGRL D ++      + NL  ++ DEADR+ E+G  ++V  I+  L  +R                 + 
Subjt:  WIVPGYITGG-ESRSKEKARLRKGISILVATPGRLLDHLKNTSSFLYSNLHWIVFDEADRIFELGCGKEVEEILDHLGSRRNIHVKKDNAISSFGFPQQN

Query:  LLFSATLNEKVIHFAKISLENPIMIGLDAGDSALEFQPSERGRFLGQDINDEVQPIRKEKSFSIADYKIPTQLVQSYVQAPCGSRLTVLFSVLKYLFERE
         LFSAT  E V   AK  L NP+ + + A                           + E S  + + K P+ L   Y++     + + L  +L     + 
Subjt:  LLFSATLNEKVIHFAKISLENPIMIGLDAGDSALEFQPSERGRFLGQDINDEVQPIRKEKSFSIADYKIPTQLVQSYVQAPCGSRLTVLFSVLKYLFERE

Query:  SFEKILVLFSTCDAVDFHYSLFGEFKFSSSESESRPEHLFLKCKIFRLHGSMKPEDRRTTFQAFKTEKLALLLSTDIAARGLDFPKVRCIIQYDPPGEAI
        S +K++V F TC +VD+   +  +     S S            +  +HG MK   R     +F       LL TD+AARGLD P +  ++QYDPP +  
Subjt:  SFEKILVLFSTCDAVDFHYSLFGEFKFSSSESESRPEHLFLKCKIFRLHGSMKPEDRRTTFQAFKTEKLALLLSTDIAARGLDFPKVRCIIQYDPPGEAI

Query:  EYVHRVGRTARLGERGDSLLFLQPTETDYLQDLQNHGVSLTE
         + HR GRTARLG +G +++FL P E  Y++ ++   V L E
Subjt:  EYVHRVGRTARLGERGDSLLFLQPTETDYLQDLQNHGVSLTE

AT5G65900.1 DEA(D/H)-box RNA helicase family protein2.0e-6536.38Show/hide
Query:  KKMVKEGEIFASCTFASLGLDPTLCDQLRDKMGFEVPTLVQAQAIPAILSRRHVLVNAATGTGKTVAYLVPIIHHLQKSTRRTQRADGTFALVLVPTREL
        +K ++E  I  + TF SL L       +++ MGF   T +QA+AIP ++    VL  A TG+GKT+A+L+P +  L +  + T R +GT  LV+ PTREL
Subjt:  KKMVKEGEIFASCTFASLGLDPTLCDQLRDKMGFEVPTLVQAQAIPAILSRRHVLVNAATGTGKTVAYLVPIIHHLQKSTRRTQRADGTFALVLVPTREL

Query:  CMQVYESLQKLLQRYHWIVPGYITGGESRSKEKARLRKGISILVATPGRLLDHLKNTSSFLYSNLHWIVFDEADRIFELGCGKEVEEILDHLGSRRNIHV
         +Q Y   ++LL +YH    G + GGE R  E   L KG+++LVATPGRLLDHL+NT+ F++ NL ++V DEADRI E    +++++IL+ L   R    
Subjt:  CMQVYESLQKLLQRYHWIVPGYITGGESRSKEKARLRKGISILVATPGRLLDHLKNTSSFLYSNLHWIVFDEADRIFELGCGKEVEEILDHLGSRRNIHV

Query:  KKDNAISSFGFPQQNLLFSATLNEKVIHFAKISLENPIMIGLDAGDSALEFQPSERGRFLGQDINDEVQPIRKEKSFSIADYKIPTQLVQSYVQAPCGSR
                     Q  LFSAT + KV   A++SL +P+ I +D G                          RKE +           L Q Y   P   R
Subjt:  KKDNAISSFGFPQQNLLFSATLNEKVIHFAKISLENPIMIGLDAGDSALEFQPSERGRFLGQDINDEVQPIRKEKSFSIADYKIPTQLVQSYVQAPCGSR

Query:  LTVLFSVLKYLFERESFEKILVLFSTCDAVDFHYSLFGEFKFSSSESESRPEHLFLKCKIFRLHGSMKPEDRRTTFQAFKTEKLALLLSTDIAARGLDFP
        L  L + LK     +  +KI+V FSTC +  FH  LF   KF   E                + G +    R  TF  F   +  +LL T++AARGLDFP
Subjt:  LTVLFSVLKYLFERESFEKILVLFSTCDAVDFHYSLFGEFKFSSSESESRPEHLFLKCKIFRLHGSMKPEDRRTTFQAFKTEKLALLLSTDIAARGLDFP

