; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0001945 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0001945
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionWRKY protein
Genome locationchr03:22940513..22942243
RNA-Seq ExpressionIVF0001945
SyntenyIVF0001945
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR003657 - WRKY domain
IPR036576 - WRKY domain superfamily
IPR044810 - WRKY transcription factor, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0064890.1 putative WRKY transcription factor 40 [Cucumis melo var. makuwa]1.32e-226100Show/hide
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NP_001267528.1 probable WRKY transcription factor 40-like [Cucumis sativus]2.74e-19791.51Show/hide
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XP_008445262.1 PREDICTED: probable WRKY transcription factor 40 [Cucumis melo]3.47e-22298.11Show/hide
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XP_023545515.1 probable WRKY transcription factor 40 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.23e-14171.78Show/hide
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XP_038885570.1 probable WRKY transcription factor 40 [Benincasa hispida]3.02e-15175.54Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LQF6 WRKY domain-containing protein1.5e-12592.61Show/hide
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A0A1S3BC94 probable WRKY transcription factor 401.0e-17198.11Show/hide
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A0A5A7VCH3 Putative WRKY transcription factor 404.5e-175100Show/hide
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A0A6J1HD49 probable WRKY transcription factor 403.3e-10971.17Show/hide
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E7CEW3 WRKY protein8.2e-15391.51Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8B0R8 WRKY transcription factor WRKY284.6e-3634.39Show/hide
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        SLDLN+  P      S P  P          S K+      + AE L R S ENKKL +ML  VV  Y  LQ QV D++  +                  
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              K+ ++    D+  + ++      A+       S D   C +       KR    + KPKV +  V    SD +L+VKDGYQWRKYGQKVTKDNP
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        +  + +  ++  + +K L +QMA  LTRDP F  AL TA++G +++
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Q0DAJ3 WRKY transcription factor WRKY282.7e-3634.39Show/hide
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        SLDLN+  P      S P  P          S K+      + AE L R S ENKKL +ML  VV  Y+ LQ QV D++  +                  
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              K+ ++    D+  + ++      A+       S D   C +       KR    + KPKV +  V    SD +L+VKDGYQWRKYGQKVTKDNP
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Q9C5T4 WRKY transcription factor 181.5e-3937.01Show/hide
Query:  INTSLDLNLNPPPYTADQSHPPT-PNSSLK----QQAPTTGILAEKLNRISSENKKLNQMLGVVVENYSVLQNQVIDLLMKS-----------KKRKAAP
        ++ SLDLN NP      +       ++ LK    +Q  +   L E+LNR++SENKKL +ML  V E+Y+ L N +  L  +            KKRK  P
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Subjt:  GCDNCCNFKRSASDQYCGCCSDDNDSCYNNKRPRENN-------------GKPKVMRVLVPTPVSDSTLIVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFA

Query:  PTCPVKRKVQRSVEDPCYLVATYEGQHNHPKPNSGIEYQLVGPINLGSNTKLDSSNNVSSSPSSSIKSPSSSSSLIPSISLDYLTKSQPQIPSPSSSNSS
        P+CPVK+KVQRS EDP  LVATYEG HNH  PN+                   S  + +S   SS            +++LD +        +   +   
Subjt:  PTCPVKRKVQRSVEDPCYLVATYEGQHNHPKPNSGIEYQLVGPINLGSNTKLDSSNNVSSSPSSSIKSPSSSSSLIPSISLDYLTKSQPQIPSPSSSNSS

Query:  SSTQKLLVQQMATLLTRDPNFTRALATAITGNMVD
        ++ Q++L+QQMA+ LT+D  FT ALA AI+G +++
Subjt:  SSTQKLLVQQMATLLTRDPNFTRALATAITGNMVD

Q9SAH7 Probable WRKY transcription factor 402.8e-4940.25Show/hide
Query:  TTTTINTSLDLNLNPPPYTADQSHPPTPNSSLKQQAPTTGILAEKLNRISSENKKLNQMLGVVVENYSVLQNQVIDLLMKSK----------KRKAAPGC
        +++ ++TSLDL +       ++              P T  L E+LNR+S+ENKKL++ML ++ +NY+VL+ Q+++ + KS           K++ +P  
Subjt:  TTTTINTSLDLNLNPPPYTADQSHPPTPNSSLKQQAPTTGILAEKLNRISSENKKLNQMLGVVVENYSVLQNQVIDLLMKSK----------KRKAAPGC

Query:  DNCCNFKRSASDQYCGCCSDDNDSCYNNKRPRENNGKPKVMRVLVPTPVSDSTLIVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPTCPVKRKVQRSVED
        ++   F  +         S D D     K+  E   K KV RV   T  SD+TL+VKDGYQWRKYGQKVT+DNPSPRAY+KC+ AP+C VK+KVQRSVED
Subjt:  DNCCNFKRSASDQYCGCCSDDNDSCYNNKRPRENNGKPKVMRVLVPTPVSDSTLIVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPTCPVKRKVQRSVED

Query:  PCYLVATYEGQHNHPKPNSGIEYQLVGPINLGSNTKLDSSNNVSSSPSSSIKSPSSSSSLIPSISLDYLTKSQPQIPSPSSSNSSSSTQKLLVQQMATLL
           LVATYEG+HNHP P+            + SN  L+   +   S S+ + +   SS  +P  ++D +     ++ SP+S       QKLLV+QMA+ L
Subjt:  PCYLVATYEGQHNHPKPNSGIEYQLVGPINLGSNTKLDSSNNVSSSPSSSIKSPSSSSSLIPSISLDYLTKSQPQIPSPSSSNSSSSTQKLLVQQMATLL

Query:  TRDPNFTRALATAITGNM
        T+DPNFT ALA A+TG +
Subjt:  TRDPNFTRALATAITGNM

Q9SK33 Probable WRKY transcription factor 601.6e-3637.77Show/hide
Query:  ILAEKLNRISSENKKLNQMLGVVVENYSVLQNQVIDLLMKSKKRKAAPGCDNCCNFKRSASDQYCGCCSDDNDSCYNNK-----RPREN--NGKPKVMRV
        +L +++NR++SENKKL +ML  V E Y  L N     LM+  + + +P      NF+   + Q  G    + D   ++       P EN  N K  V   
Subjt:  ILAEKLNRISSENKKLNQMLGVVVENYSVLQNQVIDLLMKSKKRKAAPGCDNCCNFKRSASDQYCGCCSDDNDSCYNNK-----RPREN--NGKPKVMRV

Query:  LVPTPVSDSTLIVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPTCPVKRKVQRSVEDPCYLVATYEGQHNHPKPNSGIEYQLVGPINLGSNTKLDSSNNV
              SD++L VKDGYQWRKYGQK+T+DNPSPRAY++CSF+P+C VK+KVQRS EDP +LVATYEG HNH  P+                         
Subjt:  LVPTPVSDSTLIVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPTCPVKRKVQRSVEDPCYLVATYEGQHNHPKPNSGIEYQLVGPINLGSNTKLDSSNNV

Query:  SSSPSSSIKSPSSSSSLIPSISLDYLTKSQPQIPSPSSSNSSSSTQKLLVQQMATLLTRDPNFTRALATAITGNMVDN
                      +S+  ++ LD +   Q  +          + Q++LVQQMA+ LT+DP FT ALATAI+G ++++
Subjt:  SSSPSSSIKSPSSSSSLIPSISLDYLTKSQPQIPSPSSSNSSSSTQKLLVQQMATLLTRDPNFTRALATAITGNMVDN

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G80840.1 WRKY DNA-binding protein 402.0e-5040.25Show/hide
Query:  TTTTINTSLDLNLNPPPYTADQSHPPTPNSSLKQQAPTTGILAEKLNRISSENKKLNQMLGVVVENYSVLQNQVIDLLMKSK----------KRKAAPGC
        +++ ++TSLDL +       ++              P T  L E+LNR+S+ENKKL++ML ++ +NY+VL+ Q+++ + KS           K++ +P  
Subjt:  TTTTINTSLDLNLNPPPYTADQSHPPTPNSSLKQQAPTTGILAEKLNRISSENKKLNQMLGVVVENYSVLQNQVIDLLMKSK----------KRKAAPGC

Query:  DNCCNFKRSASDQYCGCCSDDNDSCYNNKRPRENNGKPKVMRVLVPTPVSDSTLIVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPTCPVKRKVQRSVED
        ++   F  +         S D D     K+  E   K KV RV   T  SD+TL+VKDGYQWRKYGQKVT+DNPSPRAY+KC+ AP+C VK+KVQRSVED
Subjt:  DNCCNFKRSASDQYCGCCSDDNDSCYNNKRPRENNGKPKVMRVLVPTPVSDSTLIVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPTCPVKRKVQRSVED

Query:  PCYLVATYEGQHNHPKPNSGIEYQLVGPINLGSNTKLDSSNNVSSSPSSSIKSPSSSSSLIPSISLDYLTKSQPQIPSPSSSNSSSSTQKLLVQQMATLL
           LVATYEG+HNHP P+            + SN  L+   +   S S+ + +   SS  +P  ++D +     ++ SP+S       QKLLV+QMA+ L
Subjt:  PCYLVATYEGQHNHPKPNSGIEYQLVGPINLGSNTKLDSSNNVSSSPSSSIKSPSSSSSLIPSISLDYLTKSQPQIPSPSSSNSSSSTQKLLVQQMATLL

Query:  TRDPNFTRALATAITGNM
        T+DPNFT ALA A+TG +
Subjt:  TRDPNFTRALATAITGNM

AT2G25000.1 WRKY DNA-binding protein 601.1e-3737.77Show/hide
Query:  ILAEKLNRISSENKKLNQMLGVVVENYSVLQNQVIDLLMKSKKRKAAPGCDNCCNFKRSASDQYCGCCSDDNDSCYNNK-----RPREN--NGKPKVMRV
        +L +++NR++SENKKL +ML  V E Y  L N     LM+  + + +P      NF+   + Q  G    + D   ++       P EN  N K  V   
Subjt:  ILAEKLNRISSENKKLNQMLGVVVENYSVLQNQVIDLLMKSKKRKAAPGCDNCCNFKRSASDQYCGCCSDDNDSCYNNK-----RPREN--NGKPKVMRV

Query:  LVPTPVSDSTLIVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPTCPVKRKVQRSVEDPCYLVATYEGQHNHPKPNSGIEYQLVGPINLGSNTKLDSSNNV
              SD++L VKDGYQWRKYGQK+T+DNPSPRAY++CSF+P+C VK+KVQRS EDP +LVATYEG HNH  P+                         
Subjt:  LVPTPVSDSTLIVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPTCPVKRKVQRSVEDPCYLVATYEGQHNHPKPNSGIEYQLVGPINLGSNTKLDSSNNV

Query:  SSSPSSSIKSPSSSSSLIPSISLDYLTKSQPQIPSPSSSNSSSSTQKLLVQQMATLLTRDPNFTRALATAITGNMVDN
                      +S+  ++ LD +   Q  +          + Q++LVQQMA+ LT+DP FT ALATAI+G ++++
Subjt:  SSSPSSSIKSPSSSSSLIPSISLDYLTKSQPQIPSPSSSNSSSSTQKLLVQQMATLLTRDPNFTRALATAITGNMVDN

AT4G01720.1 WRKY family transcription factor1.7e-1726.37Show/hide
Query:  TTTTINTSLDLNLNPPPYTADQSHPPTPNSSLKQQAPTTGILAEKLNRISSENKKLNQMLGVVVENYSVLQNQVI-----------------------DL
        TTT + +S     N      +  H  + N    +       L  +L R+  EN KL  +L  V E+Y+ LQ +V+                         
Subjt:  TTTTINTSLDLNLNPPPYTADQSHPPTPNSSLKQQAPTTGILAEKLNRISSENKKLNQMLGVVVENYSVLQNQVI-----------------------DL

Query:  LMKSKKRKAAPGCDNCCNFKRSASDQYCG---------CCSDDNDSCYNNKRPRENNGKPKVMRVLVPTPVSDSTLIVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRA
         +++++ K           KR + D   G             D +   N++  +  + +    +  V          V DG QWRKYGQK+ K NP PRA
Subjt:  LMKSKKRKAAPGCDNCCNFKRSASDQYCG---------CCSDDNDSCYNNKRPRENNGKPKVMRVLVPTPVSDSTLIVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRA

Query:  YYKCSFAPTCPVKRKVQRSVEDPCYLVATYEGQHNHPKPNSGIEYQ----------LVGPINLGSNTKLDSSNNVSSS------PSSSIKSPSSSSSLIP
        YY+C+ A  CPV+++VQR  ED   L  TYEG HNHP P S               L G  +   +  L S +  SSS      P +S  +  S+S+  P
Subjt:  YYKCSFAPTCPVKRKVQRSVEDPCYLVATYEGQHNHPKPNSGIEYQ----------LVGPINLGSNTKLDSSNNVSSS------PSSSIKSPSSSSSLIP

Query:  SISLDYLTKSQPQIPSP----------------SSSNSSSSTQKLL--------------VQQMATLLTRDPNFTRALATAIT
        +I+LD     +P  P P                   + +++ Q+LL              V  +   +  DPNFT ALA AI+
Subjt:  SISLDYLTKSQPQIPSP----------------SSSNSSSSTQKLL--------------VQQMATLLTRDPNFTRALATAIT

