; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0002342 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0002342
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionRibosomal protein L5
Genome locationchr04:15701438..15701656
RNA-Seq ExpressionIVF0002342
SyntenyIVF0002342
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
AAP33159.1 ribosomal protein L5 [Cucumis sativus]2.33e-1980Show/hide
Query:  MEILRSQKLIQKRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNFFLQ
        MEIL  QKLIQ RGSTGKSF+SNPFL+SNKDKGYVSDLARESTLR H M +FF +
Subjt:  MEILRSQKLIQKRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNFFLQ
AEN56134.1 ribosomal protein L5 [Cucumis melo subsp. melo]6.00e-2290.38Show/hide
Query:  MEILRSQKLIQKRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNF
        MEILR QKLIQ RGSTGKSF+SNPFL+SNKDKGYVSDLARESTLR HEMSNF
Subjt:  MEILRSQKLIQKRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNF
KAA0034876.1 ribosomal protein L5 [Cucumis melo var. makuwa]1.65e-2190.38Show/hide
Query:  MEILRSQKLIQKRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNF
        MEILR QKLIQ RGSTGKSF+SNPFL+SNKDKGYVSDLARESTLR HEMSNF
Subjt:  MEILRSQKLIQKRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNF
PKI31295.1 hypothetical protein CRG98_048315 [Punica granatum]4.74e-1876.79Show/hide
Query:  MEILRSQKLIQ-KRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNFFLQ
        MEILR QK I+ +RGSTGKSFQSNPFL+SNKDK YVSDLAR+STLR H MSNF ++
Subjt:  MEILRSQKLIQ-KRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNFFLQ
YP_004849341.1 ribosomal protein L5 [Cucumis sativus]1.47e-2081.82Show/hide
Query:  MEILRSQKLIQKRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNFFLQ
        MEILR QKLIQ RGSTGKSF+SNPFL+SNKDKGYVSDLARESTLR H M +FF +
Subjt:  MEILRSQKLIQKRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNFFLQ
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A3S9JIG3 Ribosomal protein L56.2e-1690.38Show/hide
Query:  MEILRSQKLIQKRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNF
        MEILR QKLIQ RGSTGKSF+SNPFL+SNKDKGYVSDLARESTLR HEMSNF
Subjt:  MEILRSQKLIQKRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNF
A0A5A7SYB1 Ribosomal protein L5 (Mitochondrion)6.2e-1690.38Show/hide
Query:  MEILRSQKLIQKRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNF
        MEILR QKLIQ RGSTGKSF+SNPFL+SNKDKGYVSDLARESTLR HEMSNF
Subjt:  MEILRSQKLIQKRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNF
G3EIZ3 Ribosomal protein L56.9e-1581.82Show/hide
Query:  MEILRSQKLIQKRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNFFLQ
        MEILR QKLIQ RGSTGKSF+SNPFL+SNKDKGYVSDLARESTLR H M +FF +
Subjt:  MEILRSQKLIQKRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNFFLQ
G3EU44 Ribosomal protein L56.2e-1690.38Show/hide
Query:  MEILRSQKLIQKRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNF
        MEILR QKLIQ RGSTGKSF+SNPFL+SNKDKGYVSDLARESTLR HEMSNF
Subjt:  MEILRSQKLIQKRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNF
Q7Y6H0 Ribosomal protein L55.8e-1480Show/hide
Query:  MEILRSQKLIQKRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNFFLQ
        MEIL  QKLIQ RGSTGKSF+SNPFL+SNKDKGYVSDLARESTLR H M +FF +
Subjt:  MEILRSQKLIQKRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNFFLQ
SwissProt top hitse value%identityAlignment
P42793 60S ribosomal protein L5, mitochondrial7.3e-1475Show/hide
Query:  MEILRSQKLIQ-KRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNFFLQ
        MEI   QK IQ +RGSTGKSF+SNPFL SNKDKGYVSDLAR+STLR H MSNF ++
Subjt:  MEILRSQKLIQ-KRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNFFLQ
P49388 60S ribosomal protein L5, mitochondrial1.5e-1481.13Show/hide
Query:  MEILRSQKLIQ-KRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNF
        MEI R QK IQ +RGSTGKSF+SNPFL SNKDKGYVSDLAR+STLR H MSNF
Subjt:  MEILRSQKLIQ-KRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNF
P51409 60S ribosomal protein L5, mitochondrial7.6e-1169.64Show/hide
Query:  MEILRSQKLIQKRGSTGKSFQSNPFLKSNKD-KGYVSDLARESTLRRHEMSNFFLQ
        MEI   QKL ++R STGKSF+SNPFL SNKD KGYVSDLAR+STLR H MS+F ++
Subjt:  MEILRSQKLIQKRGSTGKSFQSNPFLKSNKD-KGYVSDLARESTLRRHEMSNFFLQ
Q05492 60S ribosomal protein L5, mitochondrial3.0e-1576.79Show/hide
Query:  MEILRSQKLIQ-KRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNFFLQ
        MEILR QK IQ +RGSTGKSF+SNPFL+SNKDKGYVSDLAR+S LR H MSNF ++
Subjt:  MEILRSQKLIQ-KRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNFFLQ
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G07725.1 Ribosomal L5P family protein1.0e-1581.13Show/hide
Query:  MEILRSQKLIQ-KRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNF
        MEI R QK IQ +RGSTGKSF+SNPFL SNKDKGYVSDLAR+STLR H MSNF
Subjt:  MEILRSQKLIQ-KRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNF
ATMG00210.1 ribosomal protein L51.0e-1581.13Show/hide
Query:  MEILRSQKLIQ-KRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNF
        MEI R QK IQ +RGSTGKSF+SNPFL SNKDKGYVSDLAR+STLR H MSNF
Subjt:  MEILRSQKLIQ-KRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNF

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGATTCTACGCAGTCAGAAATTGATACAGAAAAGGGGTTCGACAGGAAAGTCCTTTCAATCCAATCCATTCTTGAAGTCCAATAAAGACAAAGGATATGTCAGTGA
CCTAGCACGAGAAAGCACTCTCCGAAGGCATGAAATGTCCAATTTTTTTCTTCAAAATCATTATAGGAATAGTAATGTCTTTCTTAAATTCTCTGGCCGAAATATATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGATTCTACGCAGTCAGAAATTGATACAGAAAAGGGGTTCGACAGGAAAGTCCTTTCAATCCAATCCATTCTTGAAGTCCAATAAAGACAAAGGATATGTCAGTGA
CCTAGCACGAGAAAGCACTCTCCGAAGGCATGAAATGTCCAATTTTTTTCTTCAAAATCATTATAGGAATAGTAATGTCTTTCTTAAATTCTCTGGCCGAAATATATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEILRSQKLIQKRGSTGKSFQSNPFLKSNKDKGYVSDLARESTLRRHEMSNFFLQNHYRNSNVFLKFSGRNI