| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0049431.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucumis melo var. makuwa] | 1.18e-158 | 100 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Query: RQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSY
RQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSY
Subjt: RQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSY
|
|
| XP_004134179.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucumis sativus] | 3.84e-159 | 99.19 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRR RSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Query: RQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
R+DYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
Subjt: RQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| XP_008438778.1 PREDICTED: serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucumis melo] | 4.01e-161 | 100 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Query: RQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
RQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
Subjt: RQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| XP_022979912.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucurbita maxima] | 6.52e-151 | 95.56 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRS RRRSPARSPRRRY SYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSIS S SPRD
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Query: RQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
R+DYSRSPTPK+NGRSPR VD ARSRSRSP+ SRSPSGSRSRSYSPR
Subjt: RQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| XP_038878233.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Benincasa hispida] | 2.57e-155 | 96.77 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
M RYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKR+DDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGAR+EYLSPARSRSIS SRSPRD
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Query: RQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
R+DYSRSPTPK+NGRSPREVDNARSRSRSP+ DSRSPSGSRSRSYSPR
Subjt: RQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3AXW0 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 7.9e-127 | 100 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Query: RQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
RQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
Subjt: RQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| A0A5D3CXM8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 2.5e-125 | 100 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Query: RQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSY
RQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSY
Subjt: RQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSY
|
|
| A0A6J1C7W4 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 5.6e-117 | 93.55 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDRY ESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLR PFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSR+RGARDEYLSPARSRSIS SRSP D
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Query: RQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
R+DYSRSP+PK+NGRSPREVD RSRSRS + DSRSPSGSRS+SYSPR
Subjt: RQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| A0A6J1GW11 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 4.6e-119 | 95.16 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MA+YRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRS RRRSPARSPRRRY SYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSIS S SPRD
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Query: RQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
R+DYSRSPTPK+NGRSPR VD ARSRSRSP+ SRSPSGSRSRSYSPR
Subjt: RQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| A0A6J1IQ05 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 4.6e-119 | 95.56 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRS RRRSPARSPRRRY SYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSIS S SPRD
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD
Query: RQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
R+DYSRSPTPK+NGRSPR VD ARSRSRSP+ SRSPSGSRSRSYSPR
Subjt: RQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P30352 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.2e-20 | 41.26 | Show/hide |
Query: SGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFA--------EENRKTPQEMRVTSR
+ L V NL P+ LR FE++G V DVY+P++ YT E RGF FV+F DA +A ++ V+ GRE+R+ A +R+ P R S
Subjt: SGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFA--------EENRKTPQEMRVTSR
Query: SSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRDRQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSR
GR +RSPRRR RS SRS S +R SRSR +R + S RSRS S S+S R+ S+S + + R +RSRSRSP S+ S SR
Subjt: SSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRDRQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSR
Query: SRSYSP
SRS SP
Subjt: SRSYSP
|
|
| Q1PDV2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 9.4e-61 | 63.6 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MAR RSRSRSYSPR R R+PPR RK YDD +R RE S RD S PSGLL+RNLPLDARP DLR FERFGP+KD+YLP+NYYTGEPRGFGFVK+R+
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR--SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSR-SRGARDEYLSP-ARSRSISHSR
AEDAAEA +++NH VIGGREI IVFAEENRKTPQEMR T+ +SGR Y+R S RSPRRRYRS+SRS SP R +SR S+ D+ SP RSRSIS S
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR--SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSR-SRGARDEYLSP-ARSRSISHSR
Query: SPRDRQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYS
PR+ ++Y N RSPRE R +P SR S SRSRS S
Subjt: SPRDRQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYS
|
|
| Q8L3X8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30 | 1.6e-31 | 45.56 | Show/hide |
Query: YSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAEAKQQ
YSP RR RGR PR Y RR + LLVRN+PLD RPE+LR PFERFGPV+DVY+P++YY+G+PRGF FV+F A DA EA++
Subjt: YSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAEAKQQ
Query: LNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTS------------RSSGRSYRRR-SPARSPRR------RYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRS
+N GREI +V A E+RK P+EMRV + RS GRS R S +RSPRR RYRS S SP+P R RG DE S RS S
Subjt: LNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTS------------RSSGRSYRRR-SPARSPRR------RYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRS
Query: ISHSRSPRDRQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRS--YSPR
+ + D R+ DN + A R R + SRSPSGSRSRS SPR
Subjt: ISHSRSPRDRQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRS--YSPR
|
|
| Q9LHP2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A | 3.3e-37 | 48.39 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRTPPR--GRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDA
R RSY+P +PPR GR+ PR R+ SR S P+ LLVRNL D R EDLR PFE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGF++F DA
Subjt: RSRSYSPRRRSRTPPR--GRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDA
Query: AEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRDR---
AEAK Q++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R GRS R + RSP R YSRSP P R RSR Y SP R S S SP+DR
Subjt: AEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRDR---
Query: --QDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSP
+ YSRSP + +S SRSP+ RS S ++RSY+P
Subjt: --QDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSP
|
|
| Q9SEU4 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 | 1.2e-36 | 48.84 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
R RSY+P +PPRG R P R R RD P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGFV+F DAA+
Subjt: RSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
Query: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR-SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD-----
AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R GR RRR+P RY S SRSP P R SRSR +Y SP R S SPR+
Subjt: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR-SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD-----
Query: RQDYSRSP-TPKDNGRSPREV---------DNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
R+ YSRSP + GRS V RS SRSP+ SRSPS R+RS SPR
Subjt: RQDYSRSP-TPKDNGRSPREV---------DNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 8.8e-38 | 48.84 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
R RSY+P +PPRG R P R R RD P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGFV+F DAA+
Subjt: RSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
Query: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR-SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD-----
AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R GR RRR+P RY S SRSP P R SRSR +Y SP R S SPR+
Subjt: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR-SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD-----
Query: RQDYSRSP-TPKDNGRSPREV---------DNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
R+ YSRSP + GRS V RS SRSP+ SRSPS R+RS SPR
Subjt: RQDYSRSP-TPKDNGRSPREV---------DNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| AT1G55310.2 SC35-like splicing factor 33 | 2.4e-35 | 46.94 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
R RSY+P +PPRG R P R R RD P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGFV+F DAA+
Subjt: RSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
Query: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR-SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD-----
AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R GR RRR+P RY S SRSP P R SRSR +Y SP R S SPR+
Subjt: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR-SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRD-----
Query: RQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSP-KGDSRSPSGSRSRS
R+ YSRSP D +R RS +P +G SRS S ++ +
Subjt: RQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSP-KGDSRSPSGSRSRS
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 2.0e-34 | 46.1 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTG------------EPRGFG
R RSY+P +PPRG R P R R RD P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG +PRGFG
Subjt: RSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTG------------EPRGFG
Query: FVKFRFAEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISH
FV+F DAA+AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R G +R R R RY S SRSP P R SRSR +Y SP R
Subjt: FVKFRFAEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISH
Query: SRSPRD-----RQDYSRSP-TPKDNGRSPREV---------DNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
S SPR+ R+ YSRSP + GRS V RS SRSP+ SRSPS R+RS SPR
Subjt: SRSPRD-----RQDYSRSP-TPKDNGRSPREV---------DNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSPR
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 2.3e-38 | 48.39 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRTPPR--GRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDA
R RSY+P +PPR GR+ PR R+ SR S P+ LLVRNL D R EDLR PFE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGF++F DA
Subjt: RSRSYSPRRRSRTPPR--GRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDA
Query: AEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRDR---
AEAK Q++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R GRS R + RSP R YSRSP P R RSR Y SP R S S SP+DR
Subjt: AEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRSRGARDEYLSPARSRSISHSRSPRDR---
Query: --QDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSP
+ YSRSP + +S SRSP+ RS S ++RSY+P
Subjt: --QDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYSP
|
|
| AT5G18810.1 SC35-like splicing factor 28 | 6.7e-62 | 63.6 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MAR RSRSRSYSPR R R+PPR RK YDD +R RE S RD S PSGLL+RNLPLDARP DLR FERFGP+KD+YLP+NYYTGEPRGFGFVK+R+
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRTPPRGRKRYDDDPRDRYRESRSHRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR--SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSR-SRGARDEYLSP-ARSRSISHSR
AEDAAEA +++NH VIGGREI IVFAEENRKTPQEMR T+ +SGR Y+R S RSPRRRYRS+SRS SP R +SR S+ D+ SP RSRSIS S
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR--SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSR-SRGARDEYLSP-ARSRSISHSR
Query: SPRDRQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYS
PR+ ++Y N RSPRE R +P SR S SRSRS S
Subjt: SPRDRQDYSRSPTPKDNGRSPREVDNARSRSRSPKGDSRSPSGSRSRSYS
|
|
