; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0003821 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0003821
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionRetrotransposon protein
Genome locationchr05:7854269..7854472
RNA-Seq ExpressionIVF0003821
SyntenyIVF0003821
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0037721.1 putative nuclease HARBI1 [Cucumis melo var. makuwa]9.23e-3487.88Show/hide
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KAA0063753.1 putative nuclease HARBI1 [Cucumis melo var. makuwa]4.68e-3691.04Show/hide
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TYK08389.1 putative nuclease HARBI1 [Cucumis melo var. makuwa]4.44e-3488.06Show/hide
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TYK10940.1 putative nuclease HARBI1 [Cucumis melo var. makuwa]1.12e-3487.88Show/hide
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XP_008441953.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103485952 [Cucumis melo]4.44e-3488.06Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TJS2 Retrotransposon protein8.0e-2689.55Show/hide
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A0A5A7V6M3 Putative nuclease HARBI15.6e-2791.04Show/hide
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A0A5D3CHV9 Putative nuclease HARBI11.8e-2587.88Show/hide
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A0A5D3D8J6 Retrotransposon protein8.0e-2689.55Show/hide
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A0A5D3DG22 Retrotransposon protein7.3e-2791.04Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GATTAATTACATTGAGGCTTCAAACGGATGGAGTGAATGGAGGGATCAATTGGCTCGTACGATGTTCAGTAATTGGGAGTTACATGACCAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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