; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0001102 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0001102
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptionprotein SAMBA isoform X1
Genome locationchr04:926299..928841
RNA-Seq ExpressionIVF0001102
SyntenyIVF0001102
Gene Ontology termsGO:0046621 - negative regulation of organ growth (biological process)
GO:0010997 - anaphase-promoting complex binding (molecular function)
InterPro domainsIPR037547 - Protein SAMBA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004136197.1 protein SAMBA isoform X1 [Cucumis sativus]3.58e-7197.35Show/hide
Query:  MNTPSPANSSASTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVALS
        MNTPSPANSS STTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQV LS
Subjt:  MNTPSPANSSASTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVALS

Query:  SKRHKRKEGNGSD
        SKR KRKEGNGSD
Subjt:  SKRHKRKEGNGSD

XP_008466002.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103503566 isoform X1 [Cucumis melo]1.30e-73100Show/hide
Query:  MNTPSPANSSASTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVALS
        MNTPSPANSSASTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVALS
Subjt:  MNTPSPANSSASTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVALS

Query:  SKRHKRKEGNGSD
        SKRHKRKEGNGSD
Subjt:  SKRHKRKEGNGSD

XP_022131247.1 protein SAMBA isoform X1 [Momordica charantia]5.29e-6487.61Show/hide
Query:  MNTPSPANSSASTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVALS
        MN+ SPANSS STTAVAGRCSTNAA+S+DDFRFP+NLIS+PERKDEAM+ALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRSRINLMSRQGANC+AIPYQV LS
Subjt:  MNTPSPANSSASTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVALS

Query:  SKRHKRKEGNGSD
        SKR KR+E NGSD
Subjt:  SKRHKRKEGNGSD

XP_023553751.1 protein SAMBA isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.22e-6286.49Show/hide
Query:  MNTPSPANSSASTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVALS
        MNT SPANSS STT VAGRC+TNAA+SLDDFRFP+NL+S+ ERKDEAM+ALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQV +S
Subjt:  MNTPSPANSSASTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVALS

Query:  SKRHKRKEGNG
        SKR KRK+ NG
Subjt:  SKRHKRKEGNG

XP_038888367.1 protein SAMBA isoform X1 [Benincasa hispida]4.71e-6792.04Show/hide
Query:  MNTPSPANSSASTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVALS
        MNT SPANSS STTAVAGRCSTNAA+SLDDFRFP+NLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMS+QGANCHAIPYQV +S
Subjt:  MNTPSPANSSASTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVALS

Query:  SKRHKRKEGNGSD
        SKR KRKE NGSD
Subjt:  SKRHKRKEGNGSD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CQ80 uncharacterized protein LOC103503566 isoform X14.8e-55100Show/hide
Query:  MNTPSPANSSASTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVALS
        MNTPSPANSSASTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVALS
Subjt:  MNTPSPANSSASTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVALS

Query:  SKRHKRKEGNGSD
        SKRHKRKEGNGSD
Subjt:  SKRHKRKEGNGSD

A0A5A7TB46 Uncharacterized protein6.3e-39100Show/hide
Query:  MNTPSPANSSASTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQG
        MNTPSPANSSASTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQG
Subjt:  MNTPSPANSSASTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQG

A0A6J1BQF8 protein SAMBA isoform X19.6e-4887.61Show/hide
Query:  MNTPSPANSSASTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVALS
        MN+ SPANSS STTAVAGRCSTNAA+S+DDFRFP+NLIS+PERKDEAM+ALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRSRINLMSRQGANC+AIPYQV LS
Subjt:  MNTPSPANSSASTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVALS

Query:  SKRHKRKEGNGSD
        SKR KR+E NGSD
Subjt:  SKRHKRKEGNGSD

A0A6J1HIC3 protein SAMBA isoform X11.5e-4585.59Show/hide
Query:  MNTPSPANSSASTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVALS
        MNT SPANSS STT VAGRC+TNAA+SLDDFRFP+NL+S+ ERKDEAM+ALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQV +S
Subjt:  MNTPSPANSSASTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVALS

Query:  SKRHKRKEGNG
        SKR KRK+ +G
Subjt:  SKRHKRKEGNG

A0A6J1HU80 protein SAMBA isoform X13.8e-4484.68Show/hide
Query:  MNTPSPANSSASTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVALS
        M T SPANSS STT VAGRC+TNAA+SLDDFRFP+NL+S+ ERKDEAM+ALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINL SRQGANCHAIPYQV +S
Subjt:  MNTPSPANSSASTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVALS

Query:  SKRHKRKEGNG
        SKR KRK+ NG
Subjt:  SKRHKRKEGNG

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9C613 Protein SAMBA3.3e-2162.5Show/hide
Query:  MNTPSPANSSASTTAVA-GRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQG
        MN  SPA+S  STTAVA G  S+ AA  LDDF FP ++ S+ ERKDEAM  LK+++M  L+KEVKSL++D+WMFEGPRSRI+L+SR+G
Subjt:  MNTPSPANSSASTTAVA-GRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32310.1 unknown protein2.4e-2262.5Show/hide
Query:  MNTPSPANSSASTTAVA-GRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQG
        MN  SPA+S  STTAVA G  S+ AA  LDDF FP ++ S+ ERKDEAM  LK+++M  L+KEVKSL++D+WMFEGPRSRI+L+SR+G
Subjt:  MNTPSPANSSASTTAVA-GRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATACACCGTCCCCGGCCAATTCTTCCGCTTCCACCACGGCGGTTGCCGGAAGGTGTAGCACTAACGCCGCACTGTCGCTTGACGATTTTCGCTTTCCCTCTAATTT
AATTTCCGTACCAGAGCGCAAGGACGAGGCCATGACCGCTCTTAAATCTAATATAATGGCTGCACTGAATAAGGAGGTCAAATCCCTAGATGATGATAACTGGATGTTTG
AAGGTCCTCGCTCCCGTATCAACCTTATGTCACGACAAGGTGCTAATTGCCATGCAATTCCCTATCAGGTGGCGCTTTCCTCAAAAAGACACAAGAGAAAAGAAGGTAAT
GGATCAGATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTTACCTCTTTGACCTCACAAATTTTGGGAAATTGTCACAAAGTATTTGAACTTTTTTCCAATTGAGAGCAAAAAATTCAAAACCCTAATCTTCTCCATTTTGCTGAAT
CGAATGAATACACCGTCCCCGGCCAATTCTTCCGCTTCCACCACGGCGGTTGCCGGAAGGTGTAGCACTAACGCCGCACTGTCGCTTGACGATTTTCGCTTTCCCTCTAA
TTTAATTTCCGTACCAGAGCGCAAGGACGAGGCCATGACCGCTCTTAAATCTAATATAATGGCTGCACTGAATAAGGAGGTCAAATCCCTAGATGATGATAACTGGATGT
TTGAAGGTCCTCGCTCCCGTATCAACCTTATGTCACGACAAGGTGCTAATTGCCATGCAATTCCCTATCAGGTGGCGCTTTCCTCAAAAAGACACAAGAGAAAAGAAGGT
AATGGATCAGATTGATGAGAATGATCTTCATCTTGGAGAAATCTTGTGATTGTGCTGCGACAATAAGGTTTCATTTATTCAATCAAGTAATCAATTCCTCTTTTTCAGTC
TAGTTTTTTTTTTTTGTAGATGTAAAGAGTTTGCTAATAAATACTTGTCCAAATGAAACCTTGCAAACATAGAATTATGTGAAACACTTCTAACCTCTTGTTTGAATTGA
CTTATCAAGTGCTTAAAAAAAAAATCCAAGCGAAGAAAATGTTTTTTTAAGCACTTAAAAAGTCAATCAAATAGATTATTAACATTGATGAAATGATTTAATTCATCCAT
CAGACATATGGATCCAGTGCAGTTGGCTTCCCATAATGGACGATAGTTCATAAAATATCTCATAGTAGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNTPSPANSSASTTAVAGRCSTNAALSLDDFRFPSNLISVPERKDEAMTALKSNIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGANCHAIPYQVALSSKRHKRKEGN
GSD