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IVF0002208 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0002208
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionNADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1
Genome locationchr05:12575269..12575568
RNA-Seq ExpressionIVF0002208
SyntenyIVF0002208
Gene Ontology termsGO:0022900 - electron transport chain (biological process)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0008137 - NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001694 - NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 1/F420H2 oxidoreductase subunit H
IPR018086 - NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 1, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6621729.1 hypothetical protein I3842_Q014300 [Carya illinoinensis]1.45e-5995.96Show/hide
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VFQ90086.1 unnamed protein product [Cuscuta campestris]7.60e-5994.95Show/hide
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WP_131747037.1 NADH-quinone oxidoreductase subunit H [Candidatus Frankia meridionalis]4.57e-5995.96Show/hide
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XP_025884651.1 uncharacterized protein LOC101256862 [Solanum lycopersicum]3.77e-5995.96Show/hide
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XP_027772807.1 uncharacterized protein LOC107019352 [Solanum pennellii]1.08e-5894.95Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A290WKZ7 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 16.7e-4595.96Show/hide
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A0A3Q9CX26 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 13.6e-46100Show/hide
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A0A7D6C5G1 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 13.9e-4596.97Show/hide
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G3EIX4 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 13.6e-46100Show/hide
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G3EU12 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 13.6e-46100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P26845 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 11.2e-3576.77Show/hide
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        MA +QRRKGP+VVG  GLLQPLADGLKLMIKEP+ PSSAN  +F MAPV TF L+L A AV+PFDYG+V SD NIG+LYLFAISSLGVYGII AGW+SN
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P31839 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 12.2e-4593.94Show/hide
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P92558 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 11.1e-4492.93Show/hide
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Q01148 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 11.1e-4492.93Show/hide
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Q01300 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 11.8e-4795.96Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G07785.1 NADH dehydrogenase family protein1.3e-4592.93Show/hide
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ATCG01100.1 NADH dehydrogenase family protein1.7e-1642.86Show/hide
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        A +Q+R GP+  G  G+LQ LADG KL+ KE L PS  N  LF + P    +  L++ +V+PF   +VL+D NIG+    AISS+   G++++G+ SN
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ATMG00516.1 NADH dehydrogenase 1C1.3e-4592.93Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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