; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0002928 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0002928
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionIntegrase-type DNA-binding superfamily protein
Genome locationchr04:1214889..1215587
RNA-Seq ExpressionIVF0002928
SyntenyIVF0002928
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001471 - AP2/ERF domain
IPR016177 - DNA-binding domain superfamily
IPR036955 - AP2/ERF domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8651413.1 hypothetical protein Csa_001529 [Cucumis sativus]1.15e-10285.56Show/hide
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XP_004136219.1 ethylene-responsive transcription factor ERF043 [Cucumis sativus]1.12e-11978.42Show/hide
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XP_008466061.1 PREDICTED: dehydration-responsive element-binding protein 3-like [Cucumis melo]3.56e-14796.55Show/hide
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        VSLAPRDIQAAAAKAAH        SNPSSSSSSSSSSSLSVSTSLSPSSPSSSTQPDDDDHELTEIVKLPTLASSNYDDHEFVLMDSTEGWVYPPPWLR
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        TIEDYYYGYHTNNINDELGIGDHNHSNLSWDY
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XP_022976323.1 dehydration-responsive element-binding protein 3-like [Cucurbita maxima]1.14e-8164.57Show/hide
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        AAKAAHMD  F YS+                                DD  EL+EIVKLP+L S+NY ++EFVLMDST+GWVYPPPWLRT++D  YY   
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Query:  HTNNINDELGIGDHNHSNLSWDY
        + NNI DE+GIGD   SN  WDY
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XP_038899086.1 ethylene-responsive transcription factor TINY-like [Benincasa hispida]2.73e-8672.15Show/hide
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        N S    +KRVR   +   +YRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSAILNFP+LAHSLPRPVS APRD+QAAAAK
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Query:  AAHMDF-NFHYSSNPSSSSSSSSSSSLSVSTSLSPSSPSSSTQPDDDDHELTEIVKLPTLASSNYDDHEFVLMDSTEGWVYPPPWLRTIEDYYYGYHTNN
        AA+MD  NFH+S +P             VSTSLSPS PSS+   DDD  ELTEIVKLPTLAS NYD HEFVLMDS EGWVYPPPWLRT+ED  Y  ++NN
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Query:  INDELGIGDHNHSNLSWDY
        I D  GIGD   SN  WDY
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LHV3 AP2 domain class transcription factor4.8e-9478.84Show/hide
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        MSPTN QSQI       T+ N  +++++++++KRVR SDSIYRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSAILNFPEL
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        AHSLPRPVS APRDIQAAA+KAAHMDFNFHY          SS+SS SVSTSLSPSSP    + D+D HEL+EIVKLPTLASSNYDDHEFVLMDSTEGWV
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Query:  YPPPWLRTIEDYYYGYHTNNINDELGI--GDHNHSNLSWDY
        YPPPWLRT+EDYYYGYHTNNINDELGI   D +HSNLSWDY
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A0A1S3CQC6 dehydration-responsive element-binding protein 3-like2.9e-11596.55Show/hide
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        VSLAPRDIQAAAAKAAH        SNPSSSSSSSSSSSLSVSTSLSPSSPSSSTQPDDDDHELTEIVKLPTLASSNYDDHEFVLMDSTEGWVYPPPWLR
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        TIEDYYYGYHTNNINDELGIGDHNHSNLSWDY
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A0A6J1F7M6 dehydration-responsive element-binding protein 3-like1.8e-6463.98Show/hide
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        MS T Q SQIT+ S+ D N+ S+ ++KRVR S    +YRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSAILNFPELAHSL
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        PRPVS APRD+QAAAAKAAHMD  F YS+                                DD  EL+EIVKLP+L ++NY ++EFVLMDST+GWVYPPP
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Query:  WLRTIED-YYYGYHTNNINDELGIGDHNHSNLSWDY
        WLRT++D  Y   + NNI DE+GIGD   SN  WDY
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A0A6J1FNI3 dehydration-responsive element-binding protein 3-like1.2e-5265.84Show/hide
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        T+S    +S+SSSSSKRVR S    +YRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKG NSAILNFPELAHSLPRP S APRD
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Query:  IQAAAAKAAHMDFNFHYSSNPSSSSSSSSSSSLSVSTSLSPSSPSSSTQPDDDDHELTEIVKLPTLASSNYD----DHEFVLMDSTEG-WVYPPPWLRTI
        IQAAAAKAAHMD        PS  S+SS++                   PDD D +L EI+KLP L  +NYD    ++EFVLMDS+E  W YPPPW+RT+
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Query:  ED
        ED
Subjt:  ED

A0A6J1ILS4 dehydration-responsive element-binding protein 3-like1.4e-6463.09Show/hide
Query:  TNQQSQITRSNDDNNSSSSSSSKRVRASDS--IYRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSAILNFPELAHSLPRPV
        T   S  T  N  NN+ S+ ++KRVR S    +YRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSA LNFPELAHSLPRPV
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Query:  SLAPRDIQAAAAKAAHMDFNFHYSSNPSSSSSSSSSSSLSVSTSLSPSSPSSSTQPDDDDHELTEIVKLPTLASSNYDDHEFVLMDSTEGWVYPPPWLRT
        S APRD+QAAAAKAAHMD  F YS+                                DD  EL+EIVKLP+L S+NY ++EFVLMDST+GWVYPPPWLRT
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Query:  IED--YYYGYHTNNINDELGIGDHNHSNLSWDY
        ++D  YY   + NNI DE+GIGD   SN  WDY
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80654 Ethylene-responsive transcription factor ERF0373.5e-4153.28Show/hide
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        Q S +    D      +S  +++ KRVR SD  YRGVRMR WGKWVSEIREPRKKSRIWLGTF TPEMAARAHD AAL+IKG SA+LNFPELA  LPRP 
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        S +PRD+QAAAA AA MDF+   SS           P+ +  SSSS S   S+SLSPSS  +++  +    EL+EIV+LP+L +S YD+   EFV +DS 
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            YPP  PW +     +YY    N I+
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Q39127 Ethylene-responsive transcription factor TINY2.0e-4155.56Show/hide
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        + S + + N++        S        +YRGVR R WGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFP+PEMAARAHDVAALSIKG SAILNFP+LA S PRP SL+P
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Query:  RDIQAAAAKAAHMDFNFHYSSNPSSSSSSSSSSSLSVSTSLSPSSPSSSTQPDDDDHELTEIVKLPTLASSNYD-----DHEFVLMDSTEGWVYPPPW
        RDIQ AA KAAHM+ +  +SS+ S + SSS SSS S+ + +S S+  S         EL EIV+LP+L SS YD      +EF+  DS + W YPP W
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Q52QU1 Ethylene-responsive transcription factor ERF0422.7e-4156.73Show/hide
Query:  SNDDNNSSSSSSSKRVRASDSIYRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSAILNFPELAHSLPRPVSLAPRDIQAAA
        S+  +   SS   K       +YRG RMR+WGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPT EMAARAHDVAALSIKG+SAILNFPELA  LPRPVSL+ +DIQAAA
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Query:  AKAAHMDFN---FHY--SSNPSSSSSSS------SSSSLSVSTSLSPSSPSSSTQPDDDDHELTEIVKLPTLASSNYDDHEFVLMDSTEGWVYPPPWLRT
        A+AA MDF    FH    S P  +   +      SSSS S S+S S SS SSS+       EL +IV+LP+L   N   ++  L DS EG V  PPWL  
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Query:  IE-DYYYG
         E D+ YG
Subjt:  IE-DYYYG

Q9LYD3 Dehydration-responsive element-binding protein 32.5e-4755.9Show/hide
Query:  SNDDNNSSSSSSSKRVRASDS----IYRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSAILNFPELAHSLPRPVSLAPRDI
        S  D + +  S  K  R  DS    +YRGVRMR WGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKG +AILNFPELA S PRPVSL+PRDI
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Query:  QAAAAKAAHMDFNFHYSSNPSSSSSSSSSSSLSVSTSLSPSSPSSSTQPDDDDHELTEIVKLPTLASSNYD------DHEFVLMDSTEGWVYPPPWLRTI
        Q AA KAAHM+    +SS+ SSSSS SS+SSL     +   S + S        EL EIV+LP+L +S YD       +EFV  DS +  +YPPPW ++ 
Subjt:  QAAAAKAAHMDFNFHYSSNPSSSSSSSSSSSLSVSTSLSPSSPSSSTQPDDDDHELTEIVKLPTLASSNYD------DHEFVLMDSTEGWVYPPPWLRTI

