; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0003710 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0003710
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionEF hand calcium-binding family protein
Genome locationchr11:3341817..3343077
RNA-Seq ExpressionIVF0003710
SyntenyIVF0003710
Gene Ontology termsGO:0005509 - calcium ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002048 - EF-hand domain
IPR011992 - EF-hand domain pair
IPR018247 - EF-Hand 1, calcium-binding site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6605248.1 Calmodulin-like protein 30, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.45e-8876.6Show/hide
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XP_004148036.1 probable calcium-binding protein CML32 [Cucumis sativus]6.63e-12095.77Show/hide
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XP_008457835.1 PREDICTED: probable calcium-binding protein CML32 [Cucumis melo]9.14e-127100Show/hide
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XP_023532624.1 calmodulin-like protein 1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.70e-8876.6Show/hide
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XP_038901754.1 probable calcium-binding protein CML32 [Benincasa hispida]9.94e-10082.35Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LMP3 Uncharacterized protein7.4e-9395.77Show/hide
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A0A1S3C6F1 probable calcium-binding protein CML324.5e-98100Show/hide
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A0A5D3BJJ3 Putative calcium-binding protein CML324.5e-98100Show/hide
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A0A6J1G5E9 calmodulin-like protein 12.2e-6876.6Show/hide
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A0A6J1L0C4 calmodulin-like protein 11.8e-6775Show/hide
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        V+LKEFVELYTMS GEVK+GD++SAFKVYDSNGDG+ISAEEVM IMKILGE+TTL AC+QMVKGVD DGDGFIDI EFS LM TYS K
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P25070 Calcium-binding protein CML242.4e-2442.36Show/hide
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        A+E+  +MK LGE  ++  CK+M+  VD+DGDG ++  EF K+M
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Q9C8Y1 Probable calcium-binding protein CML231.2e-2340.13Show/hide
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        S   S++   ++E+IK  F++FD N DGKIS +E K+    L  S   +  E +   K  D DG+GF+DL EFV L+ +   SS    + D++ AF +YD
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Q9FYK2 Probable calcium-binding protein CML251.5e-2140.27Show/hide
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        +  + E++  F+KFD N DGKIS +E       L    E+ + E EK+   +D  GDG+++ +EFVEL T  M   +V + +++ AF VYD +G+G ISA
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        EE+  +++ LG+  ++  C++M+ GVD DGDG ID +EF K+M T  S+
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Q9LF55 Probable calcium-binding protein CML321.7e-2243.36Show/hide
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        FE+ D NKDGKIS++E+ EA R  A S  IT  E +  F+ +D DGD  +D+ E+     M  GE    D    ++ AF +YD +GDGKISA E+  ++K
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         LGE  T+  C  MV+ VD DGDGF+  +EF  +M   + K Q
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Q9ZQE6 Calmodulin-like protein 309.5e-2942.13Show/hide
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        KL ++   ++PS+   FS   +    SS       +P++ E++  F +FD +KDGKIS  EYK   R L   + I D    K FK VD DGDGF+D +EF
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        ++ Y  S G ++  DI ++F  +D NGDGKISAEEVM ++  LGE  +L  C +MV+ VD DGDG ++++EF K+M +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G24620.1 EF hand calcium-binding protein family1.0e-2240.27Show/hide
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        +  + E++  F+KFD N DGKIS +E       L    E+ + E EK+   +D  GDG+++ +EFVEL T  M   +V + +++ AF VYD +G+G ISA
