; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0003029 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0003029
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionMediator of RNA polymerase II transcription subunit 12-like isoform X1
Genome locationchr05:19087405..19087797
RNA-Seq ExpressionIVF0003029
SyntenyIVF0003029
Gene Ontology termsGO:0010073 - meristem maintenance (biological process)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0047564.1 GATA zinc finger domain-containing protein 10-like isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]1.08e-89100Show/hide
Query:  MYDVPIVSAPVQRRHALVQELDELEEVDQHVEEVPLVTQTQSETGYVSPVMMMSTFGMGYYDPEVGQSLDFGTRYYNSEADPSSSNFGQEYYDLGTNPSS
        MYDVPIVSAPVQRRHALVQELDELEEVDQHVEEVPLVTQTQSETGYVSPVMMMSTFGMGYYDPEVGQSLDFGTRYYNSEADPSSSNFGQEYYDLGTNPSS
Subjt:  MYDVPIVSAPVQRRHALVQELDELEEVDQHVEEVPLVTQTQSETGYVSPVMMMSTFGMGYYDPEVGQSLDFGTRYYNSEADPSSSNFGQEYYDLGTNPSS

Query:  SYMHGHGHGRGEHNEYLYYEAPAAVPEKPN
        SYMHGHGHGRGEHNEYLYYEAPAAVPEKPN
Subjt:  SYMHGHGHGRGEHNEYLYYEAPAAVPEKPN

KAA0050408.1 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]2.23e-6379.69Show/hide
Query:  MYDVPIVSAPVQRRHALVQELDELEEVDQHVEEVPLVTQTQSETGYVSPVMMMSTFGMGYYDPEVGQSLDFGTRYYNSEADPSSSNFGQEYYDLGTNPSS
        MYDVPI  APVQRR ALVQ+ D+LEEVDQHVEE+PL+TQTQSE  YVSPVMMMS FG  YYD  VGQS DFGT YYNSEA PSSSNFGQ+YYDLG++PSS
Subjt:  MYDVPIVSAPVQRRHALVQELDELEEVDQHVEEVPLVTQTQSETGYVSPVMMMSTFGMGYYDPEVGQSLDFGTRYYNSEADPSSSNFGQEYYDLGTNPSS

Query:  SYMHGHGHGRGEHNEYLYYEAPAAVPEK
        SYMHGHG G GEHNEYLYY+ PAAVPE+
Subjt:  SYMHGHGHGRGEHNEYLYYEAPAAVPEK

KAA0051098.1 serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein [Cucumis melo var. makuwa]9.99e-6582.31Show/hide
Query:  MYDVPIVSAPVQRRHALVQELDELEEVDQHVEEVPLVTQTQSETGYVSPVMMMSTFGMGYYDPEVGQSLDFGTRYYNSEADPSSSNFGQEYYDLGTNPSS
        MYDVPIV AP+QRR ALVQELDELEEVDQH+EEVP VTQT+SET YVSP++MMS FG GYYDP V QS DFGT YYN    PSSSNFGQEYYDLGTNPSS
Subjt:  MYDVPIVSAPVQRRHALVQELDELEEVDQHVEEVPLVTQTQSETGYVSPVMMMSTFGMGYYDPEVGQSLDFGTRYYNSEADPSSSNFGQEYYDLGTNPSS

Query:  SYMHGHGHGRGEHNEYLYYEAPAAVPEKPN
        SYMHGHG GRGEHNEYLYY APAAV E+PN
Subjt:  SYMHGHGHGRGEHNEYLYYEAPAAVPEKPN

XP_008449513.1 PREDICTED: mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12-like isoform X1 [Cucumis melo]1.20e-5976.92Show/hide
Query:  MYDVPIVSAPVQRRHALVQELDELEEVDQHVEEVPLVTQTQ--SETGYVSPVMMMSTFGMGYYDPEVGQSLDFGTRYYNSEADPSSSNFGQEYYDLGTNP
        MYDVPIV APVQRR  LVQE D+LEEVDQH EEVP +TQTQ  SE  YVSPVMMM TFGM YYD  VGQS DFG  YYNSEA  SS++FGQ+YYDLG++P
Subjt:  MYDVPIVSAPVQRRHALVQELDELEEVDQHVEEVPLVTQTQ--SETGYVSPVMMMSTFGMGYYDPEVGQSLDFGTRYYNSEADPSSSNFGQEYYDLGTNP

