; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0003002 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0003002
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptiontranscription factor bHLH79
Genome locationchr03:21075051..21077881
RNA-Seq ExpressionIVF0003002
SyntenyIVF0003002
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
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GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR024097 - Basic helix-loop-helix leucine zipper transcription factor
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_038884167.1 transcription factor BHLH089-like [Benincasa hispida]4.53e-19290.94Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KG05 BHLH domain-containing protein1.1e-16298.32Show/hide
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A0A1S3CNW1 transcription factor bHLH795.1e-165100Show/hide
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A0A5A7TTF0 Transcription factor bHLH795.1e-165100Show/hide
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A0A6J1G465 transcription factor BHLH094-like5.7e-13282.21Show/hide
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A0A6J1KBN0 transcription factor BHLH094-like1.2e-12980.87Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0JXE7 Transcription factor BPE2.4e-5051.56Show/hide
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Q69WS3 Transcription factor BHLH0941.9e-5552.45Show/hide
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Q84T08 Transcription factor BHLH0894.8e-5961.19Show/hide
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        G G  ++R+      E DS ++ STS G     + +   DS  KR K +    DN   +TEAE  S    K+   + P PE PKQDYIHVRARRGQATDS
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Query:  HSLAERARREKISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSRIGPGIEVFPPKDYGQQTFDSS-GVAFGSQATREYSRG
        HSLAERARREKISERMKILQDLVPGCNKVIGKA VLDEIINYIQ+LQRQVEFLSMKLEAVN+ +  GIE FPPKD+G Q ++++ G+ F  Q  REY++G
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        S+P EWLHMQIGG +ER T
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Q9FJL4 Transcription factor bHLH786.3e-3551.56Show/hide
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        A+ +PEV+P      + ++ +P G    +    +   SP  S T+  N     S +  + GGKR +     +D+ E + E E   G    N++P PE PK
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         DYIHVRARRGQATDSHSLAER RREKI ERMK+LQDLVPGCNKV GKAL+LDEIINY+QSLQRQVEFLSMKL +VN +R+   ++    KD
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Q9LV17 Transcription factor bHLH793.3e-5249.03Show/hide
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Query:  SEQDSPK-VSSTSNGNNANANSSAGNDSGGKRVKTAACRDDNHES--KTEAEPRSG-----KTEQNSQPTPEQPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARR
        SE DS K VSS+S+GN          +SG K+ K       N +   + E E  SG      TEQ ++P   +P +DYIHVRARRGQATD HSLAERARR
Subjt:  SEQDSPK-VSSTSNGNNANANSSAGNDSGGKRVKTAACRDDNHES--KTEAEPRSG-----KTEQNSQPTPEQPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARR

Query:  EKISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNS--RIGPGIEVFPPKDYGQQTFDSSGVAFGSQATREYSRGSSPEWLHM
        EKISE+M  LQD++PGCNK+IGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLE VNS    GP I VFP  D G    D     +  Q   E +R S PEWLHM
Subjt:  EKISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNS--RIGPGIEVFPPKDYGQQTFDSSGVAFGSQATREYSRGSSPEWLHM

Query:  QIGGGFERTT
        Q+ G F RTT
Subjt:  QIGGGFERTT

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G59640.1 BIG PETAL P5.6e-7154.52Show/hide
Query:  MDPPTLINQPSFPTTPNANPNITPFNLSEIWHFPIHGGTSVEDSGPALALRMAHLAHNLTHFGDIAIGNPEVSPTDPVPLQLQQRLPHGHGVSKKRRDSE
        MDP  ++N+              PFNL+EIW FP++G ++  DS      R + +  N   FGD  +          +   L Q +  G   + KRR+ E
Subjt:  MDPPTLINQPSFPTTPNANPNITPFNLSEIWHFPIHGGTSVEDSGPALALRMAHLAHNLTHFGDIAIGNPEVSPTDPVPLQLQQRLPHGHGVSKKRRDSE

