; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0003857 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0003857
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionRas-related protein Rab-6A
Genome locationchr04:480443..485953
RNA-Seq ExpressionIVF0003857
SyntenyIVF0003857
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0006890 - retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum (biological process)
GO:0006891 - intra-Golgi vesicle-mediated transport (biological process)
GO:0042147 - retrograde transport, endosome to Golgi (biological process)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004148503.1 ras-related protein RABH1b [Cucumis sativus]6.84e-140100Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSSGCAC
        PQSSGCAC
Subjt:  PQSSGCAC

XP_022159735.1 ras-related protein RABH1b [Momordica charantia]6.56e-13898.56Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAP SALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKS+GSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSSGCAC
        PQS GCAC
Subjt:  PQSSGCAC

XP_022958673.1 ras-related protein RABH1b [Cucurbita moschata]4.62e-13898.08Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKS+GSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSSGCAC
        PQS GCAC
Subjt:  PQSSGCAC

XP_022996115.1 ras-related protein RABH1b [Cucurbita maxima]1.13e-13898.56Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSSGCAC
        PQS GCAC
Subjt:  PQSSGCAC

XP_038889006.1 ras-related protein RABH1b [Benincasa hispida]2.78e-13999.52Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSSGCAC
        PQS GCAC
Subjt:  PQSSGCAC

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LI95 Uncharacterized protein2.0e-107100Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSSGCAC
        PQSSGCAC
Subjt:  PQSSGCAC

A0A1S3CQC2 ras-related protein RABH1b2.0e-107100Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSSGCAC
        PQSSGCAC
Subjt:  PQSSGCAC

A0A5A7TB19 Ras-related protein RABH1b-like isoform X12.0e-107100Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSSGCAC
        PQSSGCAC
Subjt:  PQSSGCAC

A0A6J1H3Q8 ras-related protein RABH1b4.9e-10698.08Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKS+GSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSSGCAC
        PQS GCAC
Subjt:  PQSSGCAC

A0A6J1K5U1 ras-related protein RABH1b1.7e-10698.56Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSSGCAC
        PQS GCAC
Subjt:  PQSSGCAC

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80501 Ras-related protein RABH1b1.2e-10191.83Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAP SALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQ+FLNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        +KWI+EVRTERGSDVI+VLVGNKTDLV+KRQVSIEE EAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKS+ + A+ +Q
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSSGCAC
         QS GC+C
Subjt:  PQSSGCAC

P20340 Ras-related protein Rab-6A9.0e-8174.88Show/hide
Query:  LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNTSKWIEE
        L K+KLVFLG+QSVGKTS+ITRFMYD FDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDS+VAV+VYD+ +  +F  T+KWI++
Subjt:  LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNTSKWIEE

Query:  VRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQPQS-SG
        VRTERGSDVII+LVGNKTDL +KRQVSIEEGE KA+ELNVMFIETSAKAG+N+K LFR++AAALPGME+     +EDM+D+ L+       Q QP S  G
Subjt:  VRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQPQS-SG

Query:  CAC
        C+C
Subjt:  CAC

Q9LFT9 Ras-related protein RABH1e1.3e-9588.46Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MA  S LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVA+RQ+FLNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        SKWIE+VRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVSIEEG+ KAR+  V+FIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLK T S +AQ +
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSSGCAC
         Q  GCAC
Subjt:  PQSSGCAC

Q9SID8 Ras-related protein RABH1d9.6e-9184.13Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MA  S LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDVA+R +FLNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        SKWIEEVR ER  DVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEG++K RE  VMFIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGME+ S+TK EDMVDVNLK T S ++Q  
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSSGCAC
         Q   C+C
Subjt:  PQSSGCAC

Q9SMR4 Ras-related protein RABH1c8.7e-8478.14Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MA  S LAK+KLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQ TIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVA++VYDV++RQTFLNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLS-STKQEDMVDVNLKSTGSGAAQ
        SKWIE+V  ERG S+VIIVLVGNKTDLVEKRQVSI EGE K +E  VMFIETSAK  FNIKALFRKIAAALPG+++ S +TK +DMVDVNLK+T S ++Q
Subjt:  SKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLS-STKQEDMVDVNLKSTGSGAAQ

Query:  SQPQ-----SSGCAC
         + Q       GC+C
Subjt:  SQPQ-----SSGCAC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G22290.1 RAB GTPase homolog H1D6.8e-9284.13Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MA  S LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDVA+R +FLNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        SKWIEEVR ER  DVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEG++K RE  VMFIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGME+ S+TK EDMVDVNLK T S ++Q  
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSSGCAC
         Q   C+C
Subjt:  PQSSGCAC

AT2G44610.1 Ras-related small GTP-binding family protein8.6e-10391.83Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MAP SALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQ+FLNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        +KWI+EVRTERGSDVI+VLVGNKTDLV+KRQVSIEE EAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKS+ + A+ +Q
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSSGCAC
         QS GC+C
Subjt:  PQSSGCAC

AT4G39890.1 RAB GTPase homolog H1C6.2e-8578.14Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MA  S LAK+KLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQ TIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVA++VYDV++RQTFLNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLS-STKQEDMVDVNLKSTGSGAAQ
        SKWIE+V  ERG S+VIIVLVGNKTDLVEKRQVSI EGE K +E  VMFIETSAK  FNIKALFRKIAAALPG+++ S +TK +DMVDVNLK+T S ++Q
Subjt:  SKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLS-STKQEDMVDVNLKSTGSGAAQ

Query:  SQPQ-----SSGCAC
         + Q       GC+C
Subjt:  SQPQ-----SSGCAC

AT5G10260.1 RAB GTPase homolog H1E9.2e-9788.46Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT
        MA  S LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVA+RQ+FLNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ
        SKWIE+VRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVSIEEG+ KAR+  V+FIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLK T S +AQ +
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQ

Query:  PQSSGCAC
         Q  GCAC
Subjt:  PQSSGCAC

AT5G64990.1 RAB GTPase homolog H1A1.9e-7876.38Show/hide
Query:  YKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNTSKWIEEVRT
        YKLVFLGDQ VGKTSIIT FMY KFD +YQATIGIDFLSKT   EDRT RLQLWDTAGQERF+SL+PSYIRDSSVAVIVYDVAS+Q+F+NTSKWIEEVR 
Subjt:  YKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNTSKWIEEVRT

Query:  ERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQPQSSGCAC
        ERGS VIIVLVGNKTDLV KRQVSIEEGE KARE   +F+ETSAKAGFNIK LF KI +AL G E +S TKQED+VDVNLK     +  +  Q S C+C
Subjt:  ERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQPQSSGCAC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCCCACCTCAGCTCTGGCGAAGTATAAGCTCGTCTTTCTCGGTGACCAGTCTGTTGGCAAAACCAGCATCATTACACGCTTCATGTACGACAAATTCGATAATAC
ATATCAGGCTACCATTGGTATTGATTTTCTCTCAAAAACCATGTATCTGGAAGATCGTACCGTTCGACTGCAGTTGTGGGACACTGCTGGACAGGAAAGATTCAGAAGTT
TAATACCAAGCTATATCAGGGACTCATCTGTAGCTGTCATCGTTTATGATGTTGCAAGCCGGCAAACTTTCCTAAACACTTCAAAGTGGATTGAGGAGGTGCGCACTGAG
AGAGGCAGTGATGTCATTATAGTGCTTGTTGGGAACAAAACGGACCTTGTGGAGAAGAGGCAAGTCTCCATAGAGGAAGGAGAAGCCAAAGCCCGTGAACTAAATGTCAT
GTTTATCGAAACAAGTGCTAAAGCTGGATTCAATATCAAGGCACTTTTCCGAAAAATTGCTGCAGCATTGCCGGGAATGGAAACTCTGTCGTCAACAAAACAAGAAGACA
TGGTCGATGTTAACTTGAAGTCCACAGGAAGTGGTGCCGCACAATCCCAGCCGCAGTCGAGCGGATGCGCGTGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAAAAAATGAAGGGTGAGAACGAACCGAGAAATTGGATCCGACCCGTTTGTAAAGAAATTTAGATCCTTGAGGAGTTAGTGCGAAACTGAAAGCAAATCAACACAAAG
AACAAACCAAAATCCAGAGTTTCTTCCATTTGCAACTCATTTCATTTCATTCCCAAACCTTCTTCTCCATCCCTTAATTCTTCCTCTCTCGGAATTTTCAATCACAGATC
TCCCCGGAAATGGCTCCCACCTCAGCTCTGGCGAAGTATAAGCTCGTCTTTCTCGGTGACCAGTCTGTTGGCAAAACCAGCATCATTACACGCTTCATGTACGACAAATT
CGATAATACATATCAGGCTACCATTGGTATTGATTTTCTCTCAAAAACCATGTATCTGGAAGATCGTACCGTTCGACTGCAGTTGTGGGACACTGCTGGACAGGAAAGAT
TCAGAAGTTTAATACCAAGCTATATCAGGGACTCATCTGTAGCTGTCATCGTTTATGATGTTGCAAGCCGGCAAACTTTCCTAAACACTTCAAAGTGGATTGAGGAGGTG
CGCACTGAGAGAGGCAGTGATGTCATTATAGTGCTTGTTGGGAACAAAACGGACCTTGTGGAGAAGAGGCAAGTCTCCATAGAGGAAGGAGAAGCCAAAGCCCGTGAACT
AAATGTCATGTTTATCGAAACAAGTGCTAAAGCTGGATTCAATATCAAGGCACTTTTCCGAAAAATTGCTGCAGCATTGCCGGGAATGGAAACTCTGTCGTCAACAAAAC
AAGAAGACATGGTCGATGTTAACTTGAAGTCCACAGGAAGTGGTGCCGCACAATCCCAGCCGCAGTCGAGCGGATGCGCGTGCTAATGAAGGACAATACGAGGGGTTATT
GAAGGAATCCAGTGTTTCTTGGTTTTTGCTTTGAACACCTCAACCTTCTTGAACTGTCAGCCCATTCAGGTAACAAAGATGAGGTTTTATATCTATGAATGCCTTCTTGA
GCAGAACTAAATTCGTAAAAATGTAATCGGTGGCAAAGAGTAGACTGAGTTGTTATTTTATCGAGTAATTTGATGTATTGGTTGGTGGAGTCATTGTTTGGGTTTTGGGA
TTCAGGAGATTGTAAAAAATAGAAAAAAAATTATGTGTTGGACTCGATTACAGAATTTGCTTTTATCTTGTAAGTTGTAATTCATCTCTAGAATATTTTGTTTTTCCATT
GGATTTTTGTTATGTTCTGCCTGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFLNTSKWIEEVRTE
RGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSIEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSTGSGAAQSQPQSSGCAC