| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAE8647621.1 hypothetical protein Csa_003197 [Cucumis sativus] | 3.53e-155 | 97.13 | Show/hide |
Query: MADVHRKRYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVASCFLVVEP
MADVHRKRYSRSPSPW+APSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGR+HANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLE+HFSKEGKVASCFLVVEP
Subjt: MADVHRKRYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVASCFLVVEP
Query: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRG-DRGS-RYRGGG-SFREDYGYRRSPRRSPYRGA
RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQS+LEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRG DRGS RYRGGG SFREDYGYRRSPRRSPYRGA
Subjt: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRG-DRGS-RYRGGG-SFREDYGYRRSPRRSPYRGA
Query: REYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
REYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
Subjt: REYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
|
|
| XP_016899368.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Cucumis melo] | 2.09e-164 | 100 | Show/hide |
Query: MADVHRKRYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVASCFLVVEP
MADVHRKRYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVASCFLVVEP
Subjt: MADVHRKRYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVASCFLVVEP
Query: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREY
RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREY
Subjt: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREY
Query: SPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
SPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
Subjt: SPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
|
|
| XP_022950652.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Cucurbita moschata] | 1.73e-142 | 92.59 | Show/hide |
Query: MADVHRKRYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGR-DHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVASCFLVVE
MAD HRKRYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSR PRSRSRSWSRPRS SRGRSRSRSRGR ++ NNPGNTLYVTGLSTRVTERDLE+HFSKEGKV+SCFLVVE
Subjt: MADVHRKRYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGR-DHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVASCFLVVE
Query: PRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGARE
PRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQS+LEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRG+RGSRYRGG SFREDYG+RRSPRRSPYRGARE
Subjt: PRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGARE
Query: YSPRHSPP-YGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
YSPRHSPP YGGGRSRRDHSRSP PYSP GGSPDRRYPRGSR
Subjt: YSPRHSPP-YGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
|
|
| XP_031743118.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Cucumis sativus] | 4.85e-157 | 97.13 | Show/hide |
Query: MADVHRKRYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVASCFLVVEP
MADVHRKRYSRSPSPW+APSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGR+HANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLE+HFSKEGKVASCFLVVEP
Subjt: MADVHRKRYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVASCFLVVEP
Query: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRG-DRGS-RYRGGG-SFREDYGYRRSPRRSPYRGA
RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQS+LEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRG DRGS RYRGGG SFREDYGYRRSPRRSPYRGA
Subjt: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRG-DRGS-RYRGGG-SFREDYGYRRSPRRSPYRGA
Query: REYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
REYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
Subjt: REYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
|
|
| XP_038881911.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Benincasa hispida] | 5.67e-153 | 95.45 | Show/hide |
Query: MADVHRKRYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVASCFLVVEP
MAD HRKRYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGRDHA+NPGNTLYVTGLSTRVTERDLE+HFSKEGKVASCFLVVEP
Subjt: MADVHRKRYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVASCFLVVEP
Query: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREY
RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQS+LEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRD+GYRGDRGSRYRGGGSFR+DYGYRRSPRRSPYRGAREY
Subjt: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREY
Query: SP-RHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
SP RHSPPYGG RSRRDHSRSPP PPYGGSPDRRYPRGSR
Subjt: SP-RHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0KMM4 RRM domain-containing protein | 8.7e-123 | 97.13 | Show/hide |
Query: MADVHRKRYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVASCFLVVEP
MADVHRKRYSRSPSPW+APSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGR+HANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLE+HFSKEGKVASCFLVVEP
Subjt: MADVHRKRYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVASCFLVVEP
Query: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYR-GDRG-SRYR-GGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGA
RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQS+LEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYR GDRG SRYR GGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGA
Subjt: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYR-GDRG-SRYR-GGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGA
Query: REYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
REYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
Subjt: REYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
|
|
| A0A1S4DTT1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 2.4e-128 | 100 | Show/hide |
Query: MADVHRKRYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVASCFLVVEP
MADVHRKRYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVASCFLVVEP
Subjt: MADVHRKRYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVASCFLVVEP
Query: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREY
RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREY
Subjt: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREY
Query: SPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
SPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
Subjt: SPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
|
|
| A0A6J1BUT3 serine/arginine-rich splicing factor SR45a isoform X1 | 3.2e-109 | 92.18 | Show/hide |
Query: MADVHRKRYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVASCFLVVEP
MAD HRKRYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRS SRGRSRSRSRGRDHA N GNTLYVTGLSTRVTERDLE+HFSKEGKVASCFLVVEP
Subjt: MADVHRKRYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVASCFLVVEP
Query: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYR-GGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGARE
RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQS+LEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRG RY GGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGARE
Subjt: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYR-GGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGARE
Query: YSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRY-PRGSR
Y SPPY GGRSRR+HSRS PPYSPPY GSPDRRY PRG+R
Subjt: YSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRY-PRGSR
|
|
| A0A6J1GFF0 serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 1.5e-111 | 92.59 | Show/hide |
Query: MADVHRKRYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGR-DHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVASCFLVVE
MAD HRKRYSRSPSPWRAP SRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRS SRGRSRSRSRGR ++ NNPGNTLYVTGLSTRVTERDLE+HFSKEGKV+SCFLVVE
Subjt: MADVHRKRYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGR-DHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVASCFLVVE
Query: PRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGARE
PRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQS+LEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRG+RGSRYR GGSFREDYG+RRSPRRSPYRGARE
Subjt: PRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGARE
Query: YSPRHS-PPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
YSPRHS PPYGGGRSRRDHSRS PPYSP GGSPDRRYPRGSR
Subjt: YSPRHS-PPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
|
|
| A0A6J1INV2 serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 1.5e-111 | 92.59 | Show/hide |
Query: MADVHRKRYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGR-DHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVASCFLVVE
MAD HRKRYSRSPSPWRAP SRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRS SRGRSRSRSRGR ++ NNPGNTLYVTGLSTRVTERDLE+HFSKEGKV+SCFLVVE
Subjt: MADVHRKRYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGR-DHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVASCFLVVE
Query: PRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGARE
PRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQS+LEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRG+RGSRYR GGSFREDYG+RRSPRRSPYRGARE
Subjt: PRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPYRGARE
Query: YSPRHS-PPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
YSPRHS PPYGGGRSRRDHSRS PPYSP GGSPDRRYPRGSR
Subjt: YSPRHS-PPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRYPRGSR
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P62995 Transformer-2 protein homolog beta | 1.7e-19 | 42.57 | Show/hide |
Query: RYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSR-PRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNT----------------LYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGK
R SRS S R+ SRSRSR SR RSRSRS S RS SR SR R H+++P +T L V GLS TERDL + FSK G
Subjt: RYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSR-PRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNT----------------LYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGK
Query: VASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKS-----TRDSGYRG-DRG--------SRYRGG
+A +V + ++R SRGFAFV +NVDDA + N L+GR I V+ S KRP TPTPG Y+G + RD RG DRG YRGG
Subjt: VASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKS-----TRDSGYRG-DRG--------SRYRGG
Query: GSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPYGGGRSR-RDHSRSPPPY
G G+R + R R SP +S GG RSR R S SP Y
Subjt: GSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPYGGGRSR-RDHSRSPPPY
|
|
| P62996 Transformer-2 protein homolog beta | 1.7e-19 | 42.57 | Show/hide |
Query: RYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSR-PRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNT----------------LYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGK
R SRS S R+ SRSRSR SR RSRSRS S RS SR SR R H+++P +T L V GLS TERDL + FSK G
Subjt: RYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSR-PRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNT----------------LYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGK
Query: VASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKS-----TRDSGYRG-DRG--------SRYRGG
+A +V + ++R SRGFAFV +NVDDA + N L+GR I V+ S KRP TPTPG Y+G + RD RG DRG YRGG
Subjt: VASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKS-----TRDSGYRG-DRG--------SRYRGG
Query: GSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPYGGGRSR-RDHSRSPPPY
G G+R + R R SP +S GG RSR R S SP Y
Subjt: GSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPYGGGRSR-RDHSRSPPPY
|
|
| P62997 Transformer-2 protein homolog beta | 1.7e-19 | 42.57 | Show/hide |
Query: RYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSR-PRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNT----------------LYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGK
R SRS S R+ SRSRSR SR RSRSRS S RS SR SR R H+++P +T L V GLS TERDL + FSK G
Subjt: RYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSR-PRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNT----------------LYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGK
Query: VASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKS-----TRDSGYRG-DRG--------SRYRGG
+A +V + ++R SRGFAFV +NVDDA + N L+GR I V+ S KRP TPTPG Y+G + RD RG DRG YRGG
Subjt: VASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKS-----TRDSGYRG-DRG--------SRYRGG
Query: GSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPYGGGRSR-RDHSRSPPPY
G G+R + R R SP +S GG RSR R S SP Y
Subjt: GSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPYGGGRSR-RDHSRSPPPY
|
|
| Q3ZBT6 Transformer-2 protein homolog beta | 1.7e-19 | 42.57 | Show/hide |
Query: RYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSR-PRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNT----------------LYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGK
R SRS S R+ SRSRSR SR RSRSRS S RS SR SR R H+++P +T L V GLS TERDL + FSK G
Subjt: RYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSR-PRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNT----------------LYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGK
Query: VASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKS-----TRDSGYRG-DRG--------SRYRGG
+A +V + ++R SRGFAFV +NVDDA + N L+GR I V+ S KRP TPTPG Y+G + RD RG DRG YRGG
Subjt: VASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKS-----TRDSGYRG-DRG--------SRYRGG
Query: GSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPYGGGRSR-RDHSRSPPPY
G G+R + R R SP +S GG RSR R S SP Y
Subjt: GSFREDYGYRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPYGGGRSR-RDHSRSPPPY
|
|
