; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0002065 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0002065
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptionprotein RRNAD1 isoform X1
Genome locationchr07:5692020..5697515
RNA-Seq ExpressionIVF0002065
SyntenyIVF0002065
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008444279.1 PREDICTED: protein RRNAD1 isoform X3 [Cucumis melo]7.35e-19299.63Show/hide
Query:  IRTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQLAH
        +RTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQLAH
Subjt:  IRTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQLAH

Query:  PLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWTD
        PLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWTD
Subjt:  PLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWTD

Query:  TEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT
        TEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT
Subjt:  TEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT

XP_008444281.1 PREDICTED: protein RRNAD1 isoform X4 [Cucumis melo]3.13e-19299.63Show/hide
Query:  IRTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQLAH
        +RTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQLAH
Subjt:  IRTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQLAH

Query:  PLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWTD
        PLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWTD
Subjt:  PLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWTD

Query:  TEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT
        TEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT
Subjt:  TEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT

XP_008444283.1 PREDICTED: protein RRNAD1 isoform X6 [Cucumis melo]1.85e-19399.63Show/hide
Query:  IRTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQLAH
        +RTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQLAH
Subjt:  IRTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQLAH

Query:  PLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWTD
        PLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWTD
Subjt:  PLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWTD

Query:  TEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT
        TEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT
Subjt:  TEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT

XP_016899867.1 PREDICTED: protein RRNAD1 isoform X1 [Cucumis melo]8.15e-19299.63Show/hide
Query:  IRTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQLAH
        +RTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQLAH
Subjt:  IRTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQLAH

Query:  PLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWTD
        PLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWTD
Subjt:  PLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWTD

Query:  TEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT
        TEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT
Subjt:  TEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT

XP_031737409.1 protein RRNAD1 isoform X7 [Cucumis sativus]4.57e-17891.45Show/hide
Query:  IIRTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQLA
        I+RTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNN+G+QNGFPMSFGVKSS LSLGKSGR LACQKDGGIWK KVAS ILSCML VLLSKWYSINIIQTWL LA
Subjt:  IIRTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQLA

Query:  HPLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWT
        HPLGVKERHCAVKRKGR+QYPRSV+KISLRHHNQ VADLIGG  VN NAFSHT+SDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGL RLG+QSSQD DCYGIW 
Subjt:  HPLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWT

Query:  DTEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT
        DT+PFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGS+EAILLPIFDP LSPRNVAIIARKVGTT
Subjt:  DTEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L857 Uncharacterized protein3.8e-14391.51Show/hide
Query:  MCIIRTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQ
        MCII+TFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNN+G+QNGFPMSFGVKSS LSLGKSGR LACQKDGGIWK KVAS ILSCML VLLSKWYSINIIQTWL 
Subjt:  MCIIRTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQ

Query:  LAHPLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGI
        LAHPLGVKERHCAVKRKGR+QYPRSV+KISLRHHNQ VADLIGG  VN NAFSHT+SDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGL RLG+QSSQD DCYGI
Subjt:  LAHPLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGI

Query:  WTDTEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT
        W DT+PFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGS+EAILLPIFDP LSPRNVAIIARKVGTT
Subjt:  WTDTEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT

A0A1S3B9I9 protein RRNAD1 isoform X41.8e-15399.26Show/hide
Query:  IIRTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQLA
        ++RTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQLA
Subjt:  IIRTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQLA

Query:  HPLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWT
        HPLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWT
Subjt:  HPLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWT

Query:  DTEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT
        DTEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT
Subjt:  DTEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT

A0A1S3BA33 protein RRNAD1 isoform X61.8e-15399.26Show/hide
Query:  IIRTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQLA
        ++RTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQLA
Subjt:  IIRTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQLA

Query:  HPLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWT
        HPLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWT
Subjt:  HPLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWT

Query:  DTEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT
        DTEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT
Subjt:  DTEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT

A0A1S3BAU0 protein RRNAD1 isoform X31.8e-15399.26Show/hide
Query:  IIRTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQLA
        ++RTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQLA
Subjt:  IIRTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQLA

Query:  HPLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWT
        HPLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWT
Subjt:  HPLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWT

Query:  DTEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT
        DTEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT
Subjt:  DTEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT

A0A1S4DV55 protein RRNAD1 isoform X11.8e-15399.26Show/hide
Query:  IIRTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQLA
        ++RTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQLA
Subjt:  IIRTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQLA

Query:  HPLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWT
        HPLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWT
Subjt:  HPLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWT

Query:  DTEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT
        DTEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT
Subjt:  DTEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5E9V4 Protein RRNAD11.7e-1041.76Show/hide
Query:  EKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWTDTEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARK
        E++   GL R+GL      +   +         ++  ++SL   L P++ET ILLDRLL+LQEQG    A LLPIF P+LSPRN+ ++A K
Subjt:  EKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWTDTEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARK

Q6AYG0 Protein RRNAD19.8e-1141.76Show/hide
Query:  EKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWTDTEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARK
        E++   GL R+GL      D   +         ++  ++SL   L P++ET ILLDR+L+LQEQG    A LLPIF P+LSPRN+ ++A K
Subjt:  EKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWTDTEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARK

Q6NXH8 Methyltransferase-like protein 256.3e-1025.64Show/hide
Query:  IRTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNK----GIQN-GFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTW
        +R F    EVKAV ++GCCY+LL+E   N        +N GFPM   +K      G++ R  AC                                    
Subjt:  IRTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNK----GIQN-GFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTW

Query:  LQLAHPLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQ--SKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTD
              L ++          RV   + +   SL  +   + ++I  +             +G + CEQ   K   K   F ++    L +LGL  S+ ++
Subjt:  LQLAHPLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQ--SKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTD

Query:  --CYGIWTDTEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARK
              + + +P    +  +  L+  L P +ET ILLDRL +L+EQ G   + L+ +FDP  SPR  A+IA K
Subjt:  --CYGIWTDTEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARK

Q8BZG5 Protein RRNAD17.5e-1141.76Show/hide
Query:  EKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWTDTEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARK
        E++   GL R+GL      D   +         ++  ++SL   L P++ET ILLDR+L+LQEQG    A LLPIF P+LSPRN+ ++A K
Subjt:  EKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWTDTEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARK

Q96FB5 Protein RRNAD17.5e-1141.3Show/hide
Query:  EKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWTDTEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKV
        E++   GL R+GL      +   +         ++  ++SL   L P++ET ILLDRLL+LQEQG    A LLPIF P+LSPRN+ ++A K+
Subjt:  EKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWTDTEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G16650.1 S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein1.0e-4741.45Show/hide
Query:  IIRTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQ---------KDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSIN
        ++RTF+EC+EVKA+++IGCCYNLL+E  S +   + G+PMS G++S   SLGK+ RDLACQ         +D G+   ++ S        ++LSK Y   
Subjt:  IIRTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQ---------KDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSIN

Query:  IIQTWLQLAHPLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQ
                     V     ++ R+G+  + R   + SL        D      V+      T           S + D    FEKFC S   RL L+  +
Subjt:  IIQTWLQLAHPLGVKERHCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQ

Query:  DTDCYGIWTDTEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKV
        D D    W + + FTELIGPYWS+RAALGPVLET ILLDRL+FLQEQG S++ ++LPIFDP +SPRNVAIIAR++
Subjt:  DTDCYGIWTDTEPFTELIGPYWSLRAALGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTGTATAATCAGGACTTTTGTAGAGTGCAAGGAAGTAAAAGCAGTAATTAATATTGGTTGCTGTTACAACCTTCTCACGGAGTATGGATCTAACAATAAAGGTATCCA
AAATGGATTTCCTATGAGCTTCGGTGTCAAATCTTCTAGCTTGTCTCTGGGGAAAAGTGGCAGAGACCTTGCATGTCAGAAAGATGGAGGAATTTGGAAAAAGAAGGTGG
CCTCCACAATTTTGAGTTGCATGCTTTCCGTGCTGCTTTCCAAATGGTACTCTATAAATATTATCCAGACGTGGTTGCAACTTGCCCATCCATTGGGCGTCAAGGAAAGG
CATTGCGCCGTCAAAAGAAAAGGGAGGGTTCAGTATCCTCGCAGTGTCGTGAAGATAAGCTTGAGGCATCACAATCAGTATGTTGCAGATCTTATTGGGGGGTTTCAAGT
CAATGCCAACGCTTTTTCTCATACCATTTCAGACCATGGGAGTACGCCATGTGAACAGTCCAAATCTGTTGACAAATACCCTCTTTTTGAAAAGTTTTGTCACTCTGGAT
TAATTCGCCTTGGACTCCAATCTTCACAGGACACGGATTGTTATGGAATCTGGACGGACACTGAGCCTTTTACTGAACTTATTGGGCCTTATTGGTCTCTTCGAGCTGCT
CTGGGCCCAGTATTGGAAACATGTATTCTGCTTGACAGATTACTGTTTCTCCAAGAGCAAGGTGGATCCCTTGAAGCCATATTGCTACCTATTTTTGACCCGGATTTATC
TCCAAGGAATGTGGCTATAATCGCTAGGAAAGTTGGTACAACATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTGTATAATCAGGACTTTTGTAGAGTGCAAGGAAGTAAAAGCAGTAATTAATATTGGTTGCTGTTACAACCTTCTCACGGAGTATGGATCTAACAATAAAGGTATCCA
AAATGGATTTCCTATGAGCTTCGGTGTCAAATCTTCTAGCTTGTCTCTGGGGAAAAGTGGCAGAGACCTTGCATGTCAGAAAGATGGAGGAATTTGGAAAAAGAAGGTGG
CCTCCACAATTTTGAGTTGCATGCTTTCCGTGCTGCTTTCCAAATGGTACTCTATAAATATTATCCAGACGTGGTTGCAACTTGCCCATCCATTGGGCGTCAAGGAAAGG
CATTGCGCCGTCAAAAGAAAAGGGAGGGTTCAGTATCCTCGCAGTGTCGTGAAGATAAGCTTGAGGCATCACAATCAGTATGTTGCAGATCTTATTGGGGGGTTTCAAGT
CAATGCCAACGCTTTTTCTCATACCATTTCAGACCATGGGAGTACGCCATGTGAACAGTCCAAATCTGTTGACAAATACCCTCTTTTTGAAAAGTTTTGTCACTCTGGAT
TAATTCGCCTTGGACTCCAATCTTCACAGGACACGGATTGTTATGGAATCTGGACGGACACTGAGCCTTTTACTGAACTTATTGGGCCTTATTGGTCTCTTCGAGCTGCT
CTGGGCCCAGTATTGGAAACATGTATTCTGCTTGACAGATTACTGTTTCTCCAAGAGCAAGGTGGATCCCTTGAAGCCATATTGCTACCTATTTTTGACCCGGATTTATC
TCCAAGGAATGTGGCTATAATCGCTAGGAAAGTTGGTACAACATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MCIIRTFVECKEVKAVINIGCCYNLLTEYGSNNKGIQNGFPMSFGVKSSSLSLGKSGRDLACQKDGGIWKKKVASTILSCMLSVLLSKWYSINIIQTWLQLAHPLGVKER
HCAVKRKGRVQYPRSVVKISLRHHNQYVADLIGGFQVNANAFSHTISDHGSTPCEQSKSVDKYPLFEKFCHSGLIRLGLQSSQDTDCYGIWTDTEPFTELIGPYWSLRAA
LGPVLETCILLDRLLFLQEQGGSLEAILLPIFDPDLSPRNVAIIARKVGTT