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        EE+  +++ LG+  ++  C++M+ GVD DGDG ID +EF K+M T  S+
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AT1G66400.1 calmodulin like 238.6e-2540.13Show/hide
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        S   S++   ++E+IK  F++FD N DGKIS +E K+    L  S   +  E +   K  D DG+GF+DL EFV L+ +   SS    + D++ AF +YD
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Query:  SNGDGKISAEEVMGIMKILGENTTLNACKQMVKGVDMDGDGFIDIQEFSKLM
         + +G+ISA E+  +MK LGE  ++  C++M+  VD DGDG +D +EF K+M
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AT2G15680.1 Calcium-binding EF-hand family protein6.8e-3042.13Show/hide
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        KL ++   ++PS+   FS   +    SS       +P++ E++  F +FD +KDGKIS  EYK   R L   + I D    K FK VD DGDGF+D +EF
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        ++ Y  S G ++  DI ++F  +D NGDGKISAEEVM ++  LGE  +L  C +MV+ VD DGDG ++++EF K+M +
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AT5G17470.1 EF hand calcium-binding protein family1.2e-2343.36Show/hide
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        FE+ D NKDGKIS++E+ EA R  A S  IT  E +  F+ +D DGD  +D+ E+     M  GE    D    ++ AF +YD +GDGKISA E+  ++K
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         LGE  T+  C  MV+ VD DGDGF+  +EF  +M   + K Q
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AT5G37770.1 EF hand calcium-binding protein family1.7e-2542.36Show/hide
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        ++++IK  F++FD N DGKIS +E KE  R L  S   +  E     K  D DG+GF+DL EFV L+ +  G        V D++ AF++YD +G+G+IS
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Query:  AEEVMGIMKILGENTTLNACKQMVKGVDMDGDGFIDIQEFSKLM
        A+E+  +MK LGE  ++  CK+M+  VD+DGDG ++  EF K+M
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACAAGCTTATTGAAGTTATTCAGAAGCTGTTCTGGAAAGCGACCATCCAAAAACACTTCCTTTTCCATACAAATCAAAGAAAGGTCCAATTCTTCCTCAACCTCTTC
AAAGCACTTCCGCCCAAACTTGGAGGAGATCAAATGGGCGTTTGAGAAGTTTGACTCGAACAAGGATGGAAAGATCTCATTTGAGGAGTACAAGGAAGCTCACCGAGGCT
TGGCTGGAAGCAAAGAAATCACAGACGCAGAGGCAGAGAAGTCATTCAAGCTTGTGGATGCAGATGGCGATGGATTCGTGGATTTGAAGGAGTTCGTGGAGCTGTACACG
ATGAGCAGCGGGGAAGTGAAGGTGGGTGACATCGAAAGTGCCTTCAAAGTGTACGATTCCAATGGAGATGGGAAGATAAGCGCAGAGGAGGTGATGGGAATCATGAAGAT
ATTGGGAGAGAACACCACCTTAAATGCTTGCAAGCAAATGGTGAAGGGTGTGGACATGGATGGGGATGGCTTCATTGATATTCAAGAGTTTTCTAAGCTCATGGATACGT
ACTCGAGTAAGTTTCAAAAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATAGAGGGTTGATGGTTATTCATTTTTTTGTGATAATTGGCATAGGAAGAGATGACAAGCTTATTGAAGTTATTCAGAAGCTGTTCTGGAAAGCGACCATCCAAAAACAC
TTCCTTTTCCATACAAATCAAAGAAAGGTCCAATTCTTCCTCAACCTCTTCAAAGCACTTCCGCCCAAACTTGGAGGAGATCAAATGGGCGTTTGAGAAGTTTGACTCGA
ACAAGGATGGAAAGATCTCATTTGAGGAGTACAAGGAAGCTCACCGAGGCTTGGCTGGAAGCAAAGAAATCACAGACGCAGAGGCAGAGAAGTCATTCAAGCTTGTGGAT
GCAGATGGCGATGGATTCGTGGATTTGAAGGAGTTCGTGGAGCTGTACACGATGAGCAGCGGGGAAGTGAAGGTGGGTGACATCGAAAGTGCCTTCAAAGTGTACGATTC
CAATGGAGATGGGAAGATAAGCGCAGAGGAGGTGATGGGAATCATGAAGATATTGGGAGAGAACACCACCTTAAATGCTTGCAAGCAAATGGTGAAGGGTGTGGACATGG
ATGGGGATGGCTTCATTGATATTCAAGAGTTTTCTAAGCTCATGGATACGTACTCGAGTAAGTTTCAAAAGTAAAGAAGCTAAAACTATAGTGTTCCGTTTGGTAACCAT
TTCATTTATTGTTTTAGAAGGATCATTTACATTTTTCTCAAAGTGCTATAGTTAATTTCTTACTTAATTTTCAAAAAGAAAAAAAATAAATAATAAAATGGTTAACAAAC
GAGACCTACACGTACCTCTAGTTACATGAATTTACATGAATCGAGGTGGAAAACAAAAATTCTAAGCTATGTTTGAAGTTTGTATCCAATAATTAGGAGGATGGTTATAT
TATATTGTGGCAATGTTGTTGATTAATGTGCCACTACTAGTCATTATGCAAAGTGTAGATTTGTGATGTAATTTTTGTTAAGTTGTCAACATCTTCAAACGGTGAAGGGT
TCGATGTTGATAGTGTGAATTGAAAATTTCTATTATGTAAGAAAATTGATGGCAAGATTACTTTTATTGATATTTATGTCAAAATTTACATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTSLLKLFRSCSGKRPSKNTSFSIQIKERSNSSSTSSKHFRPNLEEIKWAFEKFDSNKDGKISFEEYKEAHRGLAGSKEITDAEAEKSFKLVDADGDGFVDLKEFVELYT
MSSGEVKVGDIESAFKVYDSNGDGKISAEEVMGIMKILGENTTLNACKQMVKGVDMDGDGFIDIQEFSKLMDTYSSKFQK