Query:  SSSYMHGHGHGRGEHNEYLYYEAPAAVPEK
        SSSYMHGHG GRGEHNEYLYY+ PAAVPE+
Subjt:  SSSYMHGHGHGRGEHNEYLYYEAPAAVPEK

XP_016900498.1 PREDICTED: GATA zinc finger domain-containing protein 10-like isoform X2 [Cucumis melo]6.56e-6076.92Show/hide
Query:  MYDVPIVSAPVQRRHALVQELDELEEVDQHVEEVPLVTQTQ--SETGYVSPVMMMSTFGMGYYDPEVGQSLDFGTRYYNSEADPSSSNFGQEYYDLGTNP
        MYDVPIV APVQRR  LVQE D+LEEVDQH EEVP +TQTQ  SE  YVSPVMMM TFGM YYD  VGQS DFG  YYNSEA  SS++FGQ+YYDLG++P
Subjt:  MYDVPIVSAPVQRRHALVQELDELEEVDQHVEEVPLVTQTQ--SETGYVSPVMMMSTFGMGYYDPEVGQSLDFGTRYYNSEADPSSSNFGQEYYDLGTNP

Query:  SSSYMHGHGHGRGEHNEYLYYEAPAAVPEK
        SSSYMHGHG GRGEHNEYLYY+ PAAVPE+
Subjt:  SSSYMHGHGHGRGEHNEYLYYEAPAAVPEK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7SU33 Serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein1.4e-4777.69Show/hide
Query:  MYDVPIVSAPVQRRHALVQELDELEEVDQHVEEVPLVTQTQSETGYVSPVMMMSTFGMGYYDPEVGQSLDFGTRYYNSEADPSSSNFGQEYYDLGTNPSS
        MYDVPIV APVQRR  LVQE D+LEEVDQH EEVP +TQTQSE  YVSPVMMM TFG  YYD  VGQS DFG  YYNSEA  SS++FGQ+YYDLG++PSS
Subjt:  MYDVPIVSAPVQRRHALVQELDELEEVDQHVEEVPLVTQTQSETGYVSPVMMMSTFGMGYYDPEVGQSLDFGTRYYNSEADPSSSNFGQEYYDLGTNPSS

Query:  SYMHGHGHGRGEHNEYLYYEAPAAVPEKPN
        SYMHGHG GRGEHNEYLYYE PAAVPE+ N
Subjt:  SYMHGHGHGRGEHNEYLYYEAPAAVPEKPN

A0A5A7TX85 GATA zinc finger domain-containing protein 10-like isoform X22.8e-67100Show/hide
Query:  MYDVPIVSAPVQRRHALVQELDELEEVDQHVEEVPLVTQTQSETGYVSPVMMMSTFGMGYYDPEVGQSLDFGTRYYNSEADPSSSNFGQEYYDLGTNPSS
        MYDVPIVSAPVQRRHALVQELDELEEVDQHVEEVPLVTQTQSETGYVSPVMMMSTFGMGYYDPEVGQSLDFGTRYYNSEADPSSSNFGQEYYDLGTNPSS
Subjt:  MYDVPIVSAPVQRRHALVQELDELEEVDQHVEEVPLVTQTQSETGYVSPVMMMSTFGMGYYDPEVGQSLDFGTRYYNSEADPSSSNFGQEYYDLGTNPSS

Query:  SYMHGHGHGRGEHNEYLYYEAPAAVPEKPN
        SYMHGHGHGRGEHNEYLYYEAPAAVPEKPN
Subjt:  SYMHGHGHGRGEHNEYLYYEAPAAVPEKPN

A0A5A7U558 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12-like isoform X15.9e-4979.69Show/hide
Query:  MYDVPIVSAPVQRRHALVQELDELEEVDQHVEEVPLVTQTQSETGYVSPVMMMSTFGMGYYDPEVGQSLDFGTRYYNSEADPSSSNFGQEYYDLGTNPSS
        MYDVPI  APVQRR ALVQ+ D+LEEVDQHVEE+PL+TQTQSE  YVSPVMMMS FG  YYD  VGQS DFGT YYNSEA PSSSNFGQ+YYDLG++PSS
Subjt:  MYDVPIVSAPVQRRHALVQELDELEEVDQHVEEVPLVTQTQSETGYVSPVMMMSTFGMGYYDPEVGQSLDFGTRYYNSEADPSSSNFGQEYYDLGTNPSS

