; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0001090 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0001090
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptionethylene-responsive transcription factor ERF014-like
Genome locationchr03:12287301..12287918
RNA-Seq ExpressionIVF0001090
SyntenyIVF0001090
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0055085 - transmembrane transport (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0140359 - ABC-type transmembrane transporter activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001471 - AP2/ERF domain
IPR016177 - DNA-binding domain superfamily
IPR036955 - AP2/ERF domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KGN45974.2 hypothetical protein Csa_005716, partial [Cucumis sativus]1.50e-13094.15Show/hide
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XP_008465586.1 PREDICTED: ethylene-responsive transcription factor ERF014-like [Cucumis melo]4.66e-141100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KC86 AP2/ERF domain-containing protein1.4e-10094.15Show/hide
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A0A1S3CP73 ethylene-responsive transcription factor ERF014-like1.8e-108100Show/hide
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A0A5A7V9Q9 Ethylene-responsive transcription factor ERF014-like protein1.8e-108100Show/hide
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A0A6J1HNG9 ethylene-responsive transcription factor ERF0142.6e-7576.92Show/hide
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A0A6J1JL79 ethylene-responsive transcription factor ERF0146.8e-7675Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9CAP4 Ethylene-responsive transcription factor ERF0135.8e-3247.06Show/hide
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Q9LPE8 Ethylene-responsive transcription factor ERF0143.8e-3954.73Show/hide
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Q9LU18 Ethylene-responsive transcription factor ERF0367.4e-1937.62Show/hide
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Q9M210 Ethylene-responsive transcription factor ERF0353.3e-1937.5Show/hide
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Q9SFE4 Ethylene-responsive transcription factor ERF0125.1e-3653.4Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G21910.1 Integrase-type DNA-binding superfamily protein3.6e-3753.4Show/hide
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AT1G44830.1 Integrase-type DNA-binding superfamily protein2.7e-4054.73Show/hide
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        AA AAA          +    SS V   SPLLSS S       S S  D   ++S+  SW+N  D          +        + DDF+EE DIRLW+F
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        C
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AT1G77640.1 Integrase-type DNA-binding superfamily protein4.1e-3347.06Show/hide
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        LWSF
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AT3G16280.1 Integrase-type DNA-binding superfamily protein5.2e-2037.62Show/hide
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        +K   +  + S+S       Y+GVRMRSWG WVSEIR P +KTRIWLG++ TA+ AARA+D A L +KGSSA LNFP  +S F    +        SP  
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          + + LWSF
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AT3G60490.1 Integrase-type DNA-binding superfamily protein2.4e-2037.5Show/hide
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        +K   +DDN +   PTS   Y+GVRMRSWG WVSEIR P +K+RIWLG+Y TAE AARA+D A L +KG+S  LNFP            L      SPK 
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Query:  IQRFAAEAAANTAFFDGIVESNMAGSSDVPPLSPLLSSSSSSSSSFSSTSNSDSFT---MSDPSWFNFDDILSPKYVGQMMDWTLFDPPVMDDFYEESDI
        IQ  A +AA  T +   +++  +A       L     SS+SSS  FSS ++  S T    ++ + F+  D+ +   +     + L +       Y E D+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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