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IVF0002533 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0002533
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionProtein ROOT HAIR DEFECTIVE 3
Genome locationchr05:8710315..8710796
RNA-Seq ExpressionIVF0002533
SyntenyIVF0002533
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005789 - endoplasmic reticulum membrane (cellular component)
GO:0009536 - plastid (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR008803 - RHD3/Sey1
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase
IPR030386 - GB1/RHD3-type guanine nucleotide-binding (G) domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAF2301062.1 hypothetical protein GH714_019756 [Hevea brasiliensis]2.40e-2796.08Show/hide
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KAF5929889.1 hypothetical protein HYC85_000056, partial [Camellia sinensis]4.74e-2694.12Show/hide
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KAG2321814.1 hypothetical protein Bca52824_015027 [Brassica carinata]1.36e-2694.12Show/hide
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KAG5537881.1 hypothetical protein RHGRI_025094 [Rhododendron griersonianum]6.11e-2690.91Show/hide
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A0A218WX77 GB1/RHD3-type G domain-containing protein4.1e-2090.91Show/hide
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A0A6J1HJ25 Protein ROOT HAIR DEFECTIVE 3 homolog4.1e-2092.45Show/hide
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A0A6J1HND9 Protein ROOT HAIR DEFECTIVE 3 homolog4.1e-2092.45Show/hide
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A0A6J1KDB3 Protein ROOT HAIR DEFECTIVE 3 homolog4.1e-2092.45Show/hide
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A0A6J1KMA1 Protein ROOT HAIR DEFECTIVE 3 homolog4.1e-2092.45Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P93042 Protein ROOT HAIR DEFECTIVE 35.6e-2292.16Show/hide
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Q0JLS6 Protein ROOT HAIR DEFECTIVE 31.5e-1986.27Show/hide
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Q2QMH2 Protein ROOT HAIR DEFECTIVE 3 homolog 16.2e-2184.31Show/hide
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Q9FKE9 Protein ROOT HAIR DEFECTIVE 3 homolog 23.4e-1982.35Show/hide
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Q9SSN0 Protein ROOT HAIR DEFECTIVE 3 homolog 11.9e-2294.12Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G72960.1 Root hair defective 3 GTP-binding protein (RHD3)1.4e-2394.12Show/hide
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AT3G13870.1 Root hair defective 3 GTP-binding protein (RHD3)4.0e-2392.16Show/hide
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AT3G13870.2 Root hair defective 3 GTP-binding protein (RHD3)8.8e-2394Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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