; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0002781 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0002781
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptionarabinogalactan peptide 23-like
Genome locationchr01:30446919..30447101
RNA-Seq ExpressionIVF0002781
SyntenyIVF0002781
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR044702 - Arabinogalactan protein 23/40


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7025661.1 Arabinogalactan peptide 23, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.12e-1680.65Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVLG----ASVVSFVAAYF
        MEMKKIACAALFAAA V+A VA+DES+SPAAAPGPSSAASAALP LG    AS+VSFVA YF
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVLG----ASVVSFVAAYF

KGN45143.1 hypothetical protein Csa_016530 [Cucumis sativus]1.69e-2190.62Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISP----AAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
        MEMKKIACAALFAAAA+SAAVAADES+SP    AAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISP----AAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN

XP_008461276.1 PREDICTED: arabinogalactan peptide 23-like [Cucumis melo]2.73e-24100Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
        MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN

XP_023004714.1 arabinogalactan peptide 23-like [Cucurbita maxima]5.12e-1680.65Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVLG----ASVVSFVAAYF
        MEMKKIACAALFAAA V+A VA+DES+SPAAAPGPSSAASAALP LG    AS+VSFVA YF
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVLG----ASVVSFVAAYF

XP_038899473.1 arabinogalactan protein 23-like [Benincasa hispida]2.17e-1784.38Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVLG----ASVVSFVAAYFLN
        MEMKKIACAALFAAAAVS+AVAADES+SPAAAPGPSSAASAALP LG    AS+V+FVA YFLN
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVLG----ASVVSFVAAYFLN

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K6L5 Uncharacterized protein5.7e-1590.62Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESI----SPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
        MEMKKIACAALFAAAA+SAAVAADES+    SPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESI----SPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN

A0A1S3CDX5 arabinogalactan peptide 23-like4.7e-17100Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
        MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN

A0A6J1F3F5 arabinogalactan peptide 23-like1.6e-0977.42Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYF
        MEMKKIACAALFAAA V+A VA+DES+SPAAAPGPSSAASA LP L    GAS+VS VA YF
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYF

A0A6J1H8I1 arabinogalactan peptide 23-like2.5e-1079.03Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYF
        MEMKKIACAALFAAA ++A VA+DES+SPAAAPGPSSAASAALP L    GAS+VSFVA YF
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYF

A0A6J1KX42 arabinogalactan peptide 23-like1.1e-1080.65Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYF
        MEMKKIACAALFAAA V+A VA+DES+SPAAAPGPSSAASAALP L    GAS+VSFVA YF
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAYF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8S2W4 Arabinogalactan protein 233.0e-0560.66Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAY
        MEMKKIAC  LFAAA+++A +AA+E  +P  APGP+SAASAALP L    GAS+VS  + Y
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G57690.1 arabinogalactan protein 232.2e-0660.66Show/hide
Query:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAY
        MEMKKIAC  LFAAA+++A +AA+E  +P  APGP+SAASAALP L    GAS+VS  + Y
Subjt:  MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVL----GASVVSFVAAY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAATGAAGAAGATCGCTTGCGCTGCTCTTTTCGCCGCTGCTGCCGTCAGCGCCGCGGTGGCTGCAGACGAGTCTATCTCTCCCGCCGCCGCCCCAGGGCCGAGCAG
CGCCGCCTCCGCAGCTCTCCCCGTTCTCGGTGCCTCAGTTGTTTCCTTTGTTGCTGCTTACTTCTTGAACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAATGAAGAAGATCGCTTGCGCTGCTCTTTTCGCCGCTGCTGCCGTCAGCGCCGCGGTGGCTGCAGACGAGTCTATCTCTCCCGCCGCCGCCCCAGGGCCGAGCAG
CGCCGCCTCCGCAGCTCTCCCCGTTCTCGGTGCCTCAGTTGTTTCCTTTGTTGCTGCTTACTTCTTGAACTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEMKKIACAALFAAAAVSAAVAADESISPAAAPGPSSAASAALPVLGASVVSFVAAYFLN