| Q84TH4 Serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 1.0e-35 | 49.58 | Show/hide |
Query: MADVHRKRYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVASCFLVVEP
M+ R RYS S SP+ + R RS SRS RS +RS S A NPGN+LYVTGLS RVTERDLEDHF+KEGKV LV++P
Subjt: MADVHRKRYSRSPSPWRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVASCFLVVEP
Query: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRD-------SGYRGDRGSRYRG-------GGSFREDYGYR
TR SRGF F++M +V DANRC++ L+ SVL+GR ITVEK+RR+R RTPTPG YLGL++ R S R SR R G S+ YG R
Subjt: RTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRD-------SGYRGDRGSRYRG-------GGSFREDYGYR
Query: -RSPRRSP-YRGAREYSPRHSP-PYGGGRSRRDHSRSP
RS SP YR R YSP SP P RRD S SP
Subjt: -RSPRRSP-YRGAREYSPRHSP-PYGGGRSRRDHSRSP
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT4G35785.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.6e-63 | 66.13 | Show/hide |
Query: MAD-VHRKRYSRSPSP--WRAPSRSRSRSRSRSRP--RSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGR-DHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVASC
MAD R+R SRSPSP RA SRSRSRSRSRSRP RSRSRS RP SPSR R RSRSR R NPG TLYVTGLSTRVT++DLE HF+KEGKVASC
Subjt: MAD-VHRKRYSRSPSP--WRAPSRSRSRSRSRSRP--RSRSRSWSRPRSPSRGRSRSRSRGR-DHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVASC
Query: FLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPY
FLV+EPRTR+SRGFAFVTM ++ DA RC+K+LNQSVLEGRYITVE+SRRKRPRTPTPGHYLGLKS+RDS G R S RG R+DY RRSPR
Subjt: FLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSPY
Query: RGAREYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRY-PRGSR
R+YSPR RS H RSP S +RRY PRGSR
Subjt: RGAREYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRY-PRGSR
|
|
| AT4G35785.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.7e-65 | 66.67 | Show/hide |
Query: MAD-VHRKRYSRSPSP--WRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPR----SPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVAS
MAD R+R SRSPSP RA SRSRSRSRSRSRPR RSRS S PR S SRGRSRSRSRGR NPG TLYVTGLSTRVT++DLE HF+KEGKVAS
Subjt: MAD-VHRKRYSRSPSP--WRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPR----SPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVAS
Query: CFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSP
CFLV+EPRTR+SRGFAFVTM ++ DA RC+K+LNQSVLEGRYITVE+SRRKRPRTPTPGHYLGLKS+RDS G R S RG R+DY RRSPR
Subjt: CFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEKSRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGDRGSRYRGGGSFREDYGYRRSPRRSP
Query: YRGAREYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRY-PRGSR
R+YSPR RS H RSP S +RRY PRGSR
Subjt: YRGAREYSPRHSPPYGGGRSRRDHSRSPPPYSPPYGGSPDRRY-PRGSR
|
|
| AT4G35785.3 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 4.5e-47 | 75.51 | Show/hide |
Query: MAD-VHRKRYSRSPSP--WRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPR----SPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVAS
MAD R+R SRSPSP RA SRSRSRSRSRSRPR RSRS S PR S SRGRSRSRSRGR NPG TLYVTGLSTRVT++DLE HF+KEGKVAS
Subjt: MAD-VHRKRYSRSPSP--WRAPSRSRSRSRSRSRPRSRSRSWSRPR----SPSRGRSRSRSRGRDHANNPGNTLYVTGLSTRVTERDLEDHFSKEGKVAS
Query: CFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEK
CFLV+EPRTR+SRGFAFVTM ++ DA RC+K+LNQSVLEGRYITVE+
Subjt: CFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEK
|
|
| AT4G35785.4 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.2e-42 | 67.9 | Show/hide |
Query: MAD-VHRKRYSRSPSP--WRAPSRSRSRSRSRSRP--RSRSRSWSRPRSPSRG-----------------RSRSRSRGRDHANNPGNTLYVTGLSTRVTE
MAD R+R SRSPSP RA SRSRSRSRSRSRP RSRSRS RP SPSR RSRSRSRG + NPG TLYVTGLSTRVT+
Subjt: MAD-VHRKRYSRSPSP--WRAPSRSRSRSRSRSRP--RSRSRSWSRPRSPSRG-----------------RSRSRSRGRDHANNPGNTLYVTGLSTRVTE
Query: RDLEDHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEK
+DLE HF+KEGKVASCFLV+EPRTR+SRGFAFVTM ++ DA RC+K+LNQSVLEGRYITVE+
Subjt: RDLEDHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEK
|
|
| AT4G35785.5 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.2e-42 | 67.9 | Show/hide |
Query: MAD-VHRKRYSRSPSP--WRAPSRSRSRSRSRSRP--RSRSRSWSRPRSPSRG-----------------RSRSRSRGRDHANNPGNTLYVTGLSTRVTE
MAD R+R SRSPSP RA SRSRSRSRSRSRP RSRSRS RP SPSR RSRSRSRG + NPG TLYVTGLSTRVT+
Subjt: MAD-VHRKRYSRSPSP--WRAPSRSRSRSRSRSRP--RSRSRSWSRPRSPSRG-----------------RSRSRSRGRDHANNPGNTLYVTGLSTRVTE
Query: RDLEDHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEK
+DLE HF+KEGKVASCFLV+EPRTR+SRGFAFVTM ++ DA RC+K+LNQSVLEGRYITVE+
Subjt: RDLEDHFSKEGKVASCFLVVEPRTRISRGFAFVTMDNVDDANRCVKHLNQSVLEGRYITVEK
|
|