Query:  SYMHGHGHGRGEHNEYLYYEAPAAVPEK
        SYMHGHG G GEHNEYLYY+ PAAVPE+
Subjt:  SYMHGHGHGRGEHNEYLYYEAPAAVPEK

A0A5A7U731 Serine/threonine-protein phosphatase 7 long form-like protein2.8e-5182.31Show/hide
Query:  MYDVPIVSAPVQRRHALVQELDELEEVDQHVEEVPLVTQTQSETGYVSPVMMMSTFGMGYYDPEVGQSLDFGTRYYNSEADPSSSNFGQEYYDLGTNPSS
        MYDVPIV AP+QRR ALVQELDELEEVDQH+EEVP VTQT+SET YVSP++MMS FG GYYDP V QS DFGT YYN    PSSSNFGQEYYDLGTNPSS
Subjt:  MYDVPIVSAPVQRRHALVQELDELEEVDQHVEEVPLVTQTQSETGYVSPVMMMSTFGMGYYDPEVGQSLDFGTRYYNSEADPSSSNFGQEYYDLGTNPSS

Query:  SYMHGHGHGRGEHNEYLYYEAPAAVPEKPN
        SYMHGHG GRGEHNEYLYY APAAV E+PN
Subjt:  SYMHGHGHGRGEHNEYLYYEAPAAVPEKPN

A0A5A7VIP6 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12-like isoform X12.2e-4878.46Show/hide
Query:  MYDVPIVSAPVQRRHALVQELDELEEVDQHVEEVPLVTQTQSETGYVSPVMMMSTFGMGYYDPEVGQSLDFGTRYYNSEADPSSSNFGQEYYDLGTNPSS
        MYDVPIV APVQRR  LVQE D+LEEVDQH EEVP +TQTQSE  YVSPVMMM TFG  YYD EVGQS DFG  YYNSEA  SS++FGQ+YYDLG++PSS
Subjt:  MYDVPIVSAPVQRRHALVQELDELEEVDQHVEEVPLVTQTQSETGYVSPVMMMSTFGMGYYDPEVGQSLDFGTRYYNSEADPSSSNFGQEYYDLGTNPSS

Query:  SYMHGHGHGRGEHNEYLYYEAPAAVPEKPN
        SYMHGHG GRGEHNEYLYYE PAAVPE+ N
Subjt:  SYMHGHGHGRGEHNEYLYYEAPAAVPEKPN

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTACGATGTACCTATTGTATCTGCTCCAGTTCAAAGGAGACATGCTCTAGTGCAAGAGCTTGATGAATTGGAAGAAGTTGACCAACACGTGGAAGAAGTGCCTCTTGT
CACACAAACACAGAGCGAGACTGGTTACGTTAGTCCAGTGATGATGATGTCGACGTTTGGAATGGGATATTATGATCCAGAAGTCGGTCAATCGTTAGACTTCGGAACAC
GATATTACAATTCAGAGGCAGATCCATCATCATCAAACTTTGGACAAGAATACTATGATTTAGGGACCAATCCATCATCTTCATACATGCATGGTCACGGACACGGTCGT
GGAGAACATAACGAATATTTATACTACGAAGCGCCCGCAGCGGTACCCGAGAAACCAAATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTACGATGTACCTATTGTATCTGCTCCAGTTCAAAGGAGACATGCTCTAGTGCAAGAGCTTGATGAATTGGAAGAAGTTGACCAACACGTGGAAGAAGTGCCTCTTGT
CACACAAACACAGAGCGAGACTGGTTACGTTAGTCCAGTGATGATGATGTCGACGTTTGGAATGGGATATTATGATCCAGAAGTCGGTCAATCGTTAGACTTCGGAACAC
GATATTACAATTCAGAGGCAGATCCATCATCATCAAACTTTGGACAAGAATACTATGATTTAGGGACCAATCCATCATCTTCATACATGCATGGTCACGGACACGGTCGT
GGAGAACATAACGAATATTTATACTACGAAGCGCCCGCAGCGGTACCCGAGAAACCAAATTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MYDVPIVSAPVQRRHALVQELDELEEVDQHVEEVPLVTQTQSETGYVSPVMMMSTFGMGYYDPEVGQSLDFGTRYYNSEADPSSSNFGQEYYDLGTNPSSSYMHGHGHGR
GEHNEYLYYEAPAAVPEKPN