Query:  QDSPKVSSTSNGNNANANSSAGNDSGGKRVKTAACRDDNHESKTEAEPRSGKTEQNSQPTPEQPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKIL
          S K+ ST             ++   KR K     D+  + K EAE    +TEQ  Q    +P +DYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKIL
Subjt:  QDSPKVSSTSNGNNANANSSAGNDSGGKRVKTAACRDDNHESKTEAEPRSGKTEQNSQPTPEQPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKIL

Query:  QDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSRIGPGIEVFPPKDYGQQTFDSSGVAFGSQATREYSRGSSPEWLHMQIG-GGFERTT
        QDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSR+ PGIEVFPPK++GQQ F++  + FGSQ+TREYSRG+SPEWLHMQIG GGFERT+
Subjt:  QDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSRIGPGIEVFPPKDYGQQTFDSSGVAFGSQATREYSRGSSPEWLHMQIG-GGFERTT

AT1G59640.2 BIG PETAL P1.7e-5151.56Show/hide
Query:  MDPPTLINQPSFPTTPNANPNITPFNLSEIWHFPIHGGTSVEDSGPALALRMAHLAHNLTHFGDIAIGNPEVSPTDPVPLQLQQRLPHGHGVSKKRRDSE
        MDP  ++N+              PFNL+EIW FP++G ++  DS      R + +  N   FGD  +          +   L Q +  G   + KRR+ E
Subjt:  MDPPTLINQPSFPTTPNANPNITPFNLSEIWHFPIHGGTSVEDSGPALALRMAHLAHNLTHFGDIAIGNPEVSPTDPVPLQLQQRLPHGHGVSKKRRDSE

Query:  QDSPKVSSTSNGNNANANSSAGNDSGGKRVKTAACRDDNHESKTEAEPRSGKTEQNSQPTPEQPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKIL
          S K+ ST             ++   KR K     D+  + K EAE    +TEQ  Q    +P +DYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKIL
Subjt:  QDSPKVSSTSNGNNANANSSAGNDSGGKRVKTAACRDDNHESKTEAEPRSGKTEQNSQPTPEQPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKIL

Query:  QDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSRIGPGIEVFPPKD
        QDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSR+ PGIEVFPPK+
Subjt:  QDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSRIGPGIEVFPPKD

AT3G07340.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.1e-3354.12Show/hide
Query:  SEQDSPKVSSTSNGNNANANSSAGNDSG--GKRVKT--------AACRDDNHESKTEAEP-RSGKTEQNSQPTPE-QPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAE
        + +  P+VSS+       ++  AG  SG   ++ KT        A       E K +++P R  K+E+N   T    P +DYIHVRARRGQATDSHSLAE
Subjt:  SEQDSPKVSSTSNGNNANANSSAGNDSG--GKRVKT--------AACRDDNHESKTEAEP-RSGKTEQNSQPTPE-QPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAE

Query:  RARREKISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSRIGPGIEVFPPKD
        R RREKISERMK+LQDLVPGCNKV GKAL+LDEIINY+QSLQRQVEFLSMKL +VN+R+   ++    KD
Subjt:  RARREKISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSRIGPGIEVFPPKD

AT5G48560.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein4.4e-3651.56Show/hide
Query:  AIGNPEVSPTDPVPLQLQQRLPHGHGVSKKRRDSEQDSPKVSSTSNGNNANANSSAGNDSGGKRVKTAACRDDNHESKTEAEPRSGKTEQNSQPTPEQPK
        A+ +PEV+P      + ++ +P G    +    +   SP  S T+  N     S +  + GGKR +     +D+ E + E E   G    N++P PE PK
Subjt:  AIGNPEVSPTDPVPLQLQQRLPHGHGVSKKRRDSEQDSPKVSSTSNGNNANANSSAGNDSGGKRVKTAACRDDNHESKTEAEPRSGKTEQNSQPTPEQPK

Query:  QDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVN-SRIGPGIEVFPPKD
         DYIHVRARRGQATDSHSLAER RREKI ERMK+LQDLVPGCNKV GKAL+LDEIINY+QSLQRQVEFLSMKL +VN +R+   ++    KD
Subjt:  QDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVN-SRIGPGIEVFPPKD

AT5G62610.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.3e-5349.03Show/hide
Query:  MDPPTLINQPSFPTTPNANPNITPFNLSEIWHFPIHGGTSVEDSGPALALRMAHLAHNLTHFGDIAIGNPEVSPTDPVPLQLQQRLPHGHGVSKKRRD--
        MDPP L+N  SF     ANP  + + LSEIW FP++       SG  LA+    +     H G+  +   E S            L  G G S+K RD  
Subjt:  MDPPTLINQPSFPTTPNANPNITPFNLSEIWHFPIHGGTSVEDSGPALALRMAHLAHNLTHFGDIAIGNPEVSPTDPVPLQLQQRLPHGHGVSKKRRD--

Query:  SEQDSPK-VSSTSNGNNANANSSAGNDSGGKRVKTAACRDDNHES--KTEAEPRSG-----KTEQNSQPTPEQPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARR
        SE DS K VSS+S+GN          +SG K+ K       N +   + E E  SG      TEQ ++P   +P +DYIHVRARRGQATD HSLAERARR
Subjt:  SEQDSPK-VSSTSNGNNANANSSAGNDSGGKRVKTAACRDDNHES--KTEAEPRSG-----KTEQNSQPTPEQPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARR

Query:  EKISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNS--RIGPGIEVFPPKDYGQQTFDSSGVAFGSQATREYSRGSSPEWLHM
        EKISE+M  LQD++PGCNK+IGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLE VNS    GP I VFP  D G    D     +  Q   E +R S PEWLHM
Subjt:  EKISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNS--RIGPGIEVFPPKDYGQQTFDSSGVAFGSQATREYSRGSSPEWLHM

Query:  QIGGGFERTT
        Q+ G F RTT
Subjt:  QIGGGFERTT


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATCCACCTACTCTCATCAACCAACCTTCATTTCCAACTACCCCTAATGCCAATCCCAATATCACCCCTTTCAATCTTTCTGAGATCTGGCACTTCCCAATTCATGG
CGGAACATCCGTTGAGGATTCTGGACCTGCTCTTGCCCTCAGAATGGCCCATCTCGCTCATAATTTGACCCACTTTGGAGACATTGCCATTGGGAATCCAGAGGTTTCCC
CTACTGACCCAGTTCCTTTGCAATTGCAGCAGAGACTACCTCATGGTCATGGCGTTTCCAAGAAGCGCCGTGATTCAGAGCAAGATTCGCCTAAAGTCAGTTCGACTAGT
AATGGCAACAATGCCAATGCCAATAGCAGTGCTGGGAATGATTCTGGTGGAAAACGCGTTAAGACAGCGGCGTGTAGAGATGATAATCACGAATCCAAAACAGAAGCGGA
ACCCAGATCTGGGAAGACCGAACAGAACTCCCAGCCTACTCCAGAACAACCCAAACAGGATTACATCCATGTGCGAGCGAGAAGGGGCCAAGCAACTGATAGCCATAGTC
TCGCCGAAAGGGCTAGAAGAGAAAAGATAAGTGAGAGAATGAAAATTCTACAAGACTTGGTCCCTGGGTGTAATAAGGTCATTGGAAAAGCGCTTGTACTTGATGAGATA
ATAAATTACATTCAATCTCTTCAGCGTCAGGTTGAGTTCTTGTCAATGAAACTCGAAGCAGTTAATTCGAGAATTGGCCCTGGCATTGAAGTGTTTCCTCCAAAAGATTA
TGGTCAACAAACATTCGATTCAAGCGGTGTTGCGTTTGGTTCACAAGCAACAAGAGAATACAGCCGTGGCTCATCACCAGAATGGTTGCATATGCAGATTGGTGGTGGTT
TCGAAAGAACGACGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAGAAAAAGGAGAAAGGATTGACTGAATGGGAGAGGGTATTTGATTCCTGAGTGCGAACCAACCTACAATGTCCAAAGGAGCTTCAGGACATAAATACAACTCTCATCT
TCTTCCTTTTTCCAACCTACTTAAACTCCAAATCTCTCTCTCTCTCTATCTCGCTCTCTGTCTCTTTTGTTTTTTCAACTCAACTCACAGTACAGCTCAAACAAAACTGG
AGCTTTTCCATTAATCTCACCTTCATCCTTTTCCATTCCTTATATATATATATATATTATCATGGGTTTACTTCTACTGTTTTTTCAAACTTGAATCCACCCACAAACAC
AGAAGCTCTCGTCAAATGACATGGATCCACCTACTCTCATCAACCAACCTTCATTTCCAACTACCCCTAATGCCAATCCCAATATCACCCCTTTCAATCTTTCTGAGATC
TGGCACTTCCCAATTCATGGCGGAACATCCGTTGAGGATTCTGGACCTGCTCTTGCCCTCAGAATGGCCCATCTCGCTCATAATTTGACCCACTTTGGAGACATTGCCAT
TGGGAATCCAGAGGTTTCCCCTACTGACCCAGTTCCTTTGCAATTGCAGCAGAGACTACCTCATGGTCATGGCGTTTCCAAGAAGCGCCGTGATTCAGAGCAAGATTCGC
CTAAAGTCAGTTCGACTAGTAATGGCAACAATGCCAATGCCAATAGCAGTGCTGGGAATGATTCTGGTGGAAAACGCGTTAAGACAGCGGCGTGTAGAGATGATAATCAC
GAATCCAAAACAGAAGCGGAACCCAGATCTGGGAAGACCGAACAGAACTCCCAGCCTACTCCAGAACAACCCAAACAGGATTACATCCATGTGCGAGCGAGAAGGGGCCA
AGCAACTGATAGCCATAGTCTCGCCGAAAGGGCTAGAAGAGAAAAGATAAGTGAGAGAATGAAAATTCTACAAGACTTGGTCCCTGGGTGTAATAAGGTCATTGGAAAAG
CGCTTGTACTTGATGAGATAATAAATTACATTCAATCTCTTCAGCGTCAGGTTGAGTTCTTGTCAATGAAACTCGAAGCAGTTAATTCGAGAATTGGCCCTGGCATTGAA
GTGTTTCCTCCAAAAGATTATGGTCAACAAACATTCGATTCAAGCGGTGTTGCGTTTGGTTCACAAGCAACAAGAGAATACAGCCGTGGCTCATCACCAGAATGGTTGCA
TATGCAGATTGGTGGTGGTTTCGAAAGAACGACGTAGTCTAGAAAATTCTCTCGACCATTATTACTAATAAAAGCAAGAAAGGAGGGTGTATTCCACCTCTAGTAGAGCT
CTCAACAAGTATAGTCCATATGGAAAAAAAATCAAAGGTAGACTTAATTTTCACATTCAGGGATGAAGATATGGATGCTGTTCATAGATCTGCTTTTAAGTTAGTGATTG
AACATCTGTTAATGTGTTGGAAAGTAGATTCTCTGATATCTCTGCCTCATAAACTCCTCCATATAAATACTAAAAAGTTAACCTGCTGAACAAGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDPPTLINQPSFPTTPNANPNITPFNLSEIWHFPIHGGTSVEDSGPALALRMAHLAHNLTHFGDIAIGNPEVSPTDPVPLQLQQRLPHGHGVSKKRRDSEQDSPKVSSTS
NGNNANANSSAGNDSGGKRVKTAACRDDNHESKTEAEPRSGKTEQNSQPTPEQPKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEI
INYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSRIGPGIEVFPPKDYGQQTFDSSGVAFGSQATREYSRGSSPEWLHMQIGGGFERTT