Query:  EDYYYGYHTNNINDELGIGDHNHSNLSWD
        ED  YG+         GI  +    LSWD
Subjt:  EDYYYGYHTNNINDELGIGDHNHSNLSWD

Q9M080 Ethylene-responsive transcription factor ERF0431.0e-4555.45Show/hide
Query:  SSSSSSKRVRASDSIYRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSAILNFPELAHSLPRPVSLAPRDIQAAAAKAAHMD
        SSS   K+      +YRGVRMR+WGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPT EMA RAHDVAA+SIKG SAILNFPEL+  LPRPVSL+PRD++AAA KAA MD
Subjt:  SSSSSSKRVRASDSIYRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSAILNFPELAHSLPRPVSLAPRDIQAAAAKAAHMD

Query:  FNF------HYSSNPSSSSSSSSSSSLSVSTSLSPSSPSSSTQPDDD--DHELTEIVKLPTLASSNYDDHEFVLMDSTEGWVYPPPWLRTIEDYYYGYHT
        F+         +S  ++S+  S SS  + + S S SS SS T  ++     +L EIVKLP+L +S  + +EFV+ DS E  VY P WL   E+  + Y+ 
Subjt:  FNF------HYSSNPSSSSSSSSSSSLSVSTSLSPSSPSSSTQPDDD--DHELTEIVKLPTLASSNYDDHEFVLMDSTEGWVYPPPWLRTIEDYYYGYHT

Query:  NN
        N+
Subjt:  NN

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G77200.1 Integrase-type DNA-binding superfamily protein2.5e-4253.28Show/hide
Query:  QQSQITRSND----DNNSSSSSSSKRVRASDSIYRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSAILNFPELAHSLPRPV
        Q S +    D      +S  +++ KRVR SD  YRGVRMR WGKWVSEIREPRKKSRIWLGTF TPEMAARAHD AAL+IKG SA+LNFPELA  LPRP 
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Query:  SLAPRDIQAAAAKAAHMDFNFHYSS----------NPSSSSSSSSSSSLSVSTSLSPSSPSSSTQPDDDDHELTEIVKLPTLASSNYDD--HEFVLMDST
        S +PRD+QAAAA AA MDF+   SS           P+ +  SSSS S   S+SLSPSS  +++  +    EL+EIV+LP+L +S YD+   EFV +DS 
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Query:  EGWVYPP--PW-LRTIEDYYYGYHTNNIN
            YPP  PW +     +YY    N I+
Subjt:  EGWVYPP--PW-LRTIEDYYYGYHTNNIN

AT2G25820.1 Integrase-type DNA-binding superfamily protein1.9e-4256.73Show/hide
Query:  SNDDNNSSSSSSSKRVRASDSIYRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSAILNFPELAHSLPRPVSLAPRDIQAAA
        S+  +   SS   K       +YRG RMR+WGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPT EMAARAHDVAALSIKG+SAILNFPELA  LPRPVSL+ +DIQAAA
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Query:  AKAAHMDFN---FHY--SSNPSSSSSSS------SSSSLSVSTSLSPSSPSSSTQPDDDDHELTEIVKLPTLASSNYDDHEFVLMDSTEGWVYPPPWLRT
        A+AA MDF    FH    S P  +   +      SSSS S S+S S SS SSS+       EL +IV+LP+L   N   ++  L DS EG V  PPWL  
Subjt:  AKAAHMDFN---FHY--SSNPSSSSSSS------SSSSLSVSTSLSPSSPSSSTQPDDDDHELTEIVKLPTLASSNYDDHEFVLMDSTEGWVYPPPWLRT

