; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0002705 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0002705
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionMADS-box transcription factor
Genome locationchr07:24592673..24606629
RNA-Seq ExpressionIVF0002705
SyntenyIVF0002705
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR002487 - Transcription factor, K-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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A0A1S3BY64 MADS-box transcription factor 23 isoform X11.2e-12499.18Show/hide
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A0A1S3BYM8 MADS-box transcription factor 23 isoform X32.2e-11898.31Show/hide
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A0A1S3BYR5 MADS-box transcription factor 23 isoform X23.8e-126100Show/hide
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A0A1S3BZF2 MADS-box transcription factor 23 isoform X41.5e-11493.42Show/hide
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A0A6J1JVH1 MADS-box transcription factor 23-like isoform X11.3e-11390.46Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2RVQ5 Agamous-like MADS-box protein AGL165.7e-6356.49Show/hide
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Q38840 Agamous-like MADS-box protein AGL176.3e-6256.7Show/hide
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         +   ++   LQL QP+  +++TS
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Q6EP49 MADS-box transcription factor 271.4e-6960Show/hide
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          F +  + ++P   GL          +++ P  KLG  L
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Q9SI38 MADS-box transcription factor ANR11.6e-6863.44Show/hide
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Q9SZJ6 Agamous-like MADS-box protein AGL215.2e-6457.08Show/hide
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         + +  S   ++L+  QP++ +   P
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G14210.1 AGAMOUS-like 441.1e-6963.44Show/hide
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AT2G22630.1 AGAMOUS-like 174.5e-6356.7Show/hide
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        H LQE +RQL G EL+GLSVK+LQN+ESQLEMSL+G+R+K+E+IL++EI EL +K N +H EN+EL +K+  I +EN EL  KAYG    +         
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        H LQE HRQ+MGEELSGLSV+ LQNLE+QLE+SL+GVR+KK+++L +EI  L ++GN +HQEN++L+KK++L+ ++N EL  K     E++    +++  
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        ++L       RQ+MGEELSGLSV+ LQNLE+QLE+SL+GVR+KK+++L +EI  L ++GN +HQEN++L+KK++L+ ++N EL  K     E++    ++
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         + +  S   ++L+  QP++ +   P
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Sequences Show/hide sequences
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CATGAGACATCAATACCAGGGATAAAGCTGGGGTATGTTCTAGTAATCTGTGTTCATGAAACATGAATTAAATTCCCTATCAAATTCATCTGAATATCGATCTATACTAC
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AATTTGTCATACAGTATGGTCATGTTCAACATGAAGGAAACTCCTGTTTCAGTCACTTATGCCTTATTGTCACCTGATCCATCACATTTGGTATGCAATGTTCTTCAAAC
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TTGTGTTAAGTAATTAGACCAGACTCTAAAGTTGAGATACTAATTAGCTGAATGAAAGTTAATGTTCATCCAATCTTATATAAGGCAGTCCTAAGATGCCTCAAGAATGG
GTTTCGTTCTGTTGAGTTGCTAAAATTAACCATATTAAATGATCCCTTATCCTAAAAAAGTGAGCAGTTCTTGGGGTTAAAATAACCACTCATATCCTTCATTAACACTC
CACTTGCTTGCATTTTCAACTGAACTTAATGAATGAGATCAACAATGTAAAGCAGCTTTTAGACCATGGAATTTAAACCAGTAAAGGAATTTAAAACTAAAAGCTTCTCT
TCATTCAAAGAAACTAAAGGTTTCTCTATTGGGAGAATTTTCTGTCTTATTCTTATCCAGGATTGTATTTATTTTTTCAGTTTAACTTTAGTTTCATGTGATATTATAAG
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GTTAGATTATGACTATTTTGTTTGAATATTTCAAACACTCTGCAATATCTGCCCTGGCATACCCAACTTTAATGAATATTATATAGAAATGTCAATCTAGGACTAATACT
TGAATTGGTTTTCTTTTTTCCATTTAAAATGTTTCAAATATGGCTAGAATGGTTGATTAAGAATCTAAAATCTATGATAGAAACTAGAAAGTATTGCTGGAGTAACAATT
TTCAATTTTCAAAAGAAGGGACATTTCTCCATTTAGTCTTTGTATTTCGTAATTTGGATATTATATACTTTTCCCAAAATTATATTACCTCTCAGGGTATGTTTACATGT
TTAAGCTGGTGGTGAGTTTTCTATCTCCTTTCAAAATACCAAAAGTTGGTTTGCATAGAAAAAGAAATCGTATTCCTTCAGTGGTTATGTGAAACGCAGATGACCTCTGA
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GCGCAAGCTCAACGTGACAAGTATGACCCTCACATTTTTAATAGACTGTTGGTGGGGCTAAAGTACCTCCAGAAACCCATAGAACATATTTTTTCTATCCTAATTTGTTC
AGTGTGTGGTGGCAGATGGGAGGGATGCTTACTTTTGGGAGAATAATTGAATGAGGATAGAACCCTTTGTTCTTTATCCCTAATGTATAATCATTGTCCTTTTTGAGAAA
TTATTTGATGGCTTTGATCCATTCTCACTCTAAGAACCCGCCTTCTTCTTTGGAGTTCTGTAGTTTCTTGATCATAAAGAAAGCAACAGATATTTTGGTTTTGCTTGTAG
ACTTTCGCTTTAGCCCTGGTAGGATGGATGTTTGCATTTCAAGGCCCTGTCTATCCGAAGCTTCTCCTCCAAATCTTTATTTCAATGTTTGGTTAGTTCCTCCCCCTTAT
GTTTAGTTAGTTCCTCCAACTTGAGTGGTTCTATTTTTCCTTTGTTTGAAAAGTGAACTTTCTCAATAAGGTAAAGTTCTTCAAGTGACAAGCTATGCATGAAAGAGTTT
AACACCAAATCTCAGCCAGGGAGTCCATTTTGGTAGGTTGGCTTTGTTGTGTTATTTGCAGGAGGGAAACAGAGGACCATGATCATAACTTCAGCGGATGTAAAAATGAT
AGTGCTATTTGGAGGTGTTTCTATGAGACGTTTAACTTTTGCTTAGCTCCCAAGGTTATAGGGAGACAAAAAATTATTCTTGTGGTAGGTTGAGGTGTGCTATTTTCAGG
GATCTATGAAGCGAGAGAAATAATAAAAATCTTTAGAGACAGGTCTTACAGGGAATGTTTGCTCCCTTGTTAGATTCTATGATTCTATTTGGGTTTCCATGACAAGATCA
TTTTGTAATTACCCTATTGGTCTTATTATGTTACTCACCTAAAGTCTATTTTTGTAGTTTGGCTCCCTTTGGAAGCTTCACTTTCATAAAACTGTGTATTTTTTCATTTT
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HETSIPGIKLGYVLVICVHET