; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0003092 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0003092
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionTransmembrane protein, putative
Genome locationchr03:13873935..13876642
RNA-Seq ExpressionIVF0003092
SyntenyIVF0003092
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0049627.1 putative transmembrane protein [Cucumis melo var. makuwa]1.78e-24799.71Show/hide
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XP_022953398.1 uncharacterized protein LOC111455963 [Cucurbita moschata]2.52e-19680.94Show/hide
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XP_038885654.1 uncharacterized protein LOC120075963 isoform X1 [Benincasa hispida]3.48e-21387.1Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KC53 Uncharacterized protein4.0e-18294.43Show/hide
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A0A1S3BD72 uncharacterized protein LOC1034886031.5e-15797.92Show/hide
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A0A5D3CZV8 Putative transmembrane protein5.6e-19299.71Show/hide
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A0A6J1GN87 uncharacterized protein LOC1114559636.7e-15380.94Show/hide
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A0A6J1I448 uncharacterized protein LOC1114704511.5e-15280.94Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G25805.1 unknown protein5.9e-10967.77Show/hide
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        AR+ P   ++A    E +S +RR+++ LLW +EAVYILWLFLLPYAPGDPVWAISSETVNSL+GLSLNFFFVLP  N+ GI  + APVLHPM+EGLFNFV
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        IAWTLMFAPLL+TDRKR++Y  SLD+LW L MFLTNTFLIPYMA+RLN+A     P  +S+LG +MT GAP+VG+ G  +C+IS +WS  GRADG+FGG+
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Query:  AERWEFLIQYLSSERLAYAFIWDICLYSVFQPWLIGGNLQNVKESKVGVVSSLRFVPVVGLIAYLLFLKLDEE
         +RW++LI YL SERLAYAFIWDICLY++FQPWLIG NLQNVK++K+ +V  LRFVPV GL+AY LFL L++E
Subjt:  AERWEFLIQYLSSERLAYAFIWDICLYSVFQPWLIGGNLQNVKESKVGVVSSLRFVPVVGLIAYLLFLKLDEE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCAAGGCCATGATAGCATCTCAACCTTTACTCTGCAACCTCTCCTTTCCAGTGATTAAACCCTTCGCTCTAACTTCTCCCCTCTCTCCTTTTCGTTTCTTCAGACC
ACAACAACCACTGCTCTCTCCTTTAATCTCCACCCCCACTCCCTTCTCACTCTCACCCAATCGCCGGAATTGTTCTCTTACCCGCCCTGCCGCTCGCAAGAACCCCACAT
TCGTCGATTCTGCAGATTTTTCCAACGAGGGCAATTCCGATGTCCGACGGTTGCTTCAAATTCTGCTCTGGGGTGCTGAGGCTGTTTACATTTTGTGGCTATTTCTCCTT
CCTTATGCTCCGGGAGATCCCGTGTGGGCAATCAGTTCAGAGACTGTGAATTCTCTTGTGGGTCTTTCTCTGAATTTCTTCTTTGTATTGCCTGCTATGAACTCTGTGGG
CATTCGTGTGATTGATGCTCCTGTTCTTCACCCAATGTCTGAGGGATTGTTCAATTTTGTCATTGCATGGACGCTCATGTTTGCTCCCCTGCTATTCACGGATCGAAAGA
GGGACCAATACAGTGGTTCGTTGGACTTATTGTGGGGCTTGCAGATGTTCCTTACAAACACCTTTTTGATACCTTATATGGCCATCCGGCTTAATGAGGCTAGTGAATAC
TCTGCCCCGCAACCGCAGTCGAAGCTGGGCACTTTGATGACCAATGGAGCTCCTGTCGTTGGCGTGATCGGTGGTGCAATATGCATCATATCGATAATATGGTCGTTTGT
TGGTCGAGCAGATGGTAACTTTGGAGGTGTAGCAGAGAGATGGGAGTTCTTGATCCAATATCTATCTTCAGAGAGGTTAGCTTATGCTTTTATTTGGGATATTTGCCTTT
ACAGTGTATTCCAGCCTTGGTTGATTGGAGGAAACCTTCAAAATGTTAAGGAGAGCAAGGTTGGAGTGGTAAGTTCCCTTAGATTTGTCCCTGTGGTTGGCTTAATTGCC
TATCTTCTTTTTCTCAAACTTGATGAGGAATTATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTGGATTCCAAATCCAAATTAGCAGCCATAACTTTGCCACGCACAGTTTTTCGGAGAGAAAAATGGCCAAGGCCATGATAGCATCTCAACCTTTACTCTGCAACCTCTCC
TTTCCAGTGATTAAACCCTTCGCTCTAACTTCTCCCCTCTCTCCTTTTCGTTTCTTCAGACCACAACAACCACTGCTCTCTCCTTTAATCTCCACCCCCACTCCCTTCTC
ACTCTCACCCAATCGCCGGAATTGTTCTCTTACCCGCCCTGCCGCTCGCAAGAACCCCACATTCGTCGATTCTGCAGATTTTTCCAACGAGGGCAATTCCGATGTCCGAC
GGTTGCTTCAAATTCTGCTCTGGGGTGCTGAGGCTGTTTACATTTTGTGGCTATTTCTCCTTCCTTATGCTCCGGGAGATCCCGTGTGGGCAATCAGTTCAGAGACTGTG
AATTCTCTTGTGGGTCTTTCTCTGAATTTCTTCTTTGTATTGCCTGCTATGAACTCTGTGGGCATTCGTGTGATTGATGCTCCTGTTCTTCACCCAATGTCTGAGGGATT
GTTCAATTTTGTCATTGCATGGACGCTCATGTTTGCTCCCCTGCTATTCACGGATCGAAAGAGGGACCAATACAGTGGTTCGTTGGACTTATTGTGGGGCTTGCAGATGT
TCCTTACAAACACCTTTTTGATACCTTATATGGCCATCCGGCTTAATGAGGCTAGTGAATACTCTGCCCCGCAACCGCAGTCGAAGCTGGGCACTTTGATGACCAATGGA
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TAACTTTATAGAACACAATTTACATTAAGTAAAGTTTGAAATATCAAGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAKAMIASQPLLCNLSFPVIKPFALTSPLSPFRFFRPQQPLLSPLISTPTPFSLSPNRRNCSLTRPAARKNPTFVDSADFSNEGNSDVRRLLQILLWGAEAVYILWLFLL
PYAPGDPVWAISSETVNSLVGLSLNFFFVLPAMNSVGIRVIDAPVLHPMSEGLFNFVIAWTLMFAPLLFTDRKRDQYSGSLDLLWGLQMFLTNTFLIPYMAIRLNEASEY
SAPQPQSKLGTLMTNGAPVVGVIGGAICIISIIWSFVGRADGNFGGVAERWEFLIQYLSSERLAYAFIWDICLYSVFQPWLIGGNLQNVKESKVGVVSSLRFVPVVGLIA
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