; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0001938 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0001938
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptionglycine-rich protein
Genome locationchr01:23649262..23655840
RNA-Seq ExpressionIVF0001938
SyntenyIVF0001938
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7020285.1 hypothetical protein SDJN02_16968 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.91e-4489.89Show/hide
Query:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGLAH
        GGRSL CPENS  AGT+YDAVPRSLTISNHNLTTDTD LLLEFPNQPL TNVYVRNNA+ASVPLLWSRVQVQGQISLLSG VL+FGLAH
Subjt:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGLAH

XP_004148428.1 uncharacterized protein LOC101205923 [Cucumis sativus]4.02e-4592.13Show/hide
Query:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGLAH
        GGRSLACPENS  AGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTD LLLEFPNQPL TNVYVRNNA+ASVPLLWSRVQVQGQISLLSG VL+FGLAH
Subjt:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGLAH

XP_022996851.1 uncharacterized protein LOC111491974 [Cucurbita maxima]1.39e-4492.13Show/hide
Query:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGLAH
        GGRSLACPENS  AGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTD LLLEFPNQPL TNVYVRNNA+ASVPLLWSRVQVQGQISLLSG VL FGLAH
Subjt:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGLAH

XP_023545693.1 uncharacterized protein LOC111805058 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.39e-4492.13Show/hide
Query:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGLAH
        GGRSLACPENS  AGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTD LLLEFPNQPL TNVYVRNNA+ASVPLLWSRVQVQGQISLLSG VL FGLAH
Subjt:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGLAH

XP_038885385.1 uncharacterized protein LOC120075785 isoform X2 [Benincasa hispida]4.02e-4592.13Show/hide
Query:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGLAH
        GGRSLACPENS  AGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTD LLLEFPNQPL TNVYVRNNA+ASVPLLWSRVQVQGQISLLSG VL+FGLAH
Subjt:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGLAH

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LLG8 Uncharacterized protein5.8e-3892.13Show/hide
Query:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGLAH
        GGRSLACPENS  AGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTD LLLEFPNQPL TNVYVRNNA+ASVPLLWSRVQVQGQISLLSG VL+FGLAH
Subjt:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGLAH

A0A5A7VHV7 Uncharacterized protein4.9e-3791.01Show/hide
Query:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGLAH
        GGRSLACPENS  AGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTD LLLEFPNQPL TNVYVRN A+ASVPLLWSRVQVQGQISLLSG VL+FGLAH
Subjt:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGLAH

A0A6J1GJU7 uncharacterized protein LOC1114545192.9e-3789.89Show/hide
Query:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGLAH
        GGRSL CPENS  AGT+YDAVPRSLTISNHNLTTDTD LLLEFPNQPL TNVYVRNNA+ASVPLLWSRVQVQGQISLLSG VL+FGLAH
Subjt:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGLAH

A0A6J1K5W6 uncharacterized protein LOC1114919741.7e-3792.13Show/hide
Query:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGLAH
        GGRSLACPENS  AGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTD LLLEFPNQPL TNVYVRNNA+ASVPLLWSRVQVQGQISLLSG VL FGLAH
Subjt:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGLAH

A0A6J1KIT0 uncharacterized protein LOC1114961242.9e-3789.89Show/hide
Query:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGLAH
        GGRSL CPENS  AGT+YDAVPRSLTISNHNLTTDTD LLLEFPNQPL TNVYVRNNA+ASVPLLWSRVQVQGQISLLSG VL+FGLAH
Subjt:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGLAH

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G32920.1 glycine-rich protein1.4e-2868.97Show/hide
Query:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGL
        GGRS  CPEN+ +AGTLYD +  SLTI NHN TT TD LLLEFPN  L TN+Y+RN AK +VPL WSRVQVQG ISL +G  LNFGL
Subjt:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGL

AT4G32920.2 glycine-rich protein1.4e-2868.97Show/hide
Query:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGL
        GGRS  CPEN+ +AGTLYD +  SLTI NHN TT TD LLLEFPN  L TN+Y+RN AK +VPL WSRVQVQG ISL +G  LNFGL
Subjt:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGL

AT4G32920.3 glycine-rich protein1.4e-2868.97Show/hide
Query:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGL
        GGRS  CPEN+ +AGTLYD +  SLTI NHN TT TD LLLEFPN  L TN+Y+RN AK +VPL WSRVQVQG ISL +G  LNFGL
Subjt:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGL

AT5G11700.1 LOCATED IN: vacuole4.7e-3273.03Show/hide
Query:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGLAH
        GG S+ CP+NS +AGTLYDAVPRSL +SN+N TTDT  LLLEFP QPL TNVY+++ A+A+ PLLWSRVQVQGQISLL G VL+FGLAH
Subjt:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGLAH

AT5G11700.2 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glycine-rich protein (TAIR:AT4G32920.3)4.7e-3273.03Show/hide
Query:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGLAH
        GG S+ CP+NS +AGTLYDAVPRSL +SN+N TTDT  LLLEFP QPL TNVY+++ A+A+ PLLWSRVQVQGQISLL G VL+FGLAH
Subjt:  GGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGLAH


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTTATATATGTAGGGGGACGTAGTTTGGCTTGTCCAGAAAATTCTGACAGTGCTGGAACTCTGTATGATGCTGTTCCTCGAAGCCTTACAATTTCCAATCATAACTT
GACAACAGATACAGATGCACTTCTTTTGGAGTTTCCTAATCAACCACTCACGACAAATGTTTATGTTCGAAATAATGCCAAGGCTTCAGTTCCTTTGCTCTGGAGTCGTG
TTCAGGTTCAAGGTCAGATTAGCCTTCTATCTGGCCGAGTATTAAATTTTGGGCTGGCGCACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTAAACCCCACGACAACTCCTCTCGTGCGCTCCATACACCCATCTCTCTCGCAAAGACAGACAACCCAACGCCTGTGCTGAACTGCCGAACTATCCCTCCACCGAAGAAT
GCAATCGACCCATGACCCCTCTGCCGAAGAATACTGAAGAACTCGAAGAACCACGACTCCTCCGCCGAAGAACTCGAAGAACGTTGTCGACCCTCGACCCCTCCACCGAA
GAACGTCGAAGAACACCGTCGACCCACGACCCCTCCGTCAAAGAACCCCTCCTCCGAAGAACGTCGAATTCGCCGAATCTTCACCACTGAATCCGTCGATTCTTCACAAT
CGACGACCCCTTTTTTGCTCTTTGTTGTGTTTTTTTCTAACTTAAGTCCCCTTTTCTTATTATTTGACCCTATAACGTATCTGACTTGCAATCATACTTCTAGTAGCATA
TTAGTACTCAAGCTTGACATTATTTCATTAATTGTTACCATTAAAATAAAAGGATCCAAATAATAGGGAGTAGCCTCTATTCATTTCATCAATGAAAAATGATGTTTCGG
TTTAAAAAAAATTATTGTCTGGGAACGGACCGTTGGGAAGCATAAGTATATATTATGTATGTATAGATCTTGTTTAGAAATAGAATTAAGTGCTCTTTTGTTAGCATTAA
TAAGGCCTTCAAGGTTTTACTGTGTTAAATTTTGGTATTTCCACGATATTATCTGTTAAAGGTCTTGAACTTTTTAATGGAGCGAAATAGCGTCAATATCATTCATGGTC
AGGTGACCATTGGTACTCTTATTCTTCAGGTATATGACTAAATTCCTCTTTCAATAGTTCATCATATTATTAATTAGGAGATCTTGTATTTTTTAGCAGTAGTTTGGTAA
GATGCTAAATATATGTTTATATATGTAGGGGGACGTAGTTTGGCTTGTCCAGAAAATTCTGACAGTGCTGGAACTCTGTATGATGCTGTTCCTCGAAGCCTTACAATTTC
CAATCATAACTTGACAACAGATACAGATGCACTTCTTTTGGAGTTTCCTAATCAACCACTCACGACAAATGTTTATGTTCGAAATAATGCCAAGGCTTCAGTTCCTTTGC
TCTGGAGTCGTGTTCAGGTTCAAGGTCAGATTAGCCTTCTATCTGGCCGAGTATTAAATTTTGGGCTGGCGCACTAAGCCTCTTCAGAGTTTGAGCTATTGGCAGAAGAA
