; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0001617 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0001617
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionSWIM-type domain-containing protein
Genome locationchr09:10712701..10713366
RNA-Seq ExpressionIVF0001617
SyntenyIVF0001617
Gene Ontology termsGO:0010073 - meristem maintenance (biological process)
GO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR036875 - Zinc finger, CCHC-type superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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KAA0063901.1 hypothetical protein E6C27_scaffold616G00270 [Cucumis melo var. makuwa]4.58e-4096.97Show/hide
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TYK02543.1 uncharacterized protein E5676_scaffold201G00230 [Cucumis melo var. makuwa]2.00e-3898.48Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7SW50 SWIM-type domain-containing protein2.7e-3095.45Show/hide
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A0A5A7UHL3 SWIM-type domain-containing protein9.6e-2892.42Show/hide
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A0A5A7VDU8 SWIM-type domain-containing protein1.2e-3096.97Show/hide
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A0A5D3BS92 SWIM-type domain-containing protein1.9e-3198.48Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GACACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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GACACTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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