; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0002254 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0002254
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionRetrotransposon protein
Genome locationchr04:4136977..4137180
RNA-Seq ExpressionIVF0002254
SyntenyIVF0002254
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0043564.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]2.36e-3388.06Show/hide
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TYK08389.1 putative nuclease HARBI1 [Cucumis melo var. makuwa]1.57e-3488.06Show/hide
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TYK10940.1 putative nuclease HARBI1 [Cucumis melo var. makuwa]9.03e-3487.88Show/hide
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XP_008441953.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103485952 [Cucumis melo]1.57e-3488.06Show/hide
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XP_008466673.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103504027 [Cucumis melo]4.39e-40100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B4J8 uncharacterized protein LOC1034859526.2e-2688.06Show/hide
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A0A1S3CRU3 uncharacterized protein LOC1035040272.4e-30100Show/hide
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A0A5A7U0J9 Putative nuclease HARBI16.2e-2688.06Show/hide
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A0A5D3CDG6 Putative nuclease HARBI16.2e-2688.06Show/hide
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A0A5D3CQK6 Putative nuclease HARBI12.4e-30100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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