Query:  KVRCIIQYDPPGEAIEYVHRVGRTAR-LGERGDSLLFLQPTETDYLQDLQNHGVSLTEY
         V  I+QYDPP    +Y+HRVGRTAR  G +G +LL L P E  ++Q L+   + + E+
Subjt:  KVRCIIQYDPPGEAIEYVHRVGRTAR-LGERGDSLLFLQPTETDYLQDLQNHGVSLTEY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTAGCAGCATCGAATACATCAACGAAGGGGTGAAAACGACAGCAAAGAAAATGGTTAAAGAGGGTGAGATTTTTGCGTCTTGTACTTTCGCCAGCCTCGGTCTGGA
CCCTACTCTATGCGACCAACTCCGAGATAAAATGGGATTTGAAGTTCCTACGCTTGTACAGGCTCAAGCAATTCCGGCTATTTTATCCAGGCGTCATGTTCTTGTTAATG
CAGCCACAGGCACAGGCAAAACAGTTGCGTATTTGGTTCCAATCATCCATCACTTGCAGAAATCCACTCGTAGGACTCAGCGCGCTGATGGAACTTTCGCGTTGGTTCTT
GTACCGACGCGAGAGCTATGCATGCAGGTCTACGAAAGTCTACAAAAACTATTACAACGTTATCACTGGATTGTCCCTGGTTACATAACAGGTGGAGAAAGTCGGTCGAA
AGAGAAAGCGAGGTTGCGGAAAGGTATATCAATTTTAGTTGCAACACCAGGTCGGCTCTTGGATCATTTAAAGAACACATCATCCTTTTTGTACTCAAATTTGCATTGGA
TAGTGTTTGATGAGGCAGATAGAATTTTCGAATTAGGATGTGGCAAAGAAGTTGAGGAAATACTGGATCATTTGGGCTCAAGAAGGAATATTCATGTCAAAAAGGATAAT
GCAATTTCAAGTTTTGGATTCCCGCAGCAAAATTTGCTCTTTTCAGCTACCTTAAATGAAAAAGTAATTCATTTTGCCAAAATTAGTTTAGAGAATCCCATTATGATTGG
TCTTGATGCTGGCGACAGTGCCCTTGAATTTCAACCATCTGAACGTGGTCGATTTTTGGGACAAGACATAAATGATGAAGTCCAACCCATACGGAAGGAAAAGAGCTTTT
CAATTGCAGATTATAAAATTCCAACCCAGTTAGTTCAGAGTTACGTGCAAGCACCTTGTGGTTCTCGGTTGACTGTGCTTTTTTCTGTCCTGAAGTATTTATTTGAGAGA
GAATCCTTTGAGAAGATTTTGGTACTCTTTTCAACATGTGATGCTGTAGATTTCCACTACTCCCTATTTGGTGAGTTCAAATTCTCCTCTTCAGAATCAGAATCGAGGCC
TGAACATTTGTTTCTTAAATGCAAGATTTTCCGGTTGCATGGGAGTATGAAGCCGGAAGATCGTAGAACAACATTTCAGGCCTTCAAAACAGAGAAGCTGGCTCTTCTTC
TATCCACTGATATTGCTGCTAGGGGGTTGGATTTTCCAAAAGTTAGGTGTATCATTCAATATGATCCTCCAGGAGAGGCAATTGAGTATGTGCATAGGGTTGGAAGAACT
GCTCGCTTAGGGGAAAGAGGAGACTCGTTGTTATTCCTGCAACCAACTGAAACAGATTATTTGCAAGATTTGCAGAACCATGGTGTATCTCTTACTGAATACCTCTTGTC
AAGGTGTTGGATAGTTTTCCAGCTCGTGGCAGGAAGCAGTTTGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GACAGTCGTAGAATTTTTTTTGATTTCTGGTAATATCGTGTAATTTTACCTCCTTTTCTGTCTCGCCTTCTCCCACCGTCCTCTTTCTGCCGTGGCCGCTCCATCTGCCC
TCCCCACCGTCTTCTTACTGCGGCACCCACGTCCGCAGCCGCACCGACGCCGCCTTCACATCGTTGCCATTGAAACACCTGGCGAAAGTTGGCAGCACCTAGAACTTGGG
AGCAGGCAGCCGCATAGCAGGTTAGGCTGAGCTCCTGGGATGAGTAGCAGCATCGAATACATCAACGAAGGGGTGAAAACGACAGCAAAGAAAATGGTTAAAGAGGGTGA
GATTTTTGCGTCTTGTACTTTCGCCAGCCTCGGTCTGGACCCTACTCTATGCGACCAACTCCGAGATAAAATGGGATTTGAAGTTCCTACGCTTGTACAGGCTCAAGCAA
TTCCGGCTATTTTATCCAGGCGTCATGTTCTTGTTAATGCAGCCACAGGCACAGGCAAAACAGTTGCGTATTTGGTTCCAATCATCCATCACTTGCAGAAATCCACTCGT