CTTTAAATGAGCAACTCATAAATCAAGATTGGCTCTGCTGTTGGTGGTACTTATTTTAGCTCATGAATTGGAGGTAGTAGAGGATGAAGAATGCAAGTTTATTTGAAGCC
AAGTTTCGTTCAAGGTCATTGAGTTGGGTTGATAGAAGTAATGTTTTTGTATATGACAATATCGAACAAATATGTAAAGTTTTCGAAATTTTGATACATATATGGTAAAA
TGTTAATATATGTTAAAGTTTTGGAATTGTTCTAGTGCATATTTATGTTTGAGTTTTAAAACTATATTTGATGTATATTTGTCGTTTATATGTAGTTGAATTCTTGGACC
AATAGGAGCATAATAGAGGAACAATAATATAAATAAACTACAATTTAAAAAATGAAAAAGAATACTCTTGACAGGTACAAAATGTCATAAACAATCATTTTCTTGACGGT
TATTAAATGTCATGAAAAATGCACTTTTGACGATTTTAAAATATCATGAATGTTTGTATTGTTGACGGTTTTTGCCATTCATAGTCACATTCTTGACGGTTCTAAACTGT
CATTAATACTTATAATCTTGACGGTTCTAAACTGTCATGAATAATTGAATACTTGACAGTTATAAACTATCAACATTAACAATTCTTGATGTTTTTTACAACTGTCAAGA
AAATTTCCTTTCTTGACACTGAATTCAACGACGGTTTTAACCGTCAAGAATAATCATTCTTGATAGTTTAAAACCGTCAAGAGAGTCAGTTTCTATAGTAGTGCGAATCT
GATTGTCGATAATTTGACTGTAAATGGTAGCTTTAGTTGTACTTTTATTTGTGTCCAATGTGTAATTATATGCCATTTTTTGTTTCTTGAGTTTGTTGTTTGGTGGATTC
ATTTCGATTCAATGTGATTCTTGGTATGATGAATCTTGTCTTGAATTCCACCTTATGTGGAAAAGTTCAAATTGAACTTGAAATTCTTCTCAGTTTTAAGTTGCATGGCC
AAGGTAGAAAAGGTTTCAAGTTCAACAAGCAGTAAGTTTTTCACCATTTGCCTTGAGGATGTATTCAGTTACCTTGAAACTGAAGAGTAGTCTTGGAAGTGTGACTAGAA
CTTATGGATGCTTTGCCTTATTTCACTTGTCTTTTGCCAATATTCTTGGTGTGTGATTGTTTATTGATTGTATTCTGCAATGGAATTCTCAAGTCTCCCGTTTAAACTTG
CAATATGTTTCTATGACATTATGATCAGATTTTTGTTTAAATTCTGACTTGTGTTCTTCTCTGCAAAAAATTTCAGGGCTCTATGTACAGGTATAATGAATCTTGTATTC
TTTACCTTCTACCTAATTTAGTTTTCTCATTTTCTGAACTTGCTCTAGACTTCTAAATGTAGAGGAGAAAGGTAAAACTACAAGTGGAAAAGCACTCCATTACAAAGGAA
CACCATTCCACCATATTGTATCTGGTTTCGTTATTCAAGGTGGTGATATTTTATATGGTGATGGAAAAGGATATGAATCAATTTATGGTGGTACATTTGATGAGAACTTC
AGAATAAAACATTCACATGCAGGGCTTGAACCCAATGCTTTCAAATGGCATGTTAACTTCATTATTAGTTTGTTGACTCAAGTTTCACATCTTCATTATAAATGGATTGC
TTGTTATACAGGTGTTGTCTCGATGGTAAACTCAGGACCTGATTCAAATGGCTCACAATTTTTCATTACCACCATTAAGTCCGGCTGGCTATCAGTTCAACTGGAGTTAT
GAAAGGTGACATATTTTTGGCAGATGTAGCACTCAGCTAAAGAACAACAATATCACAACTGATGTAAAAGTTGACACCCACTCCAATGTTCGCACTACTGTTACAATTGA
TGAACCTGCTCTAGGGTTGAAGGCAATTTTTAGTTTTCGTGTTCCTGACCAGAGATCTGGCAAGGTGTAGGTTCACACTGCTGTTACATTATGTTAATATGCACTTGCTG
CAAGATAGAATCAAGTTTGATGTTCTGCTAACATCATATGAGATGATTAACTTTGATGTGGGAACACTGAAGCCTATAAAATGGCAATCCCTTGTGAGAGTCTGCCATTA
GTTTATCTTTACAATGAATTCTTGATTTATGATCGTGTATTAGTTTATCTTTACAATGAATTCTTGATTTATGATCGTGTATT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFIYVGGRSLACPENSDSAGTLYDAVPRSLTISNHNLTTDTDALLLEFPNQPLTTNVYVRNNAKASVPLLWSRVQVQGQISLLSGRVLNFGLAH