; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0003082 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0003082
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionGag protease polyprotein
Genome locationchr09:13410131..13410334
RNA-Seq ExpressionIVF0003082
SyntenyIVF0003082
Gene Ontology termsGO:0006508 - proteolysis (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
GO:0008233 - peptidase activity (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0033254.1 gag protease polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]2.05e-2680.6Show/hide
Query:  MQPHRRARRGGGKGGRGAGRTQPEEQPAVQVANPTTPVTQVDLAAMEQRYQDMLRAALAPFHAVQQT
        M P R ARRGG +GGRGAGR QPEEQPAVQ ANPT PVTQ DLAAMEQRYQDMLRAALAPF+  Q+T
Subjt:  MQPHRRARRGGGKGGRGAGRTQPEEQPAVQVANPTTPVTQVDLAAMEQRYQDMLRAALAPFHAVQQT

KAA0059509.1 pol protein [Cucumis melo var. makuwa]1.64e-2584.85Show/hide
Query:  MQPHRRARRGGGKGGRGAGRTQPEEQPAVQVANPTTPVTQVDLAAMEQRYQDMLRAALAPFHAVQQ
        M P R ARRG G+GGRGAGR QP+EQPAVQ ANPT PVTQVDLAAMEQRYQDML+AALAPFHAVQQ
Subjt:  MQPHRRARRGGGKGGRGAGRTQPEEQPAVQVANPTTPVTQVDLAAMEQRYQDMLRAALAPFHAVQQ

KAA0062300.1 gag protease polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]2.81e-38100Show/hide
Query:  MQPHRRARRGGGKGGRGAGRTQPEEQPAVQVANPTTPVTQVDLAAMEQRYQDMLRAALAPFHAVQQT
        MQPHRRARRGGGKGGRGAGRTQPEEQPAVQVANPTTPVTQVDLAAMEQRYQDMLRAALAPFHAVQQT
Subjt:  MQPHRRARRGGGKGGRGAGRTQPEEQPAVQVANPTTPVTQVDLAAMEQRYQDMLRAALAPFHAVQQT

TYK22663.1 gag protease polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]3.14e-2780.6Show/hide
Query:  MQPHRRARRGGGKGGRGAGRTQPEEQPAVQVANPTTPVTQVDLAAMEQRYQDMLRAALAPFHAVQQT
        M P R ARRGGG+GGRGAGR QPEEQP VQ ANP  PVTQ DLAAMEQRYQDML+AALAPF A QQT
Subjt:  MQPHRRARRGGGKGGRGAGRTQPEEQPAVQVANPTTPVTQVDLAAMEQRYQDMLRAALAPFHAVQQT

TYK26963.1 uncharacterized protein E5676_scaffold322G00250 [Cucumis melo var. makuwa]5.51e-2678.79Show/hide
Query:  MQPHRRARRGGGKGGRGAGRTQPEEQPAVQVANPTTPVTQVDLAAMEQRYQDMLRAALAPFHAVQQ
        M PHR ARRGGG+G RGAGR QPEEQPAV  A+P  PVTQ DLAAMEQRYQDML+AALA FHA QQ
Subjt:  MQPHRRARRGGGKGGRGAGRTQPEEQPAVQVANPTTPVTQVDLAAMEQRYQDMLRAALAPFHAVQQ

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7V152 Pol protein1.7e-2084.85Show/hide
Query:  MQPHRRARRGGGKGGRGAGRTQPEEQPAVQVANPTTPVTQVDLAAMEQRYQDMLRAALAPFHAVQQ
        M P R ARRG G+GGRGAGR QP+EQPAVQ ANPT PVTQVDLAAMEQRYQDML+AALAPFHAVQQ
Subjt:  MQPHRRARRGGGKGGRGAGRTQPEEQPAVQVANPTTPVTQVDLAAMEQRYQDMLRAALAPFHAVQQ

A0A5D3CR86 Pol protein1.7e-2084.85Show/hide
Query:  MQPHRRARRGGGKGGRGAGRTQPEEQPAVQVANPTTPVTQVDLAAMEQRYQDMLRAALAPFHAVQQ
        M P R ARRG G+GGRGAGR QP+EQPAVQ ANPT PVTQVDLAAMEQRYQDML+AALAPFHAVQQ
Subjt:  MQPHRRARRGGGKGGRGAGRTQPEEQPAVQVANPTTPVTQVDLAAMEQRYQDMLRAALAPFHAVQQ

A0A5D3D824 Gag protease polyprotein1.5e-1980.6Show/hide
Query:  MQPHRRARRGGGKGGRGAGRTQPEEQPAVQVANPTTPVTQVDLAAMEQRYQDMLRAALAPFHAVQQT
        M P R ARRGG +GGRGAGR QPEEQPAVQ ANPT PVTQ DLAAMEQRYQDMLRAALAPF+  Q+T
Subjt:  MQPHRRARRGGGKGGRGAGRTQPEEQPAVQVANPTTPVTQVDLAAMEQRYQDMLRAALAPFHAVQQT

A0A5D3DRL2 Gag protease polyprotein1.9e-1982.09Show/hide
Query:  MQPHRRARRGGGKGGRGAGRTQPEEQPAVQVANPTTPVTQVDLAAMEQRYQDMLRAALAPFHAVQQT
        M P R ARR GG+GGRGAGRTQPEEQPAVQ ANP  PVTQ DLAAMEQRYQDML+AALAPF A QQT
Subjt:  MQPHRRARRGGGKGGRGAGRTQPEEQPAVQVANPTTPVTQVDLAAMEQRYQDMLRAALAPFHAVQQT

A0A5D3DSC8 Gag protease polyprotein2.5e-27100Show/hide
Query:  MQPHRRARRGGGKGGRGAGRTQPEEQPAVQVANPTTPVTQVDLAAMEQRYQDMLRAALAPFHAVQQT
        MQPHRRARRGGGKGGRGAGRTQPEEQPAVQVANPTTPVTQVDLAAMEQRYQDMLRAALAPFHAVQQT
Subjt:  MQPHRRARRGGGKGGRGAGRTQPEEQPAVQVANPTTPVTQVDLAAMEQRYQDMLRAALAPFHAVQQT

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAGCCACATAGACGTGCACGTCGAGGGGGTGGTAAGGGAGGCAGAGGAGCTGGACGTACCCAACCTGAGGAGCAACCTGCTGTGCAGGTAGCCAACCCTACCACACC
TGTCACTCAAGTGGATCTCGCCGCGATGGAGCAGCGATACCAGGACATGCTACGTGCTGCTTTGGCACCTTTTCATGCTGTCCAACAGACCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAGCCACATAGACGTGCACGTCGAGGGGGTGGTAAGGGAGGCAGAGGAGCTGGACGTACCCAACCTGAGGAGCAACCTGCTGTGCAGGTAGCCAACCCTACCACACC
TGTCACTCAAGTGGATCTCGCCGCGATGGAGCAGCGATACCAGGACATGCTACGTGCTGCTTTGGCACCTTTTCATGCTGTCCAACAGACCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQPHRRARRGGGKGGRGAGRTQPEEQPAVQVANPTTPVTQVDLAAMEQRYQDMLRAALAPFHAVQQT