Query:  IE-DYYYG
         E D+ YG
Subjt:  IE-DYYYG

AT4G32800.1 Integrase-type DNA-binding superfamily protein7.4e-4755.45Show/hide
Query:  SSSSSSKRVRASDSIYRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSAILNFPELAHSLPRPVSLAPRDIQAAAAKAAHMD
        SSS   K+      +YRGVRMR+WGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPT EMA RAHDVAA+SIKG SAILNFPEL+  LPRPVSL+PRD++AAA KAA MD
Subjt:  SSSSSSKRVRASDSIYRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSAILNFPELAHSLPRPVSLAPRDIQAAAAKAAHMD

Query:  FNF------HYSSNPSSSSSSSSSSSLSVSTSLSPSSPSSSTQPDDD--DHELTEIVKLPTLASSNYDDHEFVLMDSTEGWVYPPPWLRTIEDYYYGYHT
        F+         +S  ++S+  S SS  + + S S SS SS T  ++     +L EIVKLP+L +S  + +EFV+ DS E  VY P WL   E+  + Y+ 
Subjt:  FNF------HYSSNPSSSSSSSSSSSLSVSTSLSPSSPSSSTQPDDD--DHELTEIVKLPTLASSNYDDHEFVLMDSTEGWVYPPPWLRTIEDYYYGYHT

Query:  NN
        N+
Subjt:  NN

AT5G11590.1 Integrase-type DNA-binding superfamily protein1.8e-4855.9Show/hide
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        S  D + +  S  K  R  DS    +YRGVRMR WGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKG +AILNFPELA S PRPVSL+PRDI
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Query:  QAAAAKAAHMDFNFHYSSNPSSSSSSSSSSSLSVSTSLSPSSPSSSTQPDDDDHELTEIVKLPTLASSNYD------DHEFVLMDSTEGWVYPPPWLRTI
        Q AA KAAHM+    +SS+ SSSSS SS+SSL     +   S + S        EL EIV+LP+L +S YD       +EFV  DS +  +YPPPW ++ 
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Query:  EDYYYGYHTNNINDELGIGDHNHSNLSWD
        ED  YG+         GI  +    LSWD
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AT5G25810.1 Integrase-type DNA-binding superfamily protein1.5e-4255.56Show/hide
Query:  QQSQITRSNDDNNSSSSSSSKRVRASDSIYRGVRMRAWGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFPTPEMAARAHDVAALSIKGNSAILNFPELAHSLPRPVSLAP
        + S + + N++        S        +YRGVR R WGKWVSEIREPRKKSRIWLGTFP+PEMAARAHDVAALSIKG SAILNFP+LA S PRP SL+P
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        RDIQ AA KAAHM+ +  +SS+ S + SSS SSS S+ + +S S+  S         EL EIV+LP+L SS YD      +EF+  DS + W YPP W
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CGTGAGAATGCGAGCTTGGGGCAAATGGGTGTCCGAAATCCGTGAGCCACGCAAGAAATCCCGCATTTGGCTCGGTACTTTCCCTACCCCTGAAATGGCCGCTCGAGCCC
ACGACGTTGCCGCTTTGTCCATTAAAGGTAACTCCGCCATTCTTAACTTCCCTGAACTCGCTCACTCTCTTCCTCGTCCTGTCTCCCTCGCCCCTCGTGACATTCAAGCC
GCTGCTGCTAAAGCCGCTCACATGGACTTCAACTTTCATTACTCTTCTAATCCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTTATCTGTTTCCACTTCTTTATC
TCCTTCTTCGCCTTCCTCCTCCACCCAGCCTGACGACGACGACCACGAACTCACCGAGATCGTTAAACTCCCTACTCTCGCTTCCTCCAACTATGACGACCACGAATTCG
TTCTCATGGACTCCACCGAGGGATGGGTCTATCCACCACCTTGGTTACGAACCATTGAAGATTATTATTACGGCTACCATACCAACAATATTAACGATGAATTGGGAATT
GGTGATCATAATCATAGTAATTTGTCGTGGGATTATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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GGTGATCATAATCATAGTAATTTGTCGTGGGATTATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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GDHNHSNLSWDY