AGGACTCAGCGCGCTGATGGAACTTTCGCGTTGGTTCTTGTACCGACGCGAGAGCTATGCATGCAGGTCTACGAAAGTCTACAAAAACTATTACAACGTTATCACTGGAT
TGTCCCTGGTTACATAACAGGTGGAGAAAGTCGGTCGAAAGAGAAAGCGAGGTTGCGGAAAGGTATATCAATTTTAGTTGCAACACCAGGTCGGCTCTTGGATCATTTAA
AGAACACATCATCCTTTTTGTACTCAAATTTGCATTGGATAGTGTTTGATGAGGCAGATAGAATTTTCGAATTAGGATGTGGCAAAGAAGTTGAGGAAATACTGGATCAT
TTGGGCTCAAGAAGGAATATTCATGTCAAAAAGGATAATGCAATTTCAAGTTTTGGATTCCCGCAGCAAAATTTGCTCTTTTCAGCTACCTTAAATGAAAAAGTAATTCA
TTTTGCCAAAATTAGTTTAGAGAATCCCATTATGATTGGTCTTGATGCTGGCGACAGTGCCCTTGAATTTCAACCATCTGAACGTGGTCGATTTTTGGGACAAGACATAA
ATGATGAAGTCCAACCCATACGGAAGGAAAAGAGCTTTTCAATTGCAGATTATAAAATTCCAACCCAGTTAGTTCAGAGTTACGTGCAAGCACCTTGTGGTTCTCGGTTG
ACTGTGCTTTTTTCTGTCCTGAAGTATTTATTTGAGAGAGAATCCTTTGAGAAGATTTTGGTACTCTTTTCAACATGTGATGCTGTAGATTTCCACTACTCCCTATTTGG
TGAGTTCAAATTCTCCTCTTCAGAATCAGAATCGAGGCCTGAACATTTGTTTCTTAAATGCAAGATTTTCCGGTTGCATGGGAGTATGAAGCCGGAAGATCGTAGAACAA
CATTTCAGGCCTTCAAAACAGAGAAGCTGGCTCTTCTTCTATCCACTGATATTGCTGCTAGGGGGTTGGATTTTCCAAAAGTTAGGTGTATCATTCAATATGATCCTCCA
GGAGAGGCAATTGAGTATGTGCATAGGGTTGGAAGAACTGCTCGCTTAGGGGAAAGAGGAGACTCGTTGTTATTCCTGCAACCAACTGAAACAGATTATTTGCAAGATTT
GCAGAACCATGGTGTATCTCTTACTGAATACCTCTTGTCAAGGTGTTGGATAGTTTTCCAGCTCGTGGCAGGAAGCAGTTTGTAGAAAAGCTTGTTTCTTTGGAGTCACA
TTCCTGGATCATGTTCTTGCAGAGGGCTGTCGAATCGTTCGTTGCAGCTGAGCCAGGAATGATGAAACTGGCCCAGAAAGCGTTTTGCTCTTGGGTTCGTGCATATACTG
CTCATCGTGGTGAGTTGAAAAGAATTTTTGTGGTGAAGAAACTTCATTTGGGGCATGTTGCAAAGAGCTTTGCGTTGAAACAACAACCATCTGTTGTTGGAAAATCATTC
AAGAAACAGGTAAAGAAGAGGAAAAGAGATTCAAGGCAGGATGTCTCATCATCAAAAAAGAGGACTTTGTAAATCGGTGGAAAGGGTAAAAGCATGGACGGGCTCGTGGT
GAATGTGTAAAGTAACTGTTGATTCATTGTCTACTTTTTCTACATGGTAGCAATTTGAGTGCTGCGACTGTGAACTGTGTTTTCATGTCTAGGGTCGTGTGCATCAACTG
CAAAGCACCTCCTTCAAATTTTGAATTATTTTTGGTTCGGTCCCCATGTTTGTCATGAGTTAGGTGTATGCAACATATAATCCAAATCTATACTATAATTGATTTTGAGT
TGGATTAATTGGTATGTGTACGTACAATATCAAATATAGCACAAAATTGAAACTATTTAAAAAATATAGCAAAAAACTTAAACGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSSIEYINEGVKTTAKKMVKEGEIFASCTFASLGLDPTLCDQLRDKMGFEVPTLVQAQAIPAILSRRHVLVNAATGTGKTVAYLVPIIHHLQKSTRRTQRADGTFALVL
VPTRELCMQVYESLQKLLQRYHWIVPGYITGGESRSKEKARLRKGISILVATPGRLLDHLKNTSSFLYSNLHWIVFDEADRIFELGCGKEVEEILDHLGSRRNIHVKKDN
AISSFGFPQQNLLFSATLNEKVIHFAKISLENPIMIGLDAGDSALEFQPSERGRFLGQDINDEVQPIRKEKSFSIADYKIPTQLVQSYVQAPCGSRLTVLFSVLKYLFER
ESFEKILVLFSTCDAVDFHYSLFGEFKFSSSESESRPEHLFLKCKIFRLHGSMKPEDRRTTFQAFKTEKLALLLSTDIAARGLDFPKVRCIIQYDPPGEAIEYVHRVGRT
ARLGERGDSLLFLQPTETDYLQDLQNHGVSLTEYLLSRCWIVFQLVAGSSL