AT4G31800.1 WRKY DNA-binding protein 181.1e-4037.01Show/hide
Query:  INTSLDLNLNPPPYTADQSHPPT-PNSSLK----QQAPTTGILAEKLNRISSENKKLNQMLGVVVENYSVLQNQVIDLLMKS-----------KKRKAAP
        ++ SLDLN NP      +       ++ LK    +Q  +   L E+LNR++SENKKL +ML  V E+Y+ L N +  L  +            KKRK  P
Subjt:  INTSLDLNLNPPPYTADQSHPPT-PNSSLK----QQAPTTGILAEKLNRISSENKKLNQMLGVVVENYSVLQNQVIDLLMKS-----------KKRKAAP

Query:  GCDNCCNFKRSASDQYCGCCSDDNDSCYNNKRPRENN-------------GKPKVMRVLVPTPVSDSTLIVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFA
          D    F    S       S + D  +++++  + N              K KV  V VPT  SD++L VKDG+QWRKYGQKVT+DNPSPRAY++CSFA
Subjt:  GCDNCCNFKRSASDQYCGCCSDDNDSCYNNKRPRENN-------------GKPKVMRVLVPTPVSDSTLIVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFA

Query:  PTCPVKRKVQRSVEDPCYLVATYEGQHNHPKPNSGIEYQLVGPINLGSNTKLDSSNNVSSSPSSSIKSPSSSSSLIPSISLDYLTKSQPQIPSPSSSNSS
        P+CPVK+KVQRS EDP  LVATYEG HNH  PN+                   S  + +S   SS            +++LD +        +   +   
Subjt:  PTCPVKRKVQRSVEDPCYLVATYEGQHNHPKPNSGIEYQLVGPINLGSNTKLDSSNNVSSSPSSSIKSPSSSSSLIPSISLDYLTKSQPQIPSPSSSNSS

Query:  SSTQKLLVQQMATLLTRDPNFTRALATAITGNMVD
        ++ Q++L+QQMA+ LT+D  FT ALA AI+G +++
Subjt:  SSTQKLLVQQMATLLTRDPNFTRALATAITGNMVD

AT4G31800.2 WRKY DNA-binding protein 181.3e-4137.13Show/hide
Query:  INTSLDLNLNPPPYTADQSHPPTPNSSLK----QQAPTTGILAEKLNRISSENKKLNQMLGVVVENYSVLQNQVIDLLMKS-----------KKRKAAPG
        ++ SLDLN NP      +      ++ LK    +Q  +   L E+LNR++SENKKL +ML  V E+Y+ L N +  L  +            KKRK  P 
Subjt:  INTSLDLNLNPPPYTADQSHPPTPNSSLK----QQAPTTGILAEKLNRISSENKKLNQMLGVVVENYSVLQNQVIDLLMKS-----------KKRKAAPG

Query:  CDNCCNFKRSASDQYCGCCSDDNDSCYNNKRPRENN-------------GKPKVMRVLVPTPVSDSTLIVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAP
         D    F    S       S + D  +++++  + N              K KV  V VPT  SD++L VKDG+QWRKYGQKVT+DNPSPRAY++CSFAP
Subjt:  CDNCCNFKRSASDQYCGCCSDDNDSCYNNKRPRENN-------------GKPKVMRVLVPTPVSDSTLIVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAP

Query:  TCPVKRKVQRSVEDPCYLVATYEGQHNHPKPNSGIEYQLVGPINLGSNTKLDSSNNVSSSPSSSIKSPSSSSSLIPSISLDYLTKSQPQIPSPSSSNSSS
        +CPVK+KVQRS EDP  LVATYEG HNH  PN+                   S  + +S   SS            +++LD +        +   +   +
Subjt:  TCPVKRKVQRSVEDPCYLVATYEGQHNHPKPNSGIEYQLVGPINLGSNTKLDSSNNVSSSPSSSIKSPSSSSSLIPSISLDYLTKSQPQIPSPSSSNSSS

Query:  STQKLLVQQMATLLTRDPNFTRALATAITGNMVD
        + Q++L+QQMA+ LT+D  FT ALA AI+G +++
Subjt:  STQKLLVQQMATLLTRDPNFTRALATAITGNMVD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAACCCACAACTACCACCATCAATACTTCTCTTGACCTCAATTTGAATCCTCCGCCCTACACCGCCGACCAATCTCATCCACCCACTCCTAATTCTTCACTCAAACA
ACAGGCTCCAACAACAGGCATTCTTGCTGAAAAATTGAATCGGATTAGTTCGGAGAATAAGAAGCTGAATCAGATGCTTGGGGTAGTGGTTGAGAATTACAGCGTTTTGC
AAAATCAAGTTATCGATTTACTTATGAAATCCAAAAAACGAAAAGCAGCTCCAGGATGTGATAATTGTTGTAATTTCAAACGGAGCGCTTCCGATCAGTATTGCGGTTGT
TGTAGCGATGATAATGATTCCTGTTATAATAATAAGAGGCCTAGAGAAAATAATGGTAAACCCAAGGTTATGAGAGTCCTCGTTCCCACCCCAGTTTCTGATTCCACTTT
GATTGTGAAGGATGGATATCAATGGAGGAAATACGGTCAAAAGGTGACTAAAGACAATCCGTCACCAAGAGCTTACTATAAATGCTCATTTGCCCCTACCTGTCCGGTGA
AGAGAAAGGTACAAAGAAGTGTTGAAGATCCATGTTATTTAGTAGCAACATATGAAGGACAGCACAATCATCCAAAACCCAATTCAGGAATTGAGTATCAACTAGTTGGA
CCAATTAATTTAGGTTCAAATACAAAGCTTGATTCTTCTAATAATGTTTCGTCATCACCTTCTTCTTCTATCAAATCTCCATCATCATCATCATCATTAATACCTTCTAT
TTCTCTTGATTACTTAACTAAATCTCAACCTCAAATACCATCACCTTCATCATCTAACTCTTCTTCTTCAACACAAAAGCTTCTTGTTCAACAAATGGCCACTCTTTTGA
CCAGAGACCCTAATTTCACTAGAGCTCTTGCCACTGCCATTACCGGAAACATGGTGGACAATGAAATTTGGAGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAACCCACAACTACCACCATCAATACTTCTCTTGACCTCAATTTGAATCCTCCGCCCTACACCGCCGACCAATCTCATCCACCCACTCCTAATTCTTCACTCAAACA
ACAGGCTCCAACAACAGGCATTCTTGCTGAAAAATTGAATCGGATTAGTTCGGAGAATAAGAAGCTGAATCAGATGCTTGGGGTAGTGGTTGAGAATTACAGCGTTTTGC
AAAATCAAGTTATCGATTTACTTATGAAATCCAAAAAACGAAAAGCAGCTCCAGGATGTGATAATTGTTGTAATTTCAAACGGAGCGCTTCCGATCAGTATTGCGGTTGT
TGTAGCGATGATAATGATTCCTGTTATAATAATAAGAGGCCTAGAGAAAATAATGGTAAACCCAAGGTTATGAGAGTCCTCGTTCCCACCCCAGTTTCTGATTCCACTTT
GATTGTGAAGGATGGATATCAATGGAGGAAATACGGTCAAAAGGTGACTAAAGACAATCCGTCACCAAGAGCTTACTATAAATGCTCATTTGCCCCTACCTGTCCGGTGA
AGAGAAAGGTACAAAGAAGTGTTGAAGATCCATGTTATTTAGTAGCAACATATGAAGGACAGCACAATCATCCAAAACCCAATTCAGGAATTGAGTATCAACTAGTTGGA
CCAATTAATTTAGGTTCAAATACAAAGCTTGATTCTTCTAATAATGTTTCGTCATCACCTTCTTCTTCTATCAAATCTCCATCATCATCATCATCATTAATACCTTCTAT
TTCTCTTGATTACTTAACTAAATCTCAACCTCAAATACCATCACCTTCATCATCTAACTCTTCTTCTTCAACACAAAAGCTTCTTGTTCAACAAATGGCCACTCTTTTGA
CCAGAGACCCTAATTTCACTAGAGCTCTTGCCACTGCCATTACCGGAAACATGGTGGACAATGAAATTTGGAGATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEPTTTTINTSLDLNLNPPPYTADQSHPPTPNSSLKQQAPTTGILAEKLNRISSENKKLNQMLGVVVENYSVLQNQVIDLLMKSKKRKAAPGCDNCCNFKRSASDQYCGC
CSDDNDSCYNNKRPRENNGKPKVMRVLVPTPVSDSTLIVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPTCPVKRKVQRSVEDPCYLVATYEGQHNHPKPNSGIEYQLVG
PINLGSNTKLDSSNNVSSSPSSSIKSPSSSSSLIPSISLDYLTKSQPQIPSPSSSNSSSSTQKLLVQQMATLLTRDPNFTRALATAITGNMVDNEIWR