CuGenDBv2

Gene ID	IVF0003647
Organism	Cucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Description	Unknown protein
Genome location	chr07:16955109..16965999
RNA-Seq Expression	IVF0003647
Synteny	IVF0003647
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	IPR039495 - TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A-like

Homology

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e value

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A0A0A0KXN5 Uncharacterized protein

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A0A6J1CPA4 uncharacterized protein LOC111012919

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A0A6J1FSH8 uncharacterized protein LOC111446895

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A0A6J1IWZ8 uncharacterized protein LOC111479331

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Subjt:  NNFKYAVDVYNLLDKQNDRDLFLFLKRHMKNAFGLRSKL

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G53200.1 unknown protein

7.2e-59

33.41

Show/hide

Query:  MQMPESANDPMSNMIIGLTFRQLWFSTIPEEIQWRDSLQLRSPIH----SDGMILNSDG-----CSISNSHGVGALSWSNTESSVM-NDKVVHVDIEGHT
        MQ  + A  P +N+ IG++F ++W +   +E+Q  D+    S  +      G ++   G     CS+++       +  ++E+SVM N KV H+ I   +
Subjt:  MQMPESANDPMSNMIIGLTFRQLWFSTIPEEIQWRDSLQLRSPIH----SDGMILNSDG-----CSISNSHGVGALSWSNTESSVM-NDKVVHVDIEGHT

Query:  EASLDVDHKIHNIKVENHPLNFEAQDFCVSSAEKDENEASFSDNGGYQHYVSIFSALEGLDPLLLPLQLPPSIENWENAISLCGEFLNDYYKDAVKHLGL
        E  +D   K+ +      P     Q + +S    +ENEAS  D G  +   ++ + L  +DP LLP + P   + +   ++      + YYK+AVK++  
Subjt:  EASLDVDHKIHNIKVENHPLNFEAQDFCVSSAEKDENEASFSDNGGYQHYVSIFSALEGLDPLLLPLQLPPSIENWENAISLCGEFLNDYYKDAVKHLGL

Query:  ALNSNPPI-LVALLPLIQLLLIGGRIDKALDEMEKFCLDSNAALPFRLRAALVEHFDRSNNVLLSTCYEQTLKKDPTCYHSMGKLVQMHRNGNYNLESLL
         L S P + L AL PL+Q+LLIGG +D+A+  +E+ C   +   PFR++A ++E F R N+ +L+ CYE  LK DP C  ++ KL+ M     Y+ ESL 
Subjt:  ALNSNPPI-LVALLPLIQLLLIGGRIDKALDEMEKFCLDSNAALPFRLRAALVEHFDRSNNVLLSTCYEQTLKKDPTCYHSMGKLVQMHRNGNYNLESLL

Query:  EMIALHLDGTYPEYDTWRELAVCFLKLHQS-EEDRVSTACSIGTGGHK--LVSSLKINSNIKLLTEKNSRNTWRLRCRWWLTRHFGHEITPES----SVV
        EMIALH++ ++PE + W+ELA CF    ++ +EDR+S  C  G+   +     S++ N   K  T    + +W LR +WWL RHF  ++        ++ 
Subjt:  EMIALHLDGTYPEYDTWRELAVCFLKLHQS-EEDRVSTACSIGTGGHK--LVSSLKINSNIKLLTEKNSRNTWRLRCRWWLTRHFGHEITPES----SVV

Query:  GNLELLTYKAACGCHLYGNNFKYAVDVYNLLDKQNDRDLFLFLKRHMKN
        G+ E++TYKAAC  ++YG  F Y   VY LL   N R+ F FL+ H  N
Subjt:  GNLELLTYKAACGCHLYGNNFKYAVDVYNLLDKQNDRDLFLFLKRHMKN

AT1G53200.2 unknown protein

7.2e-59

33.41

Show/hide

Query:  MQMPESANDPMSNMIIGLTFRQLWFSTIPEEIQWRDSLQLRSPIH----SDGMILNSDG-----CSISNSHGVGALSWSNTESSVM-NDKVVHVDIEGHT
        MQ  + A  P +N+ IG++F ++W +   +E+Q  D+    S  +      G ++   G     CS+++       +  ++E+SVM N KV H+ I   +
Subjt:  MQMPESANDPMSNMIIGLTFRQLWFSTIPEEIQWRDSLQLRSPIH----SDGMILNSDG-----CSISNSHGVGALSWSNTESSVM-NDKVVHVDIEGHT

Query:  EASLDVDHKIHNIKVENHPLNFEAQDFCVSSAEKDENEASFSDNGGYQHYVSIFSALEGLDPLLLPLQLPPSIENWENAISLCGEFLNDYYKDAVKHLGL
        E  +D   K+ +      P     Q + +S    +ENEAS  D G  +   ++ + L  +DP LLP + P   + +   ++      + YYK+AVK++  
Subjt:  EASLDVDHKIHNIKVENHPLNFEAQDFCVSSAEKDENEASFSDNGGYQHYVSIFSALEGLDPLLLPLQLPPSIENWENAISLCGEFLNDYYKDAVKHLGL

Query:  ALNSNPPI-LVALLPLIQLLLIGGRIDKALDEMEKFCLDSNAALPFRLRAALVEHFDRSNNVLLSTCYEQTLKKDPTCYHSMGKLVQMHRNGNYNLESLL
         L S P + L AL PL+Q+LLIGG +D+A+  +E+ C   +   PFR++A ++E F R N+ +L+ CYE  LK DP C  ++ KL+ M     Y+ ESL 
Subjt:  ALNSNPPI-LVALLPLIQLLLIGGRIDKALDEMEKFCLDSNAALPFRLRAALVEHFDRSNNVLLSTCYEQTLKKDPTCYHSMGKLVQMHRNGNYNLESLL

Query:  EMIALHLDGTYPEYDTWRELAVCFLKLHQS-EEDRVSTACSIGTGGHK--LVSSLKINSNIKLLTEKNSRNTWRLRCRWWLTRHFGHEITPES----SVV
        EMIALH++ ++PE + W+ELA CF    ++ +EDR+S  C  G+   +     S++ N   K  T    + +W LR +WWL RHF  ++        ++ 
Subjt:  EMIALHLDGTYPEYDTWRELAVCFLKLHQS-EEDRVSTACSIGTGGHK--LVSSLKINSNIKLLTEKNSRNTWRLRCRWWLTRHFGHEITPES----SVV

Query:  GNLELLTYKAACGCHLYGNNFKYAVDVYNLLDKQNDRDLFLFLKRHMKN
        G+ E++TYKAAC  ++YG  F Y   VY LL   N R+ F FL+ H  N
Subjt:  GNLELLTYKAACGCHLYGNNFKYAVDVYNLLDKQNDRDLFLFLKRHMKN

Sequences

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CDS sequence

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ATGCAAATGCCTGAATCTGCGAATGATCCAATGTCAAATATGATTATAGGATTGACATTTAGGCAGCTGTGGTTCTCTACCATTCCAGAAGAGATTCAGTGGAGGGACTC
TCTCCAGTTGCGCTCTCCAATTCATTCAGACGGGATGATTTTGAACTCAGATGGATGTTCCATAAGCAACTCTCATGGTGTTGGTGCTTTGTCTTGGAGTAACACAGAGA
GTTCTGTCATGAATGATAAAGTAGTTCACGTAGATATTGAAGGACACACTGAAGCTTCTTTAGATGTTGATCATAAGATTCATAACATAAAAGTGGAAAATCATCCTCTG
AACTTTGAGGCACAAGATTTTTGTGTTAGTTCTGCCGAAAAAGATGAAAATGAAGCTTCTTTCTCAGACAATGGAGGTTATCAGCACTACGTTTCAATTTTCTCTGCTCT
TGAGGGATTGGATCCACTATTGTTACCTCTACAATTACCACCTTCCATTGAGAATTGGGAGAATGCCATTAGTCTATGTGGTGAGTTTCTGAATGACTATTATAAGGATG
CAGTGAAGCATCTAGGCCTTGCTCTTAACTCAAATCCTCCAATATTGGTTGCCTTACTTCCTCTTATACAGTTGTTGTTGATTGGAGGTCGAATTGATAAAGCACTTGAT
GAAATGGAAAAATTCTGTCTTGATTCAAATGCAGCACTTCCCTTCAGATTGAGGGCTGCACTTGTGGAACATTTTGATCGTAGTAACAATGTCTTGCTTTCAACTTGTTA
TGAGCAAACATTGAAGAAGGATCCAACTTGTTATCATTCAATGGGAAAACTTGTTCAAATGCATAGAAATGGCAATTACAATCTTGAATCTCTATTGGAAATGATAGCTT
TGCACTTGGATGGTACATATCCTGAATATGATACATGGAGAGAGCTAGCTGTGTGTTTTCTGAAACTTCATCAATCTGAGGAGGATAGAGTATCAACAGCGTGTTCAATT
GGGACTGGCGGGCATAAGCTGGTATCCTCATTGAAGATTAACAGTAACATTAAGTTGTTAACTGAAAAGAACTCGAGAAACACTTGGAGATTGCGTTGTCGATGGTGGTT
GACACGCCACTTCGGCCATGAAATAACACCAGAGTCTTCAGTTGTAGGTAATTTGGAGCTGCTGACTTACAAAGCGGCATGCGGATGTCATTTGTATGGAAACAATTTCA
AGTATGCGGTAGATGTGTACAACCTTTTAGATAAGCAAAACGATAGGGACTTGTTTTTGTTCTTAAAGAGGCACATGAAAAATGCGTTTGGACTCCGTTCTAAATTATAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

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MQMPESANDPMSNMIIGLTFRQLWFSTIPEEIQWRDSLQLRSPIHSDGMILNSDGCSISNSHGVGALSWSNTESSVMNDKVVHVDIEGHTEASLDVDHKIHNIKVENHPL
NFEAQDFCVSSAEKDENEASFSDNGGYQHYVSIFSALEGLDPLLLPLQLPPSIENWENAISLCGEFLNDYYKDAVKHLGLALNSNPPILVALLPLIQLLLIGGRIDKALD
EMEKFCLDSNAALPFRLRAALVEHFDRSNNVLLSTCYEQTLKKDPTCYHSMGKLVQMHRNGNYNLESLLEMIALHLDGTYPEYDTWRELAVCFLKLHQSEEDRVSTACSI
GTGGHKLVSSLKINSNIKLLTEKNSRNTWRLRCRWWLTRHFGHEITPESSVVGNLELLTYKAACGCHLYGNNFKYAVDVYNLLDKQNDRDLFLFLKRHMKNAFGLRSKL

